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颗粒水凝胶作为脆性屈服应力流体
小鼠模型代表了研究与人类疾病相关的基因和变体的强大平台。虽然基因组编辑技术提高了模型开发的速率和精度，但在小鼠中预测和安装了模仿本地人类遗传环境的小鼠中特定类型的突变。计算工具可以识别和对齐来自不同物种的直系同源野生型遗传序列；但是，反映人类变体的核苷酸和/或多肽变化效应的等效小鼠变体的预测建模和工程仍然具有挑战性。在这里，我们提出了H2M（人类到鼠标），这是一种计算管道，用于分析人类遗传变异数据以系统地建模并预测等效小鼠变体的功能后果。我们表明，H2M可以使用精确的基因组编辑管道来整合鼠标到人类和旁系同源物变体映射分析分析，以制定针对小鼠中特定变体的模型定制的策略。我们利用这些分析来建立一个包含> 300万型人鼠的等效突变对，以及在计算机设计的基础和主要编辑库中的数据库，以设计4,944个经常性变体对。使用H2M，我们还发现，预测的致病性和免疫原性评分在人鼠变体对之间高度相关，这表明具有相似序列变化效应的变体也可能表现出广泛的种间功能保护。可以在https://human2mouse.com上访问H2M数据库（包括软件包和文档）。总体而言，H2M通过建立一个强大而多功能的计算框架来识别和建模物种之间的同源变体，同时提供关键的实验资源来增强功能遗传学和精确医学应用，从而填补了现场的空白。
抑制甲基腺苷磷酸化酶可保护免受实验性急性肾损伤 Startrace：个性化医学的多重器官Avatar药物测试平台 MAO-B抑制剂在鼠中的功能功效 抗血管病原体的水力发电 一种基于CRISPR-CAS9的工具，用于研究DSB剂量依赖性 农药暴露对神经炎症和小胶质细胞2 的影响 肠道3凝胶：一种用于培养人肠道菌群nataliasuárezvargas 1 *的高吞吐量粘液模型，Miguel Antunes 1 *; JoãoSobral1， 生物信息学分析确定了PHARC相关脂肪酶ABHD12 的酶活性序列决定因素 自闭症中E/I不平衡的验证和分析 NeuroDisk：一种自动化神经成像遗传学中连续询问驱动的发现的AI方法 用壳测量 与嗜性粒细胞增生的心脏病的病理生理学 通过功能 - 进行有效的K-MER设置操作 从文学到生物多样性数据：带有机器学习的采矿节肢动物和生态特征 颗粒水凝胶作为脆性屈服应力流体 小鼠人类遗传变异的计算建模 基于微型微镜的哺乳动物脑组织的密集连接组重建 创新的Nitinol Lumbar椎骨植入物
此预印本版的版权持有人于2025年2月23日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.19.639065 doi：Biorxiv Preprint
正常细胞和恶性细胞在染色体脆性和神经节苷脂表达方面的表型差异
通过光学显微镜观察 8 名恶性肿瘤患者和 8 名健康对照者的外周血淋巴细胞的中期，检测了自发性染色体脆性。在受试患者中，与对照组相比，自发性染色体脆性的频率明显更高，尤其是在着丝粒染色体区域。特别令人感兴趣的是涉及神经节苷脂、三肽谷胱甘肽 (GSH) 的还原形式和/或肿瘤抑制蛋白 HACE1 的相互作用。在实验室培养的小鼠胚胎 3T3 成纤维细胞、小鼠恶性骨髓瘤细胞以及两种细胞类型的混合培养物的实验体外模型提取物中神经节苷脂和抗神经节苷脂抗体的平均滴度之前，先将每个提取物通过 GSH-琼脂糖柱，以“选择”所述样本中对 GSH 具有亲和力的分子。此外，还测试了肿瘤抑制基因 HACE-1 在小鼠胚胎干细胞 (mESC) 和恶性人类宫颈癌 HeLa 细胞基因组中的存在和表达，这两种细胞都含有该基因的额外拷贝，通过用含有肿瘤抑制基因拷贝的适当重组 DNA 载体转染插入。开发的实验体外模型显示了特定的分子间相互作用，可以阻止疾病的发展。此外，还展示了非淋巴细胞类型产生抗体/免疫球蛋白的可能性。因为以这种方式产生的抗体位于专门的淋巴组织和器官中的生发中心之外，所以通过小离子和分子（如神经节苷脂）控制它们的功能非常重要。
打破脆性X染色体综合征的障碍
脆性 X 综合征 (FXS) 是一种遗传性疾病，由 X 染色体上的脆性 X 信使核糖核蛋白 1 (FMR1) 基因突变引起，导致智力障碍、行为障碍和独特的身体特征。该基因编码 FMRP 蛋白，该蛋白对于调节突触功能和可塑性至关重要。1,2 在 FXS 中，CGG 三核苷酸重复扩增超过 200 次重复会导致 FMR1 基因启动子区域高甲基化，从而导致转录沉默和随后的 FMRP 缺失。3 这种缺失会破坏对 mRNA 翻译的正常抑制，导致突触处各种蛋白质的过度合成。这些蛋白质的过量产生会干扰突触信号传导和可塑性，导致 FXS 中观察到的认知障碍和行为特征。4
脆性 X 综合征的女性携带者
母亲为前突变携带者（55-200 次重复）：CGG 重复在前突变范围内的女性是 FXS 携带者。她们本身没有 FXS，但有在以后的生活中患上脆性 X 相关疾病的风险。在 FXS 的女性携带者中，遗传变化可以随着传递给后代而扩大。这种扩大的可能性随着 CGG 重复次数的增加而增加。因此，具有前突变的女性可能会将全部突变遗传给她的孩子。
脆性星基因组照亮了动物附属再生的遗传基础
几乎所有现存的动物谱系中的物种都能够再生身体部位。但是，尚不清楚控制再生的基因表达程序是否在进化上保守。脆性恒星是一类具有出色再生能力的棘皮动物类，但是有限的基因组资源阻碍了对该组再生遗传基础的研究。在这里，我们报告了脆性恒星Amphiura Filiformis的染色体规模的基因组组件。我们表明，脆性星基因组是到目前为止测序的棘皮动物中最重新排列的，其重新组织的HOX群集让人联想到海胆中观察到的重排。此外，我们在脆性恒星成人手臂再生过程中对基因表达进行了广泛的分析，并确定了控制伤口愈合，增殖和分化的基因表达的顺序波。我们与其他无脊椎动物和脊椎动物模型进行了比较转录组分析，以进行附加物再生，并发现了数百个具有保守表达动力学的基因，尤其是在再生的增殖阶段。我们的发现强调了棘皮动物检测脊椎动物和经典无脊椎动物再生模型系统之间的远程表达保护的关键重要性。
对脆性和硬材料的超快激光处理的调查审查
摘要：由于开发了搅动的脉冲扩增技术，超快激光技术已从超快转移到了超强。超快激光技术，例如飞秒激光器和皮秒激光器，已迅速成为处理脆性和硬材料以及复杂的微型组件的灵活工具，这些工具被广泛用于医疗，航空航天，半导体应用等。但是，超快激光与脆性和硬材料之间相互作用的机制尚不清楚。同时，这些材料的超快激光处理仍然是一个挑战。此外，还需要开发使用超快激光器的高效和高精度制造。本综述着重于脆性和硬材料的超快激光处理的常见挑战和现状，例如基于镍的超合金，热屏障陶瓷，钻石，二氧化硅和碳化硅复合材料。首先，根据其带隙宽度，导热率和其他特征来区分不同的材料，以揭示在脆性和硬材料的超快激光处理过程中激光能量的吸收机制。其次，通过分析激光诱导的等离子体中的光子与电子和离子之间的相互作用以及与材料连续体的相互作用来研究激光能量转移和转化的机制。第三，讨论了关键参数与超快激光处理质量之间的关系。最后，详细探讨了复杂的三维微型组件的高效和高精度制造的方法。
自闭症和脆性 X 综合征患者的皮层下大脑发育：婴儿期动态、年龄和疾病特异性轨迹的证据
卡罗来纳发育障碍研究所和精神病学系（Shen、Girault、Kim、Smith、Graves、Weisenfeld、Gross、Styner、Hazlett、Piven）和北卡罗来纳大学教堂山分校医学院神经科学中心（Shen）；明尼阿波利斯明尼苏达大学教育心理学系（Wolff）、儿童发展研究所（Elison）和儿科学系（Elison、Burrows）；圣路易斯华盛顿大学医学院 Mallinckrodt 放射学研究所（Flake、McKinstry、Botteron）；西雅图华盛顿大学医学中心放射学系（Dager）；费城宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院费城儿童医院自闭症研究中心（Pandey、Schultz）；纽约大学坦登工程学院计算机科学与工程系（Gerig）；蒙特利尔神经学研究所，麦吉尔大学，蒙特利尔（MacIntyre、Fonov、Collins、Evans）；加拿大艾伯塔大学，埃德蒙顿，儿科系（Zwaigenbaum）；华盛顿大学，西雅图，言语和听力科学系（St. John、Estes）；德克萨斯大学达拉斯分校，行为与脑科学学院（Swanson）。