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留尼汪岛新分离的 Dysmorphococcus 菌株作为高价值类胡萝卜素潜在来源的研究
摘要：某些次级类胡萝卜素，如虾青素和角黄素，在人类营养、食品、健康和化妆品以及饲料和水产养殖领域具有越来越大的经济价值，特别是因为它们具有多种生物活性，例如其显著的抗氧化特性。本研究致力于评估在光生物反应器中培养从留尼汪岛生物多样性中新分离的 Dysmorphococcus 菌株以生产这些有价值的叶黄素的可行性。结果表明，所有这些菌株都能够在环境压力下产生和积累角黄素和虾青素。其中，一株与其他 Dysmorphococcus 菌株相比，其形态、遗传和生化特性非常有趣，在 3 L 台式光生物反应器中进一步培养，发现其产生的富含类胡萝卜素的生物质浓度最高，产量分别约为 4 g L − 1 dw 和 0.055 g L − 1 d − 1 dw。我们还发现，生物质中含有高达 1.2 mg g − 1 dw 的角黄素和 0.7 mg g − 1 dw 的不同形式的虾青素，主要是虾青素单酯。我们发现这些类胡萝卜素的生产率低于之前报道的其他微藻物种的生产率，我们建议需要进一步优化培养和胡萝卜素生成诱导过程，以提高生产率，并使这种局部分离的 Dysmorphococcus 菌株可用于未来商业化生产天然角黄素和虾青素。
Mycoplasmoides Cavipharyngis菌株的完整基因组117c，是血液营养不良的亲戚
ycoplasmoides（同义词：[mycoplasma]）Cavipharyngis（1），最初从豚鼠的鼻咽中分离出来，特征在于，葡萄糖发酵的葡萄糖发酵型支原体，对16s rrna gene of MycopoplastoIses of Mycopoplasmoidies of Mycoplastoioses offioside offioside offioside oscopiosidiose（2）castioside oftsidiosides（2）。基于16S rRNA序列的系统发育分析揭示了在支原体肺炎肺炎肺炎链球菌中的Cavipharyngis和M. factidiosum的独特簇的形成，称为M. factidiosum cluster（3）。该簇被描述为与血液营养不良（HM）（3-5）最密切相关。hms是高度特别的，迄今为止无法培养的细菌，在全球各种哺乳动物中引起感染性溶血性贫血（6）。相反，M。fostidiosum和M. cavipharyngis是具有建立的维特罗培养系统的良好的致命物种（2，7）。因此，有关Cavipharyngis和M. factidiosum的基因组信息对于理解HM与其他支原体物种的进化分离以及对视野内种植系统的解密新方法至关重要。
乳酸乳杆菌乳腺癌益生菌菌株在治疗铬酸盐诱导的皮炎
铬酸盐诱导的皮炎是一个重大的职业健康问题。铬酸盐（CR）抗乳糖酶鼠李糖菌株是从商业益生菌prepro和Hiflora中分离出来的。在13个耐CR的细菌分离株中，根据500 ug/ml的高铬酸盐耐药性选择了6种。选定的分离株进行生化和分子表征以及体内分析。DPC测定，以确定分离细菌的降低潜力。选定的分离株被鉴定为L. rhamnosus -L1（Pp493917），L。rhamnosus -L2（Pp493918），L。Rhamnosus-L3（PP493921）L。 Rhamnosus -L12（PP493923）。乳酸乳杆菌L1SHOSUS l1展示了对CR（VI）的最高耐药性，降低了潜在的56％。进行了体内实验，以评估分离的细菌菌株对小鼠皮肤的愈合作用，并用苏木精和曙红（H＆E）染色，用于鉴定皮肤组织中严重的皮炎并评估益生菌菌株的治疗作用。使用生物信息学工具进行了鼠李乳杆菌的黄素还原酶蛋白的结构测定。这些工具预测了细菌CR（VI） - 氧化系统中黄素还原酶蛋白的基于结构的功能同源。由于其较高的铬酸盐耐药性和降低潜力，可有效地用于铬酸盐诱导的皮炎，可有效地用于乳酸酶乳酸乳酸酶乳酸乳腺乳酸乳酸乳酸酶。
从珍珠牡蛎中分离出的乳杆菌菌株的益生菌潜力
传染病暴发是水产养殖中的主要挑战之一。因此，对可持续水产养殖实践的益生菌的应用有越来越多的兴趣，以最大程度地减少传染病的传播。在这项研究中，将细菌从Pinctada降射中分离出来，以检查其益生菌潜力。 乳酸细菌（LAB）可能是水产养殖的益生菌候选物。 从珍珠牡蛎p的肠道含量中分离出五个实验室菌株。 Radiata（Leach，1814年），位于红海的吉达海岸。 实验室在形态，生物学和生化上进行了特征，检查了其益生菌特性，并使用16S rRNA测序鉴定。 五个选定的孤立实验室菌株是革兰氏阳性（杆和球菌），并测试了过氧化氢酶和氧化酶的阴性。 实验室菌株被鉴定为Valezensis（POR1），B。siamensis（Por2），葡萄球菌表皮＃1和S。 表皮＃2（POR3和POR5）和s。 hominis（POR4）。 POR1和POR2测试了γ-溶血活性的阴性，而POR3，POR4和POR5测试了α-溶血活性阳性。 所有五种菌株均对抗生素敏感，包括红霉素（E10），硝基纤维化（F100）和Novobiocin（NV5），四种菌株显示出高达2.5 pH的酸耐受性。 在分离株中，POR1、2、4、5耐受的3小时暴露于0.3％的胆汁盐。 所有实验室菌株均表现出对S临床菌株的拮抗活性。 金黄色葡萄球菌，鲍马尼杆菌，耐甲氧西林的s。 金黄色和大肠杆菌。在这项研究中，将细菌从Pinctada降射中分离出来，以检查其益生菌潜力。乳酸细菌（LAB）可能是水产养殖的益生菌候选物。从珍珠牡蛎p的肠道含量中分离出五个实验室菌株。Radiata（Leach，1814年），位于红海的吉达海岸。实验室在形态，生物学和生化上进行了特征，检查了其益生菌特性，并使用16S rRNA测序鉴定。五个选定的孤立实验室菌株是革兰氏阳性（杆和球菌），并测试了过氧化氢酶和氧化酶的阴性。实验室菌株被鉴定为Valezensis（POR1），B。siamensis（Por2），葡萄球菌表皮＃1和S。表皮＃2（POR3和POR5）和s。hominis（POR4）。POR1和POR2测试了γ-溶血活性的阴性，而POR3，POR4和POR5测试了α-溶血活性阳性。所有五种菌株均对抗生素敏感，包括红霉素（E10），硝基纤维化（F100）和Novobiocin（NV5），四种菌株显示出高达2.5 pH的酸耐受性。在分离株中，POR1、2、4、5耐受的3小时暴露于0.3％的胆汁盐。所有实验室菌株均表现出对S临床菌株的拮抗活性。金黄色葡萄球菌，鲍马尼杆菌，耐甲氧西林的s。金黄色和大肠杆菌。因此，可以建议从p的肠道含量分离出的五个实验室菌株。辐射可能是水产养殖应用的良好候选益生菌。
表征从污水感染沙门氏菌的临床菌株的kayfunavirus属的沙门氏菌噬菌体
在沙门氏菌中多药耐药性的出现，引起食物传播感染，是一个重大问题。在沙门氏菌中有超过2,600种血清射手，至关重要的是为每种血清的特定溶液确定特定溶液。噬菌体疗法是另一种治疗选择。在这项研究中，VB_SALP_792噬菌体是从污水中获得的，在13个经过测试的临床S.肠分离株中，有8个形成斑块。透射电子显微镜（TEM）检查显示出T7样形式。噬菌体的特征是食物来源中其稳定性，生命周期，抗生素和裂解能力。噬菌体在整个温度（-20至70°C），pH值（3-11）以及氯仿和乙醚中保持稳定。它还在0.0001至100的MOI范围内表现出裂解活性。生命周期表明，在3分钟内附着在宿主上的噬菌体中有95％，然后是5分钟的潜在时期，导致50 PFU/细胞爆发的大小。VB_SALP_792噬菌体基因组的DSDNA长度为37,281 bp，GC含量为51％。有42个编码序列（CD），有24个具有推定功能，没有抗性或毒力相关的基因。VB_SALP_792噬菌体显着降低了已建立的生物膜和蛋清中的细菌载荷。Thus, vB_SalP_792 phage can serve as an effective biocontrol agent for preventing Salmonella infections in food, and its potent lytic activity against the clinical isolates of S. enterica , sets out vB_SalP_792 phage as a successful candidate for future in vivo studies and therapeutical application against drug- resistant Salmonella infections.
迷你审查：人类健康的宝贵盟友：limosilactobacillus reuteri的益生菌菌株
摘要。世界卫生组织将益生菌定义为“活体生物，如果以足够的量给予益生菌，则赋予宿主的健康益处”。研究最精心的益生菌之一是limosilactobacillus reuteri，这是一种革兰氏阳性的棒状细菌，可在哺乳动物和鸟类的粘膜表面定居，被认为是人类微生物组的自卫星。遗传分析已经确定了这种微生物与其宿主共同发展，这是建立共同关系的前提。一方面，L。Reuteri通过释放抗菌化合物（例如Reuterin和数值活性代谢产物）来促进宿主的健康，这些化合物可以越过上皮屏障并达到不同的靶标。其次，由于形成生物膜的能力，它可以直接防止致病细菌通过致病性细菌的粘膜定植。由L. Reuteri产生的许多效应分子的表征提供了对机制的广泛理解，通过这种机制，它不仅在胃肠道内显示出抗微生物和免疫调节活性，而且还可以影响身体远端位置的正确平衡。这个微型审查的过程简要概述了，该概述与R. Reuteri高乳杆菌的最著名特性有关所涉及的主要生物过程。
食品微生物之检验方法-乳酸菌-青春双叉乳酸杆菌之检验
Applied Biosystems QuantStudio TM 5 Real-Time PCR System 鑑別試驗用 5 µM 引子 F .......................................................................................... 1.0 µL 5 µM 引子 R ......................................................................................... 1.0 µL 3.3 µM 探針 P ........................................................................................................................................................................................................................................... ............................................................................................... 20.0 µL 註 3 ： Real-time PCR 溶液應於冰浴中配製。 2.6.检体DNA溶液之制备2.6.1。分离菌株之dna
酵母 synIX 菌株中端粒酶相关适应性缺陷和染色体替代技术的后果
Build-A-Genome 课程的作者：Breeana G. Anderson、Abena Apaw、Pavlo Bohutskyi、Erin Buchanan、Daniel Chang、Melinda Chen、Eric Cooper、Amanda Deliere、Kallie Drakos、Justin Dubin、Christopher Fernandez、Zheyuan Guo、Thomas Harrelson、Dongwon Lee、Jessica McDade、Scott Melamed、Héloise Muller、Adithya Murali、José U. Niño Rivera、Mira Patel、Mary Rodley、Jenna Schwarz、Nirav Shelat、Josh S. Sims、Barrett Steinberg、James Steinhardt、Rishi K. Trivedi、Christopher Von Dollen、Tianyi Wang、Remus Wong、Yijie Xu、Noah Young、Karen Zeller 和 Allen Zhan。 1 纽约大学朗格尼健康学院系统遗传学研究所和生物化学与分子药理学系，纽约，纽约州 10016，美国 2 约翰霍普金斯大学彭博公共卫生学院环境健康与工程系，美国马里兰州巴尔的摩 21205，美国 3 欧洲分子生物学实验室 (EMBL)，基因组生物学部，德国海德堡 69117 4 爱丁堡大学生物科学学院，英国爱丁堡 EH9 3BF 5 爱丁堡大学信息学院，英国爱丁堡 EH8 9AB 6 约翰霍普金斯大学惠廷工程学院生物医学工程系，美国马里兰州巴尔的摩 21218，美国 7 约翰霍普金斯大学克里格艺术与科学学院生物学系，美国马里兰州巴尔的摩 21218，美国 8 化学与生物分子工程系，约翰霍普金斯大学怀廷工程学院，美国马里兰州巴尔的摩 21218 9 洛克菲勒大学细胞与结构生物学实验室，美国纽约州纽约 10065 10 格罗宁根大学医学中心欧洲老龄化生物学研究所，荷兰格罗宁根 11 哈佛医学院麻省总医院病理学系，美国马萨诸塞州波士顿 02114 12 约翰霍普金斯大学医学院医学系/传染病科，美国马里兰州巴尔的摩 21205 13 约翰霍普金斯大学医学院高通量生物学中心，美国马里兰州巴尔的摩 21205 14 斯坦福大学斯坦福基因组技术中心，美国加利福尼亚州帕洛阿尔托 94304 15 斯坦福大学医学院遗传学系，美国加利福尼亚州斯坦福 94305 16 纽约大学生物医学工程系Tandon 工程学院，纽约布鲁克林 11201，美国 17 现地址：欧莱雅研究与创新，新泽西州克拉克 07066，美国 18 现地址：Pondicherry Biotech Private Limited，Pondicherry 工程学院校区，East Coast Road，Pillaichavady，Puducherry 605014，印度 19 现地址：哈佛大学陈曾熙公共卫生学院生物统计学系，马萨诸塞州波士顿 02115，美国 20 现地址：Neochromosome，Inc.，纽约长岛市 11101，美国 21 现地址：科学与工业研究中心，基因组学与综合生物学研究所，Sukhdev Vihar，Mathura Road，新德里 110025，印度 22 这些作者贡献相同 23 主要联系人 * 通讯：weimin.zhang@nyulangone.org (WZ)，jef.boeke@nyulangone.org (JDB), chandra@jhmi.edu (SC)
铜绿假单胞菌噬菌体抗性菌株中防御系统的积累
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可，根据未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者（此版本于 2023 年 6 月 2 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.08.12.503731 doi：bioRxiv 预印本
从芽型农业菌株中利用发育基因进行利他转化
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