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种子接种耐盐菌株可促进十字花科植物在盐渍条件下的幼苗生长
摘要：土壤盐分抑制作物发芽和幼苗生长，导致作物立地不均、生长不均匀、产量低下。本研究旨在评估接种从盐渍土中分离的植物生长促进细菌 (PGPB) 菌株 (E1 和 T7) 的十字花科种子的早期耐盐性。在对照和盐度条件下培养未接种和接种的 Lobularia maritima、Sinapis alba 和 Brassica napus 种子，首先在琼脂平板中评估每种盐的发芽抑制浓度，然后在用含有 0 或 75 mM NaCl 的水灌溉的土壤中培养。我们的结果表明，T7 是唯一能够在盐渍条件下增加 L. maritima 发芽的菌株。然而，接种 T7 的 L. maritima 和 S. alba 植物以及接种 E1 的 B. napus 植物的茎生物量、根长和分枝数均有所增加。同时，这些幼苗表现出较少的氧化损伤和更强的平衡植物活性氧生成的能力。这项研究表明，用耐盐 PGPB 菌株接种种子是一种适合在早期阶段改善盐度负面影响的策略。尽管如此，观察到的特定植物-宿主相互作用凸显了针对特定不利环境条件建立定制的 PGPB-作物关联的必要性。
沙门氏菌菌株中1类整合子的基因盒的抗菌抗性和分子表征
2022年3月8日收到； 2022年6月23日接受；于2022年9月7日出版作者分支：1个Weifang People Hospital的临床实验室，中国山东省Weifang街151号； 2中国山东省Qingdao Binhai大学临床实验室临床实验室。*通信：Shirong Li，LSR2270@163. COM关键字：1类Integron;沙门氏菌；抗生素抗性；发起人。缩写：氨苄青霉素的放大器； AZ，阿奇霉素； Caz，头孢济； CIP，环丙沙星； CRO，头孢曲松； Inti1，1级整数； Lev，左氧氟沙星； MDR，多药电阻； MIC，最小抑制浓度； PCR，聚合酶链反应； SXT，甲氧苄啶/磺胺甲恶唑。存储库：GenBank No。KY399738.1（样本号 68）; GenBank No。 KY399738.1（样本号 77）; GenBank No。 fr875297.1（示例号 45）; GenBank No。 CP054232.1（样本号 79）; GenBank No。 CP033636.1（样本号 35）; GenBank No。 EU675686.2（样本号 44）。 001574©2022作者KY399738.1（样本号68）; GenBank No。KY399738.1（样本号 77）; GenBank No。 fr875297.1（示例号 45）; GenBank No。 CP054232.1（样本号 79）; GenBank No。 CP033636.1（样本号 35）; GenBank No。 EU675686.2（样本号 44）。 001574©2022作者KY399738.1（样本号77）; GenBank No。fr875297.1（示例号45）; GenBank No。CP054232.1（样本号79）; GenBank No。CP033636.1（样本号 35）; GenBank No。 EU675686.2（样本号 44）。 001574©2022作者CP033636.1（样本号35）; GenBank No。EU675686.2（样本号 44）。 001574©2022作者EU675686.2（样本号44）。001574©2022作者
从粪便样品中分离出的甲烷素史密斯菌株B181的基因组序列
3。课程C，Hammer HF，Hammer，Hammer， 人类胃鼻虫中的甲烷发育。 Hepol Gastroenterol Nat 19：805–813。 ：//doi.org/10.1038/s41575-022- 00673-z 4。 Catelier E，完成T，Qin J，Prince E，Hildebrand F，False G，Aluminum M，Aluminant M，Batto J-M，Kennedy S等。 2013。 人类具有代谢标记的丰富性。 自然500：541–546。 https://doi.org/10.1038/natur12506 5。 用户U，Shukla R，Wrimp D，UC Hashal。 2016。 非常综合征肠。 Word 10：932–938。 https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡，Van Dijk JB，CM Pluge，CM。 1993。 IMPL返回微生物59：1114–1119。 59.4.4 fastQC：数据集的质量控制。 编织：http：//www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织： 练习A，Antipov D，Meleshko D，Lapidus A，Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70：E102。课程C，Hammer HF，Hammer，Hammer，人类胃鼻虫中的甲烷发育。Hepol Gastroenterol Nat 19：805–813。Catelier E，完成T，Qin J，Prince E，Hildebrand F，False G，Aluminum M，Aluminant M，Batto J-M，Kennedy S等。2013。人类具有代谢标记的丰富性。自然500：541–546。https://doi.org/10.1038/natur12506 5。 用户U，Shukla R，Wrimp D，UC Hashal。 2016。 非常综合征肠。 Word 10：932–938。 https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡，Van Dijk JB，CM Pluge，CM。 1993。 IMPL返回微生物59：1114–1119。 59.4.4 fastQC：数据集的质量控制。 编织：http：//www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织： 练习A，Antipov D，Meleshko D，Lapidus A，Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70：E102。https://doi.org/10.1038/natur12506 5。用户U，Shukla R，Wrimp D，UC Hashal。2016。非常综合征肠。Word 10：932–938。 https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡，Van Dijk JB，CM Pluge，CM。 1993。 IMPL返回微生物59：1114–1119。 59.4.4 fastQC：数据集的质量控制。 编织：http：//www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织： 练习A，Antipov D，Meleshko D，Lapidus A，Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70：E102。Word 10：932–938。https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡，Van Dijk JB，CM Pluge，CM。 1993。 IMPL返回微生物59：1114–1119。 59.4.4 fastQC：数据集的质量控制。 编织：http：//www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织： 练习A，Antipov D，Meleshko D，Lapidus A，Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70：E102。https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。AJM海峡，Van Dijk JB，CM Pluge，CM。1993。IMPL返回微生物59：1114–1119。59.4.4fastQC：数据集的质量控制。编织：http：//www.braham。B.2014。BBTools软件包装。编织：练习A，Antipov D，Meleshko D，Lapidus A，Chorobell A.2020。使用组件的水疗中心。原始的Currish Bioinform 70：E102。https：//doi.org/10.1002/cpbi.102
评估抑制谷菌孢子菌素的能力，在某些酵母菌菌株的芒果上引起炭疽病
这项研究的目的是在HOA loc sand芒果果皮上收集，分离和识别一些酵母品种，能够抑制浓咖啡酸盐的糖菌蘑菇，这些蘑菇在收获后在舞台上在芒果上引起炭疽病。在这项研究中，酵母菌菌株从芒果壳中取代，芒果壳基于许多不同的方法，包括形态特征，生化特征和分析26S rDNA序列。结果确定了三种酵母菌，包括Hanseniasporta Thailandica，Hanseniasporta Oputiae和Pichia Barkeri。然后，这些酵母菌菌株对Colletotrichum gloeosporioides的抑制能力是通过CO培养方法在体外进行的，结果表明，在培养10天后，拮抗剂比50％以上的拮抗率高于50％。这项研究最初表明，使用酵母来控制生物学是控制收获后对芒果的致病作用的潜在方法。
使用液滴微流体技术进行可扩展且自动化的基于 CRISPR 的菌株工程
摘要 我们提出了一种基于液滴的微流体系统，该系统可在芯片上实现基于 CRISPR 的基因编辑和高通量筛选。微流体装置包含一个 10 × 10 元件阵列，每个元件包含用于两个电场驱动操作的电极组：用于合并液滴以混合试剂的电润湿和用于转化的电穿孔。该装置可以并行执行多达 100 个基因改造反应，为生成遗传途径组合优化和可预测生物工程所需的大量工程菌株提供了一个可扩展的平台。我们通过基于 CRISPR 的两个测试案例的工程改造展示了该系统的能力：（1）破坏大肠杆菌中酶半乳糖激酶（galK）的功能；（2）靶向改造谷氨酰胺合成酶基因（glnA）和蓝色色素合成酶基因（bpsA），以提高大肠杆菌中的靛蓝素产量。
比较基因组学揭示了果乳杆菌菌株的遗传多样性和代谢性状的变化
精神病经历（PES）发生在5 - 10％的一般人群中，并且与儿童创伤和产科并发症有关。然而，这些关联下的神经生物学机制尚不清楚。使用了父母和孩子的雅芳纵向研究（ALSPAC），我们研究了138名20岁的年轻人（n = 49个怀疑，n = 53，定义，n = 36个精神病）和275个对照。Voxel-based morphometry assessed whether MRI measures of grey matter volume were associated with (i) PEs, (ii) cumulative childhood psychological trauma (weighted summary score of 6 trauma types), (iii) cumulative pre/peri-natal risk factors for psychosis (weighted summary score of 16 risk factors), and (iv) the interaction between PEs and cumulative trauma or pre/peri-natal risk.pes与较小的左后扣带回（p fwe <0.001，z = 4.19）和丘脑体积（p fwe = 0.006，z = 3.91）有关。累积前/围产期风险与较小的左下扣带回体积有关（P FWE <0.001，Z = 4.54）。A signi fi cant interaction between PEs and cumulative pre/perinatal risk found larger striatum ( p FWE = 0.04, Z = 3.89) and smaller right insula volume extending into the supramarginal gyrus and superior temporal gyrus ( p FWE = 0.002, Z = 4.79), speci fi cally in those with de fi nite PEs and psychotic disorder.累积的儿童创伤与较大的左背纹状体（P FWE = 0.002，Z = 3.65），右前额叶皮层（P FWE <0.001，Z = 4.63）和所有参与者中较小的左岛体积相关（P FWE = 0.03，Z = 3.60），并且与PES组无关。总而言之，预/周期的危险因素和儿童心理创伤会影响相似的大脑通路，即较小的岛状和较大的纹状体体积。在患有更严重的PE的患者中，前/围产期风险的影响最大，而在所有参与者中都看到创伤的影响。总而言之，环境风险因素会影响与精神分裂症有关的大脑网络，这可能会增加个人发展以后精神病的倾向。
通过挥发性有机化合物促进植物生长促进，该化合物发出的vallismortis菌株Extn-1
挥发性有机化合物（VOC）由潜在的植物生长促进根瘤菌（PGPR）在植物相互作用中起重要作用。然而，这种现象的基础机制尚不清楚。我们的发现表明，PGPR菌株Vallismortis（Extn-1）对烟草植物生长的VOC的影响取决于所使用的培养基。从含糖媒体（例如马铃薯葡萄糖琼脂（PDA）和国王B（KB）媒体）发行的VOCs非常有效。然而，暴露于营养琼脂（NA），胰蛋白酶大豆琼脂（TSA）和Luriabertani（LB）中的VOC暴露导致氯化和发育迟缓的植物生长。这种效果是由大量氨的排放引起的，从而改变了植物生长培养基的pH值。在VOC中暴露于10天的幼苗，即使在温室条件下消除了VOC，也会表现出改善的生长。与未处理的对照相比，与未处理的对照相比，用VOC的种子启动24和48小时，与未经处理的对照相比，与24小时的治疗相比，接触48小时的种子更好。使用与气相色谱 - 质谱法（GC-MS）结合的固相微萃取（SPME）在不同培养基中发出的VOC的化学表征，显示所有光谱中存在2,3-丁烷甲苯和一氧化氢。然而，1-丁醇是在Kb和Na中生长的Extn-1的显着峰值，而Acetoin在PDA中最高，其次是KB。Heneicosane和苯甲醛是在NA培养基中仅生产的，这些合成化合物改善了I-Plate分析的生长。这项工作表明从Extn-1释放的VOC对于ExtN-1的增长效应很重要。
新型的野生型Pediococcus和Lactiplantibacillus菌株作为益生菌候选者，以管理与肥胖相关的胰岛素抵抗
1分子生物学与遗传学系，德拉斯民主大学，希腊68100 Alexandroupolis； swmalouparaskevi@gmail.com（P.S.）; iprapa@mbg.duth.gr（i.p.）; elastyl@gmail.com（E.S.）; aikspiridopoulou@gmail.com（K.S.）; gskavdis@mbg.duth.gr（G.S.）; mgrigor@mbg.duth.gr（M.E.G.）2克里特岛克里特大学医学院实验室医学系临床化学实验室，希腊克里特岛71003； eleftheriaier@hotmail.com（e.i。 ）; tsatsani@uoc.gr（C.T。） 3应用技术中心应用科学研究所，希腊塞萨洛尼基57001； riafeidaki@gmail.com（k.f. ）; Argiriou@certh.gr（A.A.）4阿埃吉亚大学食品科学与营养系，希腊81400，希腊5 QLC，26442 Patras，希腊； panas@qlc.gr 6分子生物学与生物技术研究所，希腊赫拉克里昂71100 *通信：ikourkou@mbg.duth.gr;电话。 ： +30-25510-30633†这些作者对这项工作也同样贡献。2克里特岛克里特大学医学院实验室医学系临床化学实验室，希腊克里特岛71003； eleftheriaier@hotmail.com（e.i。）; tsatsani@uoc.gr（C.T。）3应用技术中心应用科学研究所，希腊塞萨洛尼基57001； riafeidaki@gmail.com（k.f.）; Argiriou@certh.gr（A.A.）4阿埃吉亚大学食品科学与营养系，希腊81400，希腊5 QLC，26442 Patras，希腊； panas@qlc.gr 6分子生物学与生物技术研究所，希腊赫拉克里昂71100 *通信：ikourkou@mbg.duth.gr;电话。： +30-25510-30633†这些作者对这项工作也同样贡献。
开发一种快速定量方法，以区分MS1疫苗菌株与野生型支原体Synoviae
支原体Synoviae（MS）是家禽行业中经济上重要的病原体。疫苗接种是预防和控制MS感染的有效方法。目前可获得两种活体减毒MS疫苗，即温度敏感的MS-H疫苗菌株和NAD独立的MS1疫苗菌株。疫苗菌株与野生型（WT）菌株的分化对于监测MS感染至关重要，尤其是在疫苗接种后。在这项研究中，我们开发了一种Taqman双链实时聚合酶链反应（PCR）方法，以鉴定来自WT菌株的MS1疫苗菌株。该方法是特异性的，并且没有与其他禽病原体交叉反应。灵敏度分析表明，在双工实时PCR中，探针或混合模板和纯模板之间没有抑制作用。与基于熔体的不匹配扩增突变测定（MAMA）相比，我们的方法更敏感和快速。总而言之，Taqman双工实时PCR方法是单个反应中WT-MS和MS1疫苗菌株的诊断和分化的有用方法。
抗螺旋内乳房蛋白质抗螺旋体ZEA菌株的染色体规模基因组组装蛋白
Helicoverpa Zea（鳞翅目：夜养科）是北美洲和南美主要种植作物的害虫。该物种适应了不同的宿主植物，并对几种杀虫剂产生了抗性，包括苏云金芽孢杆菌（BT）杀虫蛋白在转基因棉和玉米中。Helicoverpa Zea种群在热带和亚热带地区全年持续存在，但是季节性迁移到温带地区增加了相关作物损害的地理范围。为了更好地了解这些生理和生态特征的遗传基础，我们为来自BT抗性菌株的单个H. Zea雄性HAZSTARK_CRY1ACR生成了高质量的染色体水平组装。HI-C数据用于将最初的375.2 MB重叠组装脚手架成30个常染色体和Z性染色体（支架N50 = 12.8 MB和L50 = 14）。SCAF折叠组件是通过新型管道PolishClr对错误校正的。线粒体基因组通过改进的管道组装并注释。对该基因组组装的评估表明，鳞翅目基准通用单拷贝直系同源物集的98.8％是完整的（98.5％作为完整的单副本）。重复元素约占组装的大约29.5％，其多数（11.2％）被归类为恢复元素。这个针对H. Zea的染色体规模参考组件，Ilhelzeax1.1，将促进未来的研究，以评估和增强可持续的作物生产实践。