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Minas Tirith：一种用于模拟辐射诱导的DNA损伤在细胞种群水平
抽象目标。可以通过实验和建模的结合来理解辐射诱导的DNA损伤的机制。当前，大多数生物学实验是通过辐照整个细胞群来进行的，而辐射诱导效应的建模通常是通过蒙特卡洛模拟进行的，其轨道结构代码与单细胞核的逼真的DNA几何形状结合。但是，两种方法之间的尺度差异阻碍了直接比较，因为由于能量沉积的随机性，细胞群中的剂量分布不一定均匀。因此，这项研究提出了Minas Tirith工具，以模拟辐射诱导的DNA损伤在细胞种群中的分布。方法。所提出的方法基于使用Geant4-DNA Monte Carlo Toolkit生成的微渗透参数和DNA损伤分布的预先计算数据库。首先，针对特定吸收的剂量D分配了一个特定的能量Z，在微观法形式主义之后进行了ABS。然后，根据特定能量Z分配了每个细胞的DNA损伤事件，尊重其发生的随机特征。主要结果。这项研究通过将其结果与使用Geant4-DNA轨道结构代码和基于Geant4-DNA的基于GEANT4-DNA的模拟链进行比较的结果来验证了Minas Tirith工具。明显的能力。此外，该工具可以在建模和生物学实验之间进行更直接的比较。在人群中剂量分布以及DNA损伤量计算的情况下，比较的不同元素表明Minas Tirith和Monte Carlo模拟之间的一致性。minas tirith是一种在细胞种群水平上计算辐射诱导的DNA损伤的新方法，与使用轨道结构代码获得的辐射剂量相比，该方法促进了合理的模拟时间。
Cas9和雷帕霉素诱导的CRE重组酶的本构表达促进了Berghei疟原虫中的条件基因组编辑
疟疾是由疟原虫属的原生动物寄生虫引起的，并且仍然是全球健康问题。寄生虫具有高度适应的生命周期，其中包括脊椎动物宿主中的连续无性复制和蚊子载体围绕中的性成熟。寄生虫的遗传操纵对破译疟原虫基因功能的功能具有重要作用。常规的反向遗传工具不能用于研究无性血液阶段的基本基因，从而需要制定条件策略。在各种此类策略中，雷帕霉素可诱导的可二聚化CRE（DICRE）重组酶系统是一种有条件地编辑人类感染的恶性疟原虫和啮齿动物疟疾模型寄生虫寄生虫P. Berghei的强大方法。我们先前生成了表达二甲虫的berghei线，并通过有条件地删除了几个必不可少的无性阶段基因来验证它，从而揭示了它们在孢子虫中的重要作用。另一个有效的工具是CRISPR/CAS9技术，该技术已启用了具有更高精度和特异性的目标基因组编辑，并且在疟原虫属中具有大量先进的基因组工程。在这里，我们通过在寄生虫中整合了Dicre盒和荧光标记来开发新的Berghei寄生虫线，以组成表达Cas9。由于CRISPR/CAS9和DICRE的双重整合，这些新系列允许同时进行无与伦比的基因修饰和条件调节。为了说明这种新工具的多功能性，我们有条件地淘汰了编码贝尔格（P. Berghei）类似claudin的apicomplexan微米蛋白（夹具）的基本基因，并确认了夹具在侵入红细胞细胞中的作用。
大鼠半乳糖诱导的白内障
背景：大鼠模型由于其成本效益以及与人类的显着生理和遗传相似性而广泛用于研究白内障，这项研究的目的是确定由于大鼠的半乳糖暴露而导致白内障的基因。方法：我们分析了来自基因表达综合的四个数据集，包括不同大鼠菌株中白内障的离体和体内模型。特征选择工具用于识别与白内障相关基因表达中潜在相关的基因。实施了决策树算法，并使用摇动和石灰来解释其预测。为了验证基因表达水平，在M199培养基中培养的六个大鼠透镜上进行了PCR，仅在M199中诱导白内障和六个镜片。结果：使用特征选择工具，四个关键基因 - plagl2，cmtm7，pcyt1b和nr1d2。在分析的数据集之间，只有白内障和对照组之间的PCYT1B显着差异。该模型显示出强大的预测性能，尤其是在离体数据集中。摇摆和石灰分析表明，CMTM7对模型预测的影响最大。PCR结果没有显示白内障和对照组之间基因表达的显着差异。结论：在体内数据集中训练的决策树模型可以预测过体内和体内白内障，尽管白内障和对照组之间没有发现显着的基因表达差异。给定少量样本，需要进行较大的研究来验证我们的发现。
骨髓干细胞与细胞来源的外泌体对大鼠油酸诱导的肺损伤的比较
摘要背景：急性肺损伤及其并发症急性呼吸窘迫综合征是严重的临床疾病，但治疗方法有限。其中，干细胞似乎是一种很有前途的替代疗法。在本研究中，我们首次研究并比较了骨髓干细胞 (BMSCs) 及其外泌体对油酸诱导的大鼠肺损伤的影响。方法：我们通过静脉注射油酸 (60 mg/kg) 来诱导急性肺损伤；此后，我们在注射油酸两小时后将大鼠 BMSCs (1 x 10 6 ) 和外泌体 (通过市售试剂盒从 1 x 10 6 BMSCs 中获得) 静脉注射到尾静脉。24 小时后，通过深度麻醉处死大鼠，获取肺组织。使用苏木精-伊红染色的样本检查，评估出血、白细胞浸润、水肿和增生等参数。流式细胞仪验证了从干细胞培养基中获得的外泌体。结果：肺损伤后注射干细胞和外泌体组分可恢复所有参数；然而，骨髓间充质干细胞的再生能力优于其外泌体组分（p = 0.004）。结论：干细胞及其外泌体组分可被视为治疗大鼠油酸诱导性肺损伤的替代疗法，其母体来源比外泌体更有效；干细胞似乎更有效。HIPPOKRATIA 2024, 28 (3):100-108。
左旋多巴诱导的非周期性爆发动力学变化与帕金森病的个体临床改善有关
1. 艾克斯·马赛大学，CNRS，INT，德拉蒂莫内神经科学研究所，13005，马赛，法国。 2. 艾克斯-马赛大学、INSERM、INS、系统神经科学研究所，13005，马赛，法国 3. 中央地中海学院，13013，马赛，法国。 4. APHM，马赛大学医院，蒂莫内医院神经病学和运动障碍科，13005，法国。 5. 斯特拉斯堡大学神经科学认知与适应性实验室，67000 斯特拉斯堡，法国。 6. 罗马生物医学大学校园工程系非线性物理和数学模型组，意大利 00128。 7. 外科癫痫病科、功能性和立体定向神经外科，蒂莫内大学医院，13005，马赛，法国。8. 艾克斯马赛大学，UMR INSERM 1106，功能性神经外科系，13005，马赛，法国。¡ 资深作者 * 通讯作者：hasnae.agouram@univ-amu.fr，pierpaolo.sorrentino@univ-amu.fr
NDV诱导的自噬通过NLRP3/caspase-1炎症增强了炎症，p38/MAPK途径
©作者2023。Open Access本文是根据Creative Commons Attribution 4.0 International许可获得许可的，该许可允许以任何媒介或格式使用，共享，适应，分发和复制，只要您对原始作者和来源提供适当的信誉，请提供与创意共享许可证的链接，并指出是否进行了更改。本文中的图像或其他第三方材料包含在文章的创意共享许可中，除非在信用额度中另有说明。如果本文的创意共享许可中未包含材料，并且您的预期用途不受法定法规的允许或超过允许的用途，则您需要直接从版权所有者那里获得许可。要查看此许可证的副本，请访问http：//创建ivecommons。org/licen ses/by/4。0/。Creative Commons公共领域奉献豁免（http：//创建ivecommons。Org/publi cdoma in/Zero/1。0/1。0/）适用于本文中提供的数据，除非在数据信用额度中另有说明。
表征深神经网络中子诱导的断层模型
摘要 - 在图形处理单元（GPU）上执行的深神经网络（DNN）的可靠性评估是一个具有挑战性的问题，因为硬件体系结构非常复杂，软件框架由许多抽象层组成。虽然软件级故障注入是评估复杂应用程序可靠性的一种常见且快速的方法，但它可能会产生不切实际的结果，因为它对硬件资源的访问有限，并且采用的故障模型可能太幼稚（即单位和双位翻转）。相反，用中子光束注射物理断层提供了现实的错误率，但缺乏故障传播可见性。本文提出了DNN故障模型的表征，该模型在软件级别结合了中子束实验和故障注入。我们将运行一般矩阵乘法（GEMM）和DNN的GPU暴露于梁中子，以测量其错误率。在DNNS上，我们观察到关键错误的百分比可能高达61％，并表明ECC在减少关键错误方面无效。然后，我们使用RTL模拟得出的故障模型进行了互补的软件级故障注入。我们的结果表明，通过注射复杂的断层模型，Yolov3的误导率被验证为非常接近通过光束实验测得的速率，该速率比仅使用单位倒换的断层注射测量的频率高8.66倍。
等肌苷通过抑制PDHB介导的葡萄糖代谢的重编程来减轻肝细胞癌的进展 使用行列式量子... 对电子fock态进行采样 作者校正：探索性研究局部泛焦油抑制剂在眼皮GVHD小鼠模型中的功效 透皮微针辅助超声增强的CRISPRA系统，以实现肥胖症的Sono-Gene疗法 评论 应用药物诱导的生长速率抑制和细胞内药物暴露用于全面评估细胞药物敏感性 作者校正：通过西班牙埃尔米隆洞穴的晚更新世，对人类和食肉动物持久性的沉积古代DNA观点 granzyme k激活整个补体级联 牙科的压力
丙酮酸脱氢酶B（PDHB）是丙酮酸脱氢酶复合物的重要组成部分，与改变肿瘤代谢和促进恶性肿瘤有关。然而，PDHB对肝细胞癌（HCC）代谢重编程的特定影响及其在肿瘤进展中的作用仍有待阐明。在我们的研究中，我们发现了HCC内PDHB表达的明显升高，与延迟的肿瘤分期，肿瘤分级升高和预后结局降低相关。PDHB过表达驱动体外和体内肿瘤的生长和转移。从机械上讲，PDHB通过与SLC2A1，GPI和PKM2的启动子区域结合，介导了代谢重编程，从而促进了糖酵解相关的基因转录，从而有助于HCC索拉非尼替尼耐药。另外，同肌固定会是PDHB的靶向抑制剂，并对HCC发挥抗肿瘤作用。在小鼠异种移植模型中，同肌苷和索拉非尼的组合比单独的索拉非尼表现出明显更好的作用。总而言之，我们的研究证实了PDHB为一种能够预测HCC肿瘤进展的致癌耐药性相关基因。PDHB和等肌苷可能是肝癌靶向和联合疗法的潜在途径。
太阳能电池紫外线诱导的降解或模块变色
1格勒诺布尔阿尔卑斯大学，CEA，LITEN，DTS，LSA，INES，F-38000，法国2UniversitéClermontAuvergne-CNRS，ICCF，F-63000 Clermont-Ferrand，法国，法国，法国，作者：Romain Couderc couderc gerderc lomain coudercǀ emain.main.comain.coudcrc@ic.frc@ic。 +33479792361摘要数十年来，在操作太阳阵列中观察到了由紫外线暴露引起的光伏（PV）模块。不仅仅是一种美学上的不便，这种现象可以严重损害模块的性能，并通过封装的光保护损害其他降解机制。为了更好地理解当前材料中的这种反应，在紫外线照射下，具有紫外线或紫外线商业封装的HJT单子弹模块是在紫外线照射下老化的，并通过视觉检查，荧光成像和闪光测试对其进行检查。仅通过紫外线吸收器稳定的封装物进行了变色。一方面，紫外线吸收器光氧化是导致影响光传输到细胞的黄色发色团的形成。因此，它们导致光生电流的净减少，该电流在加速4200小时后达到4％。另一方面，他们的光漂白解释了模块边缘缺乏变色。根据当前封装配方的行为，必须提高紫外线吸收添加剂的稳定性，以确保设备在30年内的耐用性。限制全球变暖的最有害影响的简介，预计我们的社会的重大变化。太阳能光伏（PV）在过去十年中飙升，到2020年达到821 TWH。在发电方面，1.5°C的情况需要在全球能量混合物中急剧增加可再生能源部分[1]。到2030年需要8倍的容量才能达到零净排放到2050年，这是1.5°C的情况[2]。由于PV系统耐用性对其水平的能源成本（LCOE）[3]和生命周期评估（LCA）[4]的影响很高，因此必须对影响PV模块的不同降解模式进行彻底研究，以确保能量过渡。
二甲基亚氧化二甲基素诱导的多能干细胞，可为更有效的肾单祖细胞和肾脏器官分化
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。根据作者/资助者提供了预印本（未经同行评审的认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2025年2月8日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2025.02.07.637033 doi：biorxiv Preprint