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背景:大鼠模型由于其成本效益以及与人类的显着生理和遗传相似性而广泛用于研究白内障,这项研究的目的是确定由于大鼠的半乳糖暴露而导致白内障的基因。方法:我们分析了来自基因表达综合的四个数据集,包括不同大鼠菌株中白内障的离体和体内模型。特征选择工具用于识别与白内障相关基因表达中潜在相关的基因。实施了决策树算法,并使用摇动和石灰来解释其预测。为了验证基因表达水平,在M199培养基中培养的六个大鼠透镜上进行了PCR,仅在M199中诱导白内障和六个镜片。结果:使用特征选择工具,四个关键基因 - plagl2,cmtm7,pcyt1b和nr1d2。在分析的数据集之间,只有白内障和对照组之间的PCYT1B显着差异。该模型显示出强大的预测性能,尤其是在离体数据集中。摇摆和石灰分析表明,CMTM7对模型预测的影响最大。PCR结果没有显示白内障和对照组之间基因表达的显着差异。结论:在体内数据集中训练的决策树模型可以预测过体内和体内白内障,尽管白内障和对照组之间没有发现显着的基因表达差异。给定少量样本,需要进行较大的研究来验证我们的发现。

大鼠半乳糖诱导的白内障

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