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黑色素瘤异质性的计算模型
皮肤黑色素瘤是一种高度侵袭性的肿瘤，尽管最近出现了一些治疗方法，但大多数晚期转移性黑色素瘤患者的临床预后不佳。黑色素瘤中最常见的突变会影响 BRAF 致癌基因，它是 MAPK 信号通路的蛋白激酶。针对 BRAF 和 MEK 的疗法仅对 50% 的患者有效，并且几乎系统地产生耐药性。与黑色素瘤细胞的强烈异质性和可塑性相关的遗传和非遗传机制被认为有利于耐药性，但人们对其了解甚少。最近，我们引入了一种新的数学形式，可以表示肿瘤异质性和耐药性之间的关系，并提出了几种用 BRAF/MEK 抑制剂治疗的黑色素瘤产生耐药性的模型。在本文中，我们使用一种新的计算模型进一步研究了这种关系，该模型可以处理用 BRAF/MEK 抑制剂治疗的黑色素瘤中单细胞 mRNA 测序数据识别的多种细胞状态。我们使用该模型来预测不同治疗策略的结果。参考疗法称为“连续”疗法，其包括不间断地应用一种或多种药物。在“联合疗法”中，几种药物按顺序使用。在“适应性疗法”中，当肿瘤大小低于下限时中断药物应用，当肿瘤大小超过上限时恢复药物应用。我们表明，与直觉相反，在 BRAF/MEK 抑制剂与假设药物（针对在肿瘤对激酶抑制剂的反应过程中后期发展的细胞状态）的联合疗法中，最佳方案是先用这种假设药物治疗。此外，尽管连续疗法和适应性疗法之间出现耐药性的时间差别不大，但在适应性疗法的情况下，不同黑色素瘤亚群的空间分布更加分区化。
Charlson综合征指数预测胰腺癌患者的存活率接受免疫疗法 生物医学，专利路径和前景分析中的反应式纳米材料 单细胞测序显示细胞异质性和与肝细胞癌微血管浸润相关的异质性途径 公共部门参与可持续粮食系统的非国家治理 - 生物多样性的观点 社论：多发性硬化症中的神经可塑性 克服肺癌和结直肠癌的抗药性 综合注意力卷积网络用于运动图像EEG分类 编辑：chatgpt和其他生成AI工具 世界气候研究计划灯塔活动
胰腺癌（PC）是一种高度恶性的消化系统肿瘤，预后极差，通常在晚期阶段被诊断出来并迅速发展（1，2）。目前，PC的治疗仍然主要依赖化学疗法，中位总生存率少于1年（3 - 5）。尽管对PC的免疫疗法进行了连续探索，但与仅化学疗法相比，它并没有改善总体预后（6）。PC患者通常伴有其他慢性疾病，并且合并症的数量较高，表明治疗效率较低，整体生存期较短。Charlson合并症指数（CCI）是一个广泛使用的指标，可以通过计算慢性病的评分和体重来评估患者的整体健康状况。它已经在各种肿瘤类型中进行了广泛的研究，包括前列腺癌（7、8），结直肠癌（9），胰腺癌（10）等，但没有关于CCI指数在PC免疫疗法中的预测作用的报道。因此，我们对现实世界数据进行了分析，以评估PC患者中CCI评分的预后意见。
使用微血管固定平台的新生血管生成形态发生和异质性中周细胞诱导的动力学的时空分析
摘要：由于它们在控制培养条件下对培养条件的卓越控制并与体内模型相比，由于它们在控制培养条件下的卓越控制并实现了实时观察，因此体外微血管模型的最新出现增强了组织工程中血管生成和血管形成的研究。然而，常规的二维（2D）观察和分析无法捕获三维（3D）形态动力学的异质性。为了克服这个问题，在本文中提出了一种新型的形态登记方法，用于通过将工程微血管的共聚焦显微镜与计算机视觉技术相结合，用于血管生成变形动力学的时空定量。使用微血管和周细胞的共培养系统，时空测量结果揭示了：（i）亲本血管和血管生成芽的不同变形模式以及生长/回归分区； （ii）周期定位和覆盖范围的时空变化； （iii）周细胞微使接触接触对局部缺口信号激活的增强作用，基质金属蛋白酶-1（MMP-1）的分布，血管生成动力学的异质性和形态成熟。该试验系统在血管生成过程中提供了共培养细胞的综合作用的特征，并在未来的有关血管形态发生的研究中实现了多模式数据的互动融合。
发育皮层中的祖细胞异质性
表 1. 一抗和二抗。抗体 宿主 用途 参考 公司 APC Ms 1:300 OP80 Calbiochem BLBP Rb 1:500 32423 Abcam DCX Rb 1:500 4604 细胞信号传导 GFAP Rb 1:1000 31745 Dako KI67 Rb 1:300 AB16667 Abcam MASH1/ ASCL-1 Rb 1:250 Ab74065 Abcam NEUN Ms 1:500 MAB377 Millipore NESTIN Ms 1:100 +citrato 4760 细胞信号传导 NG2 Rb 1:100 AB5320 Millipore OLIG 2 Rb 1:500 AB9610 Millipore PDGFR Α Rb 1:300 +MetOH 31745 细胞信号传导 S100 Β Rb 1:500 AB41548 Abcam SOX 2 Rb 1:200 2748 细胞信号传导 SOX 10 Rb 1:200 69661 细胞信号传导 TUJ 1 Ms 1:300 MAB1637 Millipore VIMENTIN Ms 1:200 V6389 Sigma-Aldrich Alexa Fluor 633 Gt α Rb Gt 1:1000 A-21070 Thermo Fisher Alexa Fluor 647 Gt α Ms Gt 1:1000 A-21236 Thermo Fisher Alexa Fluor 647 Gt α Rat Gt 1:1000 A-21247 Thermo Fisher Alexa Fluor 568 Gt α Rb Gt 1:1000 A-11011 Thermo Fisher Alexa Fluor 568 Gt α Ms Gt 1:1000 A-11004 Thermo Fisher Ms：小鼠，Rb：兔，Rt：大鼠，Gt：山羊。
间质性肺部疾病（Eurildreg asa-ild）的评估
1欧洲IPF/ILD注册表和生物库（Euripfreg/Bank，EurildReg/Bank），Giessen，德国，2，吉森大学和Marburg肺中心（UGMLC）的大学间肺和罕见肺部疾病中心，Justus-Liebig-university Giessen Instuttr，fermiam for l dermiary Centry fress for Dermand Mren，DZL，DZL） （CPI）Klinikstr，Giessen，德国，4个卓越肺部肺部疾病和结节病卓越中心，呼吸医学系，伊拉斯穆斯大学医学中心，鹿特丹，荷兰，荷兰5号ILD单位，呼吸部，呼吸部，贝尔维特（Idibell）的生物医学研究所（IDIBELL），医院6.爱尔兰都柏林枢纽，炎症研究中心，爱丁堡大学，爱丁堡大学，英国爱丁堡大学，8区，稀有肺部疾病区域转诊中心，波利克利科大学，临床和实验医学系，卡塔尼亚临床和实验医学系，意大利卡塔尼亚大学，意大利，意大利9号，国家de la saintute et la saintute et la rechemie de perical e parise e parise，hop parise，hop parise，hop parise，希望法国，10个Agaplesion肺诊所，“福音派克兰肯豪斯·米特赫森”，德国吉森
青少年功能连接发展的空间异质性和亚型
1 宾夕法尼亚大学生物医学图像计算与分析中心，美国宾夕法尼亚州费城 19104 2 宾夕法尼亚大学放射学系，美国宾夕法尼亚州费城 19104 3 中国脑研究中心，北京 102206 4 宾夕法尼亚大学精神病学系，美国宾夕法尼亚州费城 19104 5 宾夕法尼亚大学 Penn/CHOP 寿命脑研究所，美国宾夕法尼亚州费城 19104 6 宾夕法尼亚大学神经病学系，美国宾夕法尼亚州费城 19104 7 宾夕法尼亚大学宾夕法尼亚成像与可视化统计中心，美国宾夕法尼亚州费城 19104 8 宾夕法尼亚大学生物统计学、流行病学和信息学系，美国宾夕法尼亚州费城 19104 9 宾夕法尼亚大学脑成像与刺激中心，美国宾夕法尼亚州费城 19104 10 宾夕法尼亚大学脑科学、转化、创新与调节中心宾夕法尼亚大学，美国宾夕法尼亚州费城 19104，美国 11 宾夕法尼亚大学抑郁和压力神经调节中心，美国宾夕法尼亚州费城 19104，美国 12 宾夕法尼亚大学神经科学、神经外科和生物工程系，美国宾夕法尼亚州费城 19104，美国 13 宾夕法尼亚大学宾夕法尼亚寿命信息学和神经影像中心，美国宾夕法尼亚州费城 19104，美国 *通讯作者：Yong.Fan@pennmedicine.upenn.edu
单细胞测序显示细胞异质性和与肝细胞癌微血管浸润相关的异质性途径
在农业食品系统中广泛使用自然资源会对生物多样性产生广泛影响。为解决这些效果的策略在很大程度上未能大大降低生物多样性损失的速度。当前的生物多样性和可持续食品系统策略越来越多地推进两种非政府治理，多利益相关者倡议（MSI）和自愿可持续性标准（VSS）的方式，以及其关键政策工具。在本文中，我们分析了与增强生物多样性有关的公私对抗和MSI治理，并讨论了它们是否以及是否构成了2020年后策略中建议的大规模使用MSIS和VSSS的基础。我们的分析强调了政府对增强生物多样性的承诺的重要性，这是有效和强大治理的先决条件。我们还强调需要创新的监管以同时监督和推进各种VSS和MSI。我们的发现表明，到2020年，政府参与粮食治理的主要动机是食品安全法规或经济发展的进步，而不是增强生物多样性。因此，在全球范围内，公众参与VSS和MSI并不一定提供严格的生物多样性保护。在2020年，欧盟建立了一项针对生物多样性的综合战略，并将其三个十年的参与与有机农业融为一体，作为政策工具。该政策已扩散到当地的欧洲食品政策委员会。然而，资本密集型的提升在单个VSS中，使其他面向生物多样性的倡议没有实质性的政府支持。
06 原子层沉积氮化铌薄膜性能异质性研究
研究了在100 mm硅基底上采用等离子体增强原子层沉积技术制备氮化铌薄膜，并研究了薄膜性质的异质性。直径为92mm时表面电阻分布的不均匀性为7%。使用X射线反射法测量板的中心部分和距离中心40毫米的四个位置的膜厚度分布的不均匀性为4％。在基板上的相同位置进行的 X 射线衍射没有显示反射有任何可见的变化。不同区域的晶格参数差异仅为0.06%。超导测量表明，在直径为80毫米时，超导转变温度的最大偏差为1.6%，临界电流密度的最大偏差为7%。
绝对音调脑电图静息态脑网络的异质性
绝对音高 (AP) 是指无需外界参考即可轻松识别乐音的能力，其神经基础尚不清楚。关键问题之一是这一现象背后是感知过程还是认知过程，因为感觉和高级大脑区域都与 AP 有关。为了整合对 AP 的感知和认知观点，我们在此研究了感觉和高级大脑区域对 AP 静息态网络的共同贡献。我们对大量 AP 音乐家 (n = 54) 和非 AP 音乐家 (n = 51) 的源级 EEG 进行了全面的功能网络分析，采用两种分析方法：首先，我们应用基于 ROI 的分析来检查听觉皮层和背外侧前额叶皮层 (DLPFC) 之间的连接，使用几种已建立的功能连接测量方法。这项分析重复了之前的一项研究，该研究报告了 AP 音乐家这两个区域之间的连接增强。其次，我们对相同的功能连接测量进行了基于全脑网络的分析，以更全面地了解可能涉及支持 AP 能力的大规模网络的大脑区域。在我们的样本中，基于 ROI 的分析没有提供听觉皮层和 DLPFC 之间 AP 特定连接增加的证据。全脑分析显示，AP 音乐家的三个网络连接增加，包括额叶、颞叶、皮层下和枕叶区域的节点。在感觉和大脑周边区域的高级区域都发现了网络的共同点。需要进一步研究来证实这些探索性结果。
三阴性乳腺癌异质性建模揭示了一种可克服原发性耐药性的新型组合疗法
三阴性乳腺癌 (TNBC) 是一种高度侵袭性的乳腺癌亚型，其特征是显著的分子异质性。目前，尚无有效的药物靶点和先进的人类疾病临床前模型。在这里，我们生成了一种独特的乳腺肿瘤小鼠模型（MMTV-R26 Met 小鼠），该模型由野生型 MET 受体表达的细微增加驱动。MMTV-R26 Met 小鼠会自发形成排他性 TNBC 肿瘤，重现患者对治疗的原发性耐药性。MMTV-R26 Met 肿瘤的蛋白质组学分析和机器学习方法表明，该模型忠实地重现了人类 TNBC 的肿瘤间异质性。进一步的信号网络分析突出了潜在的药物靶点，其中 WEE1 和 BCL-XL 的共同靶向协同杀死 TNBC 细胞并有效诱导肿瘤消退。从机制上看，BCL-XL 抑制加剧了 TNBC 细胞对 WEE1 功能的依赖，导致组蛋白 H3 和磷酸化 S 33 RPA32 上调、RRM2 下调、细胞周期扰动、有丝分裂灾难和细胞凋亡。本研究介绍了一种独特、强大的小鼠模型，用于研究 TNBC 的形成和进化、其异质性以及确定有效的治疗靶点。