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早期结直肠癌的分子异质性
早期发作结直肠癌的分子异质性：高危人群中的途径特异性见解Cecilia Monge，M.D.，M.P.H.，F.A.C.P.1，Brigette Waldrup，B.S。 2，Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔（Enrique Velazquez-Villarreal），医学博士，博士，M.P.H。 2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市，贝克曼研究所，综合翻译科学系，杜阿尔特，加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心，加利福尼亚州杜阿尔特。 *通信：evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标：早期发作结直肠癌（EOCRC）的发生率（EOCRC）定义为50岁以前的诊断，以惊人的速度上升，西班牙裔/拉丁裔（H/L）个人在发病率和死亡率中的发病率最高。 尽管人们对公共卫生的关注越来越大，但驱动EOCRC差异的分子机制仍然知之甚少。 致癌途径，例如Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS在结直肠癌（CRC）进展中至关重要，但是尚未对不同种群的EOCRC中的特定作用进行广泛的研究。 本研究试图通过比较H/L和非西班牙裔白人（NHW）个体中的EOCRC病例来鉴定这些途径中的分子改变。 此外，我们探讨了这些发现的临床意义，以为针对高风险人群而定的精确医学策略提供依据。 方法：为了研究与Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS途径相关的基因中的突变频率，我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析。1，Brigette Waldrup，B.S。2，Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔（Enrique Velazquez-Villarreal），医学博士，博士，M.P.H。 2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市，贝克曼研究所，综合翻译科学系，杜阿尔特，加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心，加利福尼亚州杜阿尔特。 *通信：evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标：早期发作结直肠癌（EOCRC）的发生率（EOCRC）定义为50岁以前的诊断，以惊人的速度上升，西班牙裔/拉丁裔（H/L）个人在发病率和死亡率中的发病率最高。 尽管人们对公共卫生的关注越来越大，但驱动EOCRC差异的分子机制仍然知之甚少。 致癌途径，例如Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS在结直肠癌（CRC）进展中至关重要，但是尚未对不同种群的EOCRC中的特定作用进行广泛的研究。 本研究试图通过比较H/L和非西班牙裔白人（NHW）个体中的EOCRC病例来鉴定这些途径中的分子改变。 此外，我们探讨了这些发现的临床意义，以为针对高风险人群而定的精确医学策略提供依据。 方法：为了研究与Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS途径相关的基因中的突变频率，我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析。2，Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔（Enrique Velazquez-Villarreal），医学博士，博士，M.P.H。2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市，贝克曼研究所，综合翻译科学系，杜阿尔特，加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心，加利福尼亚州杜阿尔特。 *通信：evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标：早期发作结直肠癌（EOCRC）的发生率（EOCRC）定义为50岁以前的诊断，以惊人的速度上升，西班牙裔/拉丁裔（H/L）个人在发病率和死亡率中的发病率最高。 尽管人们对公共卫生的关注越来越大，但驱动EOCRC差异的分子机制仍然知之甚少。 致癌途径，例如Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS在结直肠癌（CRC）进展中至关重要，但是尚未对不同种群的EOCRC中的特定作用进行广泛的研究。 本研究试图通过比较H/L和非西班牙裔白人（NHW）个体中的EOCRC病例来鉴定这些途径中的分子改变。 此外，我们探讨了这些发现的临床意义，以为针对高风险人群而定的精确医学策略提供依据。 方法：为了研究与Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS途径相关的基因中的突变频率，我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析。2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。2希望城市，贝克曼研究所，综合翻译科学系，杜阿尔特，加利福尼亚州。3希望之城综合癌症中心，加利福尼亚州杜阿尔特。*通信：evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标：早期发作结直肠癌（EOCRC）的发生率（EOCRC）定义为50岁以前的诊断，以惊人的速度上升，西班牙裔/拉丁裔（H/L）个人在发病率和死亡率中的发病率最高。尽管人们对公共卫生的关注越来越大，但驱动EOCRC差异的分子机制仍然知之甚少。致癌途径，例如Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS在结直肠癌（CRC）进展中至关重要，但是尚未对不同种群的EOCRC中的特定作用进行广泛的研究。本研究试图通过比较H/L和非西班牙裔白人（NHW）个体中的EOCRC病例来鉴定这些途径中的分子改变。此外，我们探讨了这些发现的临床意义，以为针对高风险人群而定的精确医学策略提供依据。方法：为了研究与Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS途径相关的基因中的突变频率，我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析。研究队列由3,412例患者组成，包括302 H/L和3,110名NHW个体。患者根据年龄（EOCRC：<50岁；晚期CRC [LOCRC]：≥50岁）和人口组（H/L vs. NHW）进行分类，以评估突变患病率的变化。使用卡方检验进行了组之间突变率的统计比较，而Kaplan-Meier生存分析被用来评估与途径改变相关的总体生存差异。结果：与LOCRC相比，H/L患者之间在EOCRC和LOCRC之间鉴定了RTK/RAS途径的显着分子区别，EOCRC的RTK/RAS改变频率较低（66.7％vs. 79.3％，P = 0.01）。在此途径中，CBL（P <0.05）和NF1（P <0.05）的突变在EOCRC病例中的普遍性明显高于EOCRC病例（分别为5.8％，1.2％和11.6％和11.6％和3.7％），而BRAF突变在LOCRC中的频繁（5.1％VS.
使用牛津纳米孔测序的放大DNA异质性评估应用于细胞无细胞表达模板
摘要在这项工作中，将牛津纳米孔测序作为量化放大DNA异质性的可访问方法。此方法可以快速量化缺失，插入和取代，每个突变误差的概率及其在复制序列中的位置。放大技术测试的是传统的聚合酶链反应（PCR），具有不同水平的聚合酶保真度（OnETAQ，phusion和Q5），以及滚动圆扩增（RCA）和PHI29聚合酶。还评估了使用细菌扩增的质粒扩增。通过分析每个样本中大量序列中误差的分布，我们检查了每个样本中的异质性和误差模式。该分析表明，Q5和渗流聚合酶表现出在扩增的DNA中观察到的最低错误率。作为二级验证，我们分析了使用细胞游离表达与放大DNA合成的SFGFP荧光蛋白的发射光谱。易易受错误的聚合酶链反应证实了报道蛋白发射光谱峰宽度与DNA误差率的依赖性。所提出的纳米孔测序方法是量化其他基因扩增技术准确性的路线图，从而使它们被发现，从而实现了所需蛋白质的更无均匀的细胞表达。
1对人类的心脏成纤维细胞异质性建模...
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。该预印本版的版权持有人于2023年10月22日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.10.22.563460 doi：Biorxiv Preprint
疫苗状况同质性在COVID-19大流行中的作用：与建模的横断面调查
结果：在1304名受访者中观察到疫苗同质性，但剂量较少的受访者较低（p <0.0001）。未接种的个体具有较大的接触网络（p <0.0001），更有可能报告先前的Covid-19（p <0.0001），并报告了较低的对Covid-19预防准则的依从性（p <0.0001）。数学建模表明，在高疫苗功效和低疫苗疗效条件下，疫苗同质性在流行病中起着相当大的作用。此外，在高疫苗功效的条件下，疫苗同质性有助于未接种疫苗的个体的高性感染，并且在低疫苗功效的条件下，从未接种到接种疫苗的个体的感染力升高。
多层内异质性在慢性脊髓细胞性白血病中
组成髓样恶性肿瘤的细胞的功能多样性，即遗传和表观遗传异质性在这种多样性中的各自作用，仍然知之甚少。 这个问题在慢性脊髓细胞性白血病（一种髓样肿瘤中）解决，其中临床多样性与遗传异质性有限。 To generate induced pluripotent stem cell clones, we reprogrammed CD34 + cells collected from a patient with a chronic myelomonocytic leukemia in which whole exome sequencing of peripheral blood monocyte DNA had identified 12 gene mutations, including a mutation in KDM6A and two heterozygous muta- tions in TET2 in the founding clone and a secondary KRAS （g12d）变形。 还对来自年龄匹配的健康供体的CD34 +细胞进行了再生。 我们捕获了患者观察到的一部分遗传异质性，即 我们分析了五个具有两个遗传背景的克隆，没有KRAS（G12D）突变。 这些克隆的造血分化概括了患者疾病的主要特征，包括颗粒细胞和染色体症的过量生产。 这些分析还揭示了源自具有相似遗传背景的诱导多能干细胞克隆的造血细胞行为的显着差异，与有限的表观遗传变化相关。 这些分析表明，除了编码突变外，几个水平的隆内异质性可能参与疾病的尚未解释的临床异质性。组成髓样恶性肿瘤的细胞的功能多样性，即遗传和表观遗传异质性在这种多样性中的各自作用，仍然知之甚少。这个问题在慢性脊髓细胞性白血病（一种髓样肿瘤中）解决，其中临床多样性与遗传异质性有限。To generate induced pluripotent stem cell clones, we reprogrammed CD34 + cells collected from a patient with a chronic myelomonocytic leukemia in which whole exome sequencing of peripheral blood monocyte DNA had identified 12 gene mutations, including a mutation in KDM6A and two heterozygous muta- tions in TET2 in the founding clone and a secondary KRAS （g12d）变形。还对来自年龄匹配的健康供体的CD34 +细胞进行了再生。我们捕获了患者观察到的一部分遗传异质性，即我们分析了五个具有两个遗传背景的克隆，没有KRAS（G12D）突变。这些克隆的造血分化概括了患者疾病的主要特征，包括颗粒细胞和染色体症的过量生产。这些分析还揭示了源自具有相似遗传背景的诱导多能干细胞克隆的造血细胞行为的显着差异，与有限的表观遗传变化相关。这些分析表明，除了编码突变外，几个水平的隆内异质性可能参与疾病的尚未解释的临床异质性。
探索获得性脑损伤后认知触发性异质性：提示理解的聚类分析
Natacha Cordonier，Marion Fossard，YvesTillé，Maud Champagne-Lavau。探索获得性脑损伤后认知务实的异质性：提示理解的聚类分析。《美国语言病理学杂志》，2023，32（6），第2752-2767页。10.1044/2023_AJSLP- 22-00389。hal-04330850
使用带有可变形天花板的微设备来探测3D细胞骨料内的刚度异质性
摘要机械生物学领域的最新进展已导致开发了表征单细胞或单层机械性能并将其链接到其功能行为的方法。但是，仍然需要建立三维（3D）多细胞聚集体的联系，从而更好地模拟组织功能。在这里，我们提出了一个平台，以在一个可变形的微设备中启动并观察许多此类骨料。该平台由在3D打印的模具上铸造的单个聚二甲基硅氧烷片组成，并粘合到载玻片或盖玻片上。它由一个包含细胞球体的腔室组成，该腔室与流体独立的空气腔相邻。控制这些空气腔中的气压会导致房间天花板的垂直位移。该设备可以在秒钟到小时的时间尺度上以静态或动态模式使用，并且位移幅度从几µm到几十万微米。此外，我们通过比较不同级别的压缩级别的球体的图像相关性与有限元仿真来展示如何使用压缩方案来获得单个共培养球体内刚度异质性的测量。将细胞的标记及其细胞骨架与图像相关方法结合使用，以将共培养球体的结构与其在不同位置的机械性能相关联。该设备与各种显微镜技术兼容，包括共聚焦显微镜，可用于观察聚集体内单细胞和邻域的位移和重排。现在可以使用完整的实验和成像平台来提供多尺度的测量，这些测量将单细胞行为与聚集体的全局机械响应联系起来。
依维莫司靶向纳米疗法可减轻 PSGL-1 缺陷小鼠所致硬皮病相关间质性肺病的炎症和纤维化
Elena González-Sánchez、Antonio Muñoz-Callejas、Javier Gómez-Román、Esther San Antonio、Alessandro Marengo 等人。依维莫司靶向纳米疗法可减轻 PSGL-1 缺陷小鼠所致硬皮病相关间质性肺病的炎症和纤维化。《英国药理学杂志》，2022 年，179 (18)，第 4534-4548 页。�10.1111/bph.15898�。�hal-03786904�
主场分配计划实质性修正
非营利性营业$ 68,629.15 5％5％非营利能力建设$ 68,629.15 5％5％5％的管理和计划$ 137,583.00 10％15％15％的总房屋分配$ 1,372,583.00修改后，以下叙述详细介绍了资金来参与已确定的家庭ARP项目的资金。它还证明了最初于2023年3月28日提交的需求分析，数据研究，专业咨询和公众参与之间的持续保持一致，并获得了HUD野外办公室的批准。该修正案增加了用于支持服务和经济适用房的资金，通过TBRA纳入了用于租金援助的资金，并取消了第6-7页中指出的非营利性运营和非统治庇护所的资金。它没有对管理的重大更改，也没有对非营利能力建设的更改。