XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System质谱
正离子模式天然电喷雾电离质谱法中 DNA 复合物的带电
摘要：天然质谱 (nMS) 通过“软”电喷雾电离 (ESI) 保留非共价相互作用，从而深入了解生物大分子在其天然状态下的结构和动力学。对于天然蛋白质，获得的电荷数量与表面积和质量成比例。在这里，我们探索了高度带负电荷的 DNA 对蛋白质复合物 ESI 电荷的影响，发现质荷比降低以及变化较大。纯 DNA 组装体的电荷状态分布比蛋白质低，因为它们在气相中的密度较大，而蛋白质-DNA 复合物的电荷还可能受到 ESI 电荷分布、离子配对事件和 DNA 成分崩塌的影响。我们的研究结果表明，蛋白质-DNA 复合物的结构特征可能导致蛋白质的电荷状态低于预期。关键词：蛋白质-DNA 复合物、电荷状态分布、电喷雾电离 ■ 简介
质谱共享资源（MS）
• LC-MS 和 GC-MS 用于极性和非极性小分子分析（低分辨率） • LC-MS/MS 用于肽/蛋白质表征；测序；PTM；（高分辨率 ± 3ppm） • LC-MS/MS 用于非靶向代谢组学/脂质组学 • LC-MS/MS 用于定量靶向代谢组学（例如定制分析、PK/PD 研究） • MALDI 用于蛋白质组学和聚合物 • MALDI IMS 用于空间代谢组学/脂质组学
通过清除和诱捕气相色谱法 - 质谱（PT-GC-MS）对饮用水中发霉的气味化合物的高敏感分析
地球素和2-甲基异位酚是地表水中藻类和细菌产生的化合物，已知会在饮用水中引起味道和气味问题。在日本，饮用水质量的监管标准将这些化合物的可接受浓度设置为10 ng/l。因此，用于检测这些物质的分析工具需要高灵敏度和准确性。GC-MS通常用作分析方法，样品制备技术包括固相提取（SPE），固相微拔液（SPME）和顶空（HS）。但是，这些方法需要在制备过程中测量样品水量，而SPME和HS方法都需要进行盐分外的操作以增强灵敏度，从而使过程变得麻烦。因此，作者使用P＆T-GC-MS（最简单的VOC分析方法）优化了该方法，并报告获得令人满意的结果。
通过超高性能液相色谱与串联质谱法
抽象的姜黄素化合物是生姜中重要的生物活性化合物，但它们的分析受到低浓度的限制。在当前的研究中，使用超高绩效液相色谱和串联质谱法（UHPLC-MS/MS）建立了一种高度敏感和可靠的方法，用于同时定量检测三种姜黄素化合物。通过单个因子实验优化了提取溶剂，提取溶剂的量，超声处理时间和振荡时间。方法验证结果表明，回归系数高于0.9990，线性度令人满意。矩阵效应可忽略不计，值为94.6％–98.8％。三个峰值水平的回收率在81.7％至100.0％之间，精度小于5.4％。该方法可用于确定姜样品中的姜黄素成分，因为结果表明它易于使用，可行，可重复和准确。
高通量 PROTAC 化合物筛选工作流程，用于在 Orbitrap Astral 质谱仪上进行靶向蛋白质降解，并进行准确的无标记定量
靶向蛋白质降解 (TPD) 是药物发现中一种新兴的变革性策略，它利用细胞蛋白质降解过程来选择性消除有害蛋白质。通过实现与泛素化蛋白酶体系统的诱导接近，小分子促进致病蛋白质的降解，为以前所未有的精度和功效针对多种疾病靶向以前无法用药的蛋白质打开了大门 (图 1)。直接设计能够选择性促进诱导接近的化合物在实践中具有挑战性，因此具有可靠定量准确性的化合物筛选是 TPD 领域药物发现的关键阶段。需要对大量化合物进行准确定量筛选，这使得基于高通量质谱的工作流程成为确保准确鉴定先导化合物的不二选择。
肌电脑炎患者和健康志愿者的色氨酸代谢物的非靶向代谢组学和定量分析：使用高分辨率质谱法
摘要：肌腱脑脊髓炎/慢性疲劳综合征（ME/CFS）是一种慢性，复杂的疾病，其特征是严重且经常使身体和精神疲劳失败。到目前为止，科学家还没有完全指出疾病的生物学原因，但它影响了全球数百万的人。为了更好地了解ME/CFS，我们将38个ME/CFS患者血浆中的代谢网络与24名健康对照参与者进行了比较。除了测量包括色氨酸及其代谢产物在内的靶向物质以及酪氨酸，苯丙氨酸，B族维生素和harbosoxanthine的测量外，这涉及一种未靶向的代谢组学方法。我们观察到几种代谢途径的显着改变，包括维生素B3，精氨酸 - 丙啉和天冬氨酸 - 天冬酰胺途径，在未靶向的分析中。与对照组相比，有针对性的分析表明，ME/CFS患者中3-羟基氰酸，3-羟基基硝酸，低黄嘌呤和苯丙氨酸的水平变化。这些发现表明ME/CFS患者的免疫系统反应和氧化应激的潜在改变。关键词：高分辨率质谱，肌电脑脊髓炎（ME/CFS），神经退行性疾病，代谢组学，靶向分析，未靶向分析，生物标志物
基于质谱的直接测序从头开始和多个RNA修饰的定量映射
摘要：尽管RNA的下一代测序（NGS）广泛使用，但多个RNA核苷酸修饰的同时直接测序和定量映射仍然具有挑战性。质谱（MS）的测序可以直接序列所有RNA修饰，而无需限于特定的测序，但是它需要很少有TRNA可以提供的完美MS梯子。在这里，我们描述了一种MS梯子互补测序方法（MLC-SEQ），该方法避免了完美的阶梯要求，从而可以在单核苷酸精度下对全长异质细胞TRNA进行全长异质细胞TRNA的测序。与基于NGS的方法（失去RNA修改信息）不同，MLC-Seq保留了RNA序列多样性和修改信息，揭示了新的详细的化学计量tRNA修饰谱及其在使用DealKylating酶ALKB治疗时进行的更改。也可以将其与参考序列结合使用，以提供对总TRNA样品中不同TRNA和修改的定量分析。MLC-Seq可以实现RNA修改的系统，定量和特定于位点的映射，从而揭示了TRNA的真正完整信息内容。■简介