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酿酒酵母的口服疫苗表达ORF132可诱导针对Cyprinid Herpesvirus-2
摘要：Cyprinid疱疹病毒2（CYHV-2）是疱疹病毒造血坏死（HVHN）疾病的病因，在克鲁克斯鲤鱼培养工业中造成严重的经济损失。在这项研究中，通过在酿酒酵母细胞的表面显示ORF132（称为EBY100/PYD1-ORF132），我们评估了针对CYHV-2感染的口服给药的保护性效率。用EBY100/PYD1-ORF132口服疫苗接种后，在粘膜和全身组织中引起了强烈的先天和适应性免疫反应。重要的是，口服疫苗接种为CRUCIAS CARP CYHV-2感染提供了显着的保护，导致相对生存率（RPS）为64％。此外，口服抑制了选定组织中的病毒负荷并减轻了组织学损害。我们的结果表明，在酿酒酵母上的表面播种的ORF132可以用作针对CYHV-2感染的潜在口服疫苗。
大型酿酒厂中葡萄酒的内部微生物测试
然而，酵母在发酵发作时，尤其是“野生酵母”时的其他微生物远远超过了发酵活性弱的“野生酵母”。然而，在发酵发作后，这些酵母迅速以糖果酵母为主导，前提是必须将纯酵母培养物接种，这是标准的实践。发酵引起的酒精会抑制霉菌的生长。因此，它们没有作为葡萄酒型微生物发挥重要作用。甚至大多数细菌都无法在老年葡萄酒中生长。这留下了少量的酸性细菌，来自乳酸酸细菌，这些细菌仍然足以生长。然而，与pH和未结合的h₂sO₃相比，酒精对抑制细菌生长的中等意义。
利用 CRISPR-Cas9 方法构建工程酿酒酵母，删除 GPD2、FPS1 和 ADH2，以提高乙醇产量
摘要：生物乙醇作为可再生液体燃料具有重要价值，工业生产乙醇过程中甘油和有机酸的过量积累导致乙醇含量降低。本研究利用CRISPR-Cas9方法构建了GPD2、FPS1和ADH2基因缺失的酿酒酵母工程菌株，以提高乙醇产量。通过RNA测序和转录组分析研究基因缺失对基因表达的影响。结果表明，以50g/L葡萄糖为底物，通过同时缺失GPD2、FPS1和ADH2基因构建的酿酒酵母工程菌株SCGFA乙醇产量为23.1g/L，比野生型菌株提高了0.18%，每g葡萄糖的乙醇转化率为0.462g。此外，SCGFA中甘油、乳酸、乙酸、琥珀酸含量与野生型菌株相比分别降低了22.7%、12.7%、8.1%、19.9%、20.7%。京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析显示，上调基因富集表明糖酵解、脂肪酸和碳代谢均能影响SCGFA的乙醇生产。因此，该工程菌株SCGFA在生物乙醇生产中具有巨大的潜力。
IE 型 CRISPR-Cas 系统作为酿酒酵母的防御系统
病毒和其他移动遗传元件 (MGE) 对大多数已研究的细胞生物体而言都是潜在威胁，它们充当捕食者或降低适应性。作为应对，生物体进化出了多种防御策略，主要分为先天系统和适应性系统。先天系统的特点是被某些预设的感染特征激活。另一方面，适应性系统可以学会检测以前未被识别的病原体。长期以来，脊椎动物的适应性免疫系统是唯一已知的适应性系统的例子，但已证明古菌和细菌的成簇规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)-Cas 系统是真正的适应性免疫系统 (1)。所有已研究的 CRISPR-Cas 系统都基于短 DNA 或 RNA 序列（原间隔区），例如来自病毒基因组的序列，这些序列作为 DNA 间隔区存储在 CRISPR 基因座中。长前体 CRISPR 转录本 (pre-crRNA) 被加工成 CRISPR RNA (crRNA)，并被 Cas 蛋白效应子用来定位和摧毁匹配的靶标。根据 CRISPR-Cas 系统的类型，靶标可以是 DNA 或 RNA。CRISPR-Cas 系统种类繁多，目前分为两类。第 1 类包括 I、III 和 IV 型系统，第 2 类包括 II、V 和 VI 型系统。每种系统类型又包括几种亚型 (2, 3)。可编程核酸酶，如锌指核酸酶 (ZFN)、转录激活因子样效应核酸酶 (TALEN) 和 Cas9，可通过诱导致残突变在真核细胞中充当抗 MGE 系统。特别是，Cas9 彻底改变了真核生物的基因编辑，已被证明可以有效靶向多种人类病毒 (4)。在基本的 Cas9 技术中，DNA 切割由单一引导
酿酒酵母中编码的絮凝蛋白
摘要 真菌粘附素 (Als) 或絮凝素是一类细胞表面蛋白，可介导对各种生物和非生物表面的粘附。最初在致病性白色念珠菌中发现的 Als 蛋白的一个显著特征是形成功能性淀粉样蛋白，介导顺式相互作用，从而形成粘附素纳米结构域，以及对立细胞的淀粉样蛋白序列之间的反式相互作用。在本报告中，我们表明，酿酒酵母中 FLO11 编码的絮凝素的行为类似于白色念珠菌中的粘附素。为此，我们表明，在外部物理力作用下形成纳米结构域需要 Flo11 蛋白中一定数量的淀粉样蛋白形成序列。然后，我们利用基因组编辑方法，构建了在内源性 FLO11 启动子下表达 Flo11 蛋白变体的菌株，结果证明，淀粉样蛋白形成序列的缺失会大大降低细胞间相互作用，但对塑料粘附或琼脂中的侵袭性生长没有影响，这两种表型都依赖于 Flo11p 的 N 端和 C 端。最后，我们表明 Flo11 的位置不会因淀粉样蛋白形成序列的缺失或蛋白质 N 端或 C 端的去除而改变。
太空中的微型生物反应器：采用非侵入式监测方法的酵母（酿酒酵母）生物反应器案例研究
太空中的生物反应器可应用于从基础科学到微生物工厂的各个领域。在微重力环境下监测生物反应器在流体、通气、传感器尺寸、样品量以及培养基和培养物的扰动方面都存在挑战。我们介绍了一个小型生物反应器开发案例研究，以及一种监测酵母培养物溶解氧、pH 值和生物量的无创方法。针对系统容量 60 毫升和 10.5 毫升，测试了两种不同的生物反应器配置。对于这两种配置，光学传感器阵列 PreSens SFR vario 都会自动收集数据。使用直径为 7 毫米、固定在采样室底部的化学掺杂点监测培养物中的氧气和 pH 值。当点分别与氧分子和氢离子反应时，会发出 DO 和 pH 的荧光信号。使用以 605 nm 为中心的光反射率来感测生物量。光学阵列有三个光检测器，每个变量一个，它们返回的信号经过预校准和后校准。对于需要氧气和呼吸二氧化碳的异养培养，与光学阵列同轴的中空纤维过滤器可给细胞供氧并去除二氧化碳。这提供了足以维持稳定状态条件下有氧呼吸的氧气水平。比较并讨论了两个生物反应器中酵母代谢的时间序列。生物反应器配置可以很容易地修改为自养培养，从而增强二氧化碳并去除氧气，这是光合藻类培养所必需的。
蛋白磷酸酶 1 与 Bud14 结合抑制酿酒酵母的有丝分裂退出
摘要 芽殖酵母的有丝分裂退出取决于有丝分裂纺锤体沿细胞极性轴的正确定位。当纺锤体无法准确定位时，一种名为纺锤体位置检查点 (SPOC) 的监视机制会阻止细胞退出有丝分裂。具有缺陷 SPOC 的突变体会变成多核并失去其基因组完整性。然而，对 SPOC 机制的全面了解尚不足。在本研究中，我们确定了 1 型蛋白磷酸酶 Glc7 与其调节蛋白 Bud14 相关联，这是一种新的检查点成分。我们进一步表明，Glc7-Bud14 促进了 SPOC 效应蛋白 Bfa1 的去磷酸化。我们的结果表明，两种机制并行作用以产生强大的检查点反应：首先，SPOC 激酶 Kin4 将 Bfa1 与抑制激酶 Cdc5 隔离开来，其次，Glc7-Bud14 使 Bfa1 去磷酸化以完全激活检查点效应物。
简单使用的CRISPR-SPCAS9/SACAS9/ASCAS12A矢量系列用于基因组编辑酿酒酵母
。cc-by-nc 4.0国际许可证未获得同行评审的认证）是作者/筹款人，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。它是此预印本的版权持有人（该版本发布于2021年5月8日。; https：//doi.org/10.1101/2021.05.07.4443192 doi：biorxiv preprint
酿酒商的花谷物作为潜在的新功能食品...
第3章。Solid state fermentation of brewers' spent grains for improved nutritional profile using Bacillus subtilis WX-17 ..................................................................................... 56