DNA双链断裂(DSB),以确保基因组稳定性。至关重要的是,必须将DSB末端保持在一起才能及时修复。在酿酒酵母中,两种知之甚少的途径介导了DSB的终端。使用MRE11-RAD50-XRS2(MRX)复合物在物理上桥接DSB末端。另一个要求DSB通过EXO1转换为单链DNA(ssDNA),但桥接蛋白是未知的。我们发现该粘着蛋白,其加载器和SMC5/6用EXO1作用于Tether DSB末端。非常明显的是,寡聚中特异性受损的粘着蛋白未能束缚DSB,从而揭示了粘着蛋白寡聚的新功能。除了姐妹染色单体内聚力的已知重要性外,基于显微镜的微流体实验通过确保DSB终端连接来揭示凝聚蛋白在修复中的新作用。总的来说,我们的发现表明,粘着蛋白的低聚可防止DSB的末端分离并促进DSB修复,从而揭示了粘连在保护基因组完整性中的新型作用和作用。
摘要:放射治疗是当今癌症管理的重要组成部分,利用不同方式的电离辐射(IR)来减轻癌症的进展。ir功能。其中最有害的是DNA双链断裂(DSB)。在进化过程中,较高的真核生物的细胞已经发展出四个主要的DSB修复途径:经典的非同源末端连接(C-NHEJ),同源重组(HR),替代性最终连接(ALT-EJ)(ALT-EJ)和单链退火(SSA)。这些机械上不同的修复途径具有不同的细胞周期和同源性依赖性,但令人惊讶的是,它们具有截然不同的效果和动力学的作用,因此对细胞存活和基因组维持无效。因此,在这些DSB修复途径的参与中预期进行严格的调节和协调是合理的,以实现最大可能的基因组稳定性。在这里,我们提供了有关这些修复途径支撑的分子机制的累积知识的最新综述,重点是C-NHEJ和HR。我们讨论了最近出现的因素和过程。我们概述了整个细胞周期中DSB修复途径选择的机制,并突出了DNA终端切除在此过程中的关键作用。然而,最重要的是,我们指出在低DSB载荷下对HR的强烈偏好,因此对于在细胞周期的G 2期中受辐照的细胞而言,IR剂量较低。我们进一步探讨了从高层到低限制误差的修复途径的过渡的分子基础,并分析了这种过渡对细胞生存能力和基因组稳定性的协调和后果。最后,我们详细阐述了这些进步如何有助于制定放射治疗中的癌症治疗方案。
DNA修复因子通过时空的隔离和DNA双链断裂(DSB)的溶解作用。最近的进步表明,某些DSB修复因子经历了液 - 液相分离(LLP),并显示出类似液滴的特性以及动态材料交换。重要的是,LLP调节了各种生物学过程,异常LLP参与了农业疾病的病理发展。此外,DSB修复过程中DNA修复因子的动态冷凝和溶解的表型呈现了LLP的特性。显着,RNA,聚(ADP-核糖)[PAR]和转录后修饰(PTM),例如磷酸化,泛素化和甲基化,被认为有助于DSB修复因子的LLP。从DSB期间LLP的功能的观点中,DNA修复因子可能会在DSB传感和DNA损伤修复信号转导中作用,参与同源推荐(HR)(HR)和非同源性端始终连接(NHEJ) - 介导的DSB介导的DSB修复,并调节下游径流的途径。基于这些发现,研究人员专注于
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本(未经同行评审认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2023年9月6日发布的此版本中显示此版本的版权所有。 https://doi.org/10.1101/2023.08.29.555258 doi:Biorxiv Preprint
3 https://www.researchgate.net/profile/Carlo-Cafiero/publication/320882959_Food_security_measurement_in_a_global_context_The_Food_Insecurity_Experie nce_Scale/links/5a0572e6aca2726b4c779a9c/Food-security-measurement-in-a-global-context-The-Food-Insecurity-Experience-Scale.pdf 4 https://www.actionagainsthunger.org/the-hunger-crisis/world-hunger-facts/ 5 https://uniteforsight.org/hunger/module1 6 https://www.un.org/esa/socdev/egms/docs/2015/sd-agenda2030/Kakwani-Paper.pdf 7 https://www.worldvision.org/hunger-news-stories/world-hunger-facts 8 https://www.wilsoncenter.org/blog-post/forty-percent-world-food-programs-wheat-supplies-come- ukraine#:~:text=and%20AgricultureUkraine-,世界粮食计划署 (World%20Food%20Program) 的 40% 小麦供应量抵达乌克兰,等待出口。
摘要:DNA双链断裂(DSB)是有害的DNA病变,如果无法正确修复,这会对基因组稳定性产生灾难性后果。dsb可以通过非同源末端连接(NHEJ)或同源重组(HR)来修复。这两种途径之间的选择取决于哪种蛋白质结合到DSB末端以及如何调节其作用。nhej启动了KU复合物与DNA末端的结合,而HR是由5'触发的DNA链的核解度降解引发的,这需要几种DNA核酸酶/解旋酶并产生单链DNA悬垂。dsb修复发生在精确组织的染色质环境中,其中DNA围绕组蛋白八聚体形成核小体。核 - 躯体对DNA末端加工和修复机械施加了障碍。修改DSB周围的染色质组织可以通过去除整个核小体的去除,这要么通过染色质重塑因子的作用,或者是通过染色质重塑因子的作用,或者通过染色体后的转换修改来允许进行正确的DSB修复,从而可以增加染色质的功能,从而增加修复enzymes对DNA的可及性。在这里,我们回顾了酵母酿酒酵母中DSB周围发生的翻译后修饰及其在DSB修复中的作用,并特别注意DSB修复途径选择。
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* 通讯作者。kris.wood@duke.edu。贡献 MA、RSS、OML 和 KCW 概念化了该项目。MA、ML、CFB 和 KCW 负责方法论。MA、ML、HXA、RSS、HMH 和 CFB 进行了体外机制和验证研究 MA、ML、CEE 和 DLK 进行了体内机制和验证研究 MA、CG、CMB、CEM、TGB 和 KCW 对肿瘤标本进行分类和分析 MA、CJF、HAY 和 KCW 进行了肿瘤基因组序列和相关生存分析 数据由 MA 和 KCW 整理 原稿由 MA 和 KCW 撰写 所有作者审阅并编辑了论文。MA 负责可视化。KCW 监督该项目。资金由 MA、HXA、RSS、TGB 和 KCW 获得
* 通讯作者。kris.wood@duke.edu。贡献 MA、RSS、OML 和 KCW 概念化了该项目。MA、ML、CFB 和 KCW 负责方法论。MA、ML、HXA、RSS、HMH 和 CFB 进行了体外机制和验证研究 MA、ML、CEE 和 DLK 进行了体内机制和验证研究 MA、CG、CMB、CEM、TGB 和 KCW 对肿瘤标本进行分类和分析 MA、CJF、HAY 和 KCW 进行了肿瘤基因组序列和相关生存分析 数据由 MA 和 KCW 整理 原稿由 MA 和 KCW 撰写 所有作者审阅并编辑了论文。MA 负责可视化。KCW 监督该项目。资金由 MA、HXA、RSS、TGB 和 KCW 获得
当细胞受到低 LET 辐射(60 Co 约为 0.3 keV/µm)时,大多数 DNA 损伤不是由辐射场与 DNA 的直接相互作用引起的,而是由辐解后的化学反应引起的。因此,辐射化学对于理解电离辐射造成的生物损伤的潜在机制至关重要。蒙特卡洛径迹结构 (MCTS) 代码可以详细模拟细胞等介质中的粒子径迹。几种 MCTS 代码已经进一步开发,具有模拟水的辐解和随后的非均相化学的能力。最初的 MCTS 模拟使用纯水作为目标,并叠加 DNA 几何形状来表征物理相互作用(Charlton 1986)。现在,MCTS 代码已经变得更加复杂,可以将电离辐射的物理化学过程与 DNA 几何模型相结合。