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土耳其计算和理论化学
摘要：糖尿病及其并发症是死亡和残疾的主要原因之一。视网膜病变，心血管疾病和神经病逐渐长期性高血糖症逐渐发展。找到有效且安全的药物具有更少的副作用来处理与糖尿病有关的并发症。许多科学家正在发起新的计划，以调查植物来源，这些植物来源众所周知，这些植物源包含大量活跃的代理。可食用的海洋藻类caulerpa racemosa具有生物活性，包括抗糖尿病，抗炎和神经保护性。因此，进行了当前的研究，以使用Silico方法中的Caulerpa racemosa进行研究。选择了五个双丁物，例如caulerpin，caulersin，caulersin A，aramososin b和caremosin c，以预测其相互作用的结合模式以及对NF -κB的相互作用结合模式以及与NF -κB（例如Tak1（7nti）相关的蛋白质靶标的相互作用能量，而使用NIK（4IDV）和MMP -9（4H3X）（4H3X），而Vina use则usecterse useanse（4H3X）使用Web工具PKCSM®进行ADMET。结果表明，所有化合物均被预测与蛋白质靶标的结合位点的氨基酸相互作用，而预测的药物和毒性表明，大多数化合物符合ADMET特性中的最低标准参数。发现的结果表明，在caulerpa racemosa中包含的双孔可能有可能用于治疗与糖尿病相关的并发症。关键字：Caulerpa，Admet，Bisindoles，对接，糖尿病1。引言糖尿病是一种代谢性疾病，影响了全球人群的相当一部分。根据IDF糖尿病图集2021，有5.37亿成年人（20 - 79年）患有糖尿病，或1分。到2030年，该数字预计将达到6.43亿，到2045年将达到7.83亿[1]。糖尿病会影响众多器官系统，并且随着时间的流逝会导致严重的并发症。可以鉴定出糖尿病的微血管和大血管并发症。对神经系统的损害（神经病），肾脏（肾病）和眼睛（视网膜病）是
分子对接，ADMET，DFT研究和新苯甲酰唑酮衍生物作为HIV-1逆转录酶（RT）抑制剂的曲折策略
背景：血友病-A是一种与性别有关的遗传性出血疾病，例如普通人群，心血管疾病的死亡率目前是血友病患者死亡的三分之一。方法：对五十名儿童进行了一项案例对照研究；与二十五名健康男性儿童相比，有25名男性血友病-A。12铅表面ECG，24小时的Holleter监测和基本的超声心动图评估均已为所有参与的儿童进行。结果：ECG记录表明，血友病儿童与对照组中的心率（B/分钟），QTC/MSEC，最大和QT分散体在血友病儿童中增加了24小时holter。将血友病儿童中HRV（MS）的时间域参数降低与健康对照组进行了比较。在受试者的数量和频率中，患病组和健康组之间观察到显着差异，而QTC分散剂的增加超过了ECG检测到的70 ms，但没有被Holter检测到。结论：血友病儿童的QT分散量增加，这使他们有患心律失常，通过抑郁率HRV检测到的同情迷神经失衡，并使他们暴露于心脏病发病和心脏突然死亡。
药物吸收、分布、代谢的空间分析...
质谱成像 (MSI) 正在成为一种强大的分析工具，可通过对薄组织切片进行原位质谱分析，对内源性和外源性分子进行检测、量化和同时进行空间分子成像，而无需化学标记。MSI 可生成所施用药物和代谢物的化学特异性和空间分辨的离子分布信息，这可用于涉及药物吸收、分布、代谢、排泄和毒性 (ADMET) 各个阶段的研究的众多应用。基于 MSI 的药代动力学成像分析提供了有关动态药物分布和代谢过程的组织学背景和细胞环境，并有助于了解药物的空间药代动力学和药效学特性。在此，我们讨论了 MSI 的当前技术发展，这些技术可提供临床前和临床组织标本中小分子药物、抗体和寡核苷酸大分子药物及其代谢物的定性、定量和空间位置信息。我们重点介绍全身、脑、肺、肝、肾、胃、肠组织切片、类器官中的宏观和微观药物分布，以及 MSI 在药物 ADMET 研究中的最新应用。
可卡因成瘾的蛋白质组机器学习研究
摘要：尽管经过数十年的努力，但美国食品和药物管理局尚未批准任何一种抗可卡因成瘾药物。主要的挑战是可卡因成瘾的分子机制错综复杂，涉及多巴胺转运蛋白上游和下游蛋白质之间的协同相互作用。然而，用传统实验很难研究如此多的蛋白质，这凸显了该领域对创新策略的需求。我们提出了一个蛋白质组信息机器学习 (ML) 平台，用于发现近乎最佳的抗可卡因成瘾先导化合物。我们分析了可卡因依赖的蛋白质组蛋白质-蛋白质相互作用网络，以确定 141 个相关药物靶点，并建立了 32 个 ML 模型，用于对 60,000 多种候选药物或实验药物进行跨靶点分析，以了解其副作用和重新利用潜力。我们进一步预测了它们的 ADMET（吸收、分布、代谢、排泄和毒性）特性。我们的平台显示，基本上所有现有的候选药物都在跨目标和 ADMET 筛选中失败，但确定了几个近乎最佳的线索以供进一步优化。
亚麻微绿木脂素作为新型前列腺癌靶向抑制剂的分子建模与鉴定
前列腺癌 (PCa) 是最常见的癌症类型之一，其在 70 岁以上的老年男性中的发病率呈上升趋势。在药物治疗中，天然化合物及其结构类似物已用于治疗癌症。多项研究已证明亚麻（Linum usitatissimum，俗称亚麻）在治疗各种癌症方面具有治疗潜力。然而，亚麻衍生化合物作用于 PCa 的具体机制仍不清楚。本研究旨在通过鉴定和评估亚麻嫩芽中的生物活性化合物来填补这一空白。GCMS 分析使用 Shimadzu（GCMS-TQ8040 NX）进行。仪器温度设置为从 50°C 到 300°C，持续 37 分钟，以得到 100% 的总峰面积。分子对接研究是使用 AutoDock tools 4.2 版软件进行的。使用 SWISSADME 在线 (http://www.swissadme.ch/) 和 ProTox-3.0 在线 (https://tox.charite.de/protox3/ index.php?site) 预测工具预测和分析 ADMET 特性。GC-MS 分析鉴定了亚麻嫩芽甲醇提取物中的 58 种植物化合物。其中，CID11002708 和 CID290541 对 PCa 靶蛋白表现出最高的结合亲和力。ADME/T 结果显示这些化合物具有低毒性和特定的代谢特性。考虑到分子对接和 ADMET 评估的结果，可以得出结论，CID11002708 和 CID290541 有望成为治疗 PCa 的新型抑制剂。目前的结果可以通过体外和体内研究进一步验证。
nadeem siddiqui，int。 J. of Pharm。 Sci。，2025，第3卷，第3期，316-323
一种称为阿尔茨海默氏病的退化性神经系统疾病导致脑细胞和脑收缩死亡。痴呆症的最常见原因是阿尔茨海默氏病，其特征是损害一个人独立功能能力的精神，行为和社会能力的稳定恶化。诸如阿尔茨海默氏病（AD）之类的神经退行性疾病以社会识别和学习社会线索的困难为特征。我们探讨了β1-甲状腺素能信号传导是否可以通过检查其对认知性能的影响来成为AD的潜在治疗靶标。此信号传导也可能有助于调节记忆障碍患者的血压变化。苦杏仁用于治疗阿尔茨海默氏病。使用软件研究了加利福尼亚杏仁的主要化学成分用于分子对接。使用代码5OG及其共结晶的配体ivastigmine（docking得分-6.0），辛多佩齐尔（对接得分-9.0）的胆碱酯酶抑制剂蛋白数据库（PDB）文件用于此目的。评估了植物化学物质与氨基酸的相互作用。靶蛋白 - 蛋白质同源性建模，蛋白质结构验证和能量最小化。使用文献中记录的植物化学物质进行了一种比较硅对接分析的比较，以与标准药物以及标准药物一起与阿尔茨海默氏病有关。使用Autodock Vina进行了初步的对接研究，并用Autodock 4.2.6和Swissdock验证了结果。对这些植物化学物质的吸收，分布，代谢，排泄和毒性（ADMET）特性进行了评估，并且仅包括通过ADMET过滤器的那些。
通过 PDK3 抑制发现肺癌治疗候选药物——一种药物再利用方法
排除了泛测定干扰化合物 (PAINS)（表 S1）。这些化合物表现出与多个生物靶标结合的强亲和力，可能导致非特异性脱靶副作用，因此它们不是药物发现的好选择。考虑到这些问题，对选定的命中进行了 PAINS 过滤，从而改进了选择过程。在分子对接过程后对 PDK3 表现出最高亲和力的化合物（称为 FDA 化合物的热门命中）随后进行了进一步研究以评估其 ADMET 特性。使用 swissADME 网络服务器评估了两种化合物 bagrosin（-10.6 kcal/mol）和脱氢胆酸（10.5 kcal/mol）的药代动力学特性。分析表明，这两种化合物都
AI 预测的 mTOR 抑制剂可减少癌细胞增殖并延长秀丽隐杆线虫的寿命
摘要：雷帕霉素 (mTOR) 激酶的机制靶点是促进健康和延长寿命的首要药物靶点之一。除雷帕霉素外，只有少数其他 mTOR 抑制剂被开发出来并被证明能够减缓衰老。我们使用机器学习来预测针对 mTOR 的新型小分子。我们选择了一种小分子 TKA001，基于对高靶向概率、低毒性、良好的物理化学性质和更好的 ADMET 特征的计算机预测。我们通过分子对接和分子动力学对 TKA001 结合进行了计算机建模。TKA001 在体外可有效抑制 TOR 复合物 1 和 2 信号传导。此外，TKA001 在体外可抑制人类癌细胞增殖并延长秀丽隐杆线虫的寿命，这表明 TKA001 能够在体内减缓衰老。
生物物理学：弥合生物学与物理学之间的差距
1。Horwitz R.细胞生物物理学。Biophys J.2016; 110（5）：993-996.1。 2。 Henon S，Lenormand G，Richert A，Gallet F.使用光学镊子对人红细胞膜的剪切模量的新确定。 Biophys J. 1999; 76（2）：1145-1151。 3。 Asano M，Basieva I，Khrennikov A，Ohya M，Tanaka Y，YamatoI。量子信息生物学：从量子力学的信息解释到分子生物学和认知心理学的应用。 找到了物理。 2015; 45：1362-1378。 4。 Zimmerberg J.膜生物物理学。 Curr Biol。 2006; 16（8）：R272-276。 5。 Holdgate G，Embrey K，Milbradt A，Davies G.早期药物发现中的生物物理方法。 ADMET DMPK。 2019; 7（4）：222-241。 6。 sun X，Zhou Y，Wang Z，Peng M，Wei X，Xie Y等。 生物分子冷凝物破译细胞命运的分子代码：从生物物理基本原理到治疗实践。 int J Mol Sci。 2024; 25（7）：4127。 7。 Mohs RC，Greig NH。 药物发现和开发：基本生物学研究的作用。 阿尔茨海默氏症痴呆症（n y）。 2017; 3（4）：651-657。2016; 110（5）：993-996.1。2。Henon S，Lenormand G，Richert A，Gallet F.使用光学镊子对人红细胞膜的剪切模量的新确定。Biophys J.1999; 76（2）：1145-1151。 3。 Asano M，Basieva I，Khrennikov A，Ohya M，Tanaka Y，YamatoI。量子信息生物学：从量子力学的信息解释到分子生物学和认知心理学的应用。 找到了物理。 2015; 45：1362-1378。 4。 Zimmerberg J.膜生物物理学。 Curr Biol。 2006; 16（8）：R272-276。 5。 Holdgate G，Embrey K，Milbradt A，Davies G.早期药物发现中的生物物理方法。 ADMET DMPK。 2019; 7（4）：222-241。 6。 sun X，Zhou Y，Wang Z，Peng M，Wei X，Xie Y等。 生物分子冷凝物破译细胞命运的分子代码：从生物物理基本原理到治疗实践。 int J Mol Sci。 2024; 25（7）：4127。 7。 Mohs RC，Greig NH。 药物发现和开发：基本生物学研究的作用。 阿尔茨海默氏症痴呆症（n y）。 2017; 3（4）：651-657。1999; 76（2）：1145-1151。3。Asano M，Basieva I，Khrennikov A，Ohya M，Tanaka Y，YamatoI。量子信息生物学：从量子力学的信息解释到分子生物学和认知心理学的应用。找到了物理。2015; 45：1362-1378。 4。 Zimmerberg J.膜生物物理学。 Curr Biol。 2006; 16（8）：R272-276。 5。 Holdgate G，Embrey K，Milbradt A，Davies G.早期药物发现中的生物物理方法。 ADMET DMPK。 2019; 7（4）：222-241。 6。 sun X，Zhou Y，Wang Z，Peng M，Wei X，Xie Y等。 生物分子冷凝物破译细胞命运的分子代码：从生物物理基本原理到治疗实践。 int J Mol Sci。 2024; 25（7）：4127。 7。 Mohs RC，Greig NH。 药物发现和开发：基本生物学研究的作用。 阿尔茨海默氏症痴呆症（n y）。 2017; 3（4）：651-657。2015; 45：1362-1378。4。Zimmerberg J.膜生物物理学。Curr Biol。2006; 16（8）：R272-276。 5。 Holdgate G，Embrey K，Milbradt A，Davies G.早期药物发现中的生物物理方法。 ADMET DMPK。 2019; 7（4）：222-241。 6。 sun X，Zhou Y，Wang Z，Peng M，Wei X，Xie Y等。 生物分子冷凝物破译细胞命运的分子代码：从生物物理基本原理到治疗实践。 int J Mol Sci。 2024; 25（7）：4127。 7。 Mohs RC，Greig NH。 药物发现和开发：基本生物学研究的作用。 阿尔茨海默氏症痴呆症（n y）。 2017; 3（4）：651-657。2006; 16（8）：R272-276。5。Holdgate G，Embrey K，Milbradt A，Davies G.早期药物发现中的生物物理方法。ADMET DMPK。2019; 7（4）：222-241。6。sun X，Zhou Y，Wang Z，Peng M，Wei X，Xie Y等。生物分子冷凝物破译细胞命运的分子代码：从生物物理基本原理到治疗实践。int J Mol Sci。2024; 25（7）：4127。7。Mohs RC，Greig NH。药物发现和开发：基本生物学研究的作用。阿尔茨海默氏症痴呆症（n y）。2017; 3（4）：651-657。2017; 3（4）：651-657。
昼夜节律对药物反应的调节：朝向性 -
先前的评论检查了年流制药的互补方面（3-8）。在这里，我们强调的是，对昼夜节律反应的研究现在已成为从细胞填充到类器官，动物模型和患者的连续性。性二态性目前正在成为昼夜节律调节主要吸收，分布，代谢，消除和毒性（ADMET）机制的重要因素。我们总结了那些靶向免疫，癌症，凝结，代谢，心血管系统以及炎症性和风湿病学的那些定药的最新进展。我们研究了性二态效应对年代疗法的影响，即根据昼夜节律的治疗，以减少不良事件和/或提高功效。我们进一步分析了新分子时钟剂的当前发育状况及其对年代疗法的承诺。