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Zobell Marine Agar 2216
某些厌氧菌需要添加维生素K和Hemin（1,2）才能生长。因此，建议将硫代糖果培养基和维生素K用于分离和培养临床材料中存在于临床材料中存在的刺激性或缓慢增长的强制性厌氧微生物。也建议将多种有氧和辅助厌氧微生物分离和培养。色氨酸和酵母提取物提供氮化合物，维生素B复合物以及其他必要的生长养分，可用于细菌代谢。硫代基酸钠和l-cyst ine充当减少剂并在培养基中保持低氧张力。维生素K是某些prevotella黑色素毒素菌株的生长需求。顶部的粉红色环（氧化培养基）是由于硫唑蛋白指示剂引起的。hemin是X因子的来源，它刺激了许多微生物的生长。
工业生物技术进行嗜热
从化石原料中过渡对于减轻气候变化至关重要，因此必须使用可再生，替代碳和能源来促进循环碳经济。在这种情况下，木质纤维素生物量和一碳化合物出现是有希望的原料，可以通过气体发酵或综合的生物处理对增值产物进行嗜热厌氧菌（Thermoanaerobes）重新升级。在这篇综述中，讨论了热虫虫对具有成本效益，有效和可持续生物生产的潜力。代谢和生物处理工程方法进行了审查，以全面了解当前的发展和未来观点，以将可再生饲料库存转换为感兴趣的化学物质和燃料。概述了选定的生物处理方案，为大规模的热虫生物的适用性提供了实用的见解。总体而言，热虫在过程经济学方面的潜在优势可能有助于更容易过渡到具有可再生原料的可持续生物过程。
缺氧条件下的微生物单细胞应用
摘要 微生物学领域传统上侧重于在群体水平上研究微生物。然而，包括微流体和成像技术在内的单细胞水平方法的应用揭示了群体内的异质性，使得这些方法对于以更高的分辨率了解细胞活动和相互作用至关重要。此外，单细胞分选为从微生物群体或复杂的微生物群落中分离感兴趣的细胞开辟了新途径。这些分离的细胞可以在下游的单细胞“组学”分析中进一步研究，提供生理和功能信息。然而，由于厌氧微生物对氧气敏感，将这些方法应用于原位条件下的研究仍然具有挑战性。在这里，我们回顾了现有的在单细胞水平上分析活体厌氧微生物的方法，包括活体成像、细胞分选和微流体（芯片实验室）应用，并解决了它们在缺氧操作中遇到的挑战。此外，我们还讨论了针对厌氧菌的非破坏性成像技术的开发，例如不依赖氧气的荧光探针和替代方法。
微生物群对牙周组织炎症性疾病发生发展的影响
口腔器官和组织功能的一个重要特征是，其中发生的所有过程都是在各种微生物的不断存在下进行的，这些微生物会导致体内病理过程的发展或与之相关。在慢性全身性牙周炎的发病机制中，牙菌斑穿透牙龈沟底部，渗透到上皮下方进入结缔组织基质，引起其炎症。细菌会产生多种对周围组织有毒性作用的毒性物质。大多数细菌会产生链状脂肪酸，抑制白细胞和吞噬细胞的趋化作用。厌氧菌和螺旋体会分泌多种对大多数组织具有极大毒性的物质（丙酸和吲哚）。牙周组织中的炎症是由牙菌斑生物膜的微生物群引起的。随着牙周炎的发展，牙龈卟啉单胞菌、中间卟啉单胞菌和福赛丝菌的数量增加了100多倍。因此，给出的数据证明，在牙周组织炎症过程的发展和过程中，涉及复杂的菌群失调和组织-细胞相互作用，其动态平衡取决于其结果。
甲烷产生和氧化微生物显示...
人为气候变化是二十一世纪的关键问题之一，它有可能通过温度和降水的变化来严重影响自然泥炭地（IPCC，2021年）。虽然气候变化模型预测北纬度地区的降水增加，但预计这些事件的集中度更高，并且时间更少，而两者之间的较长时期则温暖的天气（IPCC，2021年）。这些事件通常会导致地下水位深度降低，从而暴露于甲壳状的氧气中。这可能通过减少甲基毒性古细菌产生CH 4的可居住性缺氧区来减少甲烷（CH 4）对大气的排放，但也有可能通过增加的活性和甲烷营养丰度，从而导致CH 4的更高消耗（Keane等人，2021； Rinne等，202020202020）。这些居住在天然泥炭地的微生物群落在温暖的气候下容易受到干扰，但是目前难以预测微生物群落的潜在结构转移，这导致了当前CH 4预算的高度不确定性（Dean等人，2018年； Saunois等，2020年）。
生物多样性I（微生物，藻类，真菌和苔藓植物）
气体交换；细胞呼吸 - 糖酵解，发酵（厌氧），TCA循环和电子传输系统（有氧）；能量关系 - 产生的ATP分子数量；两性途径；呼吸商。植物生长调节剂 - 陶氏素，gibberellin，cytokinin，乙烯，ABA；种子休眠；春光周期。碳水化合物，脂质，蛋白质，核酸和酶（16％）单糖家族：醛糖和酮，三位糖，四分之一，五齿和己糖。葡萄糖和果糖的呋喃糖和吡喃糖形式。二糖；减少和非还原糖的概念，麦芽糖，乳糖和蔗糖的Haworth投影。多糖，储存多糖，淀粉和糖原。结构多糖，纤维素，肽聚糖。定义和主要类别的存储和结构脂质。存储脂质。脂肪酸：结构和功能。必需脂肪酸。三酰基甘油结构，结构脂质。磷酸甘油酯：构建基块，一般结构。氨基酸，蛋白质的组成部分。氨基酸的一般公式和zwitterion的概念。蛋白质结构：初级，次级，第三和第四纪结构。核苷酸，DNA和RNA的螺旋；分子生物学中央教条的简要概念。 酶的分类。 apoenzyme，辅酶，修复组，辅因子。 酶的结构。 酶的作用机理：活性位点，激活能，过渡状态复合物。核苷酸，DNA和RNA的螺旋；分子生物学中央教条的简要概念。酶的分类。 apoenzyme，辅酶，修复组，辅因子。 酶的结构。 酶的作用机理：活性位点，激活能，过渡状态复合物。酶的分类。apoenzyme，辅酶，修复组，辅因子。酶的结构。酶的作用机理：活性位点，激活能，过渡状态复合物。多烯酶复合物：丙酮酸脱氢酶； Isozyme: lactate dehydrogenase Microbial growth in response to environment (4%) - temperature (psychrophiles, psychrotrophs, mesophiles, thermophiles, thermodurics), pH (acidophiles, alkaliphiles), solute and water activity (halophiles, xerophiles, osmophiles), oxygen (aerobes, anaerobes, microaerophilic, facultative飞氧，兼性厌氧菌），静水压力（男性）。对营养和能量的响应微生物生长 - 自养/光营养，异育；光学组织，化学硫代基因营养素：化学硫代植物，化学硫代骨骼营养，化学果蝇营养，光载体促营养。人类生理学（7％）消化和吸收：消化道和消化腺；消化酶和胃肠道激素的作用；蠕动，消化，吸收和吸收蛋白质，碳水化合物和脂肪。呼吸和呼吸：动物中的呼吸器官（仅回忆）；人类的呼吸系统；呼吸机制及其在人类中的调节 - 气体的交换，气体的运输以及呼吸的调节，呼吸量；与呼吸哮喘，肺气肿，职业呼吸系统疾病有关的疾病。排泄物及其消除：排泄模式 - ammenotelism，犹太人主义，乌瑞特主义；人类排泄系统 - 结构和功能；尿形成，渗透调节；调节肾脏功能 - 肾素 - 血管紧张素，心房纳地酸因子，ADH和糖尿病肌肉症；其他器官在排泄中的作用；疾病 - 尿毒症，肾衰竭，肾脏骨化，肾炎；透析和人造肾脏。
阳性血液培养液的宏基因组测序，以进行精确细菌和真菌鉴定：一项初步研究
摘要：随着血流感染（BSI）代表了全球死亡率和发病率的主要原因，血液培养物在诊断中起着至关重要的作用，但是它们的临床应用会因长时间的转弯时间而抑制，并且仅检测到可培养的病原体。在这项研究中，我们直接从阳性血液培养液体中直接开发了shot弹枪元基因组学测序（MNG）测试，从而可以更快地鉴定出挑剔或缓慢生长的微生物。该测试是基于先前验证的下一代测序测试而构建的，该测试依赖于细菌和真菌识别的几个关键标记基因。新测试利用开源宏基因组学CZ-ID平台进行初始分析来生成最可能的候选物种，然后将其用作下游，确定分析的参考基因组。这种方法具有创新性，因为它利用了开源软件的不可知分类呼叫能力，同时仍依靠更具成熟和先前验证的基于标记基因的识别方案，从而增加了最终结果中的态度。对细菌和真菌微生物的测试表现出很高的精度（100％，30/30）。我们进一步证明了其临床实用性，尤其是针对厌氧和分枝杆菌的临床实用性，它们要么是挑剔，生长缓慢或不寻常的。尽管仅适用于有限的设置，但血液培养的阳性MNGS测试在解决诊断有挑战性BSI的临床需求方面提供了逐步改善。
巨噬细胞属的种群基因组学。揭示神秘的宿主专业化和减数分裂重组的证据
阴道微生物组组成与宿主健康密切相关。由特定厌氧菌（例如，阴道gardnerella）主导的微生物组称为细菌性阴道病（BV），与负面的健康结果有关，而乳酸杆菌属物种的定殖被认为可以预防BV。然而，乳酸杆菌内体在阴道健康中的作用是有争议的，有证据表明某些菌株可能无法预防BV，而其他菌株则可能无法防止BV。为了更好地表征L. iners菌株，需要在体外研究它们与阴道细菌和人类细胞的相互作用，但由于缺乏液体培养基的快速生长而阻碍了这种情况。我们开发了三种液体培养基的生长：Serrador适应ISCOVE的ISCOVE的培养基（Slim），这导致了强大的L. Iners生长，Slim-V（Slim-V）的阴道适应性版本（Slim-V）和一种化学定义的培养基（Slim-CD）（Slim-CD）。纤细和纤细的V型生长可显着改善。纤细-CD导致生长速度较慢，但可能被证明可用于表征L. iners的营养需求或代谢物生产。修改后的Slim-V版本支持人宫颈上皮细胞的生长，并为将来的共培养工作提供了基础。在这里，我们介绍了纤细，纤细V和Slim-CD的制剂，并比较了培养基中细菌菌株和人类细胞的生长。
男性不育的肠道，尿液和精液的功能和分类性营养不良
背景：关于泌尿生殖器和胃肠道菌群在男性不育症发病机理中的作用知之甚少。目的：比较肠道，精液和尿液微生物的分类和功能性填充物。设计，设置和参与者：我们前瞻性地招募了25名具有特发育原发性不孕症的男性和12名健康的父亲，我们收集了直肠拭子，精液样本，中游尿液样本和实验控制。结果测量和统计分析：我们对定量高分辨率分类法进行了全面的精液分析，16S rRNA测序以及shot弹枪元基因组学，中位数为1.4亿个样品，用于功能代谢途径。结果和局限性：我们确定了与尿液微生物组相似的多种精液微生物组。不育男性藏有增加的a -di -dectity和独特的B多样性，精确的空气菌和直肠呼吸菌的减少。prevotella的丰度与精子浓度成反比，假单胞菌与总运动精子数直接相关。输精管切除术似乎改变了精液微生物组，表明睾丸或附睾的贡献。厌氧菌在具有静脉曲张的不育男性精液中高度代表性，但是氧化应激和白细胞植物植物仅与微妙的差异有关。结论：这项试验研究代表了对男性不育症中微生物组的第一次全面研究。宏基因组学数据鉴定出S-ade-Nosyl-L-甲硫代周期中的显着改变，该循环可能在通过DNA甲基化，氧化应激，/或多胺合成中在不孕症的发病机构中起多方面的作用。这些发现为未来的研究提供了基础，以探索因果关系，并为患有这种复杂且情绪上破坏性疾病的男性确定基于微生物组的新型诊断和治疗疗法。