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摘要 微生物学领域传统上侧重于在群体水平上研究微生物。然而，包括微流体和成像技术在内的单细胞水平方法的应用揭示了群体内的异质性，使得这些方法对于以更高的分辨率了解细胞活动和相互作用至关重要。此外，单细胞分选为从微生物群体或复杂的微生物群落中分离感兴趣的细胞开辟了新途径。这些分离的细胞可以在下游的单细胞“组学”分析中进一步研究，提供生理和功能信息。然而，由于厌氧微生物对氧气敏感，将这些方法应用于原位条件下的研究仍然具有挑战性。在这里，我们回顾了现有的在单细胞水平上分析活体厌氧微生物的方法，包括活体成像、细胞分选和微流体（芯片实验室）应用，并解决了它们在缺氧操作中遇到的挑战。此外，我们还讨论了针对厌氧菌的非破坏性成像技术的开发，例如不依赖氧气的荧光探针和替代方法。
缺氧条件下的微生物单细胞应用
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