牙源性起源的口腔排水鼻窦通常缺乏口腔内症状,因此可以被诊断为皮肤病变。它很少见,可能与多种疾病(例如毛茸茸,中腹炎)相关,与下颌骨第三磨牙相关,腮腺瘘,前鼻窦,根尖和牙周病理学等。患者可能会从医生那里寻求治疗,因为他们不知道其牙源性起源,并且这些病例通常被误诊并导致不适当的治疗。目的:讨论成功治疗的两种流入鼻窦的详细管理。病例报告:第一个病例是由口腔和上颌面外科系转诊,用于管理源自牙齿的鼻窦鼻腔排出36。在第二种情况下,鼻窦排干是由几个下颌前牙的牙髓坏死引起的。受感染根管中主要是肌肉症的胸腔内微生物,如果未经治疗的静止,可能引起这些类型的症状。结论:由于罕见和缺乏任何牙齿症状,因此,诊断这类病例以治疗疾病并避免不必要的治疗(例如长时间的抗生素处方处方)至关重要。因此,应为任何皮肤窦道排除牙科原因,以便可以确定正确的诊断,并可以将适当的治疗交付给患者。
产品代码:413777脑心脏输注(BHI)(脱水培养基)用于微生物学制备,暂停了37克一升蒸馏水中的培养基。充分混合并通过频繁搅拌加热来溶解。煮沸一分钟,直到完全溶解。分配到适当的容器中,并在121°C进行15分钟进行消毒。制备的培养基应存储在2-8°C下。颜色是琥珀色。为了获得最佳效果,应在同一天使用培养基,或者在沸水床上加热以排出溶解的氧气,然后在使用前冷却。脱水的培养基应具有均匀的,自由流的和颜色的浅色烤制。如果有任何物理变化,请丢弃培养基。使用脑心脏输液汤(BHIB)是一种富含营养素的液体培养基,适合种植几种细菌菌株,例如链球菌,脑膜炎球菌和肺炎球菌,真菌和酵母菌。bhiB。0.5 mL BHI肉汤的试管用于培养用于制备接种物的细菌,用于微稀释液中最小的抑制浓度(MIC)和识别(ID)测试面板。牛肉心脏和小牛脑输注和蛋白质混合物的营养丰富的碱提供氮,维生素,矿物质和氨基酸,对于多种微生物的生长必不可少。葡萄糖是碳能源,氯化钠保持渗透平衡。这种媒介非常通用,并支持许多挑剔的生物的生长。加入0.1%琼脂,该培养基用于培养厌氧菌。添加0.1%琼脂会减少氧对流电流的流动,并鼓励厌氧和微生物的发展。BHI肉汤用于制备S. aureus的培养物,以用于凝结酶测试。接种并在35±2°C下孵育18-24小时。构图参见数据表(TDS)中。
摘要人类肠道菌群在出生后立即形成,对宿主的健康很重要。在第一个日子里,师生的细菌种类通常占主导地位,例如肠杆菌科。这些由严格的厌氧物种(尤其是双杆菌种类)继承。早期过渡到双杆菌物种与健康益处有关;例如,双杆菌物种抑制病原竞争者的生长并调节免疫反应。替代多杆菌被认为是由于辅助厌氧菌(包括肠杆菌科)在新生儿中存在于新生儿中的氧氧氧气所致。为了研究过渡到双杆菌物种的氧气耗竭,我们在这里引入了一个多尺度数学模型,该模型考虑了代谢,空间细菌种群动力学和交叉进食。使用Agora Collection的公开代谢网络数据,该模型从头开始模拟了严格和某些厌氧物种在肠道和氧气影响下的肠道状环境中的竞争。该模型预测,新生婴儿的殖民地内氧的个体差异可以解释观察到的与厌氧物种,尤其是双杆菌物种的术中观察到的个体变异。双杆菌种类通过使用双杆分流器在模型中变为模型,这使双杆菌可以切换为次优屈服代谢,并在高乳糖浓度下快速生长,如此处使用液压平衡分析。因此,计算模型使我们能够检验婴儿结肠中细菌定植和继承的假设的内部合理性。
摘要。Suharti S,Novrariani N,Wiryawan KG。2023。简短的交流:形态学,生化和分子鉴定从流行热带草食动物的粪便中分离出来。生物多样性24:4046-4051。印度尼西亚的食草动物可以消耗木质纤维素的饲料,包括草,树叶,稻草和豆科植物,表明其胃肠道中存在纤维素分解细菌。因此,这项研究的目的是隔离和鉴定来自热带特有草食动物粪便的纤维溶性细菌,包括ANOA(Bubalus depressicornis),Banteng(Bos Javanicus),Muntiacus Muntjak(Muntiacus Muntiacus Muntjak)和Timor Deer(Timor Deer(Timor deer(Rusa timor timor))。使用系列稀释技术分离细菌,并在羧基甲基纤维素(CMC)培养基上进行筛选。根据其形态和生化特征,纤维素酶活性以及16S rDNA的分子鉴定来鉴定所选分离株。结果表明,总共从Anoa,Banteng,Muntjak和Timor Deer的粪便中分离了五种细菌分离株。此外,分离株还表现出具有革兰氏体阳性球菌,发酵葡萄糖,果糖,蔗糖,淀粉和纤维素的兼性厌氧菌的特征。基于纤维素分析指数,来自ANOA和Banteng Feces的分离株显示出高纤维素分解活性,指数约为1.2,表明它们作为降解细菌的潜力。分子鉴定和从ANOA和班丹粪便中纤维胰素细菌分离株的系统发育分析显示出与粪肠球菌的100%相似性。因此,来自热带特有食草动物的粪便,尤其是Anoa和Banteng的细菌具有纤维素分解活性,并且具有针对基于草料饮食的反刍动物的纤维素分解益生菌的潜力。这是第一个记录ANOA纤维素分解活性和Banteng Feces的研究。
在实验室中生长微生物的能力可以使其遗传学的可重复研究和工程化。不幸的是,由于识别培养条件所需的努力,生命树中的大多数微生物仍然没有耕种。对指导实验测试的可行生长条件的预测将是非常可取的。虽然可以通过注释的基因在计算上预测碳和能源,但很难预测其他生长的要求,例如氧,温度,盐度和pH。在这里,我们开发了基于基因组的计算模型,能够预测氧耐受性(92%平衡精度),最佳温度(r 2 = 0.73),盐度(r 2 = 0.81)和pH(r 2 = 0.48),而新的分类微生物家族无需功能基因注释。使用15,596种细菌和古细菌的生长条件和基因组序列,我们发现氨基酸频率可预测生长需求。只有两个氨基酸可以预测氧气耐受性,其精度为88%。使用蛋白质的细胞定位来计算氨基酸频率改善了pH的预测(r 2增加0.36)。由于这些模型不依赖于特定基因的存在或不存在,因此可以将它们应用于不完整的基因组中,仅需要10%的完整性。我们应用模型来预测所有85,205种测序细菌和古细菌的增长需求,发现未养殖物种富含嗜热,厌氧菌和嗜酸菌。这项工作指导了对不同微生物实验室种植的生长限制的识别。最后,我们将模型应用于具有元基因组组装的基因组的3,349个环境样品,并表明社区中的个别微生物具有不同的增长需求。
合成生物学涉及对病毒、细菌、植物和酵母等生物体的遗传物质进行改造,使其具有新的理想特性。该多学科领域采用 DNA 测序和基因组编辑等生物技术来修改或改造新生物,旨在应对医学、农业、制造业和环境方面的挑战。例如,科学家正在利用合成生物学开发下一代疫苗,改造能够捕获碳的生物,并为农作物创造养分,以最大限度地减少对工业肥料的需求。新的机器人工作流程和机器学习驱动的技术已经出现,以加速和原型化微生物的设计,以应用于生物技术。这种基础设施位于称为生物铸造厂的设施中,其中大部分由制药和生物技术公司私有和运营。为了扩大获得最先进技术、工作流程、流程和知识的渠道,美国国家科学基金会 (NSF) 创建了生物铸造厂计划。 8 月,美国国家科学基金会宣布向加州大学圣巴巴拉分校提供为期六年、总额为 2200 万美元的资助,用于建立极端和特殊真菌、古菌和细菌生物实验室 (ExFAB),该实验室由加州大学圣巴巴拉分校牵头,与加州大学河滨分校 (UCR) 和加州州立理工大学波莫纳分校 (CPP) 合作建立。美国国家科学基金会 ExFAB 生物实验室建立了美国首个生物实验室,专注于生活在极端和不寻常环境中的尚未开发和探索的微生物。“我们非常兴奋,因为这笔资金使我们可以使用以前没有人,特别是学术界无法使用的仪器和基础设施,”ExFAB 主任、加州大学圣巴巴拉分校化学工程和生物工程教授 Michelle O'Malley 表示。“该设施将使我们能够开启新一代合成生物学的前景,该合成生物学专注于从自然界中分离出的极端和不寻常微生物。” “UCSB 在推动多学科、中心级科学方面处于世界领先地位,”UCSB 工程学院院长、电气与计算机工程教授 Umesh Mishra 说道。“我们非常自豪能够主办 NSF ExFAB BioFoundry,因为它首次将我们校园的多项优势整合在一起——从海洋科学到化学工程和生物工程。这项金额巨大的 NSF 奖项提升了我们校园的知名度,并成为 UCSB 继续投资生物技术和生物工程的重点。” Foundry 的研究人员将专注于开发技术,以学习自然界中较为不寻常的微生物,这些微生物被称为“极端微生物”,因为它们不符合实验室中的标准生长习性和培养条件。它们可能有不同寻常的营养需求,或者在极高或极低的温度下生长——甚至在没有氧气的情况下——所有这些都使得它们难以用现有基础设施进行研究。“这些极端微生物违背了我们目前对生物学的理解,但它们仍然具有我们想要用于生物技术的特性和成分,比如分解废物的酶,或可用于制造有价值产品和新药物的途径,”奥马利说道,他开创了一个新的研究领域,通过改造厌氧菌将植物废物转化为更可持续的燃料、化学品或生物基材料。
口腔感染(例如口腔念珠菌病)和牙周疾病是一系列影响口腔粘膜和牙根的多菌血症疾病[1]。口腔卫生的恶化导致真菌或细菌的口腔内定殖,据报道,诸如牙龈炎,抽吸肺炎,深层神经病,或增加的病毒病毒病毒病毒疾病的严重程度和凡人症等系统性疾病有助于系统性疾病。建议在老年人中经常看到的抽吸肺炎是由口腔中生长的口腔细菌引起的。In addi- tion to periodontal pathogens, opportunistic infectious pathogenic microorganisms such as Candida , Pseudomonas , or Staphylococcus are known to easily form multi-species biofilm coaggregations intraorally, causing various systemic conditions such as those associated with diabetes mellitus, cardiovascular diseases, pulmonary diseases, and preterm birth [ 3 , 5 ,6]。老年人群的吸入性肺炎和发烧的发生率增加,由于口腔细菌的征收以及免疫功能降低和吞咽反射。在特殊的情况下,由于独立性和唾液分泌的减少,需要护理的老年人可能会恶化口腔卫生状况,因此患肺炎的风险增加。因此,通过日常口腔护理维持口腔卫生对于预防肺炎和口腔感染很重要。口腔护理吸引了一个进入超级衰老社会的国家。白色念珠菌(c。白色唱片),c。glabrata,c。Krusei,c。Krusei,c。念珠菌物种是师生的厌氧菌,可以在充分提供氧气的环境中生长,例如口腔表面和牙齿表面,以及氧气浓度较低的环境,例如牙齿和牙周口袋之间。parapasilosis,c。热带已从口腔中分离出来。c。白色念珠菌是最孤立的物种,但近年来,非albi-libiss Candida物种感染了[7,8]。这些真菌在口腔中的增殖会导致牙龈炎症,牙周炎和深层侵入性牙龈炎症。[9]。由于糖尿病或人类免疫缺陷病毒感染,由念珠菌物种引起的口腔感染更可能因免疫缺陷或免疫力降低[10-12]。此外,据报道,不卫生的口腔条件有助于阿尔茨海默氏病的发展和/或COVID-19的严重程度和死亡率增加[13-18]。因此,周期性的口腔检查和口腔卫生的维持很重要。为了防止贫穷的口腔卫生加剧,重要的是要通过刷牙保持口腔清洁。在治疗口腔感染时,使用抗菌素通过口腔护理清洁口腔,并用抗真菌药物(如两性霉素B和米诺唑)治疗非常重要。然而,已知念珠菌很容易在牙齿和假牙的表面上形成生物膜,从而降低了刷牙和抗真菌剂的有效性[19-21]。给定生物膜的成分是多糖和死亡和活真菌[22]。
自史前时代以来,食品保鲜一直是人类社会的一个重要方面。干燥、冷藏和发酵等古代方法已经发展成为包括罐装、巴氏灭菌、冷冻、辐照和化学添加等现代技术。包装材料的进步也在现代食品保鲜中发挥了重要作用。食品腐败是指食品因各种因素(如微生物污染、昆虫侵染或酶降解)而变得不适合食用。物理和化学变化也会促进腐败。例如,植物或动物组织的撕裂或某些食物成分的氧化会导致腐败。从植物或动物获得的食物在收获或屠宰后不久就开始腐烂。收获后处理过程中的机械损伤会释放出分解细胞物质的酶,导致食品质量下降。细菌、酵母和霉菌等微生物是食品腐败和食源性疾病的主要原因。从收获到准备,食品生产的任何阶段都可能发生污染。微生物污染的主要来源包括土壤、空气、动物饲料和植物表面。细菌是单细胞生物,在最佳条件下繁殖迅速。影响细菌生长的因素包括营养物质的可用性、水分、pH 值、氧气水平以及抑制物质的存在与否。了解这些因素对于有效保存食品和最大程度降低腐败风险至关重要。铁是细菌通过利用大气气体和代谢碳水化合物和蛋白质等食物成分而获得的一种必需元素。####温度和 pH 控制生长温度和 pH 值会显著影响细菌的生长速度。根据细菌的最佳温度范围,细菌可分为三类:嗜热菌、中温菌和嗜冷菌。####最佳环境条件细菌在 pH 值为 7 的中性环境中茁壮成长,需要一定量的可用水才能生长,以水活度比来衡量。####水活度和生长控制水活度定义为食品中水的蒸气压除以特定温度下纯水的蒸气压。大多数细菌无法在低于 0.91 的水活度阈值下生长,尽管一些嗜盐菌种可以耐受更低的值。#### 生长参数细菌生长受多种因素影响,包括氧气浓度,专性需氧菌需要自由氧,专性厌氧菌会因氧气的存在而中毒。#### 细菌种群动态细菌种群的生长遵循可预测的模式,包括滞后期、对数期、稳定期和衰退期。种群的大小通常按每克或每平方厘米的表面积来衡量。食品保鲜旨在改变食品的内部和外部条件和成分,以延长其保质期并防止变质。每克含有 107 到 108 个细胞的食品会产生异味,而每克含有 5 × 10^7 个细胞以上的食品通常会出现某种形式的腐败。某些细菌可以产生对热、化学物质、干燥和紫外线具有高度抵抗力的内生孢子,保持休眠状态,直到有利条件允许它们发芽和生长。食品保鲜方法有助于延长保质期,因为它可以减缓或停止微生物的生长,同时保持清洁和消毒的条件以防止污染。各种技术,包括冷冻、脱水、罐装、发酵等,都会影响食物的内部和外部条件。目标是创造不利于腐败生物的条件,确保食品安全。有效的保存依赖于适当的卫生条件、温度监测和正确的加工时间。烹饪、冷藏和腌制等简单的厨房操作也可以被视为保鲜方法。然而,如果没有适当的卫生条件,即使是严格的保存方法也会对消费者造成伤害。FoodDocs 的软件有助于简化食品安全管理,而清晰地了解保存技术对于成功的结果至关重要。食品保存是食品工业中一个至关重要的过程,旨在减缓腐败生物并延长保质期。采用各种方法,从工业过程到烹饪、冷冻和冷藏等小规模操作。这些技术改变了食物的外部或内部条件,使其不利于微生物的生长。一些方法涉及加热、脱水或改变 pH 值或酸度。大约公元前 12,000 年,罗马人等古代文明使用一种称为“蒸馏室”的技术,利用火的热量和烟雾来干燥水果、草药和蔬菜。这种早期的食品保存方法涉及通过各种方式进行脱水,例如使用盐或香料来增强脱水过程。发酵的概念后来被路易斯·巴斯德于 1857 年理解,但有证据表明它已经实践了数千年。大约公元前 7000 年,新石器时代的中国就记录了饮料的发酵过程。保存方法旨在延长保质期,防止食物变质,同时保证安全。无论采用何种原理,保存都能保护食物免受微生物生长的影响,从而延长其保质期。食品保存的重要性在于它对食品行业的可持续性和供应做出了贡献。它确保即使在收获季节过去也有稳定的食品供应,通过减少浪费来支持经济增长,通过发酵等过程增强风味,并使用冷冻干燥等现代方法保留原有特性。食品保鲜涉及一个不采用加热等苛刻方法的过程,因为加热会改变食品的特性。这种方法可以安全地储存和长期使用食品,并保持其最佳风味。此外,它还能保留关键的健康益处和活性化合物,如抗氧化剂和抗菌特性。另一个优点是易于处理食品,因为保鲜产品保质期长,且不易受外部污染。一些保鲜方法还可以减轻产品重量,使其更节省储存空间。食品保鲜可以延长产品的保质期,通过全年保持季节性农产品新鲜来减少浪费。此外,多余的食材可以保存下来,用于其他菜肴。食品保鲜创造的条件不利于致病菌生长,确保消费者的安全。对于企业来说,保鲜食品可以改善消费者的感知并优化运营。食品保鲜除了促进微生物生长外,还可以实现以下所有目标,因为其主要目标是防止细菌生长。影响保鲜的因素包括产品的内部或外部成分。通过操纵这些因素,可以减缓或停止细菌和其他致病生物的生长。影响保存方法的关键因素是 pH 值,大多数病原体无法在酸性条件下生存。温度在保存食物方面起着至关重要的作用,不同的温度会导致不同的保存效果。罐装和巴氏灭菌等方法利用高温来消灭病原体,而干燥和脱水也依靠热量来限制微生物对水分的利用。在温度范围的另一端,低温保存技术(如冷藏和冷冻干燥)旨在减缓或停止微生物的生长。水活性是食品保存的一个关键方面,因为大多数细菌和病原体都需要水才能生长。为了解决这个问题,脱水或通过成分结合水等方法可以有效地限制病原体的生长。此外,通过改良的气氛包装或真空密封控制氧气水平可以在某些情况下防止腐败微生物的生长。光照也会导致腐臭和氧化等问题,但使用琥珀色瓶等专用容器可以减轻这些影响。发酵是另一种保存方法,它利用有益微生物产生理想的风味,同时通过产生酸性条件来抑制病原体的生长。最后,使用合适的容器是一种简单而有效的方法,可以排除外部因素对食品质量的影响。食品处理人员可以结合多种保存方法,以确保食品在较长时间内保持安全。当保护能力得到扩展时,保存方法可以产生显著的效果。在工作条件下保持清洁和卫生水平对于保护食品免受食源性病原体的侵害至关重要。例如,如果需要保存鲜肉,则需要强大的食品安全管理系统来确保符合法规。FoodDocs 提供直观的数字解决方案,帮助保持合规性并从食品保存中获益。利用数字食品安全监控系统可以自动生成监控日志、智能通知和实时仪表板,以提高合规性和运营效率。食品保存包括各种操作,这些操作根据预期用途、所需特性和储存条件生产独特的产品。常见的原理包括针对消除腐败细菌的高温方法、减缓病原微生物生长的低温方法、冻干去除水分、利用有益微生物发酵、添加抑制微生物生长的防腐剂、改良气调包装和使用电离辐射的食品辐照。最广泛使用的食品保存方法是加热和低温工艺。加热可通过干燥、脱水以及液体食品的巴氏灭菌等方法灵活地处理固体和液体食品。控制加热是消灭有害细菌而不损害食品质量的关键。在这些过程中持续监测内部温度可确保有效性。食品保鲜方法侧重于延长保质期和保持质量,低温技术(如冷藏和冷冻)被广泛使用。这些方法减缓细菌生长,确保食品长期安全食用。然而,极端温度会改变风味和质地。新技术旨在在不损害食品原有特性的情况下保存食品。冷冻干燥是一种非常有效的方法,通过冻干去除水分来保留颜色、风味和质地。该过程还可以保留生物活性化合物,增强人体健康益处。其他现代方法包括高压处理和振荡电场,与热处理相比,它们可以最大限度地减少质地变化。在食品保鲜过程中,会添加化学品来强化工艺或产生更快的反应,并遵守严格的食品安全法,确保批准的化学品不会对健康造成不利影响。常用的防腐剂包括盐、糖、柠檬酸和乳酸等有机酸、亚硝酸盐、亚硫酸盐、香料中的精油、酒精、丁羟茴醚 (BHA)、苯甲酸酯等。这些化学品经过严格的审批程序,以保证消费者的安全。目标是找到能够有效延长保质期同时保持食品品质和特性的保存方法。正确的保存方法对于保持食品品质的重要性怎么强调也不为过。用于此过程的化学品既可以来自合成来源,也可以来自天然物质。必须注意的是,保存技术需要特定条件才能有效,并且这些要求因所选方法而异。不幸的是,保存过程中经常会犯一些错误,如果操作不当,可能会导致污染和无效。其中一些错误包括: * 未能正确消毒环境和所用材料 * 保存温度控制不足 * 食品处理人员的卫生习惯不良 * 保存产品的储存不当 * 添加的防腐剂量不足 * 使用变质的原材料,这可能对某些方法有害 * 包装材料损坏 为了确保食品保存过程的成功和安全,在加工前、加工中和加工后保持一致的温度至关重要。此外,在整个操作过程中应实施适当的卫生和卫生习惯。有效食品保存的具体技巧:1. 在整个保存过程中保持一致的温度。2. 确保正确的加工时间,以防止加工不足或过度加工。3. 在用于保存食品之前对所有工具和设备进行消毒。4. 查阅已建立的文献和食品安全法规,了解批准的防腐剂含量。5. 使用信誉良好的容器。6. 检查原材料是否有任何变质迹象,因为这会影响保存方法的有效性。7. 标记保存食品的明确保质期,以准确监控其保质期。8. 将保存的食品存放在指定区域,避免与同一货架上的生食交叉污染。通过遵循这些准则并坚持正确的食品安全和卫生做法,企业可以成功保存食品成分,同时最大限度地降低污染或细菌生长的风险。这确保最终产品在延长的保质期内保持安全食用。食品安全管理可能非常繁琐,但用户友好的解决方案对于高效完成任务是必不可少的。 FoodDocs 提供直观的数字 Foos 安全管理系统,帮助保持合规性并简化运营。该系统提供基本功能,例如根据运营需求自动生成的监控表格,包括巴氏灭菌方法的烹饪温度日志、主卫生计划、员工卫生检查表和可追溯性跟踪。带有智能通知系统的移动应用程序可确保食品处理人员保持正轨,而数字解决方案只需要最少的设置时间,只需回答几个问题即可开始使用。人工智能和机器学习功能会自动生成监控日志和文档,实时仪表板会提供操作和产品可追溯性状态的概览。 可以随时同时管理食品保鲜过程和安全操作。确保符合食品安全要求,保护您的消费者免受食源性疾病的侵害。 通过 14 天免费试用体验我们数字解决方案的优势,加入通过我们的产品实施食品安全的 30,000 多名客户。 常见问题: 需要更多有关食品保鲜的信息吗?以下是有关此主题的一些最常见问题: 什么是食品保鲜? 食品保鲜通过防止腐败生物生长来延长食材的保质期。它旨在更长时间地保留营养价值、风味和安全性。 食品保鲜的 7 种方法是什么? • 加热(干燥、巴氏杀菌) • 腌制(盐、糖或蜂蜜腌制) • 冷冻 • 真空包装 • 罐装 • 烟熏 • 自由干燥 什么是天然防腐剂?例如盐、糖、蜂蜜、香料、醋和其他有机酸。为什么醋可用于食品保鲜?醋可降低食品的 pH 值,从而抑制细菌生长。它含有 pH 值较低的乙酸。我们如何保存食物?食品保鲜涉及多种操作,包括冷冻、热处理或高压加工,以使食品具有保质性。哪种保鲜方法会留下一些不会在食品中繁殖的细菌孢子?商业灭菌就是这种方法的一个例子,它针对营养细胞,但采用不太极端的温度来破坏孢子。哪种方法通过控制微生物与水的接触来保存食物?干燥和固化等方法可控制微生物与水的接触。干燥通过加热去除可用水,而固化将可用水与溶质结合。并确保更长时间的安全性。 食品保鲜的 7 种方法是什么? • 加热(干燥、巴氏灭菌) • 腌制(盐、糖或蜂蜜腌制) • 冷冻 • 真空包装 • 罐装 • 烟熏 • 自由干燥 什么是天然防腐剂? 例如盐、糖、蜂蜜、香料、醋和其他有机酸。 为什么醋用于食品保鲜? 醋会降低食品的 PH 值,防止细菌生长。 它含有乙酸,乙酸的 PH 值较低。 我们如何保存食物? 食品保鲜涉及各种操作,包括冷冻、热处理或高压加工,以使食品保质期长。 哪种保鲜方法会留下一些不会在食物供应中繁殖的细菌孢子? 商业灭菌就是这种方法的一个例子,它针对营养细胞,但应用不太极端的温度来破坏孢子。 哪种方法通过控制微生物与水的接触来保存食物? 干燥和腌制等方法可以控制微生物与水的接触。干燥通过热量去除可用水,而固化将可用水与溶质结合在一起。并确保更长时间的安全性。 食品保鲜的 7 种方法是什么? • 加热(干燥、巴氏灭菌) • 腌制(盐、糖或蜂蜜腌制) • 冷冻 • 真空包装 • 罐装 • 烟熏 • 自由干燥 什么是天然防腐剂? 例如盐、糖、蜂蜜、香料、醋和其他有机酸。 为什么醋用于食品保鲜? 醋会降低食品的 PH 值,防止细菌生长。 它含有乙酸,乙酸的 PH 值较低。 我们如何保存食物? 食品保鲜涉及各种操作,包括冷冻、热处理或高压加工,以使食品保质期长。 哪种保鲜方法会留下一些不会在食物供应中繁殖的细菌孢子? 商业灭菌就是这种方法的一个例子,它针对营养细胞,但应用不太极端的温度来破坏孢子。 哪种方法通过控制微生物与水的接触来保存食物? 干燥和腌制等方法可以控制微生物与水的接触。干燥通过热量去除可用水,而固化将可用水与溶质结合在一起。
nlm提供了对科学文献的访问,而无需暗示与内容的认可或一致。分类法涉及根据特征对微生物进行分类,细菌通过革兰氏染色反应分为两个主要组,并表现出各种形状和大小。在临床实践中,细菌是通过形态学,氧的需求和生化测试对细菌进行分类的。基因探针和基于PCR的技术等诊断测试系统检测特定细菌。细菌物种通常根据基因重组频率表现出不同的种群结构。键入分离株对于流行病学研究和监视至关重要。微生物可以分为七个大型生物群:藻类,原生动物,粘液霉菌,真菌,细菌,古细菌和病毒。藻类,原生动物,粘液霉菌和真菌是真核微生物,具有类似于动植物的细胞结构。细菌,包括支原体,立克群和衣原体组,具有原核组织。古细菌是一群独特的原核生物,与其他生物没有密切的祖先关系。只有细菌和病毒在医学或兽医上被认为是重要的。病毒是具有简单结构和不同繁殖模式的最小传染剂。病毒,无蛋白质的RNA片段,引起植物的疾病,而prion是动物和人类致命神经退行性疾病的病因。传染性同工型中发生构成变化(第60章)。系统学也称为系统发育学。分类法包括三个组成部分:分类,命名和识别。分类以有序的方式群体群体,而命名法则涉及命名这些生物,要求国际协议以持续使用。命名法的更改可能会引起混乱,并受到国际商定的规则。在临床实践中,微生物学家主要专注于根据商定的分类系统识别分离株。这些组成部分以及分类法构成了与进化,遗传学和物种有关的系统学的总体学科。原生动物,真菌和蠕虫是根据卡尔·冯·林纳(Carl vonLinné)开创性工作后的标准规则分类和命名的。大类(阶级,秩序,家庭)进一步分为由拉丁二项式指定的单个物种。细菌表现出比所有其他细胞寿命的多样性更大,这使刚性分类具有挑战性。识别主要是通过基于密钥的系统来实现的,该系统基于生化性能测试系统的生长或活动来组织细菌性状。有些测试明确鉴定了属或物种,例如葡萄球菌属的过氧化氢酶产生。和细胞色素c由铜绿假单胞菌C。其他特征可能是单个物种独有的,将它们与具有相似生化谱的人区分开来。某些细菌在实验室中不生长(麻风细菌,treponemes),需要遗传学方法鉴定。如图它们可能构成一个属。随着遗传分析技术变得越来越容易获得,它们和其他快速分析方法正在取代传统的生化方法以识别。细菌分类中使用的分类等级包括王国(原核),分区(Gracilicutes),阶级(Betaproteobacteria),订单(Burkholderiales),家庭(Burkholderiaceae),属(Burkholderia)(Burkholderia)和物种(Burkholderia cepacacia)。通过DNA同源性分析将一些属(例如动杆菌)细分为基因组物种。细菌和病毒的分类构成了挑战,这是由于表型测试在区分某些基因组物种时的局限性。当前方法识别物种复合物,这些物种复合物使用多重分类学方法分为基因组群。例如,头囊菌络合物包括从植物病原体到人类病原体的各种生物。尽管没有普遍接受的分类系统,但Bergey的手册被广泛用作权威来源。国际系统细菌学委员会控制细菌命名法,并在《国际系统和进化微生物学杂志》中发布批准的细菌名称清单。病毒由国际病毒分类学委员会(ICTV)归类,并在病毒学档案中发表。在细菌分类中,主要组以基本特征(例如细胞形状,革兰氏染色反应和孢子形成)区分。属和物种通常通过发酵反应,营养需求和致病性等性质进行区分。不同字符的相对重要性通常是任意的,而Adansonian系统则使用考虑广泛字符的统计系数来确定菌株之间的关系程度。此方法可用于分类共享主要字符的较大分组中的菌株。通过评分多个表型特征,可以估计相似性或匹配系数,这些系数可以在计算机上计算以确定生物体之间相似性的程度。3.1,可以使用相似性矩阵或树状图来构建层次分类树。这种方法允许根据相似性水平(用虚线x和y表示)将生物体分离为属和物种。DNA中鸟嘌呤 - 胞嘧啶(G-C)碱基对之间的氢键强度大于腺嘌呤 - 胸腺胺(A-T)碱基对之间的强度,从而影响DNA熔化的温度。DNA序列以确定G+C含量,该含量在细菌属之间差异很大,但在物种中仍然相对一致。另一种分类方法涉及基于其DNA碱基序列的同源性进行分组。此方法利用了在受控冷却过程中的重新形态,并在互补区域之间产生混合配对。可以通过信使RNA(mRNA)结合研究获得有关相关性的遗传证据。尽管具有不同G+C比的生物不太可能显示出明显的DNA同源性,但具有相似或相同的G+C比的生物可能不一定具有同源性。系统发育相关性。已经开发了一种实时PCR方法来估计G+C含量。核糖体RNA(rRNA)的结构似乎在进化过程中是保守的,反映了系统发育关系。核苷酸测序相对简单,并导致了许多在线医学上重要的细菌物种的DNA序列的可用性。注意:我应用了“添加拼写错误(SE)”方法,其中有10%的概率引入错误。如果您要我以不同的方式重塑它,请让我知道!在此处给定文章的分枝杆菌物种鉴定对于理解其系统发育关系至关重要。尽管rDNA序列中的高相似性(> 97%),但可以使用Microseq(Applied Biosystems)等商业系统来区分不同的物种。但是,核糖体基因可能无法提供足够的变化来区分紧密相关的物种。替代候选基因(例如RECA)已被探索,并且似乎有望用于系统发育分析。在系统发育研究中也使用了其他家政基因,包括RPOB,GROEL和GYRB。这些基因定义了与RRNA基因观察到的基因一致的进化树。分类法的主要目标是促进在临床和公共卫生环境中的个人和团体的有效管理。然而,由于基因组序列数据揭示了微生物之间的相互关系,因此对与基本理解保持一致性是必要的。表3.1根据共享特征概述了简化的分类方案。门A(属)是正确的。这些群体已与最近确定的系统发育命名法对服。可以通过补充测试,有时在物种水平上进一步识别生物。形态标准足以鉴定原生动物,蠕虫和真菌。The classification of cellular micro-organisms is as follows: Eukaryotes: Protozoa - Sporozoa Plasmodium, Isospora, Toxoplasma, Cryptosporidium Flagellates Giardia, Trichomonas, Trypanosoma, Leishmania Amoebae Entamoeba, Naegleria, Acanthamoeba Other: Babesia, Balantidium Fungi: Mould-like Epidermophyton, Trichophyton, Microsporum, Aspergillus Yeast-like Candida Dimorphic Histoplasma, Blastomyces, Coccidioides True yeast: Cryptococcus Prokaryotes: Bacteria: Actinobacteria (High G+C Gram positives) - Actinomyces, Streptomyces, Corynebacterium, Nocardia,分枝杆菌,微球菌(低g-c gram阳性) - 李斯特菌,芽孢杆菌,梭状芽孢杆菌*,乳酸杆菌*,Eubacterium*革兰氏阳性杆菌,杆菌,芽孢杆菌,芽孢杆菌* Enterococcus Gram-negative cocci: Veillonella*, Mycoplasma Proteobacteria (a very large group with 5 sub-divisions) - Neisseria, Moraxella Gram-negative bacilli: Enterobacteria – Escherichia, Klebsiella, Proteus, Salmonella, Shigella, Yersinia Pseudomonads – Pseudomonas, Burkholderia, Stenotrophomonas Haemophilus, Bordetella, Brucella, Pasteurella Rickettsia, Coxiella Gram-negative curved and spiral bacilli: Vibrio, Spirillum, Campylobacter, Helicobacter Bacteroidetes - Bacteroides*, Prevotella* Borrelia, Treponema, Brachyspira, Leptospira衣原体衣原体这些单细胞生物是非斑型生物的,具有独特的核和细胞质。它们的大小从直径2-100 µm变化,其表面膜的复杂性和刚度有所不同。有些物种在内部捕获食物颗粒,而另一些物种则以细菌为食。原生动物被认为是最低的动物生命形式,它通过二元裂变或多重裂变无性繁殖。某些鞭毛原生动物与光合藻类密切相关。最重要的医学原生动物组包括Sporozoa,Amoebae和鞭毛。这些生物具有相对刚性的细胞壁,可能是腐生的或寄生的。霉菌随着分支丝的生长而生长,称为菌丝,形成了称为菌丝体的网状作品。通过形成从营养或空中菌丝体发展的性和无性孢子来繁殖。酵母是卵形细胞,通过萌芽并形成性孢子无性繁殖。二态真菌在人造培养中产生营养菌丝体,但在感染病变中类似酵母。主要的细菌组通过微观观察到其形态和染色反应来区分。革兰氏阴性程序将细菌分为两个伟大的分区:革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌。然而,较旧的分类系统与较新的基于DNA序列的系统发育分类之间的关系是复杂的且仍在发展的。随着细菌组之间的系统发育关系开始解体,出现异常。文本描述了根据其形态学特征和染色反应对细菌和病毒进行分类的各种组。尽管如此,在临床实验室中采用的实际鉴定方案很大程度上取决于细菌的形状革兰氏阳性还是阴性,杆菌或球菌的形状,以及它们在有氧或厌氧上生长的能力。医学上有意义的细菌的主要系统发育组包括静脉细菌,其革兰氏阳性具有较高的G+C含量,具有丝状生长和菌丝体的产生; Firmicutes,一组低的G+C革兰氏阳性细菌,其中包括细菌,球菌和孢子形成器;蛋白质细菌,一大群革兰氏阴性细菌;细菌植物,革兰氏阴性厌食症;螺旋体,其特征是带有内部鞭毛的螺旋形细胞;衣原体,严格的细胞内寄生虫产生抗生素并具有非常重要的病原体。其他值得注意的组包括放线菌,链霉菌,分枝杆菌,诺卡氏菌,corynebacterium,链球菌,葡萄球菌,分枝杆菌,尿不质质,叶绿体,veillonella,veillonella,veillonella,gram阳性孢子形成的孢子形成杆菌和近亲,可能会变成gram- cortridium-new cortridiul cortridur cortriver cortridge cortridge cortridg corlam-infram-negam-inform-Gram-ne Gram-ne Gramne。例如,梭状芽胞杆菌的末端孢子具有独特的球形形状。革兰氏阳性的非孢子芽孢杆菌,包括甲ip骨和乳杆菌,倾向于在链或细丝中生长。相反,一些细菌具有使运动能力的鞭毛,例如李斯特菌。细菌可以根据其细胞壁组成,包括α-肾上腺细菌(包括人力赛组和布鲁氏菌),以及贝贝氏菌,包括静脉和伯克霍尔德里亚。尽管具有优势,但核酸测定并非没有局限性。此外,gamaproteobacteria包括大肠杆菌等肠杆菌,以及假单胞菌和军团菌。一些细菌的独特特性(例如弯曲的颤音,包括弧形霍乱)是值得注意的。divaproteobacteria群体在医学上并不显着,而Epsilonproteobacteria包括螺旋杆菌和弯曲杆菌,它们表现出螺旋形状。革兰氏阴性的非腐蚀性厌氧菌(如杆菌和prevotella)以其细长的柔性螺旋而区别。病毒,重点是它们对宿主细胞复制的依赖。某些病毒可能会包裹在脂蛋白中,而另一些病毒缺乏该外层。提出了一个分类系统,根据其遗传物质和衣壳结构对病毒进行分组。引起人类疾病的主要病毒类型包括RNA病毒,例如流感,paramyxoviruse和Flaviviviruses,以及picornaviruses和paciviruses。许多类型的病毒,包括艾滋病毒,HTLV和疱疹病毒会导致人类疾病。DNA病毒,例如痘病毒,轮状病毒和腺病毒,也感染了人。微生物学家在识别细菌时由于精确识别所需的耗时过程而面临挑战。通常,它们依赖于显微镜和培养物等简单方法,可以通过其他测试进行推定识别来支持。但是,这些方法通常至少需要24小时,因此在开始识别之前必须获得单个分离株的纯培养。与文化方法不同,非文化检测技术(例如抗原或基于核酸的检测)没有需要纯培养的缺点,但可能具有特异性的局限性。形态和染色反应可以作为将未知物种置于其适当的生物群中的初步标准。诸如革兰氏阴性,深色地面照明和阴性染色之类的技术可用于观察细菌形态,运动性和胶囊形成。在某些情况下,病理标本中某些生物体的微观特征可能足以进行假定的鉴定,例如痰液中的结节芽孢杆菌或渗出液中的T. pallidum T. pallidum。但是,许多细菌具有相似的形态特征,需要进一步测试以区分它们。固体培养基上殖民增长的出现还可以提供特征信息,包括菌落大小,形状,高程和透明度。微生物生长和特征的变化,包括透明度,不透明和颜色,可能会显着影响结果。生长所需的条件范围特定于某些生物,有些需要氧气,其他厌氧环境,而另一些则对二氧化碳水平或pH值敏感。为了区分相似的物种,可以采用评估代谢差异的测试,例如产生特定碳水化合物的酸性和气态终产物的能力。但是,现在许多实验室都使用了结合简单性和准确性的市售微磨合。此过程导致可见细菌生长的抑制作用。Some common tests used in identification include: - Production of indole or hydrogen sulphide - Presence of oxidase, catalase, urease, gelatinase, or lecithinase enzyme activities - Utilization of various carbon sources Traditionally, these tests have been performed individually according to standard guidelines.套件也可用于特定的生物组,例如肠杆菌和厌氧菌。在某些情况下,可以使用更先进的程序来分析代谢产物或全细胞脂肪酸。A fully automated system using high-resolution gas chromatography and pattern recognition software is widely used, allowing for the rapid identification of various bacterial species.Mass spectrometry also holds promise for rapid identification through matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight (MALDI-TOF) mass spectrometry.由于细菌的多样性和复杂性,对细菌的检测和鉴定可能具有挑战性。Many organisms may not grow in culture, or they may require specialized nutrients, making traditional methods time-consuming and labor-intensive.然而,核酸技术的进步彻底改变了该领域,提供了更灵敏和快速的检测方法。Commercially available systems, including PCR, transcription-mediated amplification, and hybridization with specific probes, can identify a wide range of bacterial species with high accuracy.These technologies enable the detection of multiple species simultaneously, making them ideal for epidemiological investigations and antimicrobial susceptibility testing.此方法允许进行定量和形态评估。污染,操作员技能,底漆设计以及标本中抑制性化合物的存在都会影响结果。对这些结果的解释需要仔细考虑生物体的自然栖息地和共生主义的潜力。The development of new technologies, such as peptide nucleic acid (PNA) assays, holds promise for even more rapid and sensitive detection methods.These techniques use PNA molecules with DNA binding capacity to detect and identify bacterial species on microscope slides, and can be amplified using PCR to accelerate testing times.也已经开发出高密度寡核苷酸阵列,从而可以同时分析数千种不同的探针。This enables researchers to quickly identify specific genetic markers associated with antimicrobial resistance, paving the way for more targeted treatment strategies.Recent advancements include DNA sequencing, strain genotyping, and identifying gene functions, as well as locating resistance genes and changes in mRNA expression.一种创新的方法涉及在Eppendorf管中开发的选定基因靶标的阵列。The chip embedded in the tube contains optimized sets of oligonucleotide probes specific to certain organisms or antimicrobial resistance genes.这允许自定义单个细菌或组的芯片。从样品制备到检测的测定过程在单个管中在6-8小时内完成。实时PCR已广泛开发,使用荧光在单个反应管中结合了扩增和检测。该系统比常规PCR具有显着优势,包括速度,简单性和减少手动程序。基于荧光的方法可以检测DNA产物或通过与荧光标记的探针杂交提高特异性。对靶DNA的定量也是可能的,可以估计样品中的病毒或细菌数。 此外,针对16S核糖体RNA的荧光原位杂交(FISH)已用于直接在临床标本中检测细菌,而无需培养。 可以通过血清学反应来鉴定微生物的种类和类型,这些反应依赖于特有的特定物种或类型的抗体或类型的抗体,这些抗体以特征性的方式与微生物反应。 抗体在检测细菌产生的毒素和抗原以及鉴定特定病毒方面起着至关重要的作用。 基于乳胶的试剂盒广泛用于血清学组和毒素检测。 在ELISA中,特异性抗体附着在塑料孔上,并添加了测试抗原。 通过添加更特异性的抗体检测到抗原的存在,并用启动颜色反应的酶标记。 ELISA方法可以反向使用以定量检测抗体。 在Mac-Elisa中,纯化的抗原被吸附到井中,并添加了测试血清。 任何IgM与捕获试剂结合,并添加纯化的抗原以用标记的抗体检测。 某些病毒,例如流感,在红细胞上充当桥梁的受体,形成可见的团块。 但是,这种方法缺乏可重复性。对靶DNA的定量也是可能的,可以估计样品中的病毒或细菌数。此外,针对16S核糖体RNA的荧光原位杂交(FISH)已用于直接在临床标本中检测细菌,而无需培养。可以通过血清学反应来鉴定微生物的种类和类型,这些反应依赖于特有的特定物种或类型的抗体或类型的抗体,这些抗体以特征性的方式与微生物反应。抗体在检测细菌产生的毒素和抗原以及鉴定特定病毒方面起着至关重要的作用。基于乳胶的试剂盒广泛用于血清学组和毒素检测。在ELISA中,特异性抗体附着在塑料孔上,并添加了测试抗原。通过添加更特异性的抗体检测到抗原的存在,并用启动颜色反应的酶标记。ELISA方法可以反向使用以定量检测抗体。在Mac-Elisa中,纯化的抗原被吸附到井中,并添加了测试血清。任何IgM与捕获试剂结合,并添加纯化的抗原以用标记的抗体检测。某些病毒,例如流感,在红细胞上充当桥梁的受体,形成可见的团块。但是,这种方法缺乏可重复性。Haemagglutinins can be detected in tissue culture, and red cells can be coated with specific antibodies to agglutinate in the presence of homologous virus particles.荧光染料可用于染色组织或生物体,从而在紫外线下可视化。Antibody molecules can be labeled with fluorochrome dyes, enabling direct immunofluorescence procedures for highly sensitive antigen identification.该技术将抗体技术与PCR方法相结合,以增强抗原检测能力。分子生物学中的一种新方法涉及将DNA分子与抗原抗体复合物联系起来,从而产生特定的结合物。此附件允许通过PCR扩增,验证抗原的存在。免疫-PCR的增强灵敏度超过ELISA的105倍,因此检测到只有580个抗原分子。细菌种群表现出不同的结构,从高度多样化到非常相似。Recombination frequency is the primary determinant of population structure, with some species experiencing high recombination rates and others exhibiting rare recombination events.Species such as Neisseria gonorrhoeae are naturally transformable, displaying high recombination frequencies, while Salmonella enterica populations exhibit low recombination rates.细菌克隆可能显示出瞬态或持久特征。Panmictic与克隆人群的概念突出了这两种类型之间的繁殖,重组,等位基因排列和选择性压力的差异。In each family lie many genera of each type.键入分离株可以与参考标记,识别细菌物种中的菌株和分离株进行比较。区分类似菌株的能力在追踪社区或医院环境中感染的来源或传播方面具有重要意义。已经开发了各种键入方法来帮助这一过程,这可能涉及从相同起源菌株之间识别较小的差异。尽管单个打字方法可以证明相同的响应,但这不是两种菌株相同的结论性证据。但是,使用多种打字方法大大提高了相似性的置信度。键入技术可以在不同的流行病学水平上应用,包括微流行病学,宏观流行病学和种群结构分析。从键入中得出的数据可以通过识别共同或点源,区分混合应变感染以及识别再感染与复发与复发来帮助控制感染。一些方法还有助于识别与疾病相关的特定类型,例如大肠杆菌O157和溶血性尿毒症综合征。为了使方法被认为是可靠的,必须在实验室环境和临床上可以重现。在流行病学研究的背景下,首选多种键入方法,因为它们可以针对不同的特征。这些包括生物化学测试,这些测试定义了物种内的生物型,抗性分型检测对化学物质敏感性的变化以及基于营养需求的生长需求的辅助分型。可以使用此方法分析质粒和染色体DNA。此外,许多细菌的表面结构都是抗原性的,可以使用针对它们提出的抗体将分离株分为定义的血清型。物种可以根据其独特特征分为几种抗原类型。对于某些物种,血清分型是一种识别和区分不同菌株的高效方法。在其他情况下,抗原表位的保存使血清型对流行病学目的的有用程度降低。例如,沙门氏菌的物种可以通过其体细胞和鞭毛血清型来定义。研究表明,囊抗原可能在某些生物的致病性中起作用,许多疫苗通过刺激对这些抗原的抗体来起作用。噬菌体键入是一种用于识别和区分细菌菌株的方法。这涉及使用特定噬菌体的凝集或降水反应,如果适当地适应,这可能具有很高的歧视性。但是,某些噬菌体集缺乏稳定性会导致广泛的噬菌体组,而不是定义的类型。此外,控制噬菌体分型结果解释的关键因素是歧视和可重复性。噬菌体与细菌之间的相互作用是一个复杂的过程,涉及吸附,DNA注射以及裂解或复制。裂解或有毒的噬菌体可以在复制循环结束时裂解宿主细胞,从而释放可能感染相邻细胞的新噬菌体颗粒。但是,其有效性取决于噬菌体的适应和系统的稳定性。噬菌体键入已用于包括微生物学和流行病学在内的各个领域,以识别和跟踪细菌菌株。尽管存在这些局限性,但噬菌体打字仍然是理解不同细菌菌株及其特性之间关系的重要工具。只有在两个强烈的裂解反应表现出两种不同的菌株时,才能识别出两种不同的菌株。细菌素是大多数细菌物种产生的自然存在的抗菌物质,主要靶向与生产菌株同一属内的菌株。通过分析产生的细菌素的光谱或对标准面板细菌素的敏感性,细菌素键入可以定义不同类型的细菌。蛋白质组学分析,涉及具有强洗涤剂的丙烯酰胺凝胶中的凝胶电泳,也可以通过可视化数千种蛋白质并比较分离物之间的带模式来鉴定细菌物种。另外,研究人员已使用凝胶电泳来分析代谢酶,可以使用特定底物检测到该酶,用于物种内的克隆分析。限制性核酸内切酶是在特定序列识别位点切下DNA的酶。这些切割的频率取决于寡核苷酸序列,限制位点的频率以及所检查的物种的G+C含量的百分比。频繁切割的核酸内切酶产生许多小片段,可以通过琼脂糖凝胶中的常规电泳解决,并通过用染料染色检测。通过引入脉冲或在电场方向上变化,可以分开碎片至10 MB。相比之下,不经常的切割酶产生的大型DNA片段需要脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分离。该技术涉及将细菌包裹在琼脂糖塞中,用蛋白酶K酶消化细胞,然后用酶消化DNA。CORTOUR夹具均匀的电场(Chef)设备通常用于PFGE,并具有在六角形阵列中排列的24个电极。运行时间通常在30到40小时范围内,尽管已经描述了较短的协议。几个因素影响了这些分析的结果,包括正在检查的DNA类型,酶和反应条件的选择以及所使用的设备质量。DNA样品的质量和浓度,琼脂糖凝胶电压和脉冲时间,缓冲液强度和温度会影响脉冲场凝胶电泳(PFGE)的结果。虽然解释PFGE曲线可能是由于不同物种之间的带状模式的变化而具有挑战性的,但已通过Tenover确定了特定的标准以确定差异的重要性。通常,与显示剖面无差异的单个事件中的分离物被认为是无法区分的。一到三个频段差异的人密切相关。四到六个乐队可能表明可能的关系;七个或更多的差异表明不同的菌株。但是,该规则应谨慎应用,因为即使在同一克隆的成员之间,某些物种也会表现出显着差异。Pearson系数是另一种常用的方法,具有不需要定义特定带位置的优势。可以使用计算机辅助分析软件包来计算菌株之间相似性的系数,例如jaccard和骰子系数,这些系数使用配置文件中的一致频段来确定百分比相似性。经常使用85%相似性的截止点,但应通过实验相关且无关的应变集设置。DNA探针可以根据克隆的特异性,随机序列或通用序列检测靶DNA中的限制位点异质性。rubotyping检测rDNA基因基因座的变化,并已普遍应用于各种物种。其他常用的探针是可能定义种群克隆结构的插入序列。PCR(聚合酶链反应)是一种允许在受控条件下放大特定DNA序列的技术。可以通过使用PCR的重复放大循环来制作由特定寡核苷酸引物定义的基因组区域的多个副本。该方法已广泛用于DNA指纹和键入,利用DNA分子中的可变区域,例如串联重复区域的可变数量或具有限制性核酸内切酶识别序列的区域。两种方法都有局限性,这是由于错误启动,不同的带强度以及电泳迁移差异引起的可重复性问题。基于重复序列的PCR(REP-PCR)索引在整个基因组中多个重复序列中的变化,而自动化的REP-PCR系统对应变键入显示了有望,并且可以提供与PFGE相似的歧视。狼在can属中,而狐狸则处于喧嚣中。放大的片段长度多态性结合了限制性核酸内切酶消化与PCR,以优化基因组之间单碱基对差异的可重复性和分辨率。该技术使用核苷酸测序来分析管家基因,该基因慢慢多样化,不受选择性的作用。多焦点序列分型(MLST)可以视为确定的基因分型。但是,MLST可能对诸如结核分枝杆菌等高度均匀的物种没有效。为了增加歧视,由于环境变化,毒力相关的基因提供了较高的序列变化,因此已经针对了毒力相关的基因。通过PCR扩增基因间区域,并测序了500 bp的内部片段以识别等位基因多态性。多焦点限制输入引入了放大管家基因的限制消化,从而消除了对测序的需求。可变数字串联重复序(VNTR)是拷贝数变化的短核苷酸序列,可用于快速且可再现的键入。识别其他遗传基因座可以提供进一步的见解,但随着时间的流逝,它们的稳定性仍然存在争议。DNA测序技术的最新进展使得分析整个基因组序列成为可能,从而可以更精确的比较和细菌的键入。这种方法涉及生成可以组装并与先前分离株进行比较的短核苷酸序列读取。与这些高级分析相关的成本与传统方法变得越来越具竞争力。这样的分析可以在同期和历史分离株之间建立进化关系,从而对细菌进化有更明确的理解。此外,这项技术通过提供明确的流行病学信息并确定有助于抗生素耐药性和抗原选择压力来转化医学细菌学的重要潜力。资料来源:Barrow Gi,Feltham RKA,编辑;加里斯总经理,编辑; Kaufmann我; Murray PR,Baron EJ,Jorgensen JH,编辑;欧文·RJ; Schleifer KH; Spratt BG,Feil EJ,Smith NH; Tenover FC,Arbeit Rd,Goering RV; Van Regenmortel MHV,Fauquet CM,Bishop DHL,编辑; Woese Cr。分类类别是称为分类单元的层次组,其中包含一小部分物种,该物种来自一个相对较新的共同祖先。可以在下面可视化整体层次结构以供参考:尽管研究不同生物体的科学家在分类方案中有所不同,但属背后的一般概念是它代表物种祖先相关的物种,并且与其他属不同,不包括不必要的物种。确定这在于每个研究者,但是这些一般指南在属属方面保持分类相当狭窄。属属的分类单元通常包括群体之间可识别的身体形式。例如,Felidae和Canidae分别代表类似猫的生物和类似狗的生物。最后一步,物种定义了在连续单位中共同繁殖的人群和群体。在一起,这些名字告诉您有关生物体的很多信息。在大多数情况下,由于遗传,行为或形态学差异,不同的属将不会繁殖。Carl Linnaeus通过他的生物生物命名计划(二项式命名法)普及了“属”一词,尽管他对属的定义与我们的现代观点有所不同,但在二项式命名法中使用通用epithets在二项式术语中的使用仍在继续。通用称呼是二项式命名法中描述有机体所属属的动物名称的两个单词。第二个单词或特定的称呼描述了有机体所属的生物或物种更紧密相关的群体。通过了解一个人也知道家庭,秩序和所有其他分类分类。由于分层群体是由生物之间的相似性安排的,所以这些关系告诉了我们很多有关单个动物的信息。知道该物种可以告知我们动物与该属中其他动物的独特性。例如,Honey Badger具有科学名称Mellivora Capensis。有时,属可能包含数百种物种,尤其是在鱼类和无脊椎动物中。这种品种具有误导性,因为它应该反映进化。进化多样性决定了属内生物的数量。如果许多物种随着属的传播而出现,将会有许多物种。相反,如果只有一个物种幸存,则只有一个物种。分类分类是一个持续的过程,每天都描述了新的属。一些新发现的生物从未被命名,而另一些有机体则根据DNA分析重新分类。通过分析DNA,比较性状并提出系统发育,科学家假设最可能的进化进展。这将为命名惯例提供信息,并确定哪些物种可以成为独特的属。物种代表属内生殖分离并与其他群体独特的群体。家庭是分层分类中属的分类单元。分类单元是指具有相似特征的群体。两条鱼一起游泳可能不会繁殖,而是具有类似的特征,与其他任何海洋鱼不同。如果它们可以杂交,则将被视为物种。北极熊和棕熊在同一属中是不同的物种,但仍可以成功繁殖。这是因为它们占据了独特的生态位,很少彼此遇到繁殖。生态障碍可以阻止它们自然繁殖,即使它们的后代是可行的。随着气候变化耗尽冰盖,可以将北极熊推向较低的纬度,并可能与棕熊杂交。科学家辩论是否应基于进化连接和物理特征将新物种添加到属中。如果两组共有共同的血统,则它们应属于同一属,即使它们在细胞外基质产生等特征上有所不同。在Fakus细菌的情况下是一种具有相似DNA但缺乏定义该属的独特基质的新物种,分类学家必须权衡多个领域的证据。通过分析解剖学,行为和遗传数据,科学家可以重建生物体之间的关系,并就分类做出明智的决定。