对“种族”差异和种族疾病的研究通常会强调社会状况上的遗传学,这可能是因为某些医学期刊将“种族”的社会“评论”讨论限制为“种族”作为健康的社会决定因素的代理。然而,人类学研究表明,“种族”是社会建构的。从出生前,美国持续的“种族”种族隔离将健康,教育,就业和获得性种族化。我们假设,选择性招募美国军事服务,军事训练和工作的平等机会,并获得了退伍军人管理局的医疗保健,可以减轻因种族化的早期生活剥夺和危害而造成的“种族”差异(即,健康的社会决定因素)。我们检查了老兵地位和医疗保健中最明显的“种族”差异 - 奇妙的肾脏疾病。
最近的一项研究表明,PRS 和 APOL1 基因型的线性组合可增强跨祖先的 CKD 预测。3 然而,该研究并没有进一步调查他们的评分在 APOL1 HR 中的表现。在本文中,我们评估了 PRS 在 APOL1 HR 个体中对 CKD 3 期或更高阶段的表现。我们使用来自 Bio Me(一个电子健康记录链接的多样化临床队列)的非裔美国人 (AA) 个体测试了 PRS,然后在“我们所有人”研究计划数据中验证了结果。我们首先使用与开发最新的 CKD PRS(PRS 3)相同的方法生成了两个新的 PRS(PRS 1 和 PRS 2)(Khan 等人,2022 年)。 3 第一个评分 PRS 1 与 PRS 3 的不同之处在于,我们利用 Bio Me 中具有非洲血统的个体作为优化队列,而不是欧洲血统(图 1)。我们的第二个评分 PRS 2 与 PRS 1 的不同之处在于,我们使用了不同汇总统计数据的效应大小。也就是说,我们根据一项针对 16,474 名非裔美国人队列参与者的 eGFR 的全基因组关联研究 (GWAS) 的汇总统计数据计算了 PRS 2。5 然后,我们测试了这三个评分与 CKD 3 期及以上阶段之间的关联,该关联由 Bio Me 中经过验证的电子算法定义。6 在 All of Us 中,我们使用了基于诊断代码从数据库中预先确定的病例。我们使用 Nagelkerke 的伪 R 2 和来自逻辑回归的调整比值比 (aOR) 计算了 PRS 成分的解释方差
Solubleurokinaseplasminogenactivatorreceptor(suPAR) is the circulating form of urokinase plasminogen activator receptor,aglycosyl-phosphatidylinositol – anchoredmem- brane protein expressed in various cell types including kidneypodocytesandendothelialcells(1).suPARhasbeen associated with a decline in eGFR and the risk of incident在各种临床环境中的CKD或蛋白尿(1)。在美国,与白人相比,黑人的CKD风险较高可能是至少部分属于部分属性的,apol1和镰状细胞性状,这些特质分别发生在大约13%和8%的bllackpeople.hayek等。(2)最近表明,在非裔美国人对肾脏疾病和高血压研究的研究中,SUPAR水平修改了APOL1基因型与EGFR下降之间的关联,以及接受心脏结构化的黑人登记册。在基于社区的黑人成年人样本中,supar和肾功能的关系尚不清楚,尚未评估镰状细胞性状对suPAR的潜在效果修饰。,我们在3343个自我认同的黑人中测量了基线SUPAR水平,以及来自密西西比州杰克逊市和农村地区的3343个自我认同的黑人(杰克逊心脏研究),他们经过了平均遵循的平均8.0 6 0.84年。在基线(2000 - 2004年)和考试3(2009 - 2013)上评估了肾功能。在基线时,参与者的年龄范围从20至93岁(平均55)不等,男性为37%,目前吸烟者为13%,肥胖54%,肥胖57%,糖尿病患者为25%。30 mg/g。基线特征没有DifferBysickleCellor Apol1基因型。Suparlevels在742至10,595之间(中位数2097)PG/mL。基线时,平均EGFR为94 6 22 ml/min,每1.73 m 2,7%的EGFR为EGFR,每1.73 m 2的60 ml/min。在1605 Participantswithspoturinealbumin-creatinineratio(UACR)测量的子集中,基线平均值为49.5 6 277 mg/g,而13%的基线平均值为UACR。具有基线和3年级数据的个体,平均EGFR更改为2 0.004 6 1.96 ml/min每1.73 m 2
引言肾功能衰竭是Covid-19感染的毁灭性并发症。急性肾脏损伤(AKI)复杂的住院和70%的入院和70%的入院率复杂,进而将死亡率风险增加30%至50%(1,2)。肾脏活检病例系列显示,崩溃的肾小球病是COVID-19-与AKI相关的最常见的组织病理学诊断(3)。Covid-19-19-相关的肾病(Covan;也称为COVID-19-相关倒塌的glomerulop- achy)的独特特征是对携带2种载脂蛋白L1(apoL1)的2种风险等位基因的黑人(3,4)。2个风险等位基因(命名为G1和G2)作为APOL1基因中的编码变体出现,并针对非洲锥虫病进行了判断。然而,G1G1,G2G2或G1G2的运输(是高风险基因型)增加了肾脏疾病频谱的风险,并解释了黑人人群非肾脏肾脏疾病的多种过量风险(5-8)。估计有13%的黑人携带高风险的APOL1基因型(7)。在199日大流行期间,研究人员发现,在高风险APOL1基因型的携带者中,有92%的活检证实的Covan病例是,其中有61%在介绍时需要透析(3,9)。这些发现建立了APOL1变体,作为COVID-19健康结果中种族差异的主要因素。尽管这种令人印象深刻的关联,但将高危Apol1 Geno-类型连接到SARS-COV-2感染的细胞机制和Covan崩溃的肾小球病的发病机制仍然未知。高风险APOL1基因型和Covan之间的强烈流行病学关联导致假说,即在足细胞和肾小球内皮细胞(GECS)中coVID-19诱导Apol1 G1或G2的表达 - 在崩溃的肿瘤性肿瘤性疾病中受到collopapsing glomerulopathy persosiss covan covan covan covan covan covan covan。
精确药物需要准确鉴定临床相关的患者亚组。16电子健康记录为利用机器学习的主要机会提供了17种新的患者子组的方法。然而,许多现有的方法未能充分捕获诊断轨迹与疾病之间的复杂相互作用 - 19个相关风险事件,导致亚组在事件20风险中仍然可以显示出很大的异质性,并潜在的分子机制。为了应对这一挑战,我们实施了21个Vadesc-Ehr,这是一种基于变压器的自动编码器,用于聚类从电子健康记录中提取的纵向22生存数据。我们表明,Vadesc-ehr 23在合成和现实世界基准数据集上均优于具有24个已知地面真实集群标签的合成和现实基准数据集的基线方法。在应用于克罗恩病的应用中,vadesc-ehr 25成功地识别了四个不同的亚组,具有不同的诊断轨迹和风险26个特征,从而揭示了克罗恩病的临床和遗传相关因素。我们的结果27表明,Vadesc-ehr可以成为在28中发现精密医学方法的开发中发现新型患者子组的强大工具。29
在狼疮肾炎中,非洲血统患者的肾脏组织中Apol 1风险变异与单细胞转录组学之间的关联,狼疮肾炎(Philip Carlucci,MD),apol1的基因突变,Apolipoprotein L1基因的基因突变可以加速疾病的疾病或疾病的进展。这些遗传变异几乎完全是在非洲血统的个体中发现的,并且与欧洲血统相比,非裔美国人患有狼疮肾炎的非洲裔美国人的结局较差。在吉尔·布鲁恩(Jill Buyon)博士在风湿病学和凯利·鲁格尔斯(Kelly Ruggles)的指导下,在精密医学司的指导下,这项研究利用肾脏活检数据来评估APOL1突变有助于肾脏病发病机理的机制。基于104名非洲血统患者的测序数据,这项研究的主要发现是鉴定肾小管升的薄肢中的apol1表达,以及这些细胞中APOL1表达与肾功能障碍的临床标志物之间的关联。总体而言,这些结果为寻求了解APOL1毒性并转化为临床试验的研究提供了一个新颖的未来方向。
NIDDK 慢性肾病 (CKD) 个体 在恶性载脂蛋白 L1 (APOL1) 中。大约 13% 的非裔美国人和 25% 的西非人携带高风险肾脏基因型,由两种 APOL1 风险变体 G1 和 G2 的任意组合组成。此重新提交的国家糖尿病和消化肾病研究所以患者为导向的研究职业发展奖 (K23) 旨在支持波士顿大学医学院助理教授 Titilayo Ilori 博士,他希望建立专注于机制和介入研究的职业生涯,研究饮食因素和生活方式对资源匮乏和充足环境中 CKD 发病率和进展的影响,特别是在遗传和基因组风险变异的背景下。Ilori 博士之前的研究重点是 CKD 的健康差异以及肾脏疾病中营养相关暴露和结果的二次数据分析。 Ilori 博士打算扩大她的研究范围,设计前瞻性研究来研究饮食中钠和钾在非洲人 CKD 进展和 APOL1 肾病中的作用。因此,她的 K23 培训侧重于获得全球健康研究、CKD 营养和遗传流行病学、纵向数据分析中的统计遗传学和高级生物统计学技能以及 CKD 的生物标志物。我们提出了一个研究项目,利用非洲人类遗传和健康肾脏疾病研究网络并解决以下研究目标:1) 通过对非洲人 24 小时尿液收集进行评估,对饮食中钠、钾和草酸盐摄入量之间的关联进行横断面和前瞻性检查;2) 进行横断面和前瞻性研究以确定饮食模式与 CKD 和 CKD 进展之间的关联; 3) 饮食:基因相互作用研究,以检查饮食因素(钠、钾、草酸盐或饮食模式)是否会改变 APOL1 肾基因型对 CKD 进展的影响。这是一个重要的项目,因为它可以确定饮食因素是否是 SSA 非洲人 CKD 进展的可改变风险因素,而 SSA 的透析和肾移植费用高昂。此外,饮食改变高风险 APOL1 肾风险等位基因患者的肾病风险的证据可能对研究 APOL1 肾病的新治疗靶点很重要。Elijah Paintsil
摘要虽然与欧洲血统(EAS)相比,非洲血统人士(AAS)之间的肥胖症患病率增加与社会,环境和行为因素有关,但没有常见的基因变异,并且与AA种群中肥胖症有显着相关。我们试图探索载脂蛋白L1(APOL1)基因与AAS中肥胖相关性状的祖先特异性肾风险变体之间的关联。我们从3个电子病历中进行了基因型 - 表型关联研究(Bio Me Biobank,Biobank,Biovu,Nugene);随机对照试验(了解和解决肾脏疾病差异的基因检测)和前瞻性队列研究(杰克逊心脏研究)。我们分析了APOL1肾脏风险变体与肥胖(平均体重指数(BMI)以及超重和肥胖的比例)以及身体组成量(在杰克逊心脏研究中)的关联。我们有关于11,930个自我报告的AA成年人的数据。在整个队列中,平均年龄为42岁至49岁,女性百分比从58%至75.3%。具有2个APOL1风险等位基因(AAS的14%)的个体与其他人相比具有30%的肥胖赔率(隐性模型调整后的优势比1.30; 95%的置信间隔1.16 - 1.41; P = 2.75 10 6)。一个加性模型更好地拟合了关联,其中每个等位基因(AAS的47%)将肥胖赔率增加1.13倍(调整后的优势比1.13; 95%的固定间隔1.07 - 1.19; p = 3.07 10 6); p = 3.07 10 6),将BMI增加了0.36kg/m 2(1.1kg,p = 〜1 1kg,p = 〜17 m。apoL1等位基因与整体上的重型身体组成性状无关,但与女性的无脂肪质量指数显着相关[每个等位基因的0.30kg/m 2增量; p = .03]。因此,在AAS的近一半中发现的APOL1基因中的肾脏风险变体与BMI和肥胖以加性方式相关。这些变体可以自行或与环境因素互动,解释肥胖中种族差异的比例。
崩溃的肾小球病(GC)具有严重的病程,通常与病毒感染有关,尤其是HIV和细小病毒B19,全身性红斑狼疮(LES)以及其他病因。一名35岁的女性,最近由于类风湿关节炎引起的JAK抑制剂,表现出两周的发烧,宫颈腺病和面部红斑。入院后,观察到贫血,低珠蛋白血症,蛋白尿和严重的急性肾损伤。在血清样品中检测到细小病毒B19 DNA被诊断出来。肾脏活检显示GC没有任何典型的狼疮肾炎特征。用泼尼松治疗该患者,并在几周后显示出明显改善贫血和肾功能。在这种情况下,LES患者可能是由细小病毒感染引起的B19与载脂蛋白1 G1基因型(APOL1)相关的,该基因型(APOL1)被描述为该肾小球病的决定性危险因素。目前尚不清楚LES是否与肾小球疾病有因果关系,还是伴随的原因。治疗可能具有挑战性,因为没有抗病毒药是有效的,并且免疫抑制没有明显的好处,尽管在这种情况下,使用类固醇在治疗肾脏表现方面是有效的。
抽象背景:鉴定与2型糖尿病风险(T2D)相关的循环生物标志物(T2D)可用于改善最高风险患者的当前预防策略。在这里,我们旨在研究糖尿病前受试者血浆载脂蛋白浓度的关联,并在随访期间与新发作T2D的发生率有关。方法:在IT-DIAB前瞻性研究中,每年遵循5年的空腹葡萄糖水平受损的参与者(禁食等离子体葡萄糖[FPG]:110–125 mg/dl)。随访期间,T2D的发作定义为第一个FPG值≥126mg/dl。载脂蛋白(APO)A-I,A-II,A-IV,B100,C-I,C-II,C-III,C-III,C-II,C-IV,D,E,E,F,H,H,J,J,L1,M和(A)质量浓度由质谱测定。相关性。Kaplan – Meier曲线是使用基于Terciles和Iddist T2D的三元方法来绘制的。使用COX比例危害模型确定血浆载脂蛋白浓度与T2D的发生之间的关联。结果:在5年的中位随访期间,有115名参与者(37.5%)发展了T2D。在调整了年龄,性别,体重指数,FPG,HBA 1C和他汀类药物的使用后,APOC-I,APOC-II,APOC-II,APOC-III,APOE-III,APOE,APOE,APOF,APOF,APOH,APOJ和APOL1的血浆水平与T2D的高风险呈正相关。kaplan – Meier存活曲线还表明,与中部和上部相比,血浆APOE水平的下三分之一(<5.97 mg/dl)与较低的T2D转化风险(对数秩检验,p = 0.002)显着相关。After further adjustment for plasma triglycerides, only apoE (1 SD natural-log-transformed hazard ratio: 1.28 [95% confidence interval: 1.06; 1.54]; p = 0.010), apoF (1.22 [1.01; 1.48]; p = 0.037), apoJ (1.24 [1.03; 1.49]; p = 0.024), and apoL1 (1.26 [1.05; 1.52]; P = 0.014)与T2D的发作显着相关。结论:血浆APOE水平与糖尿病前受试者的T2D风险呈正相关,这是传统危险因素的独立。APOF,APOJ和APOL1与T2D风险的可能关联也为进一步的研究铺平了道路。试验注册此试验在clinicaltrials.gov上注册为NCT01218061和NCT01432509
