哺乳动物基因组编码了近 50 种 ATP 结合盒 (ABC) 转运蛋白。这些转运蛋白的特点是保守的核苷酸结合和水解(即 ATPase)结构域,以及将各种底物类别(离子、小分子代谢物、外来生物、疏水性药物甚至多肽)定向转运进或转运出细胞或亚细胞器。尽管 ABC 转运蛋白的免疫功能才刚刚开始被揭示,但新兴文献表明这些蛋白质在 T 淋巴细胞的发育和功能中发挥着未被充分重视的作用,包括在感染、炎症或癌症反应过程中出现的许多关键效应子、记忆子和调节子集。一种特别的转运蛋白 MDR1(多药耐药性-1;由人类的 ABCB1 基因座编码)已成为免疫调节中的新参与者。尽管 MDR1 仍被广泛视为肿瘤细胞中的一种简单药物效应泵,但最近的证据表明,这种转运蛋白在增强活化 CD4 和 CD8 T 细胞的代谢适应性方面发挥着关键的内源性作用。本文,我们总结了目前对 ABC 转运蛋白在免疫调节中的生理功能的理解,重点关注 MDR1 的抗氧化功能,这种功能可能决定抗原特异性效应和记忆 T 细胞区室的大小和库。虽然关于 ABC 转运蛋白在免疫生物学中的功能仍有许多需要了解的地方,但已经清楚的是,它们代表着一片肥沃的新天地,既可用于定义新的免疫代谢途径,也可用于发现可用于优化对疫苗和癌症免疫疗法的免疫反应的新药物靶点。
在原核生物和真核生物中,大多数已鉴定的离子泵 ATPase 属于以下三种结构类型之一。(i)F1Fo ATPase(F 型)存在于线粒体内膜(2)、叶绿体类囊体膜(3)和细菌细胞质膜(4)中。(ii)E1E2 ATPase(P 型)存在于真菌(5)、植物(6)和动物的细胞质膜中[包括 Na',K4-ATPase(7)和 H +,K + -ATPase(8)],以及肌细胞的肌浆网(Ca 2+-ATPase)(9)和细菌细胞质膜(K+-ATPase)(10,11)。 (iii) 已鉴定出第三类 ATPase(V 型),并从真菌和植物液泡(参考文献 12 及其中的参考文献)、包被囊泡(13、14)和嗜铬颗粒(15、16)的膜中部分纯化。正如 Mellman 等人(17)所建议的,我们使用术语“液泡 ATPase”来指代第三类 ATPase。F1Fo ATPase 通常使用 H+ 的电化学梯度(18)或偶尔使用 Na+ 梯度(19)来合成 ATP。这种类型的酶也表现出 ATPase 活性,在某些情况下仅在用蛋白酶活化后才表现出 ATPase 活性(20)。叠氮化物和 N,N'-二环己基碳二酰亚胺可抑制 F1Fo ATPase 的酶活性;寡霉素也可抑制线粒体 ATPase(21)。在 E1E2 ATPases 中,ATP 水解释放的能量与阳离子跨膜转运偶联。酶循环通过构象状态,包括形成磷酸化中间体。酶活性不受叠氮化物或寡霉素的影响,但被钒酸盐特异性抑制,在大多数情况下被 N-乙基马来酰亚胺和异硫氰酸荧光素抑制,而对于 Na4 ,K4-ATPase,则被乌巴因抑制 (5-11)。液泡 ATPases 似乎会水解 ATP,产生质子梯度,用于酸化细胞内区室 (12、17、22)。这组 ATP 酶因其抑制剂特异性而与其他两组 ATP 酶区分开来。液泡 ATPase 不受叠氮化物、寡霉素、钒酸盐或乌巴因的抑制。相反,
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RNA位置p。 13-互动凝胶电泳实验室 - 观看有用的视频:蛋白质;转录;翻译 - 使用此文档进行修订的主要概念:ENG / AFR-在此处对DNA和RNA上的自我标记测验 - 在此处找到有关此主题的修订练习 - 在p上修改此主题的术语。 113单元1RNA位置p。 13-互动凝胶电泳实验室 - 观看有用的视频:蛋白质;转录;翻译 - 使用此文档进行修订的主要概念:ENG / AFR-在此处对DNA和RNA上的自我标记测验 - 在此处找到有关此主题的修订练习 - 在p上修改此主题的术语。 113单元1
全基因组CRISPR/CAS9屏幕鉴定出ATP2A2,该基因编码sarco/ca 2+ -ATPase(SERCA)2蛋白,对V(d)J重组很重要。SERCAS是ER跨膜蛋白,可将Ca 2+从胞质液泵入ER管腔中,以维持ER Ca 2+储层并调节胞质Ca 2+依赖性过程。在PERB细胞中,SERCA2的丢失导致V(D)J重组动力学减少,这是由于抹布介导的DNA裂解减少。B细胞中的SERCA2缺乏会导致SERCA3的表达增加,SERCA2和SERCA3的综合损失导致ER Ca 2+水平降低,胞质Ca 2+水平升高,RAG1和RAG2基因表达的降低以及V(D)J重组的深刻障碍。由杂合ATP2A2突变引起的SERCA2和人类缺乏B细胞的小鼠,成熟的B细胞数量减少。我们得出的结论是,SERCA蛋白调节细胞内Ca 2+水平以调节RAG1和RAG2基因表达以及V(D)J的重组以及SERCA功能的缺陷会导致淋巴细胞减少。
叶绿体ATP合酶包含质体和核遗传来源的亚基。为了研究这种复合物的协调生物发生,我们通过筛选绿色藻类衣原体中的新型ATP合酶突变体,通过筛选高光灵敏度。我们在这里报告了影响两个外围茎亚基B和B 0的突变体的表征,该突变体由ATPF和ATPG基因编码,以及三个鉴定核因子MDE1的独立突变体,这些突变体稳定叶绿体编码的ATPE mRNA所需的核因子MDE1。全基因组测序显示在ATPG的3 0 UTR中插入了转座子插入,而质谱显示在此敲低ATPG突变体中,功能性ATP合酶的一小部分积累。相反,通过CRISPR-CAS9基因编辑获得的敲除ATPG突变体,完全防止ATP合酶功能和积累,这也是在ATPF框架转移突变体中观察到的。与主要类囊体蛋白酶的FTSH1-1突变体穿越ATP合酶突变体将ATPH鉴定为FTSH底物,并表明FTSH显着促进了ATP合酶亚基的一致积累。在MDE1突变体中,不存在ATPE转录物完全阻止ATP合酶的生物发生和光合作用。使用嵌合ATPE基因营救ATPE转录本的积累,我们证明了一种新型的八度肽重复(OPR)蛋白MDE1遗传靶向ATPE 5 0 UTR。从主要内部生物生物症(〜1.5 Gy)的角度来看,将MDE1募集到其ATPE靶标招募了一个核/叶绿体相互作用的典范,这些相互作用是在最近进化的,在叶绿体的祖先中,我的cs cs cs exestor higlophyceae的祖先,〜300。
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与市场联系,资金获得,企业能力,缓解气候的适应性,盈利能力,增长以及赞比亚所有十个省的农民和企业的韧性有关。将通过以下方式实现:i)能力建设和/或业务发展服务,以指导项目受益人,包括财务管理,良好的农业和制造实践,商业弹性,食品安全标准,数字化和气候智能农业等主题; ii)解决协调失败,信息不对称和沿着价值链的集成不足; iii)增加了对增加价值,产品和过程升级,标准和认证,品牌和营销,技术采用以及高技能和管理培训的投资,尤其是针对妇女和农村青年。该组成部分计划的干预措施直接支持两组受益人:通过合作社或生产者组织(POS)和高增长农业综合企业相关联的小型和边缘农民。因此,该组件具有三个子组件:(a)MarketConnect; (b)生产联盟; (c)信用额度(LOC)。有关该项目的其他两个组件的信息,可以在项目评估文件中获得,可根据要求提供正式使用。
会损害另一种药物的吸收,从而导致可能致命的药理作用。由于有关 OATP 抑制机制的信息有限,并且不同研究中的实验性 OATP 抑制数据不一致,因此预测 OATP 介导的 DDI 具有挑战性。本研究引入了异构 OATP-配体相互作用图神经网络 (HOLIgraph),这是一种新颖的计算模型,它将分子建模与图神经网络相结合,以增强对药物诱导的 OATP 抑制的预测。通过将配体(即药物)分子特征与来自严格对接模拟的蛋白质-配体相互作用数据相结合,HOLIgraph 的表现优于仅依赖配体分子特征的传统 DDI 预测模型。HOLIgraph 在预测 OATP1B1 抑制剂时实现了超过 90% 的中位平衡准确度,明显优于纯基于配体的模型。除了改善抑制预测之外,用于训练 HOLIgraph 的数据还可以表征参与抑制药物-OATP 相互作用的蛋白质残基。我们确定了某些优先与抑制剂相互作用的 OATP1B1 残基,包括 I46 和 K49。我们预计此类相互作用信息将对未来对 OATP1B1 的结构和机制研究很有价值。科学贡献。HOLIgraph 通过将对接模拟得出的蛋白质-配体相互作用纳入图神经网络框架,为 DDI 预测引入了一种新范式。这种方法得益于 OATP1B1 的最新结构突破,与仅依赖配体特征的传统模型有很大不同。通过实现高预测准确性和揭示机制见解,HOLIgraph 为药物设计和 DDI 预测中的计算工具设定了新的轨迹。