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使用 CRISPR 激活剂定制设计本氏烟叶中的代谢物组成
摘要基于 CRISPR 结构的转录调控因子扩展了我们重新编程植物内源基因表达的能力。它们的潜在应用之一是通过激活给定代谢途径中的选定酶来定制植物代谢组。使用之前描述的可多路复用的 CRISPR 激活剂 dCasEV2.1，我们测定了烟草叶中四种不同黄酮类化合物（即柚皮素、圣草酚、山奈酚和槲皮素）的选择性富集。在仔细选择目标基因和引导 RNA 组合后，我们为这四种代谢物中的每一种创建了成功的激活程序，每个程序激活 3 到 7 个基因，单个基因激活水平范围为 4 到 1500 倍。对每个多基因激活程序的黄酮类化合物谱进行代谢分析显示，目标代谢物及其糖基化衍生物的富集明显且具有选择性。值得注意的是，非目标代谢谱的主成分分析根据其活化处理清楚地区分了样品，而层次聚类将样品分成五组，对应于预期的四个高度富集的代谢物组和一个未活化的对照。这些结果表明，dCasEV2.1 是一种强大的工具，可以重新引导代谢通量以积累感兴趣的代谢物，为植物中代谢内容的定制设计打开了大门。
托法替尼介导的Janus激酶/信号转导子和转录激活子信号通路抑制对胶原蛋白生物合成的影响
摘要 目的：本研究旨在研究托法替尼抑制 Janus 激酶/信号转导和转录激活因子 (JAK/STAT) 通路对成纤维细胞培养中胶原生物合成的影响。材料和方法：BJ-CRL-1474®（皮肤）和 BRL3A®（肝脏）成纤维细胞培养物在合适的培养基中增殖。将托法替尼以 25、50、100、200、400 和 800 nM 的浓度施用于 96 孔烧瓶中增殖的成纤维细胞。使用酶联免疫吸附测定法测量金属蛋白酶组织抑制剂 1 (TIMP-1)、基质金属蛋白酶 3 (MMP-3)、转化生长因子 β 1 (TGF-β1) 和羟脯氨酸水平。结果：托法替尼对皮肤和肝细胞培养物有细胞毒性作用。托法替尼的细胞毒性作用始于 100 nM（p<0.05）。在 800 nM 时效果最强。托法替尼的时间依赖性细胞毒性作用在所有浓度下 72 小时后均显著高于 24 和 48 小时（p<0.05）。即使在 25 nM 的托法替尼浓度下，TGF-β1 水平也显著降低（p<0.05）。托法替尼给药后，MMP-3、TIMP-1 和羟脯氨酸水平显著下降（p<0.05）。结论：托法替尼以浓度依赖性方式抑制成纤维细胞培养物中的成纤维细胞增殖。然而，需要进一步进行广泛的动物和人体研究以确定这种影响的临床意义。
与不同的NAD+前体组合的代谢激活剂在神经退行性疾病的动物模型中改善了代谢功能
1杀人生命实验室科学，KTH - 皇家技术学院，171 65斯德哥尔摩，瑞典； oaltay@kth.se（O.A。 ）; hong.yang@scilifelab.se（H.Y. ）; cheng.zhang@scilifelab.se（C.Z. ）; mathias.uhlen@scilifelab.se（m.u.） 2土耳其埃祖鲁姆大学兽医学院病理学系，土耳其； syildirim@atauni.edu.tr（s.y。 ）; ismail.bolat@atauni.edu.tr（i.b.） 3土耳其埃祖鲁姆大学兽医学院药理学和毒理学系，土耳其； cemil489@gmail.com 4分子生物学和遗传学系，科学学院，Erzurum技术大学，Erzurum 25240，土耳其； senaoner02@gmail.com（s.o. ）; ozlem.ozdemir@erzurum.edu.tr（O.O.T。 ）; enesiyte@gmail.com（M.E.A。） 5，阿塔图克大学医学院医学药理学系，土耳其Erzurum 25240； ahmeth@atauni.edu.tr 6主机 - 麦片互动中心，牙科学院，口腔和颅面科学学院，伦敦国王学院，英国伦敦SE1 9rt，英国伦敦伦敦； saeed.shoaie@kcl.ac.uk 7分子与临床医学系，哥德堡大学Sahlgrenska大学医院，瑞典413 45； jan.boren@wlab.gu.se 8，阿塔图克大学医学院医学系，土耳其Erzurum 25240； hasanturkez@yahoo.com *通信：adilm@scilifelab.se1杀人生命实验室科学，KTH - 皇家技术学院，171 65斯德哥尔摩，瑞典； oaltay@kth.se（O.A。）; hong.yang@scilifelab.se（H.Y.）; cheng.zhang@scilifelab.se（C.Z.）; mathias.uhlen@scilifelab.se（m.u.）2土耳其埃祖鲁姆大学兽医学院病理学系，土耳其； syildirim@atauni.edu.tr（s.y。）; ismail.bolat@atauni.edu.tr（i.b.）3土耳其埃祖鲁姆大学兽医学院药理学和毒理学系，土耳其； cemil489@gmail.com 4分子生物学和遗传学系，科学学院，Erzurum技术大学，Erzurum 25240，土耳其； senaoner02@gmail.com（s.o.）; ozlem.ozdemir@erzurum.edu.tr（O.O.T。）; enesiyte@gmail.com（M.E.A。）5，阿塔图克大学医学院医学药理学系，土耳其Erzurum 25240； ahmeth@atauni.edu.tr 6主机 - 麦片互动中心，牙科学院，口腔和颅面科学学院，伦敦国王学院，英国伦敦SE1 9rt，英国伦敦伦敦； saeed.shoaie@kcl.ac.uk 7分子与临床医学系，哥德堡大学Sahlgrenska大学医院，瑞典413 45； jan.boren@wlab.gu.se 8，阿塔图克大学医学院医学系，土耳其Erzurum 25240； hasanturkez@yahoo.com *通信：adilm@scilifelab.se5，阿塔图克大学医学院医学药理学系，土耳其Erzurum 25240； ahmeth@atauni.edu.tr 6主机 - 麦片互动中心，牙科学院，口腔和颅面科学学院，伦敦国王学院，英国伦敦SE1 9rt，英国伦敦伦敦； saeed.shoaie@kcl.ac.uk 7分子与临床医学系，哥德堡大学Sahlgrenska大学医院，瑞典413 45； jan.boren@wlab.gu.se 8，阿塔图克大学医学院医学系，土耳其Erzurum 25240； hasanturkez@yahoo.com *通信：adilm@scilifelab.se
高级材料处理系统中的传输通道
calpain活性的调节剂：抑制剂和激活剂作为潜在药物LeventeEndreDókus，Mo'Ath Yousef＆ZoltánBánócziPharmaceutics 2020，15（4），471-486，doi：10.1080/17460444441.2020.1722638 https://doi.org/10.1080/17460441.2020.1722638
EPRA-BC技术产品列表
Activators Basal digital thermometers Breathing Therapy or Monitoring Device Blood pressure monitors Comlink, diabetes informatics Console controllers Defibrillators ECG electrodes Electronic pipetters for non-clinical application Handheld meters with charger Hearing aids Lesion probes, radiofrequency Medical monitoring equipment Electronic肌肉护发素（或类似Tens的装置）减轻疼痛或抗偏毛机设备起搏器，外部PhysioControl System
耐用基因激活的超紧缩表观遗传调节剂的发现和工程
为了解决这些局限性，在这里，我们进行了高吞吐量筛选，以发现人，病毒和古细菌蛋白质组之间的新型转录调节剂，并在多种内源性人类环境中表征其功能。我们使用不同的DCAS系统中的病毒蛋白质组中识别出具有特殊鲁棒性的紧凑，有效的活化剂，其在各种细胞类型中具有出色的鲁棒性。从预测的三维结构和机器学习模型中获得的见解使我们能够在效力和持久性方面合理地改善激活剂。值得注意的是，工程活化剂在短暂递送后实现了有丝分裂耐用的基因激活。
SIRTUIN激活剂和抑制剂开发的当前趋势
摘要：Sirtuins是NAD +依赖性蛋白脱酰酶和关键的代谢调节剂，将细胞能态与选择性赖氨酸脱酰基耦合以调节许多下游细胞过程。人类编码具有不同亚细胞定位和脱酰基酶靶标的七个SIRTUIN同工型（SIRT1-7）。sirtuins被认为是保护性抗衰老蛋白，因为增加的Sirtuin活性在范围内与寿命延长相关，并且随着与衰老相关的疾病的发展而减少了活性。然而，Sirtuins还可以在活性增加有助于病理生理学的情况下扮演有害细胞的作用。因此，激活剂和抑制剂对SIRTUIN活性的调节具有定义Sirtuins在健康和疾病中的细胞作用以及发展疗法的巨大潜力。本综述不再是全面的，而是讨论了迄今为止可用的良好表征的Sirtuin活化剂和抑制剂，尤其是那些具有选择性，效力和细胞活性的抑制剂。本评论还提供了有关Sirtuin调制器发现和改进的实用研究的最佳Sirtuin激活剂和抑制剂的建议。
通过优化SGRNA ...
摘要aflysam/crispra系统最近已成为果蝇果蝇（Drosophila Melanogaster）的功能性研究的强大工具。该系统包括GAL4/UAS驱动的DCAS9激活剂和U6促进器控制的SGRNA。建立了超过其他组合的DCAS9激活剂，以进一步提高靶向激活剂的效率，我们系统地优化了SGRNA的参数。有趣的是，发现最有效的SGRNA在转录起始位点（TSS）上游的-150bp到-450bp的区域积累，并且激活效率显示与SGRNA靶向序列的GC含量的正阳性相关性很强。此外，目标区域主要是GC含量，因为SGRNA的靶向区域超过-600BP，即使含有75％的GC，TSS的SGRNA都会降低效率。令人惊讶的是，当将靶向sgrNA的活性与DNA链的活性进行比较时，靶向非模板链的SGRNA靶向均优于互补的模板链，无论是在细胞和体内。总而言之，我们定义了SGRNA设计的标准，这将极大地促进CRISPRA在功能奖励研究中的应用。
各种生物活化器的有效性可以加快堆肥过程和堆肥肥料的质量。
摘要 - 有机废物已成为城市地区的一个大环境问题。食物浪费和植物废物是来自家庭，校园环境和食品行业的有机废物的一部分。这种有机废物的占垃圾填埋场中处置的总废物的比例很高。有机废物还污染了环境，导致严重的温室气体排放。扔掉食物垃圾会产生甲烷气体，这对环境有害并导致全球变暖。为了避免食物浪费的甲烷气体和环境污染的大规模生产，非常重要的是，通过鼓励浪费回收利用，例如通过堆肥过程中的农业中使用诸如农业中的有机肥料之类的废物来最大程度地减少食物浪费。因此，有必要寻找可以通过SNI产生堆肥质量来加速堆肥过程的生物激活剂。本文介绍了可以加速堆肥速率的各种生物激活剂的使用的回顾。研究表明，已经使用了各种生物激活剂来源来堆肥食物浪费，例如水果，蔬菜，植物纤维和农业废物。需要进一步的研究来查看生物激活剂在堆肥过程中更好地组合。
从 DNA 到 RNA：RNA 转录和 mRNA 加工
9/03/24 Alberts 的第 6 章 – 第 1 部分：DNA 到 RNA • RNA 转录 • RNA 加工 • 一些相关的 CMB 技术 9/05/24 第 7 章 - 基因表达的控制 • 转录因子 • 激活因子和抑制因子 • RNAi + 文章讨论