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文章 图像质量对细菌分类模型性能的影响研究 Treesukon Treebupachatsakul 1,a , Wanwalee Chomkwah 1 ,
2 泰国曼谷拉卡邦先皇理工学院信息技术学院，1 Chalong Krung 1 Alley，Ladkrabang，Bangkok 10520，泰国电子邮件：a treesukon.tr@kmitl.ac.th，b，* suvit@it.kmitl.ac.th（通讯作者）摘要。深度学习模型构建中监督学习的关键要求之一是用于训练和验证的数据集。为了收集数据集，从不同资源获取各种质量的图像是不可避免的，这被认为会影响监督模型的性能。本研究旨在证明涉及从两个不同资源获得的高和标准数据集的图像质量对模型性能的影响。对具有革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌数据集的各种细胞特征进行了试验。这些不同的数据集被匹配并贡献了 5 个案例；案例 1：使用高质量图像进行训练和测试，案例 2：使用高质量图像进行训练并使用标准质量图像进行测试，案例 3：使用标准质量图像进行训练和测试，案例 4：使用标准质量图像进行训练并使用高质量图像进行测试，以及案例 5：结合这两种图像质量进行训练和测试。实施了预训练的 CNN 模型来证明使用和不使用分层 K 折交叉验证的目的。重新训练模型的结果表明，高性能模型需要从与测试集相同资源中获得的高质量数据集，在具有挑战性的未知数据集上进行测试时，这些数据集可产生超过 90% 的所有性能评估指标。这项研究为构建可用于自动化微生物诊断的高性能模型提供了宝贵的见解，对公共卫生和临床实践产生了影响。
分析微藻 - - 细菌种群的变化，以响应改善废水处理的环境参数
1。pormidium。camptonemaplanktothrixOscillas ......................................................................... Tychonema lyngbya 134 6。 pleurocapsa 134 7。 Pseudanaaaaena 135 8。 leptolyngby 135Oscillas .........................................................................Tychonemalyngbya 134 6。pleurocapsa 134 7。Pseudanaaaaena 135 8。leptolyngby 135
Bactivac主管，细菌疫苗网络
BACTIVAC是一个遍布92个国家 /地区的2,000多名成员的全球网络，其一个健康使命是加快针对与低收入和中等收入国家（LMIC）（LMIC）有关的全球细菌感染的疫苗开发。成立于2017年，目前由英国研究与创新（UKRI），惠康和英国政府卫生与社会护理部（DHSC）资助，Bactivac汇集了一个可持续网络中的学术界，行业和政策部门的成员。BACTIVAC支持协作项目，这些项目针对疫苗开发中的瓶颈，监督对早期研究人员的培训，并且是国际认可的细菌疫苗及其在降低抗菌耐药性中的作用的声音。
扫描电子显微镜研究菌丝细胞外基质中细菌生长的研究
真菌和细菌都生活在各种环境中，它们的相互作用在许多过程中都很重要，包括土壤健康，人类和动物生理以及生物技术应用。很难建立这些微生物之间相互作用的特异性。例如，与互动或反性相互作用相比，由于随机混合而导致的琐碎过程之间的分化。在这里，我们研究了菌丝形成生物膜形成液体培养物中浮游细菌生长共培养的单一形态学特征。也就是说，枯草芽孢杆菌的细菌共同援助因子附着于物种Hericium erinaceus的真菌菌丝。开发并利用了细菌中的细菌方法，可通过遏制在细胞外聚合物物质（EPS）和菌丝体整体细胞外基质（ECM）中连接细菌。由于产生EPS，启动结构似乎是由菌丝表面造成的。 T1-3的平均生物膜面积为3.90（µm 2）±0.72（µm 2），平均百分比覆盖率为18.33（％）±5.52（％）。 由于存在连接单个细菌和菌丝的结构，因此不能排除细菌生物膜成分的共同归因于附着结构的形成。启动结构似乎是由菌丝表面造成的。T1-3的平均生物膜面积为3.90（µm 2）±0.72（µm 2），平均百分比覆盖率为18.33（％）±5.52（％）。由于存在连接单个细菌和菌丝的结构，因此不能排除细菌生物膜成分的共同归因于附着结构的形成。
治疗肠漏症的成分对培养细菌属性的影响
摘要：消费者比以往任何时候都更加了解药草、多酚、蘑菇、氨基酸、蛋白质和益生菌等功能性成分。与酸奶及其益生菌一样，L-谷氨酰胺、槲皮素、榆树皮、蜀葵根、N-乙酰-D-葡萄糖胺、甘草根、舞茸和乳清酸锌已通过肠道微生物群显示出对健康有益。这些成分对酸奶发酵剂细菌特性的影响尚不清楚。本研究的目的是确定这些成分对益生菌特性、对胃液和溶菌酶的耐受性、蛋白酶活性以及嗜热链球菌 STI-06 和保加利亚乳杆菌 LB-12 活力的影响。在培养 0、30、60、90 和 120 分钟时测定耐酸性，在培养 0、4 和 8 小时时分析耐胆汁性。在培养 0、2、4、6、8、10、12、14 和 16 小时时测定微生物生长，在培养 0、12 和 24 小时时评估蛋白酶活性。使用蜀葵根、甘草根和榆树皮可提高嗜热链球菌的耐胆汁性和耐酸性。这些成分对保加利亚乳杆菌在培养 8 小时和 120 分钟时（分别）的耐胆汁性、耐酸性和模拟胃液性特征没有影响。同样，嗜热链球菌和保加利亚乳杆菌的生长不受这些功能成分的影响。使用蜀葵根、N-乙酰-D-葡萄糖胺和舞茸可显著提高嗜热链球菌的蛋白酶活性，而保加利亚乳杆菌的蛋白酶活性不受任何成分的影响。与对照相比，蜀葵根和槲皮素样品在模拟胃液和溶菌酶体外抗性试验中分别具有更高的嗜热链球菌平均对数计数和对数计数。对于保加利亚乳杆菌，甘草根、槲皮素、蜀葵根和榆树皮样品的对数计数高于对照样品。
o r i g i n a l r e s a r c h抗菌耐药性监测皮肤和软组织感染：医院范围内的细菌种类和抗体
目的：尽管皮肤和软组织感染（SSTIS）是常见的，但坦桑尼亚的抗菌耐药性（NAP-AMR）的国家作用计划集中于血流感染和尿路感染。这项研究评估了实验室确认的SSTI的比例，鉴定了所涉及的细菌物种，分析AMR表型，并研究了与多药耐药（MDR）SSTI相关的危险因素。患者和方法：分析横断面研究是在2023年1月至6月之间进行的，涉及614例SSTIS患者。患者的信息，并使用标准微生物程序，WHONET和Stata软件程序收集并分析了PUS拭子或脓液或坏死组织。结果：患者的中位年龄（四分位间范围）为34（14-54）年，男性占54.4％。实验室确认的SSTI为72.5％（445/614），得出586个细菌分离株。最常见的SSTIS类型是手术部位感染（30.0％），慢性伤口（27.9％）和创伤性伤口（19.7％）。最常见的病原体是金黄色葡萄球菌（17.1％），大肠杆菌（17.1％）和K.肺炎（16.0％）。鉴定出的AMR表型是金黄色葡萄球菌抗甲氧西林的29.0％；延长的谱β乳糖酶产生革兰氏阴性细菌，47.3％；和碳苯甲基阴性细菌，12.9％。与门诊患者相比，住院患者的总体SSTIS为40.9％（251/614），在住院患者中显着高于[或（95％CI）； p值：1.86（1.33–2.59）; p值<0.001]。结论：大约四分之三的患者已实验室确认的SSTI主要由MDR病原体引起。建议对BMC的SSTIS治疗指南进行重新访问，并建议在坦桑尼亚正在进行的AMR监视中纳入SSTIS。
基于高通量定量PCR
Aurore Loquet，RémiLeGuern，Teddy Grandjean，Claire Duboyez，Marvin Baudin等。基于高促销定量PCR的孕妇，用于孕妇的Bacertill阴道病诊断的克拉斯菌和回归树。分子诊断杂志，2021，23（2），pp.234-241。10.1016/j.jmoldx.2020.11.004。hal-03311394
法国可通过疫苗预防的儿童急性细菌性脑膜炎：19 年前瞻性国家监测网络的时间序列分析
背景：在法国，已实施针对 Hi 血清型 b (Hib)、肺炎球菌结合疫苗 (PCV) 和 C 群脑膜炎奈瑟菌 (MenC) 的疫苗接种。这些具有不同覆盖率和接受度的干预措施扰乱了疫苗可预防的急性细菌性脑膜炎 (ABM) 的流行病学。方法：我们分析了法国前瞻性监测网络的数据，该网络对 259 个儿科病房登记的 15 岁以下儿童的 ABM 进行了监测（估计全国覆盖率：61%）。从 2001 年到 2020 年，使用分段线性回归估计了疫苗实施的效果。结果：我们分析了 7,186 例病例，主要由脑膜炎球菌 (35.0%)、肺炎球菌 (29.8%) 和 Hi (3.7%) 引起。比较接种 MenC 疫苗前和接种 MenC 疫苗后的趋势，MenC ABM 发病率下降（-0.12%/月，95% CI：-0.17 至 -0.07，P < 0.001），而总体脑膜炎球菌 ABM 没有变化。尽管在没有疫苗接种计划的情况下，MenB ABM 发病率有所下降（-0.43%/月，95% CI：-0.53 至 -0.34，P < 0.001），但 68.3% 的脑膜炎球菌 ABM 涉及 MenB。PCV7 建议实施后，肺炎球菌 ABM 发病率没有变化。相比之下，改用 PCV13 后，发病率显著下降（-0.9%/月，95% CI：-1.6 至 -0.2%，P = 0.01）。 2014 年 5 月后，出现了反弹（0.5%/月，95% CI：0.3–0.8%，P < 0.001），89.5% 为非 PCV13 疫苗血清型。2017 年 6 月后，Hib ABM 发病率上升。结论：法国引入 PCV7 和 MenC 疫苗，疫苗接种速度慢，覆盖率低，与覆盖率最佳时从 PCV7 转换为 PCV13 相比，影响不大。我们的数据表明，MenB 和下一代 PCV 可以预防法国大部分 ABM 发病率。
研究文章中肉类培养物和血液培养的效用在儿科患者的治疗中
结果：接受ABR的78名患者需要手术干预。患者为76％的男性，在2到202个月大（平均127个月，SD 47.6）之间。34.6％的颅内并发症。在轨道并发症的78.2％中，被诊断为轨道并发症，有48.7％的轨道蜂窝织炎，有38.4％的腹膜下脓肿。 脓肿的存在是手术的最常见指征，平均脓肿长度为23.7mm。 59名患者需要重复ESS。 15例患者接受了MMCX，而55例患有BCX。 60％的MMCX和5.5％的BCX与手术培养物相对应。 百分之八十七的BCX没有生物的生长。 在Fischer的精确检验中，金黄色葡萄球菌对MMCX的生长在预测手术培养的生长方面具有统计学意义（P = 0.009）。被诊断为轨道并发症，有48.7％的轨道蜂窝织炎，有38.4％的腹膜下脓肿。脓肿的存在是手术的最常见指征，平均脓肿长度为23.7mm。59名患者需要重复ESS。15例患者接受了MMCX，而55例患有BCX。60％的MMCX和5.5％的BCX与手术培养物相对应。 百分之八十七的BCX没有生物的生长。 在Fischer的精确检验中，金黄色葡萄球菌对MMCX的生长在预测手术培养的生长方面具有统计学意义（P = 0.009）。60％的MMCX和5.5％的BCX与手术培养物相对应。百分之八十七的BCX没有生物的生长。在Fischer的精确检验中，金黄色葡萄球菌对MMCX的生长在预测手术培养的生长方面具有统计学意义（P = 0.009）。