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在山羊冷应力下，先天免疫和瘤胃菌群之间的串扰
对温度变化敏感的微生物组的平衡在维持整体健康和降低疾病风险方面起着至关重要的作用。然而，免疫力和微生物群相互作用以适应冷应激的特定机制尚未解决。在这项研究中，选择南江黄山羊作为模型，并在寒冷（冬季，冷应激）和温暖（春季）季节进行采样。对血清免疫因子以及瘤胃和粪便微生物群落的组成进行了分析，以探索在冷应激下微生物群和先天免疫之间的串扰。与温暖季节相比，在寒冷季节观察到IgA水平的显着升高（p <0.01）。相反，在冷应激下，IL-2（p = 0.02）和IL-6（p <0.01）的水平降低。但是，在IgG（p = 0.89），IgM（p = 0.42）和IL-4（p = 0.56）中没有观察到显着差异。虽然在温暖和寒冷的季节之间没有细菌群落多样性的显着变化，但观察到血清IGA，IL-2，IL-6浓度和几个属之间的正相关。此外，加权基因共表达网络分析表明，富含Mebrown模块的微生物群与IgA呈正相关，而微生物群富含Meblue模块与IL-2和IL-6正相关。某些益生菌（包括Alistipes，bacteroides，blautia和prevotellaceae _ucg.004）和IL-2的浓度和IL-6之间的强相关性表明它们在免疫调节特性中的潜在作用。这项研究在冷压力的挑战下对微生物群落和免疫反应之间的串扰提供了宝贵的见解。对这些益生菌的免疫调节特性的进一步研究将有助于发展策略，以增强动物的压力抵抗力，以改善整体健康和生存。
组合组学揭示了杜罗葡萄酒产区真菌和细菌的微生物生态位与葡萄酒挥发性特征之间的关联
葡萄酒微生物群落建立了复杂的生态系统，调节香气化合物的形成，但只有少数研究寻求特定微生物与葡萄酒挥发性物质之间的相关性。本研究结合了代谢条形码和代谢组学，以识别与杜罗河标志性地区 3 个著名品种的葡萄酒挥发性特征相关的真菌和细菌微生物生态位。在整个自然发酵过程中，鉴定了三个主要的微生物生态位，并且 Hanseniaspora - Saccharomyces 的演替时间取决于品种。最大的生态位包括 Hansenias pora、Aureobasidium、Alternaria、Rhodotorula、Sporobolomyces、Massilia、Bacillus、Staphylococcus 和 Cutibacterium，它们与 7 种代谢物呈正相关，即乙偶姻、乙酸异戊酯、丙酸乙酯、c-3-己烯醇、苯乙醚和 4-乙基苯酚。发酵酵母S. cerevisiae、Torulaspora delbrueckii和Meyerozyma caribbica与γ-丁内酯、t-威士忌内酯、异戊醇、癸酸乙酯、异丁酸乙酯、琥珀酸二乙酯、异戊酸、4-乙基愈创木酚和4-丙基愈创木酚呈强相关性。 Lachancea quebecensis 与几种致病真菌（青霉菌、白粉病菌、核盘菌、曲霉菌、Mycosphaerella tassiana）和细菌（假单胞菌属、酸拟杆菌、泛菌、Steno trophomonas 和 Enhydrobacter）聚类，与各种单萜醇和降异戊二烯类化合物（包括芳樟醇和 β-紫罗兰酮）呈正相关，此外还与苯甲醇、二乙酰、乙酸异丁酯、乙基香草酸酯和甲基香草酸酯呈正相关。代谢物-微生物群相关性表明品种特异性可能是区域芳香特征的基础。
芬兰益生菌干预队列中的13年随访期间与过敏性鼻炎相关的早期肠道菌群
据报道会影响过敏疾病风险的摘要围产期和早期生命因素可能是由肠道菌群变化介导的。在这里，我们探索了婴儿肠道菌群与童年时期的过敏性发病率之间的关联，直到13岁的植物益生菌干预队列中。从怀孕的第36周，直到6个月大的母亲，将四种益生菌菌株与半紫糖类的混合物与半紫糖类的混合物施加给母亲。在2岁和5岁的儿科医生中监测婴儿的湿疹，食物过敏，过敏性鼻炎和哮喘的表现；过敏状态随后由10岁和13岁的问卷验证。通过16S rRNA扩增子测序靶向V3-V4区域，在3个月时进行了粪便微生物群体，其中有没有调整潜在的重要早期生活因素。总体而言，在未调整和调整后的模型中，在2至13年之间对过敏性鼻炎的阳性诊断与菌群组成有关。与有两个特应性父母的父母所生的父母所生的孩子中，这种联系更为明显，其特征是双歧杆菌和埃希里希亚/志贺氏菌的相对丰度较低。和较高比例的杀菌剂。虽然先前显示在整个队列中的益生菌和半寡糖干预措施在一定程度上降低了湿疹的患病率，但在研究的亚匹配物中未发现3个月的肠道微生物群和儿童湿疹之间没有发现关联。
重复使用抗生素的病史导致微生物群 -
摘要的最新证据表明，重复使用的抗生素使用降低了微生物的多样性，并最终改变了肠道微生物群社区。然而，重复（但不是最近）抗生素使用对微生物群介导的粘膜屏障功能的生理影响在很大程度上尚不清楚。通过从深层表型的爱沙尼亚微生物组队列（ESTMB）中选择人类，我们在这里利用人类对小鼠的粪便微生物群移植来探索反复使用抗生素对肠道粘液功能的长期影响。虽然健康的粘液层可以保护肠上皮层免受感染和炎症的影响，但使用可行的结肠组织外植体的离体粘液功能分析，但我们表明，与健康对照组相比，与健康对照组相比，具有反复使用抗生素的人的史微生物群会降低粘液生长速率，并增加了粘液渗透率。此外，shot弹枪元基因组测序鉴定出抗生素形的微生物群落中的微生物群的明显改变，其中包括已知的粘液氧化细菌，包括粘膜粘膜粘膜粘膜和细菌菌属和细菌，脆弱的脆弱性脆弱的脆弱性，占主导地位。改变的菌群组成进一步以独特的代谢产物特征，这可能是由差异粘液降解能力引起的。因此，我们的概念证明研究表明，人类中的长期抗生素使用可能会导致微生物群落改变，该群落降低了肠道中保持适当粘液功能的能力。
两种不同比例的微生物配方对厨房废物堆肥中微生物群落的影响
摘要：这项研究的目的是研究散装剂对堆肥厨房废物的成熟和气态排放的影响。组成实验是由选定的核心细菌剂和通用细菌剂进行20天的。结果表明，核心微生物剂的添加有效地控制了典型的气味产生化合物的发射。核心和通用细菌剂的添加大幅降低了NH 3排放量94％和74％，并使H 2 S排放量降低了78％，27％。堆肥过程中核心微生物剂的施用将峰值温度升高至65℃，并且在有效的温度演化方面（连续8天> 55℃）。加入了核心微生物剂的初始值，有机物降解降低了65％，而对于其他治疗方法，减少量很小。将核心微生物剂添加到厨房废物中，产生了成熟的堆肥，其发芽指数较高（GI）为112％，而其他治疗方法并未完全成熟，GI的GI <70％。微生物分析表明，堆肥的核心微生物剂增加了魏森氏菌，Ignatzschineria和菌孢子的相对丰度。网络和冗余分析（RDA）表明，核心微生物剂增强了细菌与八个指标之间的关系（p <0.01），从而改善了堆肥过程中化合物的生物转化。总体而言，这些结果表明，仔细选择适当的接种微生物对于改善厨房废物的生物转化和营养含量堆肥至关重要。
肠道菌群和甲状腺疾病的最新进展
本综述综合了过去五年实验文献中的关键发现，阐明了肠道微生物组对甲状腺疾病发病机理的重要影响。一直观察到肠道菌群组成的明显转移，细菌（例如双杆菌，芽孢杆菌，芽孢杆菌，巨蛋白酶和梭状芽胞杆菌）的细菌显着降低，细菌的显着增加，包括细菌，包括细菌，proteebacteria，proteeabacteria，actacinobacteria，blebactia，kle and kle and kle and kle and kle and kle and kle and kle and and and anderaTia and kle。这些改变与包括胆汁酸和细胞因子的产生在内的代谢途径（包括降低短链脂肪酸（SCFA）（SCFA），这对于免疫调节和甲状腺激素稳态至关重要，这与甲状腺疾病的发展和进展有关。该评论还强调了益生菌在管理甲状腺条件中的治疗意义。证据表明，益生菌辅助治疗可以调节肠道菌群，从而改善甲状腺功能和患者结局。使用特异性益生菌菌株（例如lactiplantibacillus plantarum 299V和双杆菌长杆菌）在增强传统治疗的作用方面表现出了潜力，并可能恢复了平衡的肠肌菌群。值得注意的是，粪便菌群移植（FMT）已成为对Graves疾病（GD）的有前途的干预，证明了重新校准肠道菌群的潜力，从而通过gut-Brain-brain-Brain and Gut-thyroid-ater-thyroid Axes侵蚀神经递质和微量元素。将基于微生物组的疗法与传统疗法的整合可以吸引个性化甲状腺疾病管理的新时代，从而提供了更细微的患者护理方法。通过整合这项工作，该评论对肠道微生物组对甲状腺疾病的广泛影响和益生菌的治疗应用提供了创新的观点。
化学疗法引起的肠道微生物组的破坏，炎症和乳腺癌患者的认知下降
化学疗法因引起行为副作用（例如认知能力下降）而臭名昭著。值得注意的是，最近据报道，肠道微生物群岛与大脑进行交流，以影响行为，包括认知。因此，这项临床纵向观察性研究的目的是确定化学疗法诱导的肠道微生物群落结构的破坏是否与认知能力下降和循环炎症信号有关。粪便样本，血液和认知措施是从77例乳腺癌患者中收集的，此前，期间和之后。化学疗法改变了肠道微生物组的结构，并增加了循环TNF-α。化学疗法诱导的微生物相对丰度的变化和微生物多样性的降低都与循环促炎性细胞因子TNF-α和IL-6有关。参与者报告了化学疗法期间的主观认知下降，这与肠道微生物组或炎症标志物的变化无关。相比之下，总体客观认知的减少与微生物多样性的降低有关，而与循环细胞因子无关。通过基于4个客观认知检验的可靠变化指数的受试者分层，确定了35％受试者的客观认知下降。基于差分微生物的丰度分析，具有独特的分类学转移（粪酸细菌，细菌，fusicatenibacter，Erysipelotrichaceae ucg-003和二氧化碳属）比没有认知能力降低的治疗。总的来说，肠道微生物组的变化与化学疗法期间的认知下降有关，与化学疗法诱导的炎症无关。这些结果表明，与微生物组相关的策略可能有助于预测和预防化学疗法的行为副作用。
持续的术后疼痛中的肠道菌群...
持续性手术后疼痛（PPSP）被定义为疼痛，在手术手术中以显着形式进行至少三个月的手术手术后继续进行（与既往疼痛状况无关）。ppsp是一个常见的，不认可和重要的临床问题，影响了全球数百万患者。当前可用的预防措施包括选择微创手术技术和侵略性的多模式围手术型镇痛治疗方案。最近，肠道微生物群在疼痛调节中的作用变得越来越明显。本研究旨在研究肠道菌群与PPSP之间的任何关系。进行了一项对68名接受治疗乳腺癌手术的女性成年患者的前瞻性观察研究。粪便样品，以分析肠道菌群的组成。还采取了疼痛和状态性状焦虑的测量，以研究肠道菌群和PPSP之间任何关系的进一步维度。在术后12周时，有21例患者（51.2％）没有疼痛，有20例患者（48.8％）报告了当时持续存在的疼痛。对肠道菌群的分析显示，在术后60分钟和术后12周的术后60分钟的患者中，α多样性（使用三个措施）明显降低。我们首次报告肠道菌群组成与PPSP的存在或不存在之间的特定关联。A cluster of taxa represented by Bifidobacterium longum , and Faecalibacterium prausnitzii was closely associated with those individuals reporting no pain at 12 weeks postoperatively, while Megamonas hypermegale , Bacteroides pectinophilus , Ruminococcus bromii , and Roseburia hominis clustered relatively closely in the group of patients fulfilling the criteria for持续的术后疼痛。这可能会提供对肠道菌群在PPSP发展中作用的机制的进一步见解，并可以为未来的治疗策略提供信息。
性别，年龄和体重指数对肠道的影响...
方法论/主要发现：我们根据粪便样品的全元素shot弹枪测序对185名中国成年人的肠道菌群进行了分析。我们的研究重点是评估三个级别的性别，年龄和BMI对肠道微生物群的影响：多样性，基因/系统发育组成和功能组成。我们的发现表明，与肠型相比，这些表型对构成肠道微生物组的影响很小，它们在样本内或样本之间的多样性内或样本间多样性内无显着相关性。我们确定了大量与表型相关的基因和宏基因组链接组（MLG），表明肠道微环形组成的变化。特别是，在老年人和BMI较高的人群中，我们观察到有益的公司微生物，例如Eubacterium，Roseburia，Roseburia，Faecalibacterium和Ruminococcus spp。随着年龄的增长而增加。此外，Blautia和Dorea spp。随着BMI的增加而增加，与先前的研究保持一致。令人惊讶的是，年龄较大或超重的个体表现出缺乏细菌植物，这是人类肠道菌群中的主要门，包括机会性病原体，而某些众所周知的益生菌的某些物种则富集在这些组中，暗示了这些细菌的复杂相互作用。关于性别，雌性中的几种来自细菌，副细胞杆菌，梭状芽胞杆菌和阿克米西的MLG富含雌性。功能分析显示了许多与表型相关的KEGG直系同源物（KOS）。
在健康婴儿肠道中扩大已知病毒多样性
肠道微生物组是通过婴儿期形成的，并影响免疫系统的成熟，从而在生命后期预防慢性疾病。噬菌体或感染细菌的病毒，通过裂解和裂解性调节细菌生长，后者在婴儿肠道中尤为突出。病毒宏基因组（病毒瘤）很难分析，因为它们涵盖了未知的病毒多样性，缺乏标记基因和标准化的检测方法。在这里，我们系统地解决了来自哥本哈根属于哥本哈根的647名1岁儿童的粪便病毒多样性，该研究是2010年儿童哮喘的前瞻性研究，这是一个未选择的丹麦母子对的丹麦人群。通过组装和策划，我们从248个病毒家族水平进化枝（VFC）中发现了10,000种病毒物种。大多数（232个VFC）以前未知，属于小尾病毒病毒类别。使用来自同一儿童的细菌宏基因组中的簇状常规短滴定重复垫片确定噬菌体的79％的噬菌体。典型的细菌 - 感染的碎屑被未描述的噬菌体家族感染了梭菌和双歧杆菌。噬菌体生活方式在病毒家族水平上保守，有33个有毒和118个温带噬菌体家族。有毒的噬菌体更加丰富，而温带噬菌体则更为普遍和多样化。一起，在这项研究中发现的病毒家庭扩大了现有的噬菌体分类法，并提供了一种帮助未来婴儿肠道病毒蛋白研究的资源。