叶绿体ATP合酶包含质体和核遗传来源的亚基。为了研究这种复合物的协调生物发生,我们通过筛选绿色藻类衣原体中的新型ATP合酶突变体,通过筛选高光灵敏度。我们在这里报告了影响两个外围茎亚基B和B 0的突变体的表征,该突变体由ATPF和ATPG基因编码,以及三个鉴定核因子MDE1的独立突变体,这些突变体稳定叶绿体编码的ATPE mRNA所需的核因子MDE1。全基因组测序显示在ATPG的3 0 UTR中插入了转座子插入,而质谱显示在此敲低ATPG突变体中,功能性ATP合酶的一小部分积累。相反,通过CRISPR-CAS9基因编辑获得的敲除ATPG突变体,完全防止ATP合酶功能和积累,这也是在ATPF框架转移突变体中观察到的。与主要类囊体蛋白酶的FTSH1-1突变体穿越ATP合酶突变体将ATPH鉴定为FTSH底物,并表明FTSH显着促进了ATP合酶亚基的一致积累。在MDE1突变体中,不存在ATPE转录物完全阻止ATP合酶的生物发生和光合作用。使用嵌合ATPE基因营救ATPE转录本的积累,我们证明了一种新型的八度肽重复(OPR)蛋白MDE1遗传靶向ATPE 5 0 UTR。从主要内部生物生物症(〜1.5 Gy)的角度来看,将MDE1募集到其ATPE靶标招募了一个核/叶绿体相互作用的典范,这些相互作用是在最近进化的,在叶绿体的祖先中,我的cs cs cs exestor higlophyceae的祖先,〜300。
与编码基因类似,miRNA 由 RNA 聚合酶 II 从 miRNA/MIR 基因转录成长的初级转录本,称为初级/pri miRNA(图1)。此后,pri-miRNA 被 RNaseIII 样酶(称为 DICER-LIKE (DCL 1))与其他蛋白质一起切割成前体/前 miRNA。这些前 miRNA 进一步由 DCL1 加工成 20-24 个核苷酸长的 miRNA:miRNA 双链体。然后,双链体在 3' 端被 HUA 增强子 1 甲基化,并通过 EXPORTIN-5 输出到细胞质中。然后将双链体加载到含有 ARGONAUTE (AGO) 蛋白的 RNA 诱导沉默复合物 (RISC) 中。来自 miRNA:miRNA 双链中只有一条 RNA 链被加载到 RISC 上,而另一条链被小 RNA 降解核酸酶降解。最后,加载的 miRNA 将 RISC 靶向其互补的 mRNA,因此,根据其与目标 mRNA 的互补程度,它可能导致两种结果。如果 miRNA 与目标 mRNA 高度同源,则可能导致 mRNA 的位点特异性裂解,而与目标 mRNA 的弱碱基配对则导致翻译抑制(图1)。
PLENARY and CONCURRENT SESSIONS Bioinformatics & Genomics Chromatin & Epigenetics Chemical Biology of RNA New Technologies Extracellular RNA Granules & Condensates High through-put discovery Interconnected RNA Processes Long Non-coding RNAs & Circular RNAs Origins of Life and evolution Regulatory RNAs in Bacteria & Archaea Ribosome Biogenesis & Modification Ribozymes & Riboswitches RNA & Cellular Immunity RNA & Disease RNA Modification & Editing RNA Nanotechnology RNA Structure, Folding & Modeling RNA Synthetic Biology & Systems Biology RNA Transport & Localization RNA Turnover RNPs: Biogenesis, Structure & Function Polyadenylation & 3′ end formation Small Non-coding RNAs in Eukaryotes Splicing Mechanism Splicing Regulation & Alternative用于治疗和诊断转录的靶向RNA靶向RNA:机理与生物学翻译机制翻译调节tRNA:处理和功能病毒RNAS
2024 年 3 月 31 日 — CRISPR 介导的植物基因组编辑用于功能验证和生物发生;子项目 1:CRISPR 介导的基因组编辑用于功能表征...
我们小组对脂滴的生物合成和功能感兴趣。这些亚细胞器动态平衡了我们身体几乎所有细胞中中性脂质的流入、储存和消耗,因此是脂质代谢的中心枢纽。脂滴与一系列人类病理有关,包括现代社会的标志性疾病,如肥胖、糖尿病、肝脂肪变性和心血管疾病。然而,脂滴生物合成和功能以及这些过程中的病理异常背后的分子机制仍然很大程度上未知。我们实验室的项目解决了以下问题:• 蛋白质靶向和插入脂滴膜背后的分子机制是什么?• 哪些物理化学膜特性驱动蛋白质分配到脂滴中?
神经线粒体功能障碍、神经氧化应激、慢性神经炎症、毒性蛋白质积累和神经细胞凋亡是神经退行性疾病的常见原因。Elamipretide 是一种针对线粒体的小四肽,在多种线粒体相关疾病中表现出治疗效果和安全性。在神经退行性疾病中,大量研究表明,elamipretide 可增强线粒体呼吸,通过线粒体生物合成调节剂 (PCG-1 α 和 TFAM) 和转位因子 (TOM-20) 激活神经线粒体生物合成,增强线粒体融合 (MNF-1、MNF-2 和 OPA1),抑制线粒体分裂 (Fis-1 和 Drp-1),以及增加线粒体自噬 (线粒体的自噬)。此外,埃拉米普利肽已被证明可以减轻神经氧化应激(过氧化氢、脂质过氧化和 ROS)、神经炎症(TNF、IL-6、COX-2、iNOS、NLRP3、裂解 caspase-1、IL-1 β 和 IL-18)和毒性蛋白质积累(A β )。因此,埃拉米普利肽可以预防神经细胞凋亡(细胞色素 c、Bax、胱天蛋白酶 9 和胱天蛋白酶 3)并增强神经退行性疾病中的神经促存活(Bcl2、BDNF 和 TrkB)。这些发现表明,埃拉米普利肽可能通过增强线粒体呼吸、线粒体生物合成、线粒体融合和神经促存活途径,以及抑制线粒体分裂、氧化应激、神经炎症、毒性蛋白质积累和神经细胞凋亡来预防神经退行性疾病的逐渐发展。埃拉米普利肽或线粒体靶向肽可能是减缓神经退行性疾病进展的靶向药物。
蛋白质的分泌物蛋白质通过高尔基体从内质网流到质膜到质膜(5)。高尔基体中的分泌囊泡生物发生是涉及膜曲率,货物载荷和囊泡分裂的多步过程。每个步骤均由含有RAB家族成员的多蛋白复合物,ADP核糖基化因子,高尔基磷脂蛋白3(Golph3)和其他效应子(6-8)调节。这些复合物是由跨膜高尔基脚手架锚定在高尔基膜上的,该跨膜脚手架组织了专用于常见任务的客户蛋白(9)。高尔基脚手架蛋白上调,p53损失坐标是分泌驱动因素在p53缺陷型癌细胞中的作用(10,11)。因此,致癌突变通过高尔基体驱动分泌,以配合高尔基体中的分泌囊泡生物发生。鉴于有证据表明,染色体扩增子上的基因合作以协调共同的生物学过程(12),我们在这里假设染色体肿瘤的分泌囊泡生物创造的多阶段过程以建立高度的分泌状态。我们鉴定了一个3Q染色体区域,该区域在不同的肿瘤类型中得到扩增,并编码分泌囊泡生物发生的多个调节剂,包括高尔基脚手架Golgi Golgi积分膜蛋白4(GOLIM4)及其客户蛋白ATP蛋白ATP蛋白ATP蛋白ATP CA 2+
科学利益:了解蛋白质翻译起始因子,核糖体生物发生,ABC转运蛋白和多药耐药的结构功能关系。蛋白质翻译起始:古细菌的翻译起始被认为与真核病相似,而不是细菌。我们试图识别和理解古细菌中推定起始因素的结构功能关系(Gogoi等,2016,Gene; Srivastava等,2016,《理论生物学杂志》; Gogoi和Kanaujia; Gogoi and Kanaujia,2018年,2018年,科学报告和FEBS LETTLES; GOGOI LETTERS; GOGOI等,2019年GEN。 Biotechnology Journal;核糖体生物发生和抗生素耐药性:假设约200个因素与核糖体生物发生有关。其中,rRNA甲基转移酶通过修饰rRNA分子在核糖体生物发生中起关键作用,并且也已知与抗生素耐药性有关。我们的兴趣是了解对它们的结构功能关系和设计抑制剂。ABC进口商:ABC进口商仅在原核生物中鉴定出来,尽管也在少数植物中。因此,细菌ABC进口商被认为是潜在的药物靶标,也被用作药物输送系统,生物传感器和生物标志物。也已知它们参与耐药性。在这种情况下,我们一直在努力阐明少数ABC糖,金属,金属,脂质和抗菌肽等少数ABC的结构(Chandravansi等,2016,Gene; Mandal等,2019,2019,2019,Metalallomics; Metallomics; Metalolomics; Chandravanshi等,2019,Gene; Chandravanshi; Chandravanshi; Chandravanshi等人,2021年,FEBS Journal; 2021年,国际生物大分子杂志;
图 1. CRISPR-Cas 是一种天然存在于原核生物中的自适应防御系统。入侵基因组的片段在初始感染期间整合到 CRISPR 阵列中。在随后的病毒感染中,宿主经历生物发生和干扰阶段以针对特定基因组。该图取自 Hillary 等人的原创作品。5
外膜囊泡(OMV)是革兰氏阴性细菌分泌的双层脂质纳米层。OMV含有各种生物分子,是细菌,环境和宿主之间交流的重要介体,使它们成为抗肿瘤疗法的潜在有效候选者。本文回顾了OMV的结构,生物发生和生物学功能。此外,它重点介绍了OMV在抗肿瘤应用中的进展。