摘要 - 肺癌仍然是全球癌症相关死亡的主要原因,非小细胞肺癌(NSCLC)是最常见的亚型。这项研究旨在使用来自GDS3837数据集的基因表达分析在非吸烟的雄性中与III期NSCLC相关的关键生物标志物。利用机器学习算法的XGBoost,该分析实现了强大的预测性能,而AUC得分为0.835。The top biomarkers identified—CCAAT enhancer binding protein alpha (C/EBP α ), lactate dehydrogenase A4 (LDHA), UNC-45 myosin chaperone B (UNC-45B), checkpoint kinase 1 (CHK1), and hypoxia-inducible factor 1 subunit alpha (HIF- 1 α )—have been validated in the literature as being与肺癌显着相关。这些发现突出了这些生物标志物在早期诊断和个性化疗法中的潜力,强调了将机器学习与分子分析在癌症研究中的价值。索引术语 - 肺癌生物标志物,非小细胞肺癌(NSCLC),生物信息学,机器学习
背景:绿叶蔬菜(GLV)含有无机硝酸盐,该阴离子对口服微生物组具有潜在的益生元作用。然而,尚不清楚GLV和药理学补充[硝酸钾(PN)是否具有硝酸盐盐会引起对口腔微生物组的类似作用。目标:本研究旨在将GLV与PN补充对高血压个体中口腔微生物组组成和唾液生物标志物的影响进行比较。方法:将70个人随机分配给3个不同的组,以进行5周的饮食干预。第1组以GLV的形式消耗300 mg/d的硝酸盐。第2组食用的药丸,含300 mg/d的PN和低硝酸盐蔬菜。第3组用氯化钾(安慰剂:PLAC)和低硝酸盐蔬菜食用的药丸。在饮食干预之前和之后分析了口腔微生物组组成和口腔健康的唾液生物标志物。结果:GLV和PN组显示出类似的微生物变化,可能依赖硝酸盐,包括奈瑟氏菌,cap虫,弯曲杆菌,弯曲杆菌的丰富度增加,以及治疗后Veillonella,Megasphaera,segasphaera,megasphaera,sectinoryces和eubacterium种类的降低。在GLV组中观察到了Rothia物种的丰度,链球菌,Prevotella,放线菌和摩菌细菌的丰度降低,这可能是硝酸盐独立的。GLV和PN处理增加了唾液pH值,但只有GLV治疗显示唾液缓冲能力和乳酸降低的增加。结论:与PN相比,GLV组中硝酸盐依赖性和独立的微生物变化的结合对改善口服健康生物标志物具有更强的作用。
图 2. 健康个体中肺癌相关尿液 miRNA 的纵向变化。这是 25 种高保真肺癌生物标志物组中 16 种尿液生物标志物上调的一个例子,这些生物标志物基于之前在多篇(三到八篇)关于肺癌患者和原发性肺癌肿瘤血液分析的论文中与肺癌发展、进展和耐药性相关的 miRNA。 X 轴,生物标志物列表:从左到右:(1)miRNA-21-3p,(2)miRNA-21-5p,(3)miRNA-140-3p,(4)miRNA-140-5p,(5)miRNA-155,(6)miRNA-200b-3p,(7)miRNA-200b-5p,(8)miRNA-223-3p,(9)miRNA-223-5p,(10)miRNA-221-3p,(11)miRNA-221-5p,(12)miRNA-145- 3p,(13)miRNA-145-5p,(14)miRNA-150-3p,(15)miRNA-150-5p,(16)miRNA-200a-3p,(17)miRNA-200a-5p, (18)miRNA-205-3p,(19)miRNA-205-5p,(20)miRNA-210-3p,(21)miRNA-210-5p,(22)miRNA-339-3p,(23)miRNA-339- 5p,(24)miRNA-93-3p,(25)miRNA-93-5p。Y 轴表示丰度水平;我们使用基于单色实验的下一代测序数据推荐的分位数归一化方法对数据进行了归一化。
卵巢癌是女性最常见的死亡原因之一。卵巢癌经常在晚期诊断出,其存活率取决于疾病的阶段,而早期阶段大多是无症状的。早期发现该疾病是促进患者良好预后的最重要步骤之一,并且对药物治疗的反应出色,因为基因组不稳定性是卵巢癌的标志之一。在高级阶段,单个患者接受了有助于控制其生长,分裂和扩散的药物。具有靶向疗法的新一代技术和生物标志物正在迅速出现,包括microRNA,Picorna,非编码RNA及其肿瘤内部信号传导途径,血管生成,激素受体和免疫因子。由于一些有效的筛选策略,现在可以早日检测。卵巢癌被分为不同的临床亚型,并且每个亚型中仍然存在广泛的遗传和进行性多样性。一旦在具有不同临床亚型的晚期诊断出卵巢癌后,新一代的治疗方法(例如靶向治疗)就会成为可能。现在,基于由DNA水平(SNP和表观遗传学),RNA水平(mRNA,microRNA,PICO-RNA,非编码RNA)和蛋白质水平组成的新兴生物标志物和蛋白质水平,现在是时候评估与这种类型疾病治疗的生物标志物相关的早期状态和进展。
卵巢癌是女性最常见的死亡原因之一。卵巢癌经常在晚期诊断出,其存活率取决于疾病的阶段,而早期阶段大多是无症状的。早期发现该疾病是促进患者良好预后的最重要步骤之一,并且对药物治疗的反应出色,因为基因组不稳定性是卵巢癌的标志之一。在高级阶段,单个患者接受了有助于控制其生长,分裂和扩散的药物。具有靶向疗法的新一代技术和生物标志物正在迅速出现,包括microRNA,Picorna,非编码RNA及其肿瘤内部信号传导途径,血管生成,激素受体和免疫因子。由于一些有效的筛选策略,现在可以早日检测。卵巢癌被分为不同的临床亚型,并且每个亚型中仍然存在广泛的遗传和进行性多样性。一旦在具有不同临床亚型的晚期诊断出卵巢癌后,新一代的治疗方法(例如靶向治疗)就会成为可能。现在,基于由DNA水平(SNP和表观遗传学),RNA水平(mRNA,microRNA,PICO-RNA,非编码RNA)和蛋白质水平组成的新兴生物标志物和蛋白质水平,现在是时候评估与这种类型疾病治疗的生物标志物相关的早期状态和进展。
图2。健康个体中与肺癌相关的尿相关miR的纵向变化。 在25个高保真肺癌生物标志物小组内对16个尿生物标志物进行了改善的一个例子,基于miRNA,每个先前都与肺癌患者血液和原发性肺肿瘤分析的多个(三到八篇论文中的肺癌的发展,进展和耐药性)相关。 x轴,生物标志物的列表:从左到右:(1)miR-21-3p,(2)miR-21-5p,(3)miR-140-3p,(4)miR-140-5p,(5)miR-155,(5)miR-155,(6)mir-200b-200b-200b-3p,(7)mir-200B-200B-200B-200B-5P-5P,(8)Mir Mir,(8)Mir-22-3p,(8)-33 miR-221-3p, (11) miR-221-5p, (12) miR-145-3p, (13) miR-145-5p, (14) miR-150-3p, (15) miR-150-5p, (16) miR-200a-3p, (17) miR-200a-5p, (18) miR-205-3p, (19) miR-205-5p, (20) miR-210-3p, (21) mir-210-5p,(22)mir-339-3p,(23)mir-339-5p,(24)mir-93-3p,(25)mir-93-5p。 y轴,丰度;我们使用基于单色实验的下一代测序数据建议的分位数归一化方法进行了数据归一化。健康个体中与肺癌相关的尿相关miR的纵向变化。在25个高保真肺癌生物标志物小组内对16个尿生物标志物进行了改善的一个例子,基于miRNA,每个先前都与肺癌患者血液和原发性肺肿瘤分析的多个(三到八篇论文中的肺癌的发展,进展和耐药性)相关。x轴,生物标志物的列表:从左到右:(1)miR-21-3p,(2)miR-21-5p,(3)miR-140-3p,(4)miR-140-5p,(5)miR-155,(5)miR-155,(6)mir-200b-200b-200b-3p,(7)mir-200B-200B-200B-200B-5P-5P,(8)Mir Mir,(8)Mir-22-3p,(8)-33 miR-221-3p, (11) miR-221-5p, (12) miR-145-3p, (13) miR-145-5p, (14) miR-150-3p, (15) miR-150-5p, (16) miR-200a-3p, (17) miR-200a-5p, (18) miR-205-3p, (19) miR-205-5p, (20) miR-210-3p, (21) mir-210-5p,(22)mir-339-3p,(23)mir-339-5p,(24)mir-93-3p,(25)mir-93-5p。y轴,丰度;我们使用基于单色实验的下一代测序数据建议的分位数归一化方法进行了数据归一化。
1实验室医学系,中华人民共和国杭州吉安大学医学院第一家附属医院; 2国家关键诊断和治疗传染病的主要实验室,国家传染病临床研究中心,国家传染病医学中心,传染病的诊断和治疗合作创新中心,第一家分支机构医院,Zhejiang Universin 3中华人民共和国杭州大学医学院生物化学系; 4重症监护部,中国人民共和国杭州大学医学院第一家附属医院,中华人民共和国; 5中华人民共和国杭州大学医学院第一附属医院神经病学系1实验室医学系,中华人民共和国杭州吉安大学医学院第一家附属医院; 2国家关键诊断和治疗传染病的主要实验室,国家传染病临床研究中心,国家传染病医学中心,传染病的诊断和治疗合作创新中心,第一家分支机构医院,Zhejiang Universin 3中华人民共和国杭州大学医学院生物化学系; 4重症监护部,中国人民共和国杭州大学医学院第一家附属医院,中华人民共和国; 5中华人民共和国杭州大学医学院第一附属医院神经病学系
癌症是死亡的主要原因之一,也是改善全球预期寿命的重要障碍。前列腺癌是全世界第二常见的癌症。对体液中生物标志物的检测是前列腺癌诊断和预后的关键主题。尽管前列腺癌检测方法,治疗剂和新生物标志物的进展,前列腺癌仍然是一个严重的挑战。前列腺特异性抗原(PSA)被广泛认为是诊断前列腺癌的重要生物标志物。新型生物传感器用于前列腺癌检测的新型生物传感器已成为一个热门研究领域,纳米技术的进步有助于生物传感器开发。本文回顾了纳米材料和纳米技术在基于生物标志物的生物传感器中取得的最新成就和进步,用于前列腺癌检测和覆盖:i)基于PSA的生物传感器(免疫传感器,免疫传感器,基于APTAMER,基于肽的基于肽的生物体和基于Nananopore的生物体),II)II),II)II),II),II),II)t-sasesine timase tocase-toget-toget-togenget tocase torget-Target-Target-Target-target target-target-target-target-target-target-target-target target。生物传感器(前列腺癌抗原3(PCA3),血管内皮生长因子(VEGF)和前列腺特异性膜抗原(PSMA)),包括基于双生物标志物的生物传感器(PSA-VEGF,PSA-VEGF,PSA-PSMA,PSA-PSMA,PSA-PCA3和PSA-SARCOSINE)。本综述的目的是提供有关如何与各种生物标志物结合使用的纳米材料现在有助于前列腺癌诊断中的生物传感器开发的。
摘要:神经退行性疾病(NDS)与癌症之间的联系对生物医学研究产生了更大的兴趣,数十年的全球研究研究了癌症中神经退行性生物标志物,以更好地了解可能的联系。tau,淀粉样蛋白β,α-突触核蛋白,SOD1,TDP-43和其他与神经系统疾病相关的蛋白质也已在各种类型的固体和恶性肿瘤中鉴定出来,这表明潜在的病理学过程有潜在的重叠。在这篇综述中,我们旨在概述这些蛋白质在癌症中的作用的当前证据,特别研究了它们对细胞增殖,凋亡,化学抗性和肿瘤进展的影响。此外,我们讨论了这种互连的诊断和治疗意义,强调了进一步研究的重要性,以完全理解这些蛋白质在肿瘤中的临床意义。最后,我们探讨了针对这些蛋白质开发新目标抗癌疗法的挑战和机遇,从而提供了有关如何在肿瘤学研究中融合NDS知识的见解。
摘要:神经退行性疾病是一组复杂疾病,其特征是神经元的逐渐丧失和神经系统不同区域的变性。它们具有相似的机制,例如神经炎症,氧化应激和线粒体损伤,导致神经元丧失。诊断神经退行性疾病的最大挑战之一是它们的异质性。临床症状通常存在于疾病的晚期阶段,因此必须找到可以早期诊断的最佳生物标志物。由于开发了分析其他液体中蛋白质的超敏方法,例如血液,在神经退行性疾病的生物标志物领域已经取得了巨大进展。蛋白质生物标志物测量的应用不仅显着影响诊断,而且还影响了预后,分化和新疗法的发展,因为它可以识别临床前阶段或轻度症状的人的疾病早期阶段。此外,将生化标志物引入常规临床实践可能会改善诊断,并允许一组具有较高风险的人,并且由于可以及早开始治疗以来的福祉。在这篇综述中,我们专注于血液生物标志物,这可能在某些神经退行性疾病的日常医学实践中有用。