Braak

引用发布版本（APA）：van den Berg，I.，Smid，M.，Coebergh van den Braak，R。R. R. J.，van de Wiel，M.A.，van Deurzen，C.H.M.，de

共有的分子亚型（CMS）可以指导结直肠癌（CRC）的精确治疗。我们旨在确定CRC患者中CMS2和CMS3之间的甲基化标志物，目前缺乏简单的测试。为此，分析了239例I-III CRC患者的新鲜冻结肿瘤组织。使用中甲基化的甲基化450珠奇普获得了甲基化蛋白。我们通过事后组加权弹性网标记物选择了自适应群体调查的逻辑脊回归，以构建用于CMS2和CMS3分类的预测模型。使用癌症基因组图集（TCGA）数据进行验证。探针的组正则化是根据其位置相对于CPG岛或相对于CMS分类中存在的基因进行的，从而产生了两个不同的预测模型，随后进行了不同的标记面板。对于两个面板，即使仅使用五个标记，我们的队列和TCGA验证集中的精度也> 90％。我们的甲基化标记面板可准确区分CMS2和CMS3。这使得有针对性的测定能够为CRC患者提供稳健且与临床相关的分类工具。