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食品安全世界的快进繁殖
测序和表型技术用于理解基因组变异的高质量参考基因组（请参阅词汇表）是给定农作物中基因组学研究的先决条件，以获得作物性能的准确和准确的结果[2]。高构型变体通过高质量参考基因组的可用性促进，对于基因发现和操纵等遗传研究至关重要。与先进信息学工具的测序技术的“民主化”改善了现有和基因组组件的连续性和完整性。由于单个参考基因组无法捕获物种的所有基因组变异，因此可用于几种农作物的金铂或铂标准参考基因组。长阅读或链接阅读的测序平台，例如PACBIO，10X Chromium和Oxford Nanopore，并补充了来自下一代测序（NGS）的简短读数
设计培育未来水稻
水稻是 32 亿人的主食。2008 年震惊许多亚洲国家的粮食安全威胁依然存在，因为农民面临着用更少的水、土地和投入资源生产更多水稻的挑战。水稻改良的目标已经从单纯的高产转变为高产、优质、营养均衡、健康安全和可持续生产的综合目标，尤其是在中国 [1] 。培育绿色超级稻 (GSR) 等水稻品种将满足这些目标并提高水稻生产的利润。近几十年来遗传学、基因组学和育种技术的进步 [2] 为通过设计育种有效开发未来品种提供了机会。在这期特刊“水稻作为模型作物：遗传学、基因组学和育种”中，我们邀请了 19 位不同领域的专家来回顾水稻遗传学、基因组学和育种技术的进展。其中有四篇论文是关于抗非生物胁迫的，两篇是关于抗生物胁迫的，四篇是关于农艺性状的，三篇是关于基因挖掘平台的，一篇是关于基因组选择的，一篇是关于基因编辑的，两篇是关于基因组设计育种的，两篇是关于水稻杂种优势的。本期特刊的目的是综述水稻基因组学和分子育种技术的主要进展，特别是在中国。这里我们根据主题分类总结了这些论文，并添加了我们的观点。
动物育种和繁殖生物技术
遗传改善是导致当前牲畜生产系统可持续性和盈利能力的主要因素之一。现代动物育种计划依靠两种不同技术的组合来确保遗传改善。一方面，基于应用统计技术的人口和定量遗传学是公司和育种者协会进行的当前动物育种计划的基础。另一方面，基于生物学和生化技术的分子遗传学在动物育种计划中变得越来越普遍。最后，生殖生物技术提供了增强和促进定量和分子育种方法的应用工具。总体计划在这三个基本主题中提供了合理的培训，可以通过对目前在不同物种中进行的育种和生物技术计划进行批判性修改以及通过相关主题的实践工作来获得经验。
植物育种的功能基因组学
要面对迅速增长的世界人口，为了克服增强的粮食需求，必须提高农业生产率和生产。这可以通过增加耕地或部署改良的作物植物并使用下一代植物育种产量来实现。高级技术在植物中的应用已加速了各个级别的多摩变数据的产生，例如基因组，蛋白质组，转录组，表观基因组和代谢组水平。为了充分利用这一点，需要使用数学或关系模型进行综合方法来依次或相反地结合可用的多矩数据，以了解生物体范围内的分子相互作用和生理机制[1，2]。换句话说，在解决感兴趣的生物学问题时，通常会选择一种整体，综合的方法来提高解释准确性[3]。这为植物生物学家提供了对植物功能和重要特征的基础机制的更深入的了解。OMICS数据还提供了探索和将基因型与表型联系起来的机会，因此，缩小了它们之间的差距。可以在当前的特刊“植物育种功能基因组学”中找到，其中包含七个原始文章和三篇评论。高通量基因分型方法的最新改进促进了QTL识别分析方法的发展。macko-podgórni等人。根形态是定义品种类型的主要属性之一，影响了消费者的选择和食品行业需求。podwyszy'nska等。[4]提供了证据证明通过全基因组关联研究（GWAS）与胡萝卜根形状相关的DCDCAF1和DCBTAF1基因可能参与。基因组学的进步还说明了定量宿主 - 病因相互作用的高复杂性。因此，在本期中，Miedaner等人。[5]回顾了对六个最重要的悲伤系统的越来越多的知识，从而允许发展新型繁殖策略，其中人口映射，基因组选择（GS）和基因组数据的整合在加速许多病原体的耐药性繁殖过程中起着重要作用。[6]估计了新获得的四倍体苹果品种的表型和基因型变化，对苹果abs的耐药性增加特别感兴趣，这是苹果的严重真菌疾病。四倍体品种显示出较高的甲基化水平和较高的与不同耐药反应相关的基因表达水平。此外，Kibe等人。[7]与链接映射，联合链接关联映射和基因组预测进行了关联映射，以分析玉米中常见锈（CR）抗性的遗传结构。基于基因分型 - 通过测序和单核苷酸多态性通过GWAS分析使用关联映射面板和五个F3的两国种群来标记，他们可以识别出显着的标记 - 特征与特征的关联，从
植物育种和生物技术工作
最高职位HT-意大利人类米兰人类：合作进行重要的项目，以隔离和与环境相互作用进行遗传特征。协助...（发布1天，截止日期为3月16日）顶级职位MPP-瑞士的药物专利池：为产品开发和验证活动提供技术专业知识，包括分析开发，过程规模扩大和表征。（12天前发布，截止日期为2月19日）最高职位HT-意大利人类米兰人：开发和监督世界一流的翻译流行病学研究计划。有助于促进科学改进的倡议。（20天前发布，截止日期为3月28日）顶级职位SLU-瑞典农业科学大学Alnarp，瑞典：在该学科领域内进行高质量的研究，从而有助于与系主任的科学发展。（27天前发布，3月17日截止日期） - 瑞典农业科学大学Uppsala，瑞典：除其他组件外，要在各个层面上教动物分子遗传学。（61天前发布，截止日期为4月28日）CEMM-奥地利奥地利科学学院分子医学研究中心：奥地利维也纳：领导湿实验室设施，包括NGS服务提供，分析开发和对客户的支持。（4天前发布，3月31日截止日期）Max F. Perutz实验室，奥地利维也纳：研究基因组之间移动遗传元素的分子机制，探索了它们对基因组重塑的影响。验证突变效应。关注从干细胞衍生的神经细胞和神经胶质细胞。文档搜索策略。2。（未指定的截止日期）UVA-荷兰阿姆斯特丹阿姆斯特丹大学：使用CRISPR/CAS9技术创建在E-2-己烯感知或己烯酸异构酶活动中受损的突变马铃薯植物。（6天前发布，截止日期为3月13日）Embl -Ebi-英国的欧洲生物信息学研究所：监督重要的生物信息学资源，确保其在不断变化的科学环境中的持续影响和相关性。（发表于8天前，截止日期为3月16日）乌普萨拉大学 - 瑞典免疫学，遗传学和病理学系：使用各种生物学和干细胞来源开发3D打印的组织器官。（15天前发布，截止日期2月21日）ESHRE-欧洲人类繁殖与胚胎学会，布鲁塞尔，比利时：进行逐步文献搜索以确定相关证据，确保采用系统的方法来采购数据。（未指定截止日期）法国巴黎巴斯德学院：1。在KAUST可用的位置研究昆虫和哺乳动物发育中的动态过程。成功的候选人将在生物反应器设计和燃料生产中进行合作。在法国Inrae的职位发布，重点是细菌细胞外囊泡介导的细胞间通信。3。在巴黎的INRAE角色，涉及从实验室到商业规模的发酵过程的规模扩大。4。在意大利EMBL的位置，制定一个独立的研究计划，以解决环境反应的分子机制。 5。 在瑞典SLU的职位发布，重点是微生物生物技术和厌氧微生物。 6。 7。 1。在意大利EMBL的位置，制定一个独立的研究计划，以解决环境反应的分子机制。5。在瑞典SLU的职位发布，重点是微生物生物技术和厌氧微生物。6。7。1。使用尖端技术的发展生物学，计算科学和儿科心脏病学探索了巴黎研究所的项目。荷兰UVA的研究助理职位，重点是分析化学和分子寄生虫学。博士后项目负责人SLU-瑞典农业科学大学发表了7天前截止日期3月14日。生物生产KTH-皇家理工学院发表8天前截止日期3月5日。助理教授职位职位 - 免疫学cinbio-纳米材料和生物医学研究中心，维戈大学的纳米材料和生物医学中心发表了12天前的截止日期，2月28日2月28日，研究系的重点是植物育种，生物技术和产品质量。他们使用多种技术等技术来研究农作物。该团队还为苹果和土豆开展公共育种计划。作为其活动不可或缺的一部分，他们拥有著名组织的国际赠款。他们的学科领域以植物生物技术为中心，专注于使用工具和技术在北欧的适应和繁殖作物。这可能涉及在植物代谢，生物化学和基因组学等领域的研究。教授的职责包括加强部门的研究和教育环境，管理团队，确保资金，发布研究成果，教学，监督学生以及与行业和组织合作。SLU的[主题]部门以卓越的声誉而闻名。为了与大学的愿景和目标保持一致，我们希望所有员工都遵守我们的核心价值观。虽然英语主要用于我们的学术活动，但预计将在四年内获得瑞典语或斯堪的纳维亚语言的能力。这将使教授能够与同事有效沟通并促进我们的语言多样性。关键资格： *在相关领域任职博士学位或展示等效的科学专业知识 *具有出色的研究技能，包括获得外部资金并领导成功的研究小组 *展示了一个可靠的良好影响力的研究论文的记录，以发表高影响力的研究论文，并与行业利益相关者合作 *通过教学，监督和学生进行培训。优先考虑科学和教学技能。我们根据他们的研究专业知识来评估候选人，包括他们启动创新项目，确保外部资金并展示明确的科学愿景的能力。对于教学专业知识，我们考虑了课程计划，实施，考试和评估等因素，以及所有教育水平的监督和检查。我们还重视将研究和科学方法整合到教学工作中的能力。其他考虑因素包括领导才能，与外部利益相关者的合作以及有关研发工作的沟通。虽然不是强制性的，但如果申请人可以记录其使用和开发现代植物生物技术方法来改善与北欧相关的作物的能力，则认为这是一个优点。理想的候选人将记录与各种农作物合作的经验，并与行业合作伙伴紧密合作。加入SLU，成为一个动态团队的一部分，该团队促进了部门内的增长和积极性。作为SLU员工，您将沉浸在思想蓬勃发展的协作研究环境中。您还可以享受诸如瑞典家庭医疗保健，慷慨的休假政策等的巨大收益。瑞典以其高质量的教育系统，美丽的学龄前结构和丰富的文化遗产而闻名。SLU的Alnarp校园坐落在隆德，马尔默和哥本哈根附近，使其成为学者和文化爱好者的理想场所。现在应用成为这个充满活力的社区的一部分！
教学大纲遗传学和植物育种
学分的课程标题硕士（AG）在遗传学和植物育种（GPB）中*强制性的主要课程课程代码课程学分gpb 501*遗传学原理3（2+1）GPB 502*植物育种原理3（2+1）GPB 503* GPB 503*定量遗传学3（2+1）GPB 505原理的基本原理3（2+1）分子育种和生物信息学3（2+1）GPB 516抗应激性和气候变化的繁殖3（2+1）GPB 517种质特征和评估2（1+1）GPB 518遗传增强PGR利用率2（1+1）课程标题：遗传学原理* II。课程代码：GPB 501 III。学时：3（2+1）iv。为什么要这门课程？基因是所有作物改善活动的骨干。它们的化学结构和物理遗传对于任何育种计划都是关键的。因此，它必须是遗传学和植物育种硕士学位的核心课程。V.本课程的目的本课程旨在了解遗传特征继承的基本概念，帮助学生发展从经典到分子遗传学的分析，定量和解决问题的技能。vi。理论单位I的遗传学开始，遗产的早期概念，门德尔定律；讨论孟德尔的论文，染色体的遗传理论；多个等位基因，基因相互作用，性别确定，分化和性别链接，受性别影响和性别限制的特征；连锁检测，估计；真核生物，体细胞遗传学，额外的染色体遗传的重组和遗传图。II单元Mendelian人群，随机交配人群，基因和基因型的频率，变化的原因：Hardy-Weinberg平衡。第三单元的性质，结构和遗传物质的复制；染色体中的DNA组织，遗传密码；蛋白质生物合成，遗传细胞分析，等位基因互补，分裂基因，重叠基因，假基因，癌基因，
基因组辅助育种气候智能型咖啡
缩写：香气喜好，AROMA；平均产量，YIELD；贝克比率，PR；贝叶斯稀疏线性混合模型，BSLMM；豆大小，GSIZ；叶斑病，CERC；咖啡潜叶虫，LMINER；咖啡叶锈病，RUST；平衡，EQUIL；风味喜好，FLAVOR；开花时间，FL；一般配合力，GCA；一般倾向，GL；一般尺度，GSCE；全基因组关联研究，GWAS；基因组选择，GSCE；叶枯病，LBLIGHT；似然比检验，LRT；连锁不平衡，LD；标记辅助选择，MAS；成熟期，UNIF；成熟时间，MAT；参与决定表型的稀疏效应基因座的数量，n_gamma；整体喜好，OVLIKING；感知，HEDONIC；植物结构，PRT；后验包含概率，PIP；主成分分析，PCA；由具有主要效应的遗传变异解释的遗传变异比例，rho；由稀疏效应和随机效应解释的表型变异比例，PVE；仅由稀疏效应解释的 PVE 比例，PGE；数量性状基因座，QTL；鼻后，RETRO；筛残差，RES；筛孔尺寸，M15；筛孔尺寸，M13；筛孔尺寸，M10；简单序列重复，SSR；单核苷酸多态性，SNP；酸味，ACIDITY；特定配合力，SCA；甜度，SWEET；干加工和未烘焙的生豆重量（以克为单位），GREEN；使用自然干燥方法（日晒豆）后的咖啡果实重量（以克为单位），CHERRY；2014-2015 年产量，YB1； 2016-2017 年产量，YB2；2018-2019 年产量，YB3。