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RAMÓN Y CAJAL 奖学金——2023 年申请征集......
领域主题：生物科学和生物技术 姓名：CAPELLA、MATÍAS 参考号：RYC2023-044783-I 电子邮箱：mcapella@ial.unl.edu.ar 标题：分析调节重复序列以维持植物基因组稳定性的因素 记忆摘要：我的科学之旅始于阿根廷圣菲的 Instituto de Agrobiotecnología del Litoral，指导老师是 Raquel Chan 教授。在完成硕士和博士论文后，我的研究主要集中在了解特定植物 HD-Zip 转录因子在拟南芥和向日葵中的作用。值得注意的是，我发现了对转录活性很重要的关键蛋白质区域（Capella 等人，2014 Plant Cell Rep）。此外，我的研究还强调了 AtHB1 在调节生长相关蛋白表达和促进下胚轴细胞伸长方面的作用（Capella 等人，2015 New Phytol）。在此期间，我还参与了 3 篇研究论文（2 篇 BMC Plant Biol 和 1 篇 J Exp Bot）和 2 部章节书籍（1 部作为第一作者）。在生物化学与生物科学学院期间，我协助分子和细胞生物学系完成了几项任务。丰富的经验使我掌握了一套涵盖生化、分子和生理方法的多功能技能。这些技能最初专注于植物生物学，现已在不同的科学领域展现出其价值。在转向分子细胞生物学博士后研究后，我加入了慕尼黑马克斯普朗克生物化学研究所 Stefan Jentsch 教授的实验室。在那里，我提高了在酵母遗传学、基于质谱的蛋白质组学和蛋白质生物化学方面的技能。我研究了双链断裂后重复序列的核膜监视和染色质动力学，这些项目最终以第一作者和通讯作者的身份发表了两篇论文（Capella 等人，2020 年 J Cell Sci；Capella 等人，2021 年 Nature Commun）。在 Jentsch 教授去世后，我加入了慕尼黑生物医学中心 Sigurd Braun 博士的实验室。这一阶段让我能够将我的工作扩展到模型生物裂殖酵母，参与高通量遗传筛选，并获得 RNA 测序技术的专业知识。通过我在 Braun 实验室的博士后研究，我参与了一个项目，我们展示了 Lem2 在 RNA 监视中的作用（Martin Caballero 等人，2022 年 Nat Struc Mol Biol）。此外，我还参与并协助发表了 2 篇研究论文（1 篇 EMBO Rep 和 1 篇 Microbial Cell）、2 篇 News & Views（1 篇 Nat Struc Mol Biol 和 1 篇 Dev Cell，均为第一作者），并与奥地利的 Frederic Berger 教授合作通过合成生物学探索植物组蛋白变体（1 篇 Curr Biol 和 1 篇 PLoS Genet）。此外，我们正处于完成另一份手稿的最后阶段（Muhammad 等人，正在准备中）。尽管身在国外，我与我在阿根廷的前导师合作，并继续指导一名硕士生，最终以共同第一作者的身份发表了 2 篇论文（1 篇 Plant Physiol 和 1 篇 J Exp Bot），以通讯作者的身份发表了 1 篇论文（1 篇 Plant Cell Physiol），以第三作者的身份发表了 1 篇论文（1 篇 Plant Sci）。回到阿根廷后，我致力于建立自己的研究小组，重点研究确定调节植物重复序列稳定性的分子因素——这是一个尚未被探索的领域。为了实现这一目标，我目前正在指导两名博士生和一名研究生。最后，我最近成功获得了两笔资助，以资助我的独立项目，这是我研究历程中的一个关键时刻。
RAMÓN Y CAJAL 奖学金——2023 年申请征集......
主题领域：生物科学和生物技术 姓名：SANTOS MORENO, JAVIER 参考号：RYC2023-043017-I 电子邮箱：santosmoreno.j@gmail.com 职称：合成生物学家，研究基因回路对细胞行为的编程 履历：我拥有生物技术硕士学位（萨拉曼卡大学）和临床分析实验室硕士学位（庞培法布拉大学）。我在不到 3 年的时间里（2016 年，26 岁）在巴黎（索邦大学巴黎城分校）获得博士学位，研究蛋白质分泌。我研究了细菌（K. oxytoca）II 型分泌系统 (T2SS) 的分子机制，为此我描述了新的蛋白质相互作用并产生了重要的结果，这使我提出了一种新的 T2SS 分泌模型。在瑞士洛桑做博士后期间，我将研究重点从研究现有生物系统转向构建新系统。在研究大肠杆菌的过程中，我率先使用 CRISPRi 构建了一些最重要的合成电路（包括图案化电路、振荡器或双稳态开关），并将这些电路用于不同的应用，包括进化研究、人类病原体（S. penuemoniae）感染研究或细菌细胞生理学的重新编程。我目前在巴塞罗那进行研究，最初以玛丽居里研究员的身份进行，现在以胡安德拉谢尔瓦研究员的身份进行，旨在设计人类皮肤微生物组用于诊断和治疗目的。我成功地将最丰富的皮肤细菌（痤疮梭菌）变成了一种可常规转化的生物体，我为这种细菌开发了第一个分子工具箱（包括启动子、报告基因、转录因子、CRISPR 工具等），并且我构建了一种痤疮梭菌菌株，该菌株在人类皮肤细胞培养物中产生并分泌具有 ROS 清除活性的分子，这在治疗炎症性皮肤病方面具有巨大潜力。2023 年 9 月，我获得了 230 万欧元的 ERC 启动基金。我未来的研究将专注于活细胞中的编程时间。目前，我们对细胞随时间变化进行编程的能力仍然非常有限。我们依靠精确定时的人工干预或控制重复过程的分子振荡器，但我们仍然无法对细胞进行编程以在所需的时间自主执行自定义操作。我现在打算通过在 E. coli 中生成分子计时器来计算时间并在指定时间执行所需的操作，从而朝着这个目标迈出一大步。计时器将具有高度可编程性、可重复使用性和可扩展性，我将使用一种简单而有效的方法将时间可编程性扩展到其他生物体（包括酵母和哺乳动物细胞）。最后，我将利用生物计时器的潜力，将其用于不同的应用，包括：在生物控制中，在期望的时间后进行细胞程序性死亡；精确控制任务执行顺序和时间，用于生物生产；以及在期望的时间窗口内记录（外）细胞事件的“哨兵”细胞，用于生物传感。我的研究结果将释放出无数新的可能性，包括基础的和应用的。例如，在开放或难以接近的环境中（例如农田或受污染的湖泊）部署工程细胞最终可能成为现实，因为任务执行和自我毁灭将被遗传编码为在预定的时间发生。此外，编程的时间指令可以避免在大型生物反应器中对昂贵的诱导信号的需求，或者使研究发育过程时受到的外部干扰最小。总之，我的团队将开发出非常需要的、突破性的测量和编程细胞时间的能力。
AIDRAMónY Cajal-致电2022 ...
Área Temática: Biociencias y biotecnología Nombre: TOLL RIERA, MACARENA Referencia: RYC2022-036791-I Correo Electrónico: mtollriera@gmail.com Título: Evolutionary adaptations, from metazoans to bacteria Resumen de la Memoria: My research is focused on the study of进化适应，具体来说，是其起源和进化的分子机制。进化适应有助于在给定环境中生存或繁殖，并且了解它们的分子基础是进化生物学的基本问题，这对了解细菌对抗生素的抗性以及生物体对气候变化的反应具有意义。在我在Albà教授（Universitat Pompeu Fabra）的博士学位期间，我使用了比较基因组方法来研究灵长类动物中新基因的起源机制（Toll-Riera等，Mol Biol Evol Evol 2009）以及蛋白质随时间的发展（Toll-Riera等，Mol-Riera et al，Mol-Biol Evol evol 2012; Evol Biol 2013）。我的博士学位包括在Plotkin教授的小组（宾夕法尼亚大学）的短暂住宿。在我的博士后I中，我从计算生物学转变为实验进化的实验技术，微生物学和测序数据分析中的技能。我在麦克林教授（牛津大学）的小组中进行了第一个博士后，在那里我通过实验室进化和后期测序的铜绿假单胞菌的致病细菌中进化创新的基因组基础（Toll-Riera等，Toll-Riera et al，Polos Genet 2016）。我在瓦格纳教授的小组（苏黎世大学）做了第二个博士后。此外，我还参与了多次合作，以了解质粒在P. euguginosa（San Millan*，Toll-Riera* et al，Isme J 2018; San Millan*，Toll-Riera* et al，Nat Commun，2015; San Millan，Peña-Miller*，Peña-Miller*，Toll-Riera* et a a Ratiug Riera* et ant Community for Nat ant Community for Nats Community for for a P.抗生素（Qi，Toll-Riera等，Proc Biol Sci 2016; Gifford，Toll-Riera，MacLean Evolution 2016）。在那里，我使用计算方法继续研究了铜绿假单胞菌的进化创新，以了解突变鲁棒性在促进创新中的作用（Tollriera等，PLOS Genet 2016）。2016年5月，我通过Ambizione Grant（瑞士国家科学基金会，583,690€）建立了自己的初级团体领袖。自2019年11月以来，我领导了Eth Zurich主持的进化微生物学集团。该小组目前由两名博士学位学生，一名博士后研究员和一名大师旋转学生组成，并通过Prima Grant（瑞士国家科学基金会，1,445,870€）和ETH Research Grant（229,878€）资助。我们研究了促进适应环境变化以及限制适应的分子机制。我们使用跨学科和综合方法，并结合了实验室进化，计算方法，高吞吐量测序和蛋白质组学。获得Ramóny Cajal奖学金将使我能够在西班牙建立我的研究小组，并继续使用实验，计算和“ OMICS”方法以及模型以及非模型细菌的研究计划，重点介绍了研究计划。我的目标是研究：1）这是适应高温的限制，2）染色体可塑性作为快速适应环境变化的机制，以及3）细菌冷适应的基因组学。