首先,让我们开始谈论为什么今天的话题如此重要。基因和细胞疗法的领域正在迅速发展,科学发现开辟了新的途径,以解决从罕见的遗传疾病到某些形式的癌症,几乎没有或没有其他可用疗法的困难医疗状况。在美国,有7,000多种罕见疾病影响了超过3000万人。这些罕见疾病中的许多人都威胁生命,没有可用的有效治疗方法。尽管仍然有很多关于罕见疾病的学习和理解,但我们确实知道,大约80%的稀有疾病是由单基因缺陷引起的,单基因缺陷,这些缺陷在某种程度上是基因疗法,并且在某种程度上,细胞疗法的产品处于独特的解决位置。实际上,有2,000多种用于细胞和基因疗法的新药应用,证明了这些领域的快节奏生长。基因和细胞疗法可能会改变我们为患有困难且经常无法治愈的医疗状况的患者提供护理的能力,而OTP致力于促进这些创新方法的发展,以满足大量未满足的医疗需求。
评估 RNA 提取和 Illumina NGS 文库制备方法以从不同样本基质中检测病毒 RNA Sayma Afroj 1、Aaron Scholl 1、Binsheng Gong 2、Bingjie Li 1、Joshua Xu 2 和 Sandip De 1 * 1 美国食品药品管理局治疗产品办公室细胞治疗和人体组织办公室细胞治疗部 2 司肿瘤疫苗和生物技术处,10903 New Hampshire Avenue,Silver Spring,MD,20993;2 美国食品药品管理局国家毒理学研究中心生物信息学和生物统计学部 3900 NCTR Rd Jefferson,AR 72079。目标:当前的病原体和外来因子检测试验面临局限性,例如对某些病原体的特异性和灵敏度降低,这对 HCT/Ps 的安全使用提出了挑战。该项目旨在评估各种 RNA 提取和 NGS 文库制备方法,以实现对病原体和外来因子的快速、广泛、灵敏和特异性检测。方法:我们使用三种研究设计来评估 RNA 提取方法:将寨卡病毒 (ZIKV) 注入幼稚细胞、使用持续感染 ZIKV 的细胞系以及将持续感染的 ZIKV 细胞注入白膜样本。使用五种方法提取 RNA,并使用 qRT-PCR 对 ZIKV 进行定量分析。为了评估 RNA 文库制备方法,我们将病毒组 HEV RR.1 和 BEI-NR-59622(包含 PCV1、Reo、FeLV、RSV、EBV)注入 U937 细胞,提取总 RNA,并使用各种商业试剂盒和组合构建文库。这些文库在 Illumina NovaSeq 6000 平台上进行测序。正在分析 NGS 数据以确定病毒基因组图谱、基因组覆盖率和映射读取的百分比。结果与结论:总体而言,硅胶柱纯化的 TRIzol 提取被证明是提取病毒 RNA 的最佳方法。正如预期的那样,我们观察到不同的 NGS 文库制备方法之间存在显著差异。rRNA 耗竭有效减少了 NGS 文库中的人类 rRNA。正在进行进一步的数据分析,以研究各种文库制备方法对参考病毒 RNA 产生的 NGS 读数总数的影响。简明语言摘要:有效的病毒核酸提取和文库制备方法对于使用 NGS 技术从细胞和组织中检测不定病毒以及确保细胞和组织治疗的安全性至关重要。我们的研究评估了几种 RNA 提取方法,并观察到测试方法中病毒 RNA 提取效率的差异。总体而言,硅胶柱纯化的 TRIzol 是跨测试样本基质检测病毒最灵敏的方法。正如预期的那样,我们观察到不同的 NGS 文库制备方法之间存在显著差异。正在进行进一步的数据分析,以研究各种文库制备方法对参考病毒 RNA 产生的 NGS 读数总数的影响。
– 离体转基因细胞 – 非病毒载体(例如质粒) – 复制缺陷型病毒载体(例如腺病毒、腺相关病毒、慢病毒) – 复制能力强的病毒载体(例如麻疹、腺病毒、牛痘) – 微生物载体(例如李斯特菌、沙门氏菌) 干细胞/干细胞衍生
我们的一般建议是,您应该确定流程中可能出现变异和风险的地方。然后,通过风险评估,您应该确保已实施控制措施,以降低产品的变异性。这将根据产品逐一进行评估。例如,对于基于细胞的新鲜基因疗法,应进行运输验证,以确保从放行到交付和在临床现场给药期间产品质量不受影响。对于 AAV 载体,应使用标称滴度配制产品,以便您可以获得商业剂量策略的经验。这可以作为疗效评估解释的一部分。
一些要考虑的产品安全问题:•捐助者资格:自体与同种异体•发布分析:方法,控制/参考标准•无菌和支原体分析:方法论,快速测定,合格?•剂量测量测定:临床前研究的剂量测定不同;合格的?•关键原材料/试剂:来源,文档,COA•输送设备:调节状态,研究性,与药物兼容?…不是全包列表!
这是 CBER 正在考虑在 2025 日历年内制定的指导主题列表。该列表包括当前没有相关指导的主题、更新的指导可能有帮助的主题以及 CBER 已经发布的 1 级指导草案的主题,这些草案可能会在审查公众意见后最终确定。我们目前打算就这些主题制定指导文件;但是,中心不受此主题列表的约束,也不需要发布此列表上的每一份指导文件。我们可以制定不在此列表中的主题的指导文件。有关特定主题或指导的更多信息,请联系美国食品药品管理局生物制品评估和研究中心传播、外联和发展办公室,地址:10903 New Hampshire Ave., Bldg.71,Rm。3128, Silver Spring, MD 20993-0002,1-800-835-4709 或 240-402-8010,ocod@fda.hhs.gov。CBER 计划在 2025 年发布的指导文件:类别 – 血液和血液成分:
目前有许多 GE 技术可用于治疗。申办方应选择实现预期治疗效果所需的技术和基因组修饰类型。这包括是否引入双链 DNA 断裂,以及是否采用同源定向修复或非同源末端连接。申办方在设计其产品时还应考虑实现预期治疗效果所需的基因组修饰程度。我们将其称为治疗编辑阈值。在某些情况下,可以使用目前可用的替代疗法临床数据(例如干细胞移植)来确定。但是,这通常需要通过彻底的非临床研究进行解释。最后,申办方应选择最合适的产品设计和交付方法,同时考虑效率和安全性。这包括 GE 是在体内还是体外进行,以及 GE 成分如何输送。
如果赞助商已经完成了概念证明和一些安全研究,并且正处于确定性毒理学研究的设计和行为时,请求可能过于先进,并且更适合于投票前的新药应用(预印度)会议。另一个原因将被视为相互作用过于先进的原因是,是否已定义了用于临床研究的制造过程,并且您已经制定了测定法和初步释放标准。此外,如果产品的临床前测试和制造过程使用与同一赞助商提交给OTP的其他产品相同的平台,则该程序被认为处于高级阶段。,我们还将考虑相同产品和临床指示的先前研究中存在临床数据是一个更先进的开发阶段。
成为与每个美国人的生活息息相关的机构的一员!FDA 的生物制品评估与研究中心 (CBER) 治疗产品办公室 (OTP) 正在招募多名产品/化学、制造和控制 (CMC) 审查科学家作为研究员。治疗产品办公室 (OTP) 是 CBER 内新成立的超级办公室。OTP 的使命是通过数据驱动的流程促进公共健康,提供监管监督,帮助确保医疗产品安全有效。OTP 负责监督各种生物制品的开发和监管,包括细胞治疗产品、组织工程产品和基因治疗产品、源自血液的血浆蛋白产品及其重组类似物,以及用于生产这些产品的某些医疗设备。除了对产品质量、安全性和有效性进行监管审查外,超级办公室还开展与其监管的产品相关的应用科学研究,制定相关监管政策,并支持其他机构和中心部门确保遵守 CBER 生物制品法规。职责:被选中的候选人将进入尖端且快节奏的科学和监管环境。作为研究员,您将有机会: