理由:移植加速的动脉硬化是一种常见的并发症,它限制了器官移植受者的长期存活。虽然先前的研究表明CD34 +茎/祖细胞(SPC)参与此过程,但它们的异质性和潜在的不利影响仍未完全理解。方法:为了研究CD34 + SPC在移植动脉粥样硬化中的作用,我们使用了各种遗传改性的小鼠模型,包括BALB/C,C57BL/6J,CD34-CREER T2,ROSA26-TDTOMATO,ROSA26-TDTOMATO单细胞RNA测序(SCRNA-SEQ),趋化因子抗体微阵列,ELISA分析和免疫组织化学用于鉴定成纤维细胞祖细胞及其与平滑肌细胞的相互作用。此外,还进行了针对CCL11/CCR3-PI3K/AKT信号通路的体内和体外实验,以评估其在移植动脉粥样硬化的发病机理中的作用。结果:单细胞RNA-seq和遗传谱系追踪显示成纤维细胞祖细胞的亚群,其特征在于高CD34和PI16表达,它们分化为独特的趋化成纤维细胞亚群。蛋白质组学和SCRNA分析表明,该CD34 + PI16-亚组释放了CCL11(eotaxin -1),该子组通过平滑肌细胞的旁分泌激活促进了内膜增生。CCL11与其受体CCR3的结合激活了平滑肌细胞中的PI3K/AKT信号通路,驱动其增殖和迁移。体内,CCL11的过表达促进了新内膜增生,同时中和CCL11或抑制CCR3减轻了新内膜形成。结论:这些发现确定了CD34 + PI16 +成纤维细胞祖细胞,这些祖细胞分化为特定的趋化成纤维细胞,从而释放了趋化因子的趋化因子以形成新的趋化因子,这表明一种治疗策略靶向其趋化性活性。
CC 趋化因子配体 5 (CCL5) 是 CC 基序趋化因子家族的成员,该家族还包括巨噬细胞炎症蛋白 1 α (MIP-1 α ) 和巨噬细胞炎症蛋白 1 β (MIP-1 β ) (10-12)。CCL5 具有高亲和力,主要与其受体 CC 趋化因子受体 5 型 (CCR5) 以及 CCR1、CCR3、CCR4、CD44 和 GPR75 (13-15) 结合。CCL5 还通过激活核因子 κ -轻链增强子 (NF- κ B) 参与 B 细胞增殖 (16)。该蛋白在 T 淋巴细胞、巨噬细胞、血小板、滑膜成纤维细胞、小管上皮细胞和肿瘤细胞中表达 (17)。根据最近的研究,CCL5通过增强肿瘤转移(18)和重塑细胞外基质来促进肿瘤进展,从而支持肿瘤干细胞扩增(19),导致肿瘤细胞产生耐药性(20),降低DNA损伤因子的细胞毒性,减轻细胞代谢重编程(21),增加血管生成,动员免疫细胞(22),诱导巨噬细胞极化以抑制免疫反应(23)。然而,CCL5在BC中的潜在机制仍不清楚。
摘要:宿主免疫系统的稳态受到白细胞的调节,具有各种细胞表面受体用于细胞因子。趋化性细胞因子(趋化因子)激活其受体,以唤起稳态迁移或朝向炎症组织或病原体的炎症条件下免疫细胞的趋化性。免疫系统的失调导致疾病,例如过敏,自身免疫性疾病或癌症,需要有效,快速作用的药物,以最大程度地减少慢性炎症的长期影响。 在这里,我们进行了基于结构的虚拟筛选(SBV),并由Keras/Tensorflow神经网络(NN)辅助使用,以发现作用于三种趋化因子受体的新型化合物支架:CCR2,CCR3和一个CXC受体CXCR3。 keras/tensorflow nn在此使用不作为典型使用的二进制分类器,而是作为有效的多级分类器,不仅可以丢弃非活性化合物,还可以丢弃低或中等活性化合物。 在100 ns全原子分子动力学中测试了SBV和NN提出的几种化合物,以确认其结合效率。 为了改善化合物的基本结合功能,提出了新的化学修饰。 将修饰的化合物与这三种趋化因子受体的已知拮抗剂进行了比较。 已知的CXCR3化合物是最受预测的化合物之一。因此,除了基于结构的方法外,还显示了在药物发现中使用KERAS/Tensorflow的好处。 此外,我们表明KERAS/Tensorflow NN可以准确预测化合物的受体亚型选择性,SBV通常会失败。导致疾病,例如过敏,自身免疫性疾病或癌症,需要有效,快速作用的药物,以最大程度地减少慢性炎症的长期影响。在这里,我们进行了基于结构的虚拟筛选(SBV),并由Keras/Tensorflow神经网络(NN)辅助使用,以发现作用于三种趋化因子受体的新型化合物支架:CCR2,CCR3和一个CXC受体CXCR3。keras/tensorflow nn在此使用不作为典型使用的二进制分类器,而是作为有效的多级分类器,不仅可以丢弃非活性化合物,还可以丢弃低或中等活性化合物。在100 ns全原子分子动力学中测试了SBV和NN提出的几种化合物,以确认其结合效率。为了改善化合物的基本结合功能,提出了新的化学修饰。将修饰的化合物与这三种趋化因子受体的已知拮抗剂进行了比较。已知的CXCR3化合物是最受预测的化合物之一。因此,除了基于结构的方法外,还显示了在药物发现中使用KERAS/Tensorflow的好处。此外,我们表明KERAS/Tensorflow NN可以准确预测化合物的受体亚型选择性,SBV通常会失败。我们从Chembl和策划数据集检索到大麻素受体的跨测试趋化因子受体数据集。在从Chembl检索的大麻素受体数据集上训练的NN模型是受体亚型选择性预测中最准确的。在趋化因子受体数据集训练的NN模型中,CXCR3模型在区分给定化合物数据集的受体亚型方面表现出最高的精度。
摘要:宿主免疫系统的体内平衡受白细胞的调节,其中有8种细胞表面受体用于细胞因子。趋化性细胞因子(趋化因子)激活其受体9,以唤起稳态迁移或炎症条件下的免疫细胞的趋化性,即炎症组织或病原体。免疫系统的失调导致11种疾病,例如过敏,自身免疫性疾病或癌症,需要有效,快速作用的药物,以最大程度地减少慢性炎症的12种长期影响。在这里,我们进行了基于结构的虚拟筛选13(SBV),由KERAS/Tensorflow神经网络(NN)辅助,以查找在三个趋化因子受体上作用的新型化合物支架14:CCR2,CCR3和一个CXC受体CXCR3。keras/tensorflow 15 nn在这里不是用作典型使用的二进制分类器,而是作为有效的多级分类器16,不仅可以丢弃非活性化合物,而且还可以丢弃低或中等活性化合物。在100 ns全原子分子动力学中测试了SBV和NN提出的几种化合物,以确认其结合亲和力。为改善化合物的基本结合亲和力,提出了新的19种化学修饰。将修饰的化合物与这三个趋化因子受体的已知20个雄鹿主义者进行了比较。已知的CXCR3是预测的21磅,因此在基于结构的方法中显示了在药物发现中使用Keras/Tensorflow的好处。此外,我们表明KERAS/Tensorflow NN可以预测化合物的受体亚型选择性,SBV通常会失败。我们跨越了24个测试的趋化因子受体数据集,这些数据集从Chembl和策划的大麻素25受体中策划的数据集获取,网址为:http://db-gpcr-chem.uw.edu.pl。在从Chembl检索的大麻素26受体数据集上训练的NN模型是受体亚型选择性27预测中最准确的。在趋化因子受体数据集训练的NN模型中,CXCR3模型28在区分给定化合物数据集的受体亚型方面表现出最高的精度。29
摘要背景结直肠癌 (CRC) 是全球癌症相关死亡的主要原因,其进展是由结直肠癌干细胞 (CR-CSC) 驱动的,而结直肠癌干细胞受内源性和微环境信号的调控。白细胞介素 (IL)-30 已被证明对 CSC 活力和肿瘤进展至关重要。它是否参与 CRC 肿瘤发生并影响临床行为尚不清楚。方法通过蛋白质印迹、免疫电子显微镜、流式细胞术、细胞活力和球体形成试验确定 CRC 干细胞和非干细胞中 IL30 的产生和功能。CRISPR/Cas9 介导的 IL30 基因缺失、RNA-Seq 以及在 NSG 小鼠中植入转染或删除 IL30 基因的 CR-CSC 可以研究 IL30 在 CRC 致癌作用中的作用。CRC 样本的生物信息学和免疫病理学强调了临床意义。结果我们证明 CR-CSC 和 CRC 细胞均表达膜锚定 IL30,该 IL30 通过 WNT5A 和 RAB33A 调节其自我更新和/或增殖和迁移,主要通过上调 STAT3 上的 CXCR4 来调节,而 IL30 基因缺失会抑制 CXCR4 以及 WNT 和 RAS 通路。IL30 基因缺失会下调蛋白酶(如 MMP2 和 MMP13)、趋化因子受体(主要是 CCR7、CCR3 和 CXCR4)以及生长和炎症介质(包括 ANGPT2、CXCL10、EPO、IGF1 和 EGF)的表达。这些因素有助于 IL30 驱动的 CR-CSC 和 CRC 细胞扩增,而选择性阻断可消除这种扩增。 IL30 基因缺失的 CR-CSC 表现出降低的致瘤性,并在 80% 的小鼠中产生生长缓慢且转移性低的肿瘤,这些小鼠的存活时间比对照组长得多。对“结肠直肠腺癌 TCGA Nature 2012”集的生物信息学和 CIBERSORTx 以及对临床 CRC 样本中 IL30 表达的形态学评估表明,CRC 和浸润白细胞中缺乏 IL30 与总生存期延长相关。结论 IL30 是一种新的 CRC 驱动因素,因为其失活会禁用致癌途径和多个自分泌环路,从而抑制 CR-CSC 的致瘤性和转移能力。CRISPR/Cas9 介导的 IL30 靶向性的发展可以改善当前的 CRC 治疗前景。
多发性骨髓瘤(MM)是一种血液学癌,其特征是骨髓和毁灭性骨病中恶性血浆细胞的生长不受控制。MM细胞与肿瘤微环境(TME)细胞之间的相互通信驱动骨骼破坏,即使在缓解过程中,MM患者也持续存在。当前的疗法,包括双膦酸盐和denosumab,减少了MM骨化疾病患者的骨骼相关事件。仍然,这些药物的长期使用具有不利的副作用,包括骨吸收的完全关闭。因此,必须确定新的机制以将骨吸收恢复到生理水平,这对于寻找新靶标,扩展治疗选择的曲目并减少潜在的负面副作用至关重要。我们先前表明,MM细胞通过增加骨细胞凋亡和RANKL产生来刺激局部骨破坏,这是破骨细胞形成的必不可少的细胞因子。然而,OT中RANKL上调的分子机制尚不清楚。mM细胞产生丰富的MIP1α,这是一种与MM结局不佳相关的促炎性趋化因子,并且已知会增加成骨细胞中RANKL表达。在这项研究中,我们研究了MM衍生的MIP1α对MM-TME中骨细胞中RANKL调节的贡献。首先,我们确定骨细胞使用qPCR表达了良好的MIP1α受体CCR1,CCR3和CCR5。此外,我们发现重组MIP1α的治疗在骨细胞和含有原发性骨细胞的离体鼠长骨中增加了约2倍的RANKL表达。接下来,我们表明,从人JJN3 MM细胞或鼠5TGM1 MM细胞中使用25%条件培养基(CM)处理骨细胞,RANKL表达增加了约1.5-2倍。用抗MIP1α抗体处理完全阻断了这种作用。我们还观察到siRNA介导的MM细胞中MIP1α的敲低阻断了体外骨细胞RANKL调节。最后,我们生成了一个稳定的MM细胞系,MIP1α击倒了〜95%(MM-MIP1α-KD),并用盐水,MM对照细胞或MM-MIP1α-KD细胞在室内接种小鼠。对照细胞增加了在皮质骨中表达RANKL的骨细胞的数量,而MM细胞中MIP1α的敲低使RANKL-阳性骨细胞的患病率恢复为幼稚小鼠的水平。与该观察结果一致,MM细胞中MIP1α的敲低减轻骨质流失和肿瘤生长减少。这些结果表明MIP1α调节骨细胞RANKL表达以促进骨骼破坏和肿瘤进展。
A01 Mm.235137 NM_007926 Aimp1 氨酰 tRNA 合成酶复合物相互作用多功能蛋白 1 A02 Mm.103205 NM_007553 Bmp2 骨形态发生蛋白 2 A03 Mm.1283 NM_011329 Ccl1 趋化因子(CC 基序)配体 1 A04 Mm.4686 NM_011330 Ccl11 趋化因子(CC 基序)配体 11 A05 Mm.867 NM_011331 Ccl12 趋化因子(CC 基序)配体 12 A06 Mm.41988 NM_011332 Ccl17 趋化因子(CC 基序)配体 17 A07 Mm.424740 NM_011888 Ccl19 趋化因子(CC 基序)配体 19 A08 Mm.290320 NM_011333 Ccl2 趋化因子(CC 基序)配体 2 A09 Mm.116739 NM_016960 Ccl20 趋化因子(CC 基序)配体 20 A10 Mm.12895 NM_009137 Ccl22 趋化因子(CC 基序)配体 22 A11 Mm.31505 NM_019577 Ccl24 趋化因子(CC 基序)配体 24 A12 Mm.1282 NM_011337 Ccl3 趋化因子(CC 基序)配体 3 B01 Mm.244263 NM_013652 Ccl4 趋化因子(CC 基序)配体 4 B02 Mm.284248 NM_013653 Ccl5 趋化因子(CC 基序)配体 5 B03 Mm.137 NM_009139 Ccl6 趋化因子(CC 基序)配体 6 B04 Mm.341574 NM_013654 Ccl7 趋化因子(CC 基序)配体 7 B05 Mm.42029 NM_021443 Ccl8 趋化因子(CC 基序)配体 8 B06 Mm.416125 NM_011338 Ccl9 趋化因子(CC 基序)配体 9 B07 Mm.274927 NM_009912 Ccr1 趋化因子(CC 基序) 受体 1 B08 Mm.8021 NM_007721 Ccr10 趋化因子 (CC 基序) 受体 10 B09 Mm.6272 NM_009915 Ccr2 趋化因子 (CC 基序) 受体 2 B10 Mm.57050 NM_009914 Ccr3 趋化因子 (CC 基序) 受体 3 B11 Mm.1337 NM_009916 Ccr4 趋化因子 (CC 基序) 受体 4 B12 Mm.14302 NM_009917 Ccr5 趋化因子 (CC 基序) 受体 5 C01 Mm.8007 NM_009835 Ccr6 趋化因子 (CC 基序) 受体 6 C02 Mm.442098 NM_007720 Ccr8 趋化因子(CC 基序)受体 8 C03 Mm.4861 NM_011616 Cd40lg CD40 配体 C04 Mm.795 NM_007778 Csf1 集落刺激因子 1(巨噬细胞) C05 Mm.4922 NM_009969 Csf2 集落刺激因子 2(粒细胞-巨噬细胞) C06 Mm.1238 NM_009971 Csf3 集落刺激因子 3(粒细胞) C07 Mm.103711 NM_009142 Cx3cl1 趋化因子(C-X3-C 基序)配体 1 C08 Mm.21013 NM_008176 Cxcl1 趋化因子(CXC 基序)配体 1 C09 Mm.877 NM_021274 Cxcl10 趋化因子(CXC 基序)配体 10 C10 Mm.131723 NM_019494 Cxcl11 趋化因子(CXC 基序)配体 11 C11 Mm.303231 NM_021704 Cxcl12 趋化因子(CXC 基序)配体 12 C12 Mm.10116 NM_018866 Cxcl13 趋化因子(CXC 基序)配体 13 D01 Mm.64326 NM_011339 Cxcl15 趋化因子(CXC 基序)配体 15 D02 Mm.4660 NM_009141 Cxcl5 趋化因子(CXC 基序)配体 5 D03 Mm.766 NM_008599 Cxcl9 趋化因子(CXC 基序)配体 9 D04 Mm.234466 NM_009909 Cxcr2 趋化因子(CXC 基序)受体 2 D05 Mm.12876 NM_009910 Cxcr3 趋化因子(CXC 基序)受体 3 D06 Mm.6246 NM_007551 Cxcr5 趋化因子(CXC 基序)受体 5 D07 Mm.3355 NM_010177 Fasl Fas 配体(TNF 超家族,成员 6) D08 Mm.240327 NM_008337 Ifng 干扰素伽马 D09 Mm.379327 NM_008348 Il10ra 白细胞介素10 受体,α
OSCC占所有口服癌症的90%以上,是全球主要的公共卫生问题,在过去的三十年中,预后的改善最小(Shrestha等,2020; Johnson等,2020)。 这种高度异质的癌症以局部侵袭和免疫抑制为特征(Hung等,2024; Estephan等,2024; Yang等,2021),在分子和组织学水平上产生显着影响的预后(Liu等,2024)。 长期以来一直表明,不同的入侵模式(POI)具有不同的侵入性能力(Bryne等,1989; Brandwein-Gensler等,2005; Rivera-Colon等,2020; Morales-Oyarvide和Mino-oyarvide and Mino-Kenudson,2016; Langner等,2016; Langner等,2016; Langner等,2006)。 以更具侵略性的形式,主要的促炎细胞因子和趋化因子驱动肿瘤进展(Mamun等,2022; Kondoh和Mizuno-Kamiya,2022; Do等,2020; Tokunaga et al。,2020; Chen等,2015)。 我们先前的研究表明,CCL26在最严重的入侵模式(WPOI)中分泌的CCL26 4 - 5型改变了肿瘤表型并与患者存活率降低相关(Ding等,2022)。 有关CCL26在OSCC中的作用的当前文献(除了我们的研究之外)仍然很少。 CCL26,也称为嗜酸性粒细胞趋化因子-3,主要由巨噬细胞和上皮细胞表达,并对嗜酸性粒细胞,单核细胞和MDSC具有趋化作用(Korbecki等,2020)。 它通过与CX3CR1结合起作用。 已发现肝磷酸酶3通过上调通过上调CCL26诱导TAM进行锻炼,从而促进结直肠癌的侵袭和转移(Lan等,2018)。 初步发现OSCC占所有口服癌症的90%以上,是全球主要的公共卫生问题,在过去的三十年中,预后的改善最小(Shrestha等,2020; Johnson等,2020)。这种高度异质的癌症以局部侵袭和免疫抑制为特征(Hung等,2024; Estephan等,2024; Yang等,2021),在分子和组织学水平上产生显着影响的预后(Liu等,2024)。长期以来一直表明,不同的入侵模式(POI)具有不同的侵入性能力(Bryne等,1989; Brandwein-Gensler等,2005; Rivera-Colon等,2020; Morales-Oyarvide和Mino-oyarvide and Mino-Kenudson,2016; Langner等,2016; Langner等,2016; Langner等,2006)。以更具侵略性的形式,主要的促炎细胞因子和趋化因子驱动肿瘤进展(Mamun等,2022; Kondoh和Mizuno-Kamiya,2022; Do等,2020; Tokunaga et al。,2020; Chen等,2015)。我们先前的研究表明,CCL26在最严重的入侵模式(WPOI)中分泌的CCL26 4 - 5型改变了肿瘤表型并与患者存活率降低相关(Ding等,2022)。有关CCL26在OSCC中的作用的当前文献(除了我们的研究之外)仍然很少。CCL26,也称为嗜酸性粒细胞趋化因子-3,主要由巨噬细胞和上皮细胞表达,并对嗜酸性粒细胞,单核细胞和MDSC具有趋化作用(Korbecki等,2020)。它通过与CX3CR1结合起作用。已发现肝磷酸酶3通过上调通过上调CCL26诱导TAM进行锻炼,从而促进结直肠癌的侵袭和转移(Lan等,2018)。初步发现先前的研究表明,CCL26经常失调以促进许多恶性肿瘤的发作和进展(Kawano等,2021; Donlon等,2020; Luo等,2018),研究以证明其在OSCC中的有效性缺乏,这对于CCL26-Tarpertarget for oscc的未来研究至关重要。At the same time, CCL26 was previously shown to bind to and activate CCR3, a chemokine-receptor pair that may play an important role in a range of immune-mediated diseases such as persistent asthma ( Larose et al., 2015 ), CCL26 has been shown to be the most potent inducer of eosinophil migration, and increasing evidence suggests that aberrant CCL26 plays a role not only in in肿瘤侵袭的流经,还包括塑造肿瘤免疫微环境(时间)在锻炼中的变化(Domaingo等,2023),最终影响免疫疗法的效率(Li等,2023,2023; Heeran等,2021; Heeran et al。,2021; 2021; hu e e e e,202; t al。虽然先前的研究提供了对CCL26在特定癌症中的作用的初步见解,但已提出针对趋化因子及其受体作为免疫疗法的有希望的策略(Qin等,2023),但在OSCC跨OSCC领域中,其在跨越OSCC领域的广泛意义仍然是未知的。肿瘤免疫疗法是一种相对新颖的治疗方法,有望控制肿瘤复发和转移(Chen等,2023)。目前,OSCC的免疫疗法选项极为有限,因此我们迫切需要更多的治疗靶点来改善OSCC患者的生存和预后。因此,在这项工作中,我们系统地研究了CCL26趋化因子在肿瘤微环境(TME)中的临床表达模式,临床病理特征和预后价值。阐明了OSCC中CCL26的空间分布模式,并初步证实了它与患者不良的预后密切相关。此外,我们使用了生物信息学分析方法,例如多个肿瘤数据库和基因富集,以揭示其潜在的功能机制。
