PDE4C 中的区域保持稳定超过三个月。此外,表观遗传编辑引发了许多全基因组脱靶效应,这些效应具有高度可重复性,并在其他与年龄相关的 CpG 中富集 - 因此,它们不是随机的脱靶效应,而似乎类似于共同调节的表观遗传旁观者修饰。年龄相关位点的 4C 染色质构象分析显示与旁观者修饰和其他与年龄相关的 CpG 位点的相互作用增加。随后,我们在 HEK293T 和原代 T 细胞中的五个基因组区域多重分析了表观遗传修饰,这些区域在衰老时会变得高甲基化或低甲基化。虽然在年龄低甲基化的 CpG 处进行的表观遗传编辑似乎不太稳定,但它也导致其他与年龄相关的 CpG 处旁观者修饰明显富集。相反,表观遗传时钟往往会在靶向 DNA 甲基化后长达十年内加速,尤其是在高甲基化的 CpG 处。这些结果表明,有针对性的表观基因组编辑可以调节整个表观遗传衰老网络,从而干扰表观遗传时钟。
来自六项研究,报道了与神经病理学相关的CPG。 [14]但是,EWAS方法研究了仅具有感兴趣特征的单个CPG的甲基化水平的关联。 由于分析中使用的许多CPG的多次测试校正,可能会丢失具有统计学意义的生物学意义上的发现。 另外,可以假设共享其功能或生物途径的CPG倾向于共甲基化。 [15–17]考虑基因组的功能复杂性和表观遗传调节的动态性质,[18]一种分析方法,该方法将CPG的甲基化水平之间的相关性鉴定出来,可能会识别出EWAS未鉴定出的新型CPG或未鉴定的基因。 在这方面,共甲基化网络分析可能是有益的,因为:(1)它可以识别共享生物学途径的共甲基化网络模块,并且(2)它可以通过减小维度提高统计能力来识别新颖的CPGS或基因。 目前,缺乏综合性疾病的甲基化网络分析在表观遗传学研究中的应用有限,[19,20]和使用范围基因组范围的数据进行共甲基化网络分析的与AD相关的研究是有限的。来自六项研究,报道了与神经病理学相关的CPG。[14]但是,EWAS方法研究了仅具有感兴趣特征的单个CPG的甲基化水平的关联。由于分析中使用的许多CPG的多次测试校正,可能会丢失具有统计学意义的生物学意义上的发现。另外,可以假设共享其功能或生物途径的CPG倾向于共甲基化。[15–17]考虑基因组的功能复杂性和表观遗传调节的动态性质,[18]一种分析方法,该方法将CPG的甲基化水平之间的相关性鉴定出来,可能会识别出EWAS未鉴定出的新型CPG或未鉴定的基因。在这方面,共甲基化网络分析可能是有益的,因为:(1)它可以识别共享生物学途径的共甲基化网络模块,并且(2)它可以通过减小维度提高统计能力来识别新颖的CPGS或基因。目前,缺乏综合性疾病的甲基化网络分析在表观遗传学研究中的应用有限,[19,20]和使用范围基因组范围的数据进行共甲基化网络分析的与AD相关的研究是有限的。
抽象的目标是评估最相关的临床实践指南(CPG)中建议的策略顺序的相似性和差异,以治疗成年人对一线治疗的反应不足的抑郁症。数据来源,我们对跨越2011年1月至2020年8月的文献进行了系统评价,该文献在Medline,Embase,Cochrane库和12个被公认为CPGS存储库的数据库中进行了审查。使用研究和评估II指南评估(同意II)评估 CPGS质量。 研究选择资格标准是CPG,其中描述了在门诊护理环境中为18岁以上的患者治疗抑郁症的药理建议。 我们包括了考虑高质量的CPG(同意II的域3中≥80%)或被认为是临床相关的。 数据提取,两位独立的研究人员针对对所选CPG的一线药理治疗没有反应的患者提取了建议。 结果,我们包括46个CPG和选定的8个,其中5个被认为是高质量(同意II的域3中≥80%),而3个被认为是临床上相关的。 三个CPG并未定义对治疗的反应不足,而3个CPG没有建立明确的策略序列。 确定患者未反应所需的治疗持续时间在3个CPG中没有明确,并且在5个CPG中不一致。 大多数CPG都同意重新评估诊断,评估合并症的存在,遵守治疗并增加剂量作为第一步。CPGS质量。研究选择资格标准是CPG,其中描述了在门诊护理环境中为18岁以上的患者治疗抑郁症的药理建议。我们包括了考虑高质量的CPG(同意II的域3中≥80%)或被认为是临床相关的。数据提取,两位独立的研究人员针对对所选CPG的一线药理治疗没有反应的患者提取了建议。结果,我们包括46个CPG和选定的8个,其中5个被认为是高质量(同意II的域3中≥80%),而3个被认为是临床上相关的。三个CPG并未定义对治疗的反应不足,而3个CPG没有建立明确的策略序列。确定患者未反应所需的治疗持续时间在3个CPG中没有明确,并且在5个CPG中不一致。大多数CPG都同意重新评估诊断,评估合并症的存在,遵守治疗并增加剂量作为第一步。所有CPG都建议心理治疗,切换抗抑郁药以及考虑增强/组合抗抑郁药。结论相关的CPG在建议无反应者对一线抗抑郁治疗的建议中存在缺点,包括缺席和发散性,以定义不充分的反应和推荐策略顺序。总体而言,大多数相关的CPG建议重新评估诊断,评估合并症,遵守治疗,增加
FBI,CISA,EC3和NCSC-NL建议组织应用以下缓解措施,以限制对公共系统和网络发现技术的潜在对抗使用,并降低Akira Ransomware妥协的风险。这些缓解措施与CISA和美国国家标准技术研究所(NIST)开发的跨部门网络安全性能目标(CPG)保持一致。CPG提供了CISA和NIST建议所有组织实施的最低实践和保护。CISA和NIST基于现有的网络安全框架和指导,以防止最常见和有影响力的威胁和TTP。访问CISA的跨部门网络安全性能目标,以获取有关CPG的更多信息,包括其他建议的基线保护。
怀孕期间的异常血压与胎儿生长受损有关,使后代对心脏代谢异常,而生命过程中的后代异常异常。胎盘DNA甲基化可能是孕产妇血压影响胎儿和成人健康结果的调节途径。遍及胎盘样品参与者的表观基因组的关联研究研究了每个三个月的收缩压和舒张压之间的DNA甲基化和MMHG之间的关联。使用基因表达,基因途径和功能注释分析进一步研究了发现。CpG。在第一个中,孕产妇收缩压和舒张压与3个CPG相关,第二个中期为6个CPG,在第三个孕期为5%FDR(p值范围为6.6×10-15-15-15-2.3×10 -7)。 几个CPG富含包括心血管代谢发育在内的途径(P = 1.0×10 -45)。 增加的收缩压和舒张压与Col12a1的CpG甲基化和基因表达增加有关,Col12a1是一种胶原蛋白家族基因,该基因因心脏的调节功能而闻名。 在304个先前报道的CPG中,已知与心脏代谢性状有关的CPG,在我们的数据中,36个胎盘CpG与收缩压和舒张压有关。 本研究为与心脏代谢性疾病有关的基因期间胎盘DNA甲基化与孕妇血压升高之间的关联提供了第一个证据。在第一个中,孕产妇收缩压和舒张压与3个CPG相关,第二个中期为6个CPG,在第三个孕期为5%FDR(p值范围为6.6×10-15-15-15-2.3×10 -7)。几个CPG富含包括心血管代谢发育在内的途径(P = 1.0×10 -45)。增加的收缩压和舒张压与Col12a1的CpG甲基化和基因表达增加有关,Col12a1是一种胶原蛋白家族基因,该基因因心脏的调节功能而闻名。在304个先前报道的CPG中,已知与心脏代谢性状有关的CPG,在我们的数据中,36个胎盘CpG与收缩压和舒张压有关。本研究为与心脏代谢性疾病有关的基因期间胎盘DNA甲基化与孕妇血压升高之间的关联提供了第一个证据。鉴定胎盘中血压相关的甲基化位点可能会为心脏代谢功能障碍的早期起源提供线索,并为早期预防提供指南。
摘要:本文介绍了一种非线性方法,用于识别 CpG DNA 甲基化数据组合作为阿尔茨海默病 (AD) 的生物标记。本文将展示所提出的算法可以大幅减少使用的 CpG 数量,同时生成的预测比使用所有可用的 CpG 更准确。假设该过程原则上可以是非线性的;因此,非线性方法可能更合适。所提出的算法选择将哪些 CpG 用作分类问题的输入数据,该分类问题试图区分患有 AD 的患者和健康对照个体。这种类型的分类问题适用于支持向量机等技术。该算法既可用于单个数据集级别,也可用于多个数据集。开发适用于多数据集的稳健算法具有挑战性,因为实验室程序中的细微差异会对获得的数据产生影响。本文中采用的方法可以扩展到多个数据集,从而可以逐步更细致地了解底层过程。使用所提出的方法,获得了 92% 的成功分类率,这一值高于使用所有可用 CpG 获得的结果。这可能是由于该算法降低了数据维度,从而有助于降低达到局部最小值的风险。
审查2型糖尿病(T2DM)的抽象目的是世界上死亡和残疾的主要原因之一。大多数糖尿病死亡(> 80%)发生在拉丁美洲占主导地位的低收入和中等收入国家。因此,本文的目的是比较拉丁美洲T2DM药理学管理(LA)的临床实践指南(CPG)与国际参考指南。最近的调查结果最近有几个国家开发了CPG。但是,根据同意II工具,这些准则的质量尚不清楚,并将其作为国际影响的三种CPG:美国糖尿病协会(ADA),欧洲糖尿病协会(EASD)和拉丁美洲糖尿病协会(ALAD)。摘要选择了十个CPG进行分析。ADA在同意II域上得分> 80%,并被选为主要比较器。2018年之前开发了80%的LA CPG。不建议使用一个(所有域<60%)。LA中的CPG质量良好,但已过时。与参考相比,它们具有很大的差距。需要改进,因为每三年提议更新,以在所有准则中保持最佳可用临床证据。
网络安全和基础设施安全局(CISA)将跨部门网络安全绩效目标(CPG)定义为通过通过彻底的行业,政府和专家咨询的旨在有意义地降低风险的关键基础设施行动和美国人民的网络安全实践的子集。尽管CPG本质上是自愿的,但它们旨在帮助组织发展和增强其在网络安全工作中的投资。CISA的CPG已组织为与国家标准与技术研究所(NIST)的网络安全框架1.0(CSF 1.0)的五个主要功能保持一致:识别,保护,检测,响应和恢复。CISA的举措和计划是在关键基础设施部门推动服务入学率和CPG采用,其在医疗保健和公共卫生,水和废水系统,通信以及政府服务和设施领域的影响最大。关键发现:
DNA 甲基化主要发生在哺乳动物基因组中的胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤 (CpG) 二核苷酸上,并且甲基化景观在有丝分裂细胞分裂期间得以维持。有人假设相邻 CpG 之间维持甲基化活性的耦合对于细胞世代的稳定性至关重要;然而,其中的机制尚不清楚。我们使用数学模型和随机模拟来分析实验数据,这些实验探测细胞中复制后新生 DNA 的全基因组甲基化。我们发现单个 CpG 上的 DNA 甲基化维持率在局部上是相关的,并且这种相关的程度因基因组区域环境而异。通过使用蛋白质沿 DNA 扩散理论,我们表明甲基化率与基因组距离相关性的指数衰减与酶的过程性一致。我们的结果为体内全基因组甲基转移酶的过程性提供了定量证据。我们进一步开发了一种方法来解开动力学相关性的不同机械来源。根据实验数据,我们估计,如果相邻 CpG 平均相距 36 个碱基对,单个甲基转移酶会持续甲基化相邻 CpG。但对于较长的 CpG 间距离,其他耦合机制占主导地位。我们的研究表明,通过将数据驱动的统计分析与假设驱动的数学建模相结合,可以从与复制相关的基于细胞的全基因组测量中获得对酶促机制的定量洞察。