图3 a)在EN-374中,MGMT P140K蛋白的表达是由无处不在的启动子驱动的,并且通过使用抗人MGMT特异性抗体,可以评估泛元素中的基因标记。在这项研究中,通过流式细胞仪评估了在循环中性粒细胞中测量MGMT基因标记。cybb在末端分化的中性粒细胞中表达,二氢二胺(DHR)测定是一种基于流式细胞仪的方法,用于测量刺激的循环中性粒细胞中NADPH氧化酶活性。纵向b)Cybb蛋白和C)循环外周中性粒细胞中的DHR活性。垂直虚线表示富集的周期。研究结束d)循环中性粒细胞中的Cybb蛋白和e)DHR活性。水平虚线表示10%的治疗阈值。恢复超过10%的具有NADPH氧化酶活性的中性粒细胞已显示出X-CGD患者的感染结果的临床意义改善。f)散装骨髓中有效载荷的研究矢量拷贝数(VCN)。这些数据共同证明了HSC的有效体内工程的概念概念证明,从而导致X-CGD疾病模型小鼠的治疗水平上功能性CYBB的表达。
蛋白质。我们在此报告了通过同源定向修复在患者造血干细胞/祖细胞 (HSPC) 中进行基因校正,使用 CRISPR/Cas9 将腺相关病毒供体的 CYBB 外显子 1-13 或 2-13 cDNA 靶向插入内源性 CYBB 外显子 1 或外显子 2 位点。外显子 1-13 cDNA 的靶向插入不会恢复生理 gp91 phox 水平,这与 CYBB 表达对内含子 1 的要求一致。然而,外显子 2-13 cDNA 的插入完全恢复了吞噬细胞分化时 gp91 phox 和 ROS 的产生。添加土拨鼠肝炎病毒转录后调控元件不会进一步增强外显子 2-13 校正细胞中的 gp91 phox 表达,表明保留内含子 1 足以实现最佳 CYBB 表达。使用 i53 mRNA 暂时抑制非同源末端连接,靶向校正增加了约 1.5 倍。在 NSG 小鼠中植入后,校正后的 HSPC 产生了吞噬细胞,并恢复了 gp91 phox 和 ROS 的产生。我们的研究结果证明了
摘要:慢性肉芽肿病 (CGD) 是一种遗传性免疫缺陷病,主要由 X 连锁 CYBB 基因突变引起,该突变会破坏吞噬细胞和微生物防御中的活性氧 (ROS) 产生。使用造血干细胞和祖细胞 (HSPC) 中的 CRISPR/Cas9 系统进行基因修复是一种很有前途的 CGD 治疗技术。为了支持建立有效且安全的 CGD 基因疗法,我们生成了一种携带患者来源的 CYBB 基因突变的小鼠模型。我们的 CybbC517del 小鼠系显示出 CGD 的特征,并为 Cybb 缺陷的 HSPC 提供了来源,可用于评估体外和体内的基因治疗方法。在 HSPC 中使用 Cas9 RNPs 和 AAV 修复载体的设置中,我们表明 19% 的治疗细胞中的突变可以得到修复,并且治疗可以恢复巨噬细胞的 ROS 产生。总之,我们的 CybbC517del 小鼠系为改进和评估新型基因疗法以及研究 X-CGD 病理生理学提供了一个新的平台。
目的:糖尿病肾病 (DKD) 是全球慢性肾病 (CKD) 的主要原因。阐明 DKD 中铁死亡和免疫的分子机制可能有助于开发潜在有效的治疗方法。本研究旨在对 DKD 中的铁死亡和免疫相关差异表达 mRNA (DEG) 进行综合分析。材料和方法:从基因表达综合 (GEO) 数据库下载 DKD 患者和对照样本的基因表达谱。使用 R 软件筛选潜在的差异表达基因 (DEG),并从 DEG 中提取铁死亡免疫相关差异表达基因 (FIRDEG)。我们进行了功能富集分析,并构建了蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络、转录因子 (TF)-基因网络和基因-药物网络,以探索它们的潜在生物学功能。相关性分析和受试者工作特征曲线用于评估 FIRDEG。我们使用CIBERSORT算法来检查免疫细胞的组成并确定FIRDEG特征与免疫细胞之间的关系。最后,使用RT-PCR在动物肾脏样本中验证了六种FIRDEG的RNA表达。结果:我们鉴定了80个FIRDEG并进行了功能分析。我们利用PPI网络鉴定了六个枢纽基因(Ccl5、Il18、Cybb、Fcgr2b、Myd88和Ccr2),并预测了潜在的TF基因网络和基因-药物对。DKD中的免疫细胞(包括M2巨噬细胞、静息肥大细胞和γ-delta T细胞)发生了改变;FIRDEG(Fcgr2b、Cybb、Ccr2和Ccl5)与M2巨噬细胞和γ-delta T细胞的浸润丰度密切相关。最后,在小鼠肾脏样本中验证了枢纽基因。结论:我们鉴定了 DKD 中的六个枢纽 FIRDEG(Ccl5、Il18、Cybb、Fcgr2b、Myd88 和 Ccr2),并预测了潜在的转录因子基因网络和未来研究的可能治疗靶点。关键词:糖尿病肾病、铁死亡、免疫、生物信息学
摘要背景分枝杆菌包括各种毒力的普遍存在种。然而,环境和个体特定因素,特别是宿主遗传因素,在接触分枝杆菌的结果中起着至关重要的作用。单基因分枝杆菌易感性的第一个分子证据来自对分枝杆菌病 (MSMD) 孟德尔易感性的研究,这是一种罕见的 IFN-γ 免疫先天缺陷,即使对低毒力分枝杆菌感染也具有选择性易感性,患者大多为儿童,常规检查中没有可识别的免疫缺陷。本文全面、最新地描述了所有已知的 MSMD 单基因缺陷最重要的分子、细胞和临床特征。结果 在过去的 20 年中,已发现 MSMD 患者中有 19 个基因发生突变(IFNGR1、IFNGR2、IFNG、IL12RB1、IL12RB2、IL23R、IL12B、ISG15、USP18、ZNFX1、TBX21、STAT1、TYK2、IRF8、CYBB、JAK1、RORC、NEMO 和 SPPL2A),这些基因位点的等位基因异质性已导致 35 种不同的遗传缺陷的定义。尽管存在临床和遗传异质性,但几乎所有 MSMD 的遗传病因都会改变干扰素 γ (IFN- γ ) 介导的免疫力,方法是削弱或消除 IFN- γ 的产生或对该细胞因子的反应,或两者兼而有之。已证明人类 IFN- γ 水平是决定分枝杆菌感染结果的数量性状。结论 这些单基因缺陷的研究有助于了解人类分枝杆菌感染的分子机制,并有助于开发新的诊断和治疗方法以改善护理和预后。这些发现还弥合了简单的孟德尔遗传与复杂的人类遗传学之间的差距。关键词 分枝杆菌病、单基因、先天性免疫缺陷、孟德尔易感性、IFN-γ