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CRISPR/Anti-CRISPR 基因组编辑方法强调了丙酮丁醇梭菌 DSM 792 中丁醇脱氢酶的协同作用
François Wasels、Gwladys Chartier、Rémi Hocq、Nicolas Lopes Ferreira。CRISPR/Anti-CRISPR 基因组编辑方法强调了丙酮丁醇梭菌 DSM 792 中丁醇脱氢酶的协同作用。应用与环境微生物学，2020 年，86 (13)，第 e00408-20 页。�10.1128/AEM.00408-20�。�hal-02913128�
单宁酸对与球球菌和灌注梭状芽胞杆菌共同感染的肉鸡的抗氧化功能，免疫力和肠屏障
简单的摘要：坏死性肠炎（NE）主要是由球球菌和灌木梭状芽胞杆菌（CCP）引起的，这些（CCP）可以诱导肉鸡中的肠损伤和氧化应激。单宁酸（TA）是具有抗细菌，抗炎和抗氧化功能的天然多酚化合物。已经证明，补充可水解的饮食对肉鸡的生长和抗氧化能力具有有益的影响。然而，仍然需要阐明TA对具有NE条件的肉鸡中肠道健康和抗氧化功能的影响。因此，本研究旨在评估与CCP共同感染的肉鸡中TA对抗氧化功能，免疫力和肠壁的影响。结果表明，在饮食中添加1000 mg/kg ta可以改善空肠屏障，减轻空肠的炎症反应，并通过激活NRF2-keap1-keap1-keap1-keap1-keap1 pathway in ccp in ccp in cccp infected cccp infect in ccp infected nrf2-keap1-keap1 partection nrf2下游的肝脏和空肠的抗氧化能力。
艰难梭菌感染和免疫检查点抑制剂诱导的黑色素瘤结肠炎：18例和文献综述
免疫疗法已成为多种类型癌症（例如黑色素瘤）的护理标准。但是，它可以诱导毒性，包括免疫检查点抑制剂诱导的结肠炎（CIC）。CIC具有炎症性肠病（IBD）的几种临床，组织学，生物学和治疗特征。艰难梭菌感染（CDI）会使IBD的演变变得复杂。我们旨在表征抗CTLA-4和抗PD-1的CDI与CIC之间的关联。来自2010年至2021年的抗CTLA-4和抗PD-1的九个中心的患者和抗PD-1的患者包括在2010年至2021年。主要终点是CIC的出现。次要终点是发现CDI的发现。包括18名患者。用抗PD-1，四个用抗CTLA-4和抗PD-1与抗PD-1与抗CTLA-4结合使用抗PD-1，四个。在18例患者中，有6例分离出CDI，而12例患有CIC和CDI。在这12位患者中，有8例CIC患有CDI复杂，三个同时使用CIC和CDI，其中1例患有CDI，其次是CIC。CDI在三名患者中是暴发的。内窥镜和组织学特征并未具体区分CDI与CIC。CDI
生物电化学系统（BESS）中平台化学物质的无机碳同化和电合成，接种了胰囊核丁基丁基乙酸酯N1-H4
摘要：需要更绿色的过程满足平台化学物质的需求，以及从人类活动中重复使用CO 2的可能性，最近鼓励了对生物电化学系统（BESS）的设置，优化和开发的研究，以从无线电碳（Co 2，Hco 3-co 3 - ）中进行有机化合物的电合合成。在本研究中，我们测试了糖氯丁基乙二醇N1-4（DSMZ 14923）的能力，从而产生乙酸盐和D-3-羟基丁酸的D-3-羟基丁酸，从CO 2：N 2气体中存在的无机碳中产生。同时，我们测试了Shewanella Oneidensis MR1和铜绿假单胞菌PA1430/CO1财团的能力，以提供降低的能力以维持阴极的碳同化。我们测试了具有相同布局，接种物和介质的三个不同系统的性能，但是使用1.5 V外部电压，1000Ω外部负载，并且没有电极或外部设备之间的任何连接（开路电压，OCV）。我们将CO 2同化速率和代谢产物的产生（甲酸盐，乙酸3-D-羟基丁酸）与非电气对照培养物中获得的值进行了比较，并估计了我们的BESS用来同化1摩尔的CO 2的能量。我们的结果表明，当微生物燃料电池（MFC）连接到1000Ω外部电阻器时，糖链球菌NT-1的最大CO 2同化（95.5％），并以Shewanella / Pseudomonas conscontium作为电子来源。此外，我们检测到C. saccharoperbutylacetonicum nt-1的代谢发生了变化，因为它在BES中的活性延长。我们的结果开放了在碳捕获和平台化学物质的电气合成中利用BES的新观点。
酪丁酸梭菌作为微生物细胞工厂的开发，用于从木质纤维素原料中生产燃料和化学中间体
将木质纤维素底物微生物转化为燃料和平台化学中间体为建立可行的生物经济提供了一条可持续的途径。然而，这种方法面临着一系列关键的技术、经济和可持续性障碍，包括：底物利用不充分、木质纤维素水解产物和/或最终产品毒性、产品回收效率低下、培养要求不兼容以及生产率指标不足。开发具有适合在工艺相关条件下高产率转化木质纤维素底物天然特性的生产宿主，提供了一种绕过上述障碍并加速微生物生物催化剂部署开发的方法。酪丁酸梭菌是一种天然的短链脂肪酸生产菌，它表现出一系列特性，使其成为转化木质纤维素底物的理想候选菌，因此是微生物生产各种羧酸衍生产品套件的有希望的宿主。本文回顾了该细菌作为工业微生物细胞工厂的开发的最新进展和未来方向，重点是利用木质纤维素底物和代谢工程方法。
肠道梭状芽胞杆菌衍生的吲哚酸通过激活妊娠X受体
骨稳态通过破骨细胞介导的骨吸收和成骨细胞介导的骨形成保持。绝经后妇女雌激素水平的急剧下降会导致破骨细胞过度活化，骨稳态受损和随后的骨质流失。肠道微生物组的变化会影响骨矿物质密度。但是，肠道微生物组在雌激素缺乏引起的骨质流失及其潜在机制中的作用仍然未知。在这项研究中，我们发现孢子菌的丰度（C. spor。） 及其衍生的代谢产物，吲哚丙酸（IPA）在卵巢切除（OVX）小鼠中降低。 体外测定法表明IPA抑制了破骨细胞的分化和功能。 在分子水平上，IPA抑制了核因子Kappa-配体（RANKL）诱导的妊娠X受体（PXR）泛素化和降解的受体激活剂，从而导致PXR与P65的持续结合增加。 在体内每日IPA给药或重复的C. spor。 定殖侵害了OVX诱导的骨质流失。 保护活细菌免受严峻的胃环境，并延迟口服孢子孢子的排空。 从肠道，一个C. spor。 - 封装的丝纤维蛋白（SF）水凝胶系统，在OVX小鼠中获得了与重复的细菌移植或每日给药相当的OVX小鼠的骨骼保护。 总体而言，我们发现肠道孢子 - 衍生的IPA通过调节PXR/p65复合物来参与雌激素缺乏诱导的破骨细胞过度活化。在这项研究中，我们发现孢子菌的丰度（C. spor。）及其衍生的代谢产物，吲哚丙酸（IPA）在卵巢切除（OVX）小鼠中降低。体外测定法表明IPA抑制了破骨细胞的分化和功能。在分子水平上，IPA抑制了核因子Kappa-配体（RANKL）诱导的妊娠X受体（PXR）泛素化和降解的受体激活剂，从而导致PXR与P65的持续结合增加。在体内每日IPA给药或重复的C. spor。 定殖侵害了OVX诱导的骨质流失。 保护活细菌免受严峻的胃环境，并延迟口服孢子孢子的排空。 从肠道，一个C. spor。 - 封装的丝纤维蛋白（SF）水凝胶系统，在OVX小鼠中获得了与重复的细菌移植或每日给药相当的OVX小鼠的骨骼保护。 总体而言，我们发现肠道孢子 - 衍生的IPA通过调节PXR/p65复合物来参与雌激素缺乏诱导的破骨细胞过度活化。在体内每日IPA给药或重复的C. spor。定殖侵害了OVX诱导的骨质流失。保护活细菌免受严峻的胃环境，并延迟口服孢子孢子的排空。从肠道，一个C. spor。- 封装的丝纤维蛋白（SF）水凝胶系统，在OVX小鼠中获得了与重复的细菌移植或每日给药相当的OVX小鼠的骨骼保护。总体而言，我们发现肠道孢子 - 衍生的IPA通过调节PXR/p65复合物来参与雌激素缺乏诱导的破骨细胞过度活化。C.孢子。包含的SF水凝胶系统是一种有前途的工具，可打击绝经后骨质疏松症，而无需重复的细菌移植。
纤维素分解菌热纤梭菌中 IB 型和 II 型 CRISPR/Cas 基因组编辑系统的开发
C. thermocellum 强大的木质纤维素溶解活性使其成为生物燃料生产综合生物加工的最佳候选者。C. thermocellum 的遗传技术落后于模式生物，从而限制了改进生物燃料生产的尝试。为了提高对 C. thermocellum 进行工程改造的能力，我们表征了天然的 I-B 型和异源的 II 型成簇的规律间隔短回文重复 (CRISPR)/cas（CRISPR 相关）系统。我们将天然的 I-B 型系统重新用于基因组编辑。我们测试了三种嗜热 Cas9 变体（II 型），发现从 Geobacillus stear-othermophilus 中分离的 GeoCas9 在 C. thermocellum 中具有活性。我们采用 CRISPR 介导的同源定向修复将无义突变引入 pyrF 。对于这两种编辑系统，修复模板和基因组之间的同源重组似乎是限制步骤。为了克服这一限制，我们测试了三种新型嗜热重组酶，并证明从 Acidithiobacillus caldus 中分离的 exo / beta 同源物在 C. thermocellum 中具有功能性。对于 I-B 型系统，一种名为 LL1586 的工程菌株在 pyrF 基因座处产生了 40% 的基因组编辑效率，当表达重组机制时，这一效率增加到 71%。对于 II 型 GeoCas9 系统，观察到 12.5% 的基因组编辑效率，当表达重组机制时，这一效率增加到 94%。通过将嗜热 CRISPR 系统（I-B 型或 II 型）与重组酶相结合，我们开发了一种可实现高效 CRISPR 编辑的新工具。现在，我们准备利用 CRISPR 技术更好地改造 C. thermocellum，以增加木质纤维素降解和生物燃料生产。
评估制备的组合灭活疫苗针对出血的疫苗
Mahmoud M. Abotaleb 1* orcid：https：//orcid.org/0000-000-0001-9303-539x Rasha G. Tawfik 2 Orcid：https：//orcid.org/0000-0002-2-6286-3958 Dalia M.M. Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Orcid： https://orcid.org/0000-0002-7282-4346 Farida H. Mohamed 3 Orcid：https：//orcid.org/000000-0000-0000-6357-5085 Shereen M. Aly M. Aly 3 Orcid 3 orcid： OrcID：https：//orcid.org/0009-0005-9024-2859 Samir A. Nassif 1 OrcID：https：//orcid.org/0000-0002-7907-0102 1中央实验室，用于评估兽医生物学（CLEVB），农业研究中心（农业研究中心（Arc））。 开罗，埃及。 2亚历山大大学兽医学院微生物学系。 埃及。 3农业研究中心（ARC）动物健康研究所免疫学系（AHRI）。 Dokki，埃及。 4厌氧菌，兽医血清和疫苗研究所（VSVRI），农业研究中心（ARC）。 开罗，埃及。Mahmoud M. Abotaleb 1* orcid：https：//orcid.org/0000-000-0001-9303-539x Rasha G. Tawfik 2 Orcid：https：//orcid.org/0000-0002-2-6286-3958 Dalia M.M. Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Omar 1 Orcid： https://orcid.org/0000-0002-7282-4346 Farida H. Mohamed 3 Orcid：https：//orcid.org/000000-0000-0000-6357-5085 Shereen M. Aly M. Aly 3 Orcid 3 orcid： OrcID：https：//orcid.org/0009-0005-9024-2859 Samir A. Nassif 1 OrcID：https：//orcid.org/0000-0002-7907-0102 1中央实验室，用于评估兽医生物学（CLEVB），农业研究中心（农业研究中心（Arc））。开罗，埃及。2亚历山大大学兽医学院微生物学系。 埃及。 3农业研究中心（ARC）动物健康研究所免疫学系（AHRI）。 Dokki，埃及。 4厌氧菌，兽医血清和疫苗研究所（VSVRI），农业研究中心（ARC）。 开罗，埃及。2亚历山大大学兽医学院微生物学系。埃及。3农业研究中心（ARC）动物健康研究所免疫学系（AHRI）。 Dokki，埃及。 4厌氧菌，兽医血清和疫苗研究所（VSVRI），农业研究中心（ARC）。 开罗，埃及。3农业研究中心（ARC）动物健康研究所免疫学系（AHRI）。Dokki，埃及。4厌氧菌，兽医血清和疫苗研究所（VSVRI），农业研究中心（ARC）。开罗，埃及。
认可的考试程序DIN EN ISO 17025：...
Clostridium perfringens Enterotoxin gene DNA, quantitative microbiology amplification of pathogen diagnostics / quantitative PCR SOP-T-367 2 Clostridium perfringens toxin net-gen-DNA, qualitative microbiology amplification excitement diagnosis / Real Time PCR / DNA SOP-T-367 2 Clostridium perfringens toxin nete-gen-DNA, quantitative激发诊断 /定量PCR SOP-T-367的微生物学放大2灌注裂齿轮毒素毒素NETF-GEN-DNA，定性微生物学扩增激发诊断 /实时PCR / DNA SOP / DNA SOP / DNA SOP / DNA SOP / DNA SOP / DNA SOP / DNA SOP-T-T-367 2梭状芽胞杆菌量化量子 /量子量化量子量，定量量化微生物学量化微生物学量化量子学量化量化量化量化， SOP-T-367 2Clostridium perfringens Enterotoxin gene DNA, quantitative microbiology amplification of pathogen diagnostics / quantitative PCR SOP-T-367 2 Clostridium perfringens toxin net-gen-DNA, qualitative microbiology amplification excitement diagnosis / Real Time PCR / DNA SOP-T-367 2 Clostridium perfringens toxin nete-gen-DNA, quantitative激发诊断 /定量PCR SOP-T-367的微生物学放大2灌注裂齿轮毒素毒素NETF-GEN-DNA，定性微生物学扩增激发诊断 /实时PCR / DNA SOP / DNA SOP / DNA SOP / DNA SOP / DNA SOP / DNA SOP / DNA SOP-T-T-367 2梭状芽胞杆菌量化量子 /量子量化量子量，定量量化微生物学量化微生物学量化量子学量化量化量化量化， SOP-T-367 2
