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新英格兰Biolabs分析证书
通过构建由基因组DNA和DNA对照组成的Nebnext®EM-SEQ库（CPG甲基化的PUC19和未甲基化的Lambda），通过构建Nebnext®EM-SEQ库进行了功能测试，并与前面的批次进行了测试。NEBNEXT®EM-SEQ KIT的最小值和最大DNA输入要求用于制作在同一Illumina®流动池上测序的库。库评估基于指标，包括库产量，库大小，GC偏置，插入大小以及在基因组DNA和内部对照中检测到的CpG，CHG，CHH环境的5MC/5HMC百分比。
评估HIFI长读取测序与整个基因组Bisulfite测序和甲基化史诗般的Beadchip阵列：利用DNA
DNA甲基化是最丰富，最广泛研究的表观遗传修饰之一，在各种生物学过程中起着至关重要的作用，例如发育，癌症，衰老和复杂疾病。在癌症基因组图集（TCGA）等大型队列研究中，Illumina阵列已被广泛用作高通量筛查的经典平台。但是，这种类型的阵列覆盖了人类基因组中的CpG位点的3％。最新一代的DNA测序技术以PACBIO HIFI系统为例，具有产生长序列读数的独特能力，最高为25千碱基。太平洋生物科学（PACBIO）的最新进步致力于提高每碱基准确性和检测DNA修饰的能力。在这项研究中，我们使用DNA甲基化标准评估了PACBIO HIFI测序的性能。由人DNA在CpG部位酶甲基化的DNA标准和未甲基化的人DNA源自HCT116 DKO细胞系。1 ug。样品被测序为约8倍覆盖范围。DNA甲基化数据，并使用PB-CPG-Tools从BAM文件中提取甲基化值。然后，我们比较了从PACBIO HIFI测序获得的结果与由史诗阵列和整个基因组亚硫酸盐测序（WGB）产生的结果。我们发现WGB和PACBIO HIFI天然DNA甲基化调用表现出很高的一致性，表现优于史诗般的阵列，这两种史诗阵列都与甲基化标准和报道的CPG数量一致。使用甲基化的标准样品，HIFI数据报告约有85％的CpG位点的甲基化比大于90％，平均基因组宽93％。同样，WGBS数据显示了约85％的CpG位点的甲基化比大于90％，平均基因组宽95％。相比之下，Epic阵列仅报告40％的CpG位点的甲基化比大于90％，而整个基因组中平均为87％。这些结果表明，HIFI长读取测序可以准确检测到接近100％甲基化的区域的DNA甲基化信号。我们的研究提供了对检测DNA甲基化模式的PACBIO HIFI测序表现的见解及其作为史诗阵列的替代方案的潜力。这项研究的发现说明了如何将DNA甲基化标准用作评估DNA甲基化调用模型的基础真实参考。
DNA甲基化与冠心病的表观基因组分析：一项嵌套病例对照研究
背景：识别与冠心病 (CHD) 相关的 DNA 甲基化环境反应基因位点可能揭示 CHD 的新途径或治疗靶点。我们对亚洲人群中与发病 CHD 相关的 DNA 甲基化进行了首次前瞻性表观基因组范围分析。方法：我们进行了一项嵌套病例对照研究，包括发病 CHD 病例和从中国嘉道理生物库的 10 年随访中确定的 1:1 匹配对照。通过 Infinium Methylation EPIC BeadChip 测量基线血液白细胞 DNA 的甲基化水平。我们进行了单胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤 (CpG) 位点关联分析和网络方法来识别与 CHD 相关的 CpG 位点和共甲基化基因模块。结果：经过质量控制，保留了 982 名参与者（平均年龄 50.1 岁）。基因组中 25 个 CpG 位点的甲基化水平与 CHD 发病率相关（全基因组错误发现率 [FDR] < 0.05 或模块特定 FDR < 0.01）。已识别 CpG 的甲基化水平每增加一个标准差，CHD 风险就会有所不同，从降低 47% 到增加 118% 不等。中介分析显示，与吸烟相关的 CHD 风险增加的 28.5% 是由 ANKS1A 基因启动子区域的甲基化水平介导的（中介效应的 P = 0.036）。SNX30 启动子区域的甲基化水平与血压和随后的 CHD 风险相关，中介比例为 7.7%（P = 0.003），通过
Epimark甲基化的DNA富集套件，E2600，手册
通过与人MBD2A蛋白的甲基-CPG结合结构域结合与人IgG1（MBD2A-FC的FC尾巴）的甲基-CPG结合结构域结合，将甲基化的DNA从碎片的基因组DNA（5 ng-25μg）中分离出来，该蛋白与人IgG1（MBD2A-FC）的FC尾部结合，从而与paramagnetic Hydophilic Protein a betein a bead a bead a bead a bead a bead a bead a bead a bead a bead a bead a。两个FC结构域可以与具有高亲和力的蛋白质A上的一个位点结合（K d = 10 –7）。由于FC片段是二聚体，因此四个MBD2结构域暴露于每个分子蛋白A分子的溶剂，从而增加了相对平衡常数100倍。这种稳定的复合物将选择性地结合含有DNA的双链甲基化的CpG。在简单的洗涤步骤随后进行磁捕获后，通过在65°C下孵育，富集的DNA样品很容易在少量无核酸酶的水中洗脱。样本可以立即通过多种方法进行下游分析，包括：
衰老的表观遗传改变：简短的审查
结果：衰老伴随着表观遗传标记的各种改变，包括DNA甲基化（非CPG区域中的全球低甲基化和CPG岛的高甲基化），染色质的重排（整体减少组蛋白和组蛋白的重新分布和组织纳修饰）和NCRNA（尤其是miRNA）。表观遗传学是一种可逆的分子机制，可允许治疗干预措施改善或逆转与衰老相关的发病机理。可以开发基于化学的表观遗传操作和基于生活方式的表观遗传重编程策略来改善或逆转与衰老相关的条件。
增强型项目特定认证计划 (ePSCP) 指南
本文件为指南，旨在帮助在为非组织指定授权 (ODA) 持有者起草型号合格证 (TC)、修订型号合格证 (ATC)、补充型号合格证 (STC) 或修订补充型号合格证 (ASTC) 项目起草 PSCP 时定义内容和格式。本指南的使用并非强制性的；但是，强烈建议使用它来简化认证流程。本指南是根据认证流程指南 (CPG) 的原则编写的，是 FAA 和业界共同努力的结果。本指南应与相关的增强型 PSCP (ePSCP) 模板结合使用。ePSCP 模板可在 www.faacpg.com 找到，以及本指南和其他 CPG 工具的副本。
e-CPG 痛风管理（第二版）
这些指南于 2021 年发布，并将在至少四年内（2025 年）进行审查，如果需要，可能会更早。需要更新时，将通知 CPG 主席或相关专业的国家顾问。将讨论修订的必要性，包括修订后的 CPG 的范围。将组建一个多学科团队，并采用 MaHTAS 使用的最新系统审查方法。我们会尽一切努力确保本出版物在出版时的每个细节都准确无误。但是，如果有错误或遗漏，更正将在本文件的网络版本中发布，该版本始终是最终版本。此版本可在以上网站上找到。
保护 OT 行动免受正在进行的亲俄黑客活动
将网络安全考虑因素融入 OT 系统的构思、设计、开发和运行中。有关更多信息，请参阅美国能源部网络安全、能源安全和应急响应办公室 (CESER) 的《网络信息工程》出版物。 练习并保持手动操作系统的能力 [CPG 5.A]。 创建 HMI 的工程逻辑、配置和固件的备份，以实现快速恢复。让您的组织熟悉出厂重置和备份部署 [CPG 2.R]。 检查 PLC 梯形图逻辑或其他 PLC 编程语言和图表的完整性，并检查是否存在任何未经授权的修改，以确保正确操作。对手可能会尝试通过更改配置和梯形图逻辑来保持持久性或以不安全的方式秘密操作设备。 更新和保护网络图，以反映 IT 和 OT 网络 [CPG 2.P]。运营商应应用最小特权原则，并需要了解个人对网络图的访问。保持对内部和外部招揽工作（恶意和良性）的认识，以获取网络架构并将映射限制为受信任的人员。考虑使用加密、身份验证和授权技术来保护网络图文件，并实施访问控制和审计日志以监视和限制谁可以查看或修改您的网络图。 注意网络/物理威胁。对手可能会尝试通过各种物理手段获取网络凭据，包括正式访问、贸易展和会议对话以及通过社交媒体平台。 盘点并确定所有 HMI 的报废状态 [CPG 1.A]。尽快更换报废的 HMI。 对物理过程的操纵实施软件和硬件限制，限制成功入侵的影响。这可以通过使用操作联锁、网络物理安全系统和网络信息工程来实现。
味觉控制作为吞咽困难管理策略
作为一种吞咽困难管理策略，有意对口咽部进行感官刺激正受到越来越多的关注（Mulheren 等人，2022 年；Peña-Chávez 等人，2023 年；Regan，2020 年）。有意提供显著和增强的感官刺激来对抗吞咽困难的理论源于对吞咽神经生理学的理解。吞咽是一种复杂的、中枢模式发生器 (CPG) 介导的感觉运动行为（Jean，2001 年）。通常，CPG 是专用的神经回路，可产生模式化的运动动作序列并受感官输入的调节（Barlow 和 Estep，2006 年）。人类吞咽 CPG 位于延髓，包括感觉核（孤束核 [NTS]）和运动核（疑核 [NA]），它们与参与吞咽的脑神经核（如舌咽神经和迷走神经）紧密相连（Jean and Dallaporta，2006）。吞咽神经网络超出了脑干的 CPG，因为神经影像学研究报告称，许多皮质、皮质下和小脑结构在吞咽任务期间也处于活跃状态（Malandraki 等人，2009 年；Suzuki 等人，2003 年）。一次吞咽丸可以提供多种感觉输入模式，包括但不限于体感/压力、热、味觉、化学感觉、嗅觉、听觉和视觉刺激；目前尚不清楚吞咽神经网络如何优先考虑这些模式，但对其中任何一种模式的改变都可能改变吞咽机制 (Dietsch 等人，2017；Steele 和 Miller，2010)。刺激吞咽突出神经通路的感觉体验可能会对吞咽输出产生有利的前馈效应，例如更强或更及时的吞咽反应 (Ding 等人，2003)。
s t r u c t u r a l a l b i o lo lo g y iCf综合征蛋白CDCA7拥有一个独特的DNA结合域，该结构域在NO
CDCA7，用羧基末端半胱氨酸结构域（CRD）编码蛋白质，在免疫缺陷，丝状不稳定性和面部异常（ICF）综合征中突变，这种疾病与近二酸 - 近甲基卫星DNA的甲基化有关。CDCA7如何将DNA甲基化引导到并置玻璃液区域是未知的。在这里，我们表明CDCA7 CRD采用了独特的锌结合结构，该结构识别由两个序列基序形成的非B DNA中的CpG二元组。CDCA7，但不是ICF突变体，优先通过链特异性CpG半甲基化结合非B DNA。未甲基化的序列基序高度富集在人类染色体的centromeres上，而甲基化基序分布在整个基因组中。在S期，CDCA7而不是ICF突变体集中在组成型异染色质灶中，并且通过由CRD结合的外源半甲基化的非B DNA可以抑制这种灶的形成。在DNA复制过程中在近齿粒区域中形成的非B DNA的结合提供了一种机制，通过该机制CDCA7控制DNA甲基化的特异性。