XiaoMi-AI文件搜索系统
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玻璃：互联网资源复制器 div>
网络承包商经常处理机密材料和面对严格的要求，以确保该材料安全。一个重大预防措施正在网络中工作，而无需与Internet连接。但是，软件开发工作流经常假定Internet连接，无论是查找文档还是包括有用的库。典型的解决方案包括耗时，临时资源的资源方法，可将资源带入并在安全的，非互联网连接的网络上访问它们。Speculo是一种开发工具，它提供了一种简单的方法来请求资源，同步和下载它们，并在安全的，气相的网络上提供服务。在安全网络上运行的服务器可以通过HTTP和HTTPS提供资源，并具有内置命令来生成证书以验证HTTPS连接，以便Cryptic Vector的软件开发人员可以使用其工具与将其连接到Internet一样。下载已被优化，以了解何时不需要再次下载资源，并且有一个简单的命令将所有内容都划入一个文件中，以使传输简单简单。最后，有一些简单的方法可以在Internet连接的一侧添加，修改和删除资源，以便用户不必涉足较低级别的详细信息。Speculo解决了开发网络软件时面临的现实世界问题，它将继续由Cryptic Vector进入未来。
来自新西兰环境来源的大肠杆菌分离株的基因组序列草图
温血动物（包括鸟类）肠道中自然存在的大肠杆菌是淡水水质监测中粪便污染的常用指标，可作为粪便污染和病原体的替代指标（1）。然而，目前用于计数大肠杆菌的培养方法无法区分粪便大肠杆菌和归化或环境相关的“类大肠杆菌”菌株，也称为大肠杆菌隐蔽进化枝（2-4）。Escherichia whittamii（隐蔽进化枝 2）（5）、Escherichia ruysiae（隐蔽进化枝 3 和 4）（6）和 Escherichia marmotae（隐蔽进化枝 5）（7）是最近描述的类群，但宿主物种和环境持久性仍有待确定。该项目专注于大肠杆菌和大肠杆菌属的全基因组测序。来自环境来源（淡水、河流沉积物、水生生物膜、土壤和鸟类及哺乳动物的粪便）。菌株是在研究对比土地使用对大肠杆菌属的影响的研究中获取的，并按照之前描述的方式进行培养（8）。大肠杆菌和新大肠杆菌属的基因组数据将提供有关这些细菌在环境中存活的信息和更准确的粪便追踪，从而能够识别并迅速解决影响水道的最严重污染源。
Archimer- ifremer
在大多数系统基因组研究中的分类单元采样通常基于已知的分类单元和/或形态学，因此忽略了未描述的多样性和/或神秘的谱系。turridae家族是Hyperdever conoidea中的一组有毒的蜗牛，其中包括许多未描述和隐秘的物种。因此，“传统的”分类单元抽样可能构成强烈采样或过采样的强烈风险。为了最大程度地减少潜在偏见，我们建立了一种强大的抽样策略，从物种划界到系统基因组学。使用了3,000多个COX-1“条形码”序列提出201个主要物种假设，其中近一半与可能对科学的新物种相对应，包括几种隐性物种。一棵110-Taxa外显捕捕剂树，包括COX-1数据集发现的多样性的物种代表，使用了多达4,178个基因座。我们的结果表明，Gemmula属的多态被分为多达10个单独的谱系，如果仅基于所述物种，则不会检测到一半的一半。我们的结果强烈表明，必须使用盲，探索性和密集的条形码采样来避免在系统基因研究中采样偏见。
情节扭曲：当RNA证据挑战我们对DNA结果的期望时，Alexandra Richardson，MS； Terra Brannan，博士； Colin Young博士； Marcy Richa
情节扭曲：当RNA证据挑战我们对DNA结果的期望时，Alexandra Richardson，MS； Terra Brannan，博士； Colin Young博士； Marcy Richardson博士； Carrie Horton，MS-CGC； Heather Zimmermann，博士背景：配对的DNA和RNA测试（DGT-RGT）通过检测位于标准的下一代序列（NGS）捕获以外的剪接变体和提供变体分类中的证据范围来提高DNA结果的准确性。DGT-RGT的另一个好处是识别导致意外或非常规剪接事件的变体。在这里，我们提出了一个变异级别的病例系列，该病例序列突出了通过DGT-RGT在一个临床诊断实验室中鉴定出的意外RNA发现。变体呈现：变体1-NF1 C.888+2T> C会影响剪接供体部位内的规范位置，从而根据当前ACMG指南将其分类为病原（LP）。最近的研究表明，+2位置的T> c取代能够在某些基因组环境中产生野生型转录本。DGT-RGT并未确定与该变体相关的明显异常剪接，这与载体中缺乏神经纤维瘤病一致。变体2- BRIP1 c.727a> g（p.i243v）是中期错义变化，在硅剪接站点中，该算法预测了创建强大的de从头供体站点。RNA研究证实了这种新型供体部位的使用，但出乎意料地表明，外显子内的现有隐性受体位点同时被激活，从而有效地在外显子内产生了伪内龙。在计算机剪接算法中预测了新型U2受体位点的创建。变体3＆4 NF1 C.5750-184_5750-178 duptttcttc和atm c.3480g> t（p.v1160v）分别是内含子和同义中的中性和同义性中性变化。RNA测试确定了使用远处的隐性受体部位引起的异常转录本。这两个变体都会增加神秘受体上游隐秘的多吡啶氨酸段中的嘧啶含量。多嘧啶界是受体剪接位点识别中的重要组成部分，但据我们所知，尚未据报道隐性多吡啶氨酸裂纹激活作为异常剪接的机制。变体5＆6 -BRCA2 [C.6816_6841+1534DEL1560; c.6762delt]和APC c.1042c> t（p.R3248*）预计由于过早终止密码子（PTC）而导致无义介导的衰减（NMD），因此根据ACMG指南将其归类为致病性。然而，RNA测试表明，这些变体引起了框架内的剪接事件，从而去除了PTC，这一发现与载体中相关的基因 - 疾病表型不存在一致。变体7- lztr1 c.2232g> a（p.a744a）是一种高频同义词，位于内含子的下游，它通过毫无常见的U12剪接体剪接。RNA测试表明，新型U2受体位点经常与现有的上游，隐秘的U2供体站点一起使用，但仅在某些个体中。其他具有低级异常剪接的概率对于弱化隐秘的U2供体部位的常见多态性是纯合的。结论：据我们所知，这是影响内含子的U2/U12-身份的单个核苷酸变化的第一个例子，它也例证了转录组中的个体变异性。
密码学、隐私和 CLIPPER CHIP ...
密码学——密码学和密码分析的科学研究。密码学——1：秘密书写：神秘符号 2：密码信息的加密和解密 3：密码分析。密码分析——1：密码或密码系统的破解 2：破解密码或密码系统的技术或理论——也称为密码分析。（第 312 页）
使用纳米孔直接 RNA 测序对基因治疗载体进行质量控制的优化方案
尽管最近在提高慢病毒基因疗法的疗效方面取得了进展，但相当一部分生产的载体含有不完整且可能无功能的 RNA 基因组。这可能会破坏慢病毒的基因传递，并增加制造成本，必须加以改进以促进慢病毒基因疗法的广泛临床实施。在这里，我们比较了三种长读测序技术检测载体设计问题的能力，并确定纳米孔直接 RNA 测序是最强大的。我们展示了这种方法如何识别和量化由隐蔽剪接和多聚腺苷酸化位点引起的不完整 RNA，包括广泛使用的土拨鼠肝炎病毒转录后调控元件 (WPRE) 中的潜在隐蔽多聚腺苷酸化位点。使用慢病毒 RNA 的人工多聚腺苷酸化，我们还在分析的慢病毒载体中识别出多个发夹相关截断，这些截断占检测到的 RNA 片段的大部分。最后，我们表明这些见解可用于优化慢病毒载体设计。总之，纳米孔直接 RNA 测序是慢病毒载体质量控制和优化的有力工具，可能有助于改进慢病毒制造，从而开发更高质量的慢病毒基因疗法。
生态聚会小册子 - 蝴蝶和飞蛾
翼展：1 ¾ - 2 ½” 颜色：扇贝状，边缘不规则，边缘有明显的凹痕。隐蔽的颜色使冬眠的成虫能够伪装在枯叶中。前翅为橙色，带有深褐色斑点，后翅在夏天大多为黑色，但在春天和秋天为橙色，带有黄色斑点。后翅下侧有一个小的白色或银色逗号形状，两端扩大。栖息地：开阔林地和树林边缘是主要的繁殖和冬眠栖息地。范围：遍布美国东部大部分地区，从南部到佛罗里达州中北部和北部墨西哥湾沿岸各州，从西部到怀俄明州和科罗拉多州东部。生命周期：每年 2 代。
UC Merced
气候变化正在重塑全球物种的分布，但不同的因素可能会在从全球到局部的不同空间尺度上驱动物种的反应。环境条件和生物相互作用可能会根据所考虑的空间范围影响物种的发生，从而相对重要，这是一种多尺度方法，这是理解物种分布和未来范围动态的多尺度方法。在这项研究中，我们测试了气候和种间竞争在整体和区域尺度上塑造两种神秘物种的分布中的相对作用。也就是说，我们评估了两个Oecanthus Tree板球（O. pellucens和O. dulcisonans）对气候变化的空间反应，这些反应表现出生态和形态相似性，部分范围重叠。我们发现与温度和降水有关的生物气候变量的显着且特异性的关联。我们还观察到两种物种之间的预测反应的差异，显示了O. pellucen的大量范围损失，并且在未来情况下，O. dulcisonans的略有扩展。这一结果也得到了环境利基分析的支持，表明O. pellucens在气候生态位方面是明显的专业分类单元。在区域范围内，我们提供了证据表明，种间竞争如何在确定物种的存在方面发挥强烈而不对称的作用，只有O. pellucen受到O. dulcisonans的显着影响，而不是反之亦然。我们的结果阐明了正翅目对气候变化的潜在反应，以及气候和竞争在塑造物种分布中的空间特异性作用。此外，我们强调了在神秘的物种络合物中，竞争动态和利基专业化中如何代表确定赢家和失败者在反对气候变化中的关键要素。
生物多样性评估方法五年回顾
假设存在会导致计算最大物种信用义务，从而激励应用更准确的方法。然而，对开发提案的分析表明，在大多数评估中，至少有一种物种信用物种被假设存在，有时是所有物种信用物种都被假设存在。依赖此选项的原因尚不清楚，但可能与成本有关（例如，与调查或专家报告的成本相比，信用的价格具有竞争力）、调查难度（例如缺乏指导、隐秘物种或需要季节性调查的物种、项目时间表），或进行专家报告的专家数量有限（例如，部门网站上列出的专家数量很少，可能是由获得专家地位的过程推动的）。