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乳腺癌治疗
乳腺癌是全球女性癌症死亡的主要原因，也是美国女性癌症死亡的第二大原因。风险评估工具可以识别乳腺癌的风险，高风险患者可能适合服用降风险药物。药物的选择因绝经状态而异。乳腺癌治疗取决于分期。0 期为导管原位癌，为非侵袭性，但多达 40% 的患者会发展为侵袭性癌症。导管原位癌的治疗方法为乳房肿瘤切除术和放射治疗或乳房切除术。如果导管原位癌为雌激素受体阳性，患者也可能接受内分泌治疗。早期侵袭性阶段（I、IIa、IIb）和局部晚期阶段（IIIa、IIIb、IIIc）为非转移性，有三个治疗阶段。当肿瘤表达雌激素、孕酮或 ERBB2 受体时，术前阶段使用全身内分泌或免疫疗法。也可以使用术前化疗，当肿瘤没有这三种受体时，这是唯一的选择。手术阶段有两种选择，存活率相似；如果肿瘤可以完全切除并获得良好的美容效果，则进行乳房肿瘤切除术和放射治疗，或进行乳房切除术。当怀疑有淋巴结疾病时，也会进行前哨淋巴结活检。术后阶段包括放疗、内分泌治疗、免疫治疗和化疗。绝经后女性也应接受术后双膦酸盐治疗。IV 期（转移性）乳腺癌可以治疗但无法治愈。治疗目标包括改善生活长度和生活质量。（Am Fam Physician。2021；104（2）：171-178。版权所有 © 2021 美国家庭医生学会。）
一个统一的平台，使用 1250 种癌细胞系的转录组数据对 1562 种药物进行生物标志物排序和验证
简介：体外细胞系模型为研究可用于癌症全身化疗的化合物提供了宝贵的资源。然而，由于数据分散在几个不同的数据库中，这些资源的利用受到限制。在这里，我们的目标是建立一个平台，能够验证化学耐药性相关基因并对可用的细胞系模型进行排序。方法：我们处理了四个独立的数据库，DepMap、GDSC1、GDSC2 和 CTRP。对基因表达数据进行分位数归一化，并分配 HUGO 基因名称以明确识别基因。导出所有药物的耐药性值。使用 ROC 检验计算基因表达与治疗耐药性之间的相关性。结果：我们将四个数据集与 1562 种药物的化学敏感性数据和 1250 种癌细胞系的转录组水平基因表达相结合。我们已利用该数据库建立了一个在线工具，以便在统一的分析流程中关联可用的细胞系敏感性数据和治疗反应 ( www.roc- plot.com/cells )。我们利用已建立的流程对与阿法替尼和拉帕替尼（两种 ERBB2 酪氨酸激酶结构域抑制剂）耐药性相关的基因进行排序。讨论：该计算工具可用于 1) 将基因表达与耐药性关联起来，2) 识别和排序耐药和敏感细胞系，以及 3) 排序耐药相关基因、癌症标志和基因本体途径。该平台将通过验证基因-耐药性相关性和为新实验选择最佳细胞系模型，为加速癌症研究提供宝贵支持。2022 作者。由 Elsevier BV 代表计算和结构生物技术研究网络出版。这是一篇根据 CC BY 许可 ( http://creativecommons. org/licenses/by/4.0/ ) 开放获取的文章。
兽医癌症的靶向疗法
参考：1。伦敦，Cheryl A.等。“多中心，安慰剂对照，双盲，随机研究口服磷酸盐（SU11654），一种受体酪氨酸激酶抑制剂，用于治疗手术后的经常性（局部或远距离）肥大细胞肿瘤的狗。”临床癌症研究15.11（2009）：3856-3865。2。Weishaar，K。M.等。“用泼尼松和toceranib或vinblastine治疗的狗中的肥大细胞肿瘤中的C-KIT突变和定位状态作为反应预测因子。”;兽医内科杂志32.1（2018）：394-405。3。Sheppard-Olivares，Sabina等。“用磷酸盐的犬类胰岛素治疗：30例（2009-2019）。” （2020）。4。伦敦，谢丽尔等。“实体瘤中磷酸盐（Palladia®）生物学活性的初步证据。”兽医和比较肿瘤学10.3（2012）：194-205。5。Heaton，Caitlin M.等。“对狗的吞噬腺肛门囊腺癌的治疗评估。”兽医内科杂志34.2（2020）：873-881。6。Berger，Erika P.等。“回顾性评估Toceranib磷酸盐（Palladia®）用于治疗狗的胃肠道肿瘤。” 《兽医内科》杂志32.6（2018）：2045-2053。7。Ehling，Tara Jean等。8。OHUE，Yoshihiro和Hiroyoshi Nishikawa。 “癌症中的调节T（Treg）细胞：Treg细胞可以成为新的治疗靶点吗？”癌症科学110.7（2019）：2080-2089。 9。OHUE，Yoshihiro和Hiroyoshi Nishikawa。“癌症中的调节T（Treg）细胞：Treg细胞可以成为新的治疗靶点吗？”癌症科学110.7（2019）：2080-2089。9。“一种前瞻性，多中心的兽医疗法肿瘤学组研究揭示了毒氨酸磷酸盐（Palladia）作为犬类鼻癌治疗的主要或辅助剂的潜在疗效。”兽医和比较肿瘤学20.1（2022）：293-3-303。Regan，Daniel P.等。 “ Losartan阻止了骨肉肉瘤吸收的单核细胞募集，并与激酶抑制剂Toceranib结合使用，在犬转移性骨肉瘤中具有显着的临床益处。”临床癌症研究（2021）。 10。 Maeda，Shingo等。 “拉帕替尼是狗肌肉尿无尿癌的一线治疗。”科学报告12.1（2022）：1-10。 11。 Rodrigues，Lucas等。 “在自发产生的癌症中共享热点突变，作为精确治疗的无与伦比的比较模型。” Biorxiv（2021）。 12。 eStabrooks，蒂莫西，询问犬脾脏heman giosarcoma中体细胞突变的临床意义。 兽医学会，虚拟会议，1221年11月4日至6日。 13。 Rodrigues，Lucas等。 lapatinib治疗携带ERBB2 V659E突变的II级和III级肺癌：初步数据。 兽医癌症协会年中大会，瓦拉尔塔港，2022年4月9日至12日。Regan，Daniel P.等。“ Losartan阻止了骨肉肉瘤吸收的单核细胞募集，并与激酶抑制剂Toceranib结合使用，在犬转移性骨肉瘤中具有显着的临床益处。”临床癌症研究（2021）。10。Maeda，Shingo等。“拉帕替尼是狗肌肉尿无尿癌的一线治疗。”科学报告12.1（2022）：1-10。11。Rodrigues，Lucas等。“在自发产生的癌症中共享热点突变，作为精确治疗的无与伦比的比较模型。” Biorxiv（2021）。12。eStabrooks，蒂莫西，询问犬脾脏heman giosarcoma中体细胞突变的临床意义。兽医学会，虚拟会议，1221年11月4日至6日。13。Rodrigues，Lucas等。lapatinib治疗携带ERBB2 V659E突变的II级和III级肺癌：初步数据。兽医癌症协会年中大会，瓦拉尔塔港，2022年4月9日至12日。
下一代测序和基因组图谱
简介：肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因，在摩洛哥发病率很高。该国这种疾病的流行病学复杂，需要深入分析基因图谱以改善诊断和治疗。本研究利用新一代测序 (NGS) 绘制摩洛哥肺癌患者的基因变异图谱，而这一领域的分子数据严重缺乏。重要的是，本研究使用新一代测序技术对摩洛哥人群中的肺癌进行了开创性的分析。虽然以前的研究只关注有限数量的基因，但我们的研究提供了对该队列中基因变异的全面而详细的视角，包括肿瘤印迹的生成。方法：本研究涉及 100 名经组织学确诊的肺癌患者。使用 NGS 技术结合 Oncomine Precision Assay GX 方案检测基因异常。制备、纯化和测序肺活检样本，并分析所得数据以识别显著的遗传变异。结果：分析显示 13 种不同基因存在遗传变异，其中 TP53、KRAS 和上皮生长因子受体 (EGFR) 基因的突变率较高。TP53 突变出现在 27% 的病例中，而 KRAS 和 EGFR 分别在 19% 和 14% 的样本中出现突变。ALK、MET、ERBB2 和 ROS1 基因中也发现了具有临床意义的突变，凸显了该群体中存在大量基因组多样性。结论：本研究结果增强了对摩洛哥肺癌患者遗传变异的了解，并强调了加强摩洛哥先进分子诊断工作的必要性。NGS 的使用已经确定了关键的基因突变，促进了个性化治疗的发展并改善了临床结果。这些发现为旨在改进诊断和治疗策略的未来研究铺平了道路，从而有助于更好地管理患者。
引用了本文：Tarantino P，Morganti S，Curigliano G.靶向HER2在乳腺癌中：新药和范式在地平线上。探索目标抗
根据HER2蛋白的过表达和/或ERBB2基因的过表达，所有乳腺癌（BCS）的大约15-20％是人类表皮生长因子受体2（HER2）定义的。这种改变会导致疾病的更具侵略性的行为，但也可以预测对针对HER2的治疗的反应。的确，在过去的二十年中已经开发和批准了几种抗HER2化合物，从而显着提高了我们在早期治疗患者的能力，并在高级环境中大大延长了他们的生存。然而，该领域的最新发展有望通过既定的Her2靶向策略以及对新型策略的探索来进一步改善成果。In particular, the engineering of new antibody-drug conjugates, with higher drug-to-antibody ratios (DARs) and cleavable linkers, has already led to the development of a highly effective drug, namely trastuzumab deruxtecan, recently approved by the Food and Drug Administration (FDA) and European Medicines Agency (EMA) for the treatment of advanced HER2-positive (HER2 + ) BC, and currently in study in the早期环境。此外，新型的酪氨酸激酶抑制剂tucatinib最近获得了FDA和EMA的批准，该抑制剂是为了提高HER2 +晚期BC患者的生存，尤其是在患有脑转移的患者中。免疫疗法也通过免疫检查，癌症疫苗和收养细胞疗法在HER2 +亚型中进行了研究。总体而言，预计有希望的抗HER2化合物的武器库有望在未来几年中对早期和晚期HER2 + BC的预后进行显着改善。此外，一些此类代理商在HER2-LOW Advanced BC患者中表现出令人鼓舞的活动，这挑战了当前的BC分类。如果得到确认，这种新的范式将有可能扩大来自HER2靶向治疗的人口受益，最多可以扩大所有晚期BC患者的70％，从而导致当前治疗算法的革命，并可能重新定义HER2分类。
评论文章 ErbB 抑制剂作为三阳性乳腺癌的新辅助治疗：网络荟萃分析
摘要：背景：关于 ErbB 抑制剂干预对三阳性乳腺癌 (TPBC) 女性的有效性的证据很少。据报道，激素受体的暴露会掩盖靶向干预的效果。在此，我们旨在探索 TPBC 的最佳靶向方案。方法：我们对针对激素受体阳性和 HER2 (ErbB2) 阳性患者的新辅助靶向治疗的文献进行了全面搜索，并使用随机效应模型进行了比较方案的网络荟萃分析。病理完全缓解率 (pCR) (ypT0/is) 是主要结果。使用比值比 (OR) 和 95% 置信区间 (CI) 来评估十二种方案之间的关联。结果：纳入了十三项符合纳入标准的研究。接受 ado-trastuzumab emtansine 加拉帕替尼治疗的 TPBC 患者经历 pCR 事件的人数明显多于其他患者。 12个方案高性能排序中，ado-trastuzumab emtansine加拉帕替尼（TDM-1+L）位居前列，其后依次为ado-trastuzumab emtan sine（TDM-1）、曲妥珠单抗加卡铂、紫杉烷和帕妥珠单抗（TCHP）、曲妥珠单抗加多西他赛和拉帕替尼（THL）、曲妥珠单抗、紫杉烷和帕妥珠单抗（THP）、ado-trastuzumab emtansine加帕妥珠单抗（TDM1+P）、曲妥珠单抗加紫杉烷（TH）、曲妥珠单抗加紫杉烷和来那替尼、紫杉烷加帕妥珠单抗（HP）、紫杉烷和来那替尼（HN）、曲妥珠单抗加拉帕替尼（TL）、曲妥珠单抗加帕妥珠单抗（TP）。结论：在以化疗为基础的方案中，双靶向治疗与单靶向治疗相比，pCR 效果更好，而 TDM-1+L 效果更佳。无论是单靶向治疗还是双靶向治疗，不含化疗的方案总是比含靶向治疗的方案更差。我们的数据支持指南，该指南建议在新辅助治疗中联合使用化疗和靶向治疗治疗早期 TPBC。
晚期胃肠道癌的甲基腺苷磷酸化酶基因组损失
摘要背景：癌症中最常见的零星纯合缺失之一是9p21损失，其中包括甲基硫酸盐基因氨基磷酸化酶（MTAP），CDKN2A和CDKN2B，并且与恶化的结构和免疫治疗疗法相关。mtap -loss是通过与MAT2A和PMRT5抑制剂的合成致死性来发展的药物靶标。这项研究的目的是研究晚期胃肠道（GI）肿瘤中MTAP-损失的患病率和基因组局势，并研究其作为预后生物标志物的作用。材料和方法：我们对包括5个GI癌的64 860个肿瘤进行了下一代测序以及比较基因组和临床分析。我们比较了一项回顾性研究，比较了gi癌患者的临床结果。结果：GI癌症中MTAP -loss的患病率为8.30％。mtap -loss在胰腺导管腺癌（PDAC）中最普遍，为21.7％，结直肠癌（CRC）为1.1％。mTAP -loss肿瘤更为普遍。在MTAP -loss肿瘤中观察到了潜在靶向基因组改变的患病率（ATM，BRAF，BRCA2，ERBB2，IDH1，PIK3CA和PTEN）的显着差异，并根据肿瘤类型而变化。mtap -loss PDAC，IHCC和CRC的患病率较低或肿瘤突变负担升高。结论：在GI癌中，MTAP -loss是9P21损失的一部分，总体患病率为8％。阳性PD -L1肿瘤细胞表达在MTAP -loss与MTAP -INTACT IHCC肿瘤（23.2％vs 31.2％，p = .017）中的频率较低。mtap -loss发生在22％的PDAC，15％的IHCC，8.7％的胃食管腺癌，2.4％的肝细胞癌和CRC的1.1％，并且与其他可靶向突变相互排斥。关键词：MTAP损失； 9p21损失；基因组学；生物标志物；瘤;胆管癌。
2022; 13(5): 1565-1572。doi: 10.7150/jca.65370 研究论文下一代测序揭示肺腺癌的年龄依赖性遗传基础
背景：超过 40% 的肺癌患者在 70 岁以上时才被确诊。然而，他们之间的基因组和临床特征仍然难以捉摸。在这里，我们进行了靶向捕获序列分析，以表征中国肺腺癌 (LUAD) 患者各年龄段的突变谱。患者和方法：2025 名 LUAD 患者分为三组：年轻（≤50 岁）（n=416，20.54%）、中年（51~69 岁）（n=1271，62.77%）和老年（≥70 岁）（n=338，16.69%）。使用 1,021 个基因组和 59 个基因组对组织样本进行测序。研究了 LUAD 患者的基因改变和肿瘤突变负荷 (TMB)。结果 ：20个基因的突变频率在老年组中显著高于青年组，其中14个基因突变以前没有被报道过，包括涉及细胞周期/凋亡信号转导（FAT1、FAT2）、DNA损伤修复（FANCA和FANCM）、染色质组蛋白修饰（KDM6A）、RTK/RAS/PI3K信号转导（FLT4和MTOR）、NOTCH信号转导（NOTCH1、NOTCH2和NOTCH4）以及其他信号通路或细胞调控因子（KEAP1、ASXL1、EPHB1和ABCB1）。6个以前报道的突变基因（RBM10、KRAS、LRP1B、CDKN2A和KMT2C/D）在老年组中的发生率也显著高于青年组。在临床可操作的突变位点中，KRAS突变在老年组中更为常见； MET 14号外显子跳跃和MET扩增均与高龄呈显著正相关；ALK、ROS1、RET和ERBB2 20号外显子插入等融合在老年组中较少见。此外，老年组的TMB水平高于青年组。结论：本研究揭示了青年和老年LUAD患者体细胞基因突变和TMB的差异，为今后针对老年患者的靶向治疗和免疫治疗提供优势。
大量未经选择的转移性结直肠癌的分子特征与
摘要背景：我们已经报道，在基于人群的转移性结直肠癌 (mCRC) 患者队列中，BRAF V600E 突变和微卫星不稳定性高 (MSI-H) 比临床试验或医院患者组报告的更为普遍。目的是探索 mCRC 中的其他突变在这些队列中在错配修复状态和原发肿瘤位置方面的流行率是否不同，以及骨或脑转移的存在是否与任何突变有关。材料和方法：使用来自斯堪的纳维亚半岛三个地区的 798 名 mCRC 患者的人群队列。在定制设计的 Ampliseq 热点面板中研究了 44 种癌症相关基因。使用 Kaplan - Meier 估计量和 Cox 回归分析分析了生存期的差异。结果：在 449/501 名患者中可以确定 40/44 个基因的突变。除了 19% 的肿瘤中出现的 BRAF V600E 外，其他任何突变似乎都没有比试验队列中更普遍的。8% 的肿瘤中出现的 BRAF V600E 和 MSI-H 与不良预后有关，右侧原发肿瘤位置 (39%) 与左侧和直肠相比也与不良预后有关；然而，在多变量回归中，只有 BRAF 突变保留了其统计意义。没有其他突变与不良预后相关。如果在诊断时存在骨转移，则 ERBB2 改变更为常见（17% vs. 4%，p = .011）。未发现与脑转移有关。52% 的患者出现改变，可以通过 FDA 批准的靶向疗法治疗，主要是通过 EGFR 抑制剂治疗 RAS 野生型，以及通过检查点抑制剂治疗 MSI-H 肿瘤。结论：肿瘤位于右侧、存在 BRAF V600E 突变（但没有其他研究突变）和 MSI-H 在未经选择的队列中比临床患者队列中报告的更常见，可能是因为它们表明预后不良。一半患者的肿瘤可使用 FDA 已批准的针对 mCRC 的靶向药物治疗。
利用网络药理学和分子药物设计研究硝唑尼特治疗肝细胞癌的分子靶点和途径
硝唑尼特已被研究用于治疗结直肠癌和乳腺癌。然而，其分子靶点和途径尚未被探索用于治疗肝细胞癌 (HCC)。利用网络药理学方法，研究了硝唑尼特治疗 HCC 的潜在靶点和分子途径。从 GeneCards 数据库中提取 HCC 靶点。使用 Swiss Target Prediction 和 Super Pred 预测硝唑尼特的潜在靶点。使用 VENNY 在线工具分析相交靶点。使用 Cytoscape 构建了蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI)、聚类和核心靶点-途径网络。使用注释、可视化和集成发现数据库 (DAVID)、基因本体 (GO) 和京都基因和基因组百科全书 (KEGG) 进行途径富集分析。使用 Auto Dock Vina 将硝唑尼特与抗 HCC 核心靶点进行分子对接。共鉴定出硝唑尼特168个潜在靶点、13,415个HCC相关靶点和153个交叉靶点。鉴定出前8个抗HCC核心靶点：SRC、EGFR、CASP3、MMP9、mTOR、HIF1A、ERBB2和PPARG。GO富集分析表明，硝唑尼特可能通过影响参与多个生物过程（BP）（蛋白质磷酸化、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶（RTKs）信号通路、MAP激酶活性的正向调控等）的基因靶点而发挥抗HCC作用。KEGG通路和核心靶点-通路网络分析表明，癌症中的通路和癌症中的蛋白聚糖是两条对硝唑尼特抗HCC作用有显著贡献的关键通路。分子对接结果显示，抗HCC八大核心靶点与硝唑尼特之间存在活性相互作用的潜力。我们的研究为硝唑尼特可能对HCC具有独特的治疗效果这一观点提供了理论基础，而所确定的药理学靶点和途径可能作为HCC治疗的生物标志物。