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摘要背景:癌症中最常见的零星纯合缺失之一是9p21损失,其中包括甲基硫酸盐基因氨基磷酸化酶(MTAP),CDKN2A和CDKN2B,并且与恶化的结构和免疫治疗疗法相关。mtap -loss是通过与MAT2A和PMRT5抑制剂的合成致死性来发展的药物靶标。这项研究的目的是研究晚期胃肠道(GI)肿瘤中MTAP-损失的患病率和基因组局势,并研究其作为预后生物标志物的作用。材料和方法:我们对包括5个GI癌的64 860个肿瘤进行了下一代测序以及比较基因组和临床分析。我们比较了一项回顾性研究,比较了gi癌患者的临床结果。结果:GI癌症中MTAP -loss的患病率为8.30%。mtap -loss在胰腺导管腺癌(PDAC)中最普遍,为21.7%,结直肠癌(CRC)为1.1%。mTAP -loss肿瘤更为普遍。在MTAP -loss肿瘤中观察到了潜在靶向基因组改变的患病率(ATM,BRAF,BRCA2,ERBB2,IDH1,PIK3CA和PTEN)的显着差异,并根据肿瘤类型而变化。mtap -loss PDAC,IHCC和CRC的患病率较低或肿瘤突变负担升高。结论:在GI癌中,MTAP -loss是9P21损失的一部分,总体患病率为8%。阳性PD -L1肿瘤细胞表达在MTAP -loss与MTAP -INTACT IHCC肿瘤(23.2%vs 31.2%,p = .017)中的频率较低。mtap -loss发生在22%的PDAC,15%的IHCC,8.7%的胃食管腺癌,2.4%的肝细胞癌和CRC的1.1%,并且与其他可靶向突变相互排斥。关键词:MTAP损失; 9p21损失;基因组学;生物标志物;瘤;胆管癌。

晚期胃肠道癌的甲基腺苷磷酸化酶基因组损失

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