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澳大利亚和新西兰环境DNA生物监测的最佳实践指南
Abbott，C.，Coulson，M.，Gagné，N.，Lacoursière-Roussel，A.，Parent，G。J.，Bajno，R.，Dietrich，C。，＆May-McNally，S。（2021）。 使用有针对性的环境DNA（EDNA）分析用于管理有风险的水生入侵物种和物种的指导。 dfo可以。 SCI Adviss Sec Res文档。 2021/019。 iv + 42 p。 Bani，A.，De Brauwer，M.，Creer，S.，Dumbrell，A.J.，Limmon，G.，Jompa，J.，Von der Heyden，S。，＆Beger，M。（2020）。 通过环境DNA告知海洋空间规划决策。 生态学研究的进步，62，375–407。 Barnes，M。A.和Turner，C。R.（2016）。 环境DNA的生态及其对保护遗传学的影响。 保护遗传学，17（1），1-17。 https://doi.org/10.1007/s1059 2-015-0775-4 Barnes，M.A. 环境条件会影响水生系统中的Edna持久性。 环境科学技术，48（3），1819– 1827年。 https://doi.org/10.1021/es404 734p Bowers，H。A.，Pochon，X.，von Ammon，U.，U.，Gemmell，N. L.，Jeunen，G.-J。，Sherman，C。D. H.和Zaiko，A。 （2021）。 朝Abbott，C.，Coulson，M.，Gagné，N.，Lacoursière-Roussel，A.，Parent，G。J.，Bajno，R.，Dietrich，C。，＆May-McNally，S。（2021）。使用有针对性的环境DNA（EDNA）分析用于管理有风险的水生入侵物种和物种的指导。dfo可以。SCI Adviss Sec Res文档。2021/019。iv + 42 p。 Bani，A.，De Brauwer，M.，Creer，S.，Dumbrell，A.J.，Limmon，G.，Jompa，J.，Von der Heyden，S。，＆Beger，M。（2020）。通过环境DNA告知海洋空间规划决策。生态学研究的进步，62，375–407。Barnes，M。A.和Turner，C。R.（2016）。 环境DNA的生态及其对保护遗传学的影响。 保护遗传学，17（1），1-17。 https://doi.org/10.1007/s1059 2-015-0775-4 Barnes，M.A. 环境条件会影响水生系统中的Edna持久性。 环境科学技术，48（3），1819– 1827年。 https://doi.org/10.1021/es404 734p Bowers，H。A.，Pochon，X.，von Ammon，U.，U.，Gemmell，N. L.，Jeunen，G.-J。，Sherman，C。D. H.和Zaiko，A。 （2021）。 朝Barnes，M。A.和Turner，C。R.（2016）。环境DNA的生态及其对保护遗传学的影响。保护遗传学，17（1），1-17。https://doi.org/10.1007/s1059 2-015-0775-4 Barnes，M.A.环境条件会影响水生系统中的Edna持久性。环境科学技术，48（3），1819– 1827年。https://doi.org/10.1021/es404 734p Bowers，H。A.，Pochon，X.，von Ammon，U.，U.，Gemmell，N.L.，Jeunen，G.-J。，Sherman，C。D. H.和Zaiko，A。 （2021）。 朝L.，Jeunen，G.-J。，Sherman，C。D. H.和Zaiko，A。（2021）。朝
高频环境DNA元法编码可快速有效地监测鱼类社区动力学
fi g u r e 2 edna测序读数的变化（Hellinger被改造并用作代理人的丰度），用于包括（A）Lee河和（B）Richmond Lock的Thames Sites的鱼类的鱼类。颜色强度和较大的点都表明了测序读数的丰度。丰富性基于3个生物学重复中的2种中存在的物种。
第十一届鱼类寄生虫国际研讨会...
9:15 - 9:30 Hupalo - 寄生虫 eDNA Přikrylová - 观赏鱼的寄生虫 9:30 - 9:45 Oliva - 寄生虫回流？ Bott - 蓝鳍金枪鱼上的 Cardicola 9:45 - 10:00 Scholz - 被忽视的绦虫北美 10:00 - 10:30 咖啡休息 (Patio Central, CCU) 时间 房间 1. 生物多样性 (一般, 绦虫) 主席: Anindo Choudhury
在使用诱导多能的使用方面有希望的发展...
最初发表于：Yde Ohki，Cristine Marie； McNeill，Rhiannon V；尼伯勒，马蒂亚斯； Radtke，Franziska； Kittel-Schneider，Sarah；格伦布拉特，埃德娜（2022）。在ADHD研究中使用诱导多能干细胞的有希望的发展。in：斯坦福大学，S Clare； Sciberras，Emma。注意力缺陷多动障碍行为神经科学中的新发现。纽约：施普林格，483-501。doi：https：//doi.org/10.1007/7854_2022_346
处理环境DNA样品的不同方法对鱼类，细菌和古细菌群落具有明显的影响
沿海泻湖是加利福尼亚州流行和受威胁物种的重要栖息地，这些栖息地影响了城市化和干旱的影响。环境DNA已被提升为帮助监测生物群落的一种方式，但在不同的方案中引入的偏见尚待理解，该方案旨在克服旨在克服研究中的独特系统提出的挑战。浑浊水是这些系统中EDNA恢复的一种方法论挑战，因为它迅速堵塞了过滤器，从而阻止了样品的及时处理。我们研究了两种解决方案产生的社区组合中的偏见，以克服由于浊度而缓慢的效果：冻结在填充前（用于存储目的和长期处理）和使用沉积物（与水样品相反）。在下游EDNA分析中对社区组成的偏差评估进行了两组底漆，12s（Fin）和16S（细菌和古细菌）。我们的结果表明，在使用较大的孔径（3 µm）的滤波器时，在填充前的冷冻水对每个底漆的社区组成有不同的影响。尽管如此，在关注菲什社区（12s）时，预冰的水样品仍然可以作为存储和处理浊度水样品的可行替代方案。应谨慎使用沉积物样品作为处理水样品的替代方法，至少应增加采样的生物复制和/或体积的数量。
使用...
作为新热带淡水的面部令人震惊的生物多样性丧失，迫切需要更有效，准确的生物监测工具，而这些工具比传统方法需要更少的分类专业知识。虽然对水或沉积物环境DNA（EDNA）的分析已迅速越来越受欢迎，但越来越多的研究正在研究“天然采样器” - 通过其喂养行为汇总Edna的生物 - 作为生物监测的工具。在这里，我们研究了大型新热带河流中丰富且分布广泛的淡水虾是否可以提供可靠的局部鱼类组合的快照。对虾饮食DNA的多标记元法码分析显示，研究区域的10天库存含量如此之多，而物种是监视计划中常用的基于Gillnet的方法的近三倍。这些有害生物的通才和机会喂养行为允许以大小的大小来检测广泛的物种，包括被传统的基于吉尼特的调查所忽略的小型。此外，由于近乎详尽的条形码参考数据库的可用性，大多数鱼类群都在物种水平上识别出来。随着分子分析的成本和速度继续降低，采样和加工的相对易于性使得该方法特别适合进行快速的生物多样性评估，并检测人类植物干扰的局部生态系统影响，互补观察方法，互补可提供对丰度，生物群，生物群和条件的数据。
细胞壁脂蛋白CD1687在脱氧氯酸诱导的生物膜艰难梭菌中形成的生物膜中充当DNA结合蛋白
细菌病原体建立复发和持续感染的能力经常与它们形成生物膜的能力有关。梭状芽胞杆菌的差异感染具有较高的复发率和复发率，并且假设生物膜参与其致病性和持久性。生物膜通过C.差异仍然很少了解。已经表明，诸如脱氧胆酸（DCA）或甲硝唑诱导生物膜形成的特定分子，但所涉及的机制仍然难以捉摸。在这项研究中，我们描述了C.差异脂蛋白CD1687在DCA诱导的生物膜形成过程中的作用。我们表明，CD1687的表达是CD1685-CD1689基因簇中的操纵子的一部分，由多个转录启动位点控制，有些是响应DCA诱导的。生物膜形成只需要CD1687，而CD1687的过表达足以诱导生物膜形成。使用RNASEQ分析，我们表明CD1687影响转运蛋白和代谢途径的表达，我们通过下拉测定法（包括转运 - 相关的细胞外蛋白）来识别几个潜在的结合伴侣。然后，我们证明了CD1687在C.差异中暴露于表面，并且该定位是DCA诱导的生物膜形成所必需的。鉴于这种定位以及C.差异形成Edna富生物膜的事实，我们确认CD1687以非特定方式结合DNA。因此，我们假设CD1687是通过通过结合EDNA促进细胞与生物纤维矩阵之间的相互作用，是对DCA的下游响应的组成部分。
Adv> Advansentinel Inc.启动“ QuickConct”
套件，例如Qiagen的Dneasy血液和组织套件，如《环境DNA社会手册》中列出。⚫多合一包：该套件包括所有必要的试剂和设备，使您可以立即开始采样而无需组装。QuickConc™QuickConc™的好处有望显着提高EDNA分析的效率，从而带来以下好处：⚫更有效的生物多样性监测：可以在更少的时间内分析更多样本。⚫促进保护工作：快速数据采集可以实施更及时的保护措施。⚫促进EDNA分析：预计用户友好的操作将鼓励更多的研究人员和机构进行环境DNA分析。如果您对产品还有其他任何疑问或需要更多信息，请随时与我们联系以详细说明。（https://advansentinel.com/en/contact）销售细节您可以在以下网站上购买QuickConc™（每1盒20次测试）：https：//www.amazon.co.co.jp/dp/dp/dp/dp/dp/dp/b0d91vymk3 this产品目前仅在日本出售，但在日本上可用，但我们可以在日本出售。您可以使用套件中包含的QR码访问的免费示例管理应用程序来轻松管理采样位置和元数据。该应用程序支持CSV导出和离线操作。如果您有兴趣使用它，请随时与我们联系。（请注意，此新闻稿基于具有（https://advansentinel.com/en/contact）附加信息与该产品的开发有关的论文是与科比大学人类发展与环境研究生院合作编写的，目前可作为预先打印。
提高控制红沼泽小龙虾procambarus clarkii
在托斯卡纳（意大利中部），侵入性外星红沼泽小龙虾procambarus clarkii的人口出现在罗姆纳湖（Lake Romena），靠近国家公园，并威胁着保护本地白爪小龙虾澳大利亚小龙虾澳大利亚小龙虾pallipes pallipes pallipes。进行了一项现场研究，以通过密集的陷阱活动来减少clarkii群体的丰度，并使用三种不同类型的陷阱提高捕获的有效性：两个丝网陷阱（圆柱形和矩形）和人造避难所陷阱。这项研究还旨在评估湖动物群落的组成，特别是小龙虾捕食者（使用Edna）的存在，以及Clarkii P. clarkii的潜在传播。在2022 - 2023年在两个诱捕季节进行的控制活动导致小龙虾种群的丰度指数（每单位努力）的至少50％。圆柱形陷阱捕获了更多个体，尤其是大人物和男性，人造避难陷阱捕获了相对较大的女性和较小的个体。Edna采样强调了一个多元化的社区，主要由外星物种和一些小龙虾捕食者组成（例如，鱼）。在周围地区进行的调查显示，湖下游存在Clarkii。应保持使用不同类型的陷阱的控制活动，以进一步降低Clarkii P. clarkii的丰度，同时应进行其他管理活动，以停止该物种在湖外的传播，以防止其进一步的生态影响。
ⅲ– 4 ．环境 dna：水产业の観点から...
1）Taberlet P，Coissac E，Hajibabaei M，Rieseberg LH。环境DNA。环境。DNA 2012; 21：1789 - 1793。2）Yamamoto S，Masuda R，Sato Y，Sado T，Araki H，Kondoh M，Minamoto T，Miya M.环境DNA Metabarcoding揭示了富裕的沿海海中的当地鱼类社区。SCI。 REP。 2017; 7：40368。 3 ） Minegishi Y, Wong MKS, Nakao M, Nishibe Y, Tachibana A, Kim YJ, Hyodo S. Species-specific pat- terns in spatio-temporal dynamics of juvenile chum salmon and their zooplankton prey in Otsuchi Bay, Ja- pan, revealed by simultaneous eDNA quantification of diverse taxa from the same water samples. 鱼。 Oceanogr。 2023; 32：311 - 326。 4）Yamanaka H，MinamotoT。鱼类环境DNA作为确定栖息地连通性的有效方法。 ecol。 指示。 2016; 62：147 - 153。 5） 3月 ecol。 prog。 ser。 2019; 609：187 - 196。SCI。REP。 2017; 7：40368。 3 ） Minegishi Y, Wong MKS, Nakao M, Nishibe Y, Tachibana A, Kim YJ, Hyodo S. Species-specific pat- terns in spatio-temporal dynamics of juvenile chum salmon and their zooplankton prey in Otsuchi Bay, Ja- pan, revealed by simultaneous eDNA quantification of diverse taxa from the same water samples. 鱼。 Oceanogr。 2023; 32：311 - 326。 4）Yamanaka H，MinamotoT。鱼类环境DNA作为确定栖息地连通性的有效方法。 ecol。 指示。 2016; 62：147 - 153。 5） 3月 ecol。 prog。 ser。 2019; 609：187 - 196。REP。2017; 7：40368。3 ） Minegishi Y, Wong MKS, Nakao M, Nishibe Y, Tachibana A, Kim YJ, Hyodo S. Species-specific pat- terns in spatio-temporal dynamics of juvenile chum salmon and their zooplankton prey in Otsuchi Bay, Ja- pan, revealed by simultaneous eDNA quantification of diverse taxa from the same water samples.鱼。Oceanogr。 2023; 32：311 - 326。 4）Yamanaka H，MinamotoT。鱼类环境DNA作为确定栖息地连通性的有效方法。 ecol。 指示。 2016; 62：147 - 153。 5） 3月 ecol。 prog。 ser。 2019; 609：187 - 196。Oceanogr。2023; 32：311 - 326。4）Yamanaka H，MinamotoT。鱼类环境DNA作为确定栖息地连通性的有效方法。ecol。指示。2016; 62：147 - 153。5）3月ecol。prog。ser。2019; 609：187 - 196。