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肠道特异性非炎性T淋巴细胞与慢性厌食性神经和宪法薄度的关联
摘要：有人提出，在无氧环境中，最后一个普遍的共同祖先（LUCA）在高温19次下进化，类似于深海通风口和火山斜坡上的环境。20因此，自发性DNA衰变（例如碱基损失和胞嘧啶脱氨酸）是影响卢卡基因组完整性的主要因素21。宇宙辐射是由于弱地球磁场和烷基化的22种代谢自由基所引起的，添加了这些威胁。在这里，我们提出，古代生活形式只有两种不同的23种修复机制：多功能的肾上腺素/肾上腺素（AP）核酸内核酸内核酸内核酸酶，以应对AP位点和24个脱氨基残基，以及酶催化紫外线和烷基化损害的直接逆转。在某些古细菌中，尿素-DNA N-糖基酶的缺失以及AP核酸内切酶的存在，即26可以切割含尿嘧啶的DNA，这表明AP内核酸内核酸酶引起的核苷酸切口修复27（NIR）途径27（NIR）途径从分别从Glycosylase介导的碱基降低层独立于Glycosypiend介导的碱基上的远程摄取。nir可能是28个遗物，出现在早期的嗜热祖先中，以抵消自发的DNA损伤。我们 - 29提出，地球大气中的氧气水平升高〜2 ga触发了狭窄的AP核酸内切酶和DNA糖基酶的狭窄狭窄，以有效地应对氧化量扩大的氧化31碱基损伤和复杂的DNA病变。32
替代辅助进化算法中替代模型准确性对性能和模型管理策略的影响
替代辅助进化算法（SAEAS）来解决昂贵的优化问题。尽管SAEAS使用使用机器学习技术近似解决方案评估的替代模式，但先前的研究并未充分研究SAEAS中搜索性能和模型管理策略的Sherrotage模型准确性对搜索性能的影响。这项研究分析了替代模型准确性如何影响搜索绩效和模型管理策略。为此，我们构建了一个具有可调节精度的伪气管模型，以确保在不同的模型管理策略之间进行公平比较。我们比较了三种模型管理策略：（1）预选前（ps），（2）基于个人（IB）和（3）基于一代的基准基准问题的基于生成（GB）的基线模型，而基线模型不使用替代物。实验结果表明，较高的替代模型精度可提高搜索性能。但是，影响根据所使用的策略而变化。具体来说，随着估计精度的提高，PS证明了性能的明显趋势，而当准确性超过一定阈值时，IB和GB表现出强大的性能。模型策略
世界各地选定地点的气候变异性和冰川演变：过去的趋势和未来预测
世界人口的16％以上依赖冰川和融雪作为水的来源（Barnett等，2005）。在热带和亚热带干旱和半干旱地区，人类使用的淡水中有80％来自山脉（Messerli，2001； Vuille等，2008）。Cauvy-Fraunié和Dangles（2019）将冰川覆盖率和熔融率（除其他因素）确定为可以调节分类单元敏感性的关键变量。温度和沉淀（PR）变化预计会对冰圈过程产生相当大的影响（Beniston等，2018）。此外，大气温室气体浓度的增加也会导致气候变化的变化（Boer等，2000）。到目前为止仍然鲜为人知的一个主题是这些气候过程在冰川化的地区如何运作，在冰川地区，原位详细的测量通常很少或不存在。
单胺氧化酶（MAO）抑制测定
800家生物技术公司，学术机构以及其他医疗保健利益相关者。evotec在当前服务不足的治疗领域中拥有战略活动，例如神经病学，肿瘤学以及代谢和传染病。在这些专业知识领域中，EVOTEC旨在为创新的治疗学创建世界领先的共同拥有的管道，并迄今已建立了200多个专有和共同拥有的研发项目，从早期发现到临床开发。Evotec在全球范围内与5,000多名高素质的人一起运作。该公司在欧洲和美国的网站提供高度协同的技术和服务，并作为卓越的互补群。有关其他信息，请访问www.evotec.com，然后在x/twitter @evotec和LinkedIn上关注我们。
利用基于质谱的蛋白质组学用于连续的定向进化
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。它是制作
degronmd：利用靶向蛋白质的降解，突变和药物反应的进化和结构特征
靶向蛋白质的降解是一种新兴而有希望的治疗方法。降解的特异性和细胞稳态的维持是由E3泛素连接酶和脱脂信号（称为Degrons）之间的相互作用确定的。人类基因组编码超过600个E3连接酶；但是，到目前为止，仅确定了少数目标的DEGRON实例。在这项研究中，我们引入了DeGronmd，这是一个开放知识库，旨在研究DEGRON，它们相关的功能障碍事件和药物反应。我们驱逐出来，degrons在进化上是保守的，并且倾向于在蛋白质翻译修饰部位附近发生，尤其是在无序结构和较高溶剂可访问性的区域。通过模式识别和机器学习技术，我们构建了跨人类蛋白质组的降解景观，产生了超过18,000个新的脱脂剂，用于靶向蛋白质降解。此外，DEGRON的功能障碍会破坏降解过程，并导致蛋白质的异常积累。此过程与各种类型的人类癌症有关。基于由体细胞突变引起的估计表型变化，我们从系统地进行了量化并评估突变对pan-Canters degron功能的影响；这些结果有助于建立有关人类降解的全球突变图，其中包括89,318个可起作用的突变，这些突变可能引起降解和破坏蛋白质降解途径的功能障碍。多组合综合分析揭示了与功能性脱粒突变相关的400多个耐药性事件。degronmd，可在https://bioinfo.uth.edu/degronmd上访问，是探索生物学机制，推断蛋白质降解以及在Degron上的药物发现和设计的有用资源。
刺激循环二核苷酸 - 甲状腺纳米颗粒唤起急性髓样白血病的可靠免疫力
急性髓样白血病（AML）是成年人中最常见的白血病类型之一，5年生存率为30.5％。这些差的患者结局归因于肿瘤复发，这是由于无效的先天免疫激活，T细胞耐受性和缺乏免疫记忆的原因。因此，需要新的策略来激活先天和效应的免疫细胞并引起对AML的长期免疫力。一种解决这些问题的方法是通过干扰素基因（STING）途径激活的刺激剂，该途径会产生I型干扰素（I型IFN）对先天性和适应性免疫激活至关重要。在这里，我们报告说，带有Mn 2+的基于脂质的纳米颗粒平台（CMP）的系统性免疫疗法在传播AML的小鼠模型中表现出强大的抗肿瘤疗效。此外，CMP免疫疗法与免疫检查点结合了针对细胞毒性T-淋巴细胞相关蛋白4（抗CTLA-4）引起的强大先天和适应性免疫激活，并具有增强的细胞毒性免疫激活，并增强了对AML的细胞毒性潜能，从而在与Aml恢复后延伸了动物生存。总体而言，这种CMP组合免疫疗法可能是针对AML和其他传播癌症的有前途的方法。
Tenascin-C是否与脊椎动物的一般免疫系统共进？
tenascin-c在免疫中起重要作用。Toll样受体4，整合素A 9 B 1和趋化因子和趋化因子已经被确定为执行Tenascin-C的免疫调节功能的关键参与者。 Tenascin-C也存在于淋巴组织的网状纤维中，这些淋巴组织是参与适应性免疫调节的主要部位。“工具箱”是否用于阅读和解释Tenistins和Tenascin-C共同进化所施加的免疫调节指令？尽管细胞外基质是古老的，但替代蛋白最近进化了。tenascin样基因是在头足体和静脉体中首次遇到的，这些基因被广泛接受为早期分支的脊柱谱系。脊椎动物缺乏lamp鼠，但有tenaincin，但是在Tenascin-C中首先出现的Tenascin基因出现在软骨鱼中。自适应免疫显然是在颌骨和颌骨脊椎动物中独立演变的，前者使用可变淋巴细胞受体进行抗原识别，而后者则使用免疫球蛋白。因此，虽然田丁蛋白早于适应性免疫的出现，但第一个tenascin-c似乎在基于免疫球蛋白的适应性免疫的第一个生物中进化。虽然lamp上存在C-X-C趋化因子，但C-C趋化因子也出现在具有免疫球蛋白基于免疫球蛋白的适应性免疫的第一个生物中，主要的组织相容性复合物，T-Cell受体，TOLL-FOLL-HOUDER-HOUDER-HOUDER-HOUDER-HOUDER-HOUDER-HOFFEROR-4和INTEMERIN鉴于Tenascin-C在炎症事件中的重要性，Tenascin-C的共同进化以及适应性和先天免疫的关键要素暗示了这种细胞外基质糖蛋白在颌骨的免疫反应中的基本作用。鉴于Tenascin-C在炎症事件中的重要性，Tenascin-C的共同进化以及适应性和先天免疫的关键要素暗示了这种细胞外基质糖蛋白在颌骨的免疫反应中的基本作用。
利用蛋白质的网络的演变来逆转认知
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2025年3月2日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.28.640897 doi：Biorxiv Preprint
“多代理”筛选提高了定向酶进化的效率
酶的进化使生物技术方面的进步得以巨大进步。但是，定向的进化程序仍然需要许多迭代的筛选以识别最佳的突变序列。这是由于健身景观的稀疏性，这又是由于“隐藏”突变仅与其他突变相结合的“隐藏”突变所致。这些“隐藏”突变仅通过评估突变组合，需要大型组合文库或迭代筛选。在这里，我们报告了一种多代理的定向进化方法，该方法在筛选过程中融合了各种底物类似物。具有多种底物，像多个辅助健身景观一样，我们能够识别“隐藏”突变残基，这些突变型残基无需测试众多组合。我们最初在工程中验证了这种方法，以改善各种非天然底物的活性。我们发现“隐藏”突变通常与活动站点相距甚远，因此很难使用基于结构的方法进行预测。有趣的是，预计在这种情况下确定的许多“隐藏”突变会破坏三级结构元素之间的相互作用，从而可能影响蛋白质的柔韧性。这种方法可能广泛适用于加速酶工程。最后，多机构系统启发的方法可能在解决生物学中其他复杂的组合搜索问题方面更为广泛。