TR-FRET E3 检测涉及铽标记的 TUBE,其与由目标 E3 连接酶合成的荧光素标记的多泛素链结合。铽和荧光素是一对 FRET 对,因此含有荧光素标记的泛素的多泛素链在与铽-TUBE 结合时会产生 FRET 信号。该信号可以以均质、高通量的形式随时间监测,使其成为小分子筛选的理想选择。
紫外光可以选择性激发QD供体,而FP和FD表现出的相对较窄的吸光度带通常会导致受体的直接激发。相比之下,QD-QD FRET在传感应用方面的研究不如QD-FP(D) FRET深入。14,15QD吸光度曲线的宽带性质使直接激发不可避免,干扰了基于观察受体敏化发射的分析。可以通过评估供体荧光寿命的变化来规避这个问题,因为它不直接受到高受体背景信号的影响,但是这些测量的实验设置和分析可能比收集和分析光谱数据更困难且更耗时。此外,PL寿命仪器不太普及,很少配备有助于测量多种样品条件的读板机。最近,QD已非常成功地用作镧系元素配合物的FRET受体。 16 在这些系统中,可以使用时间门控 PL 测量,这比寿命测量简单得多,并且可以通过许多商用平板读数器进行测量。然而,由于其出色的亮度,QD – QD FRET 的开发对于具有易于读取的视觉输出的即时诊断传感器 (POC) 可能很有意义 — 特别是,† 提供电子补充信息 (ESI)。参见 DOI:10.1039/d0an00746c
同质 FRET 过程依赖于供体发射和受体吸收之间的光谱重叠。只有当 QD 彼此足够接近时,才会发生这种情况。这就是我们添加 APTES 将它们聚集成簇的原因。因此,从小波长到大波长的相关能量转移导致 QD 群体的发射带红移。从现象学上讲,这种红移类似于我们在胶体悬浮液中增加 QD 浓度时观察到的红移。在这种情况下,QD 不会聚集且不会相互耦合,因此它们无法实现同质 FRET。然而,鉴于它们的高浓度,内滤波效应 (IFE) 开始发挥作用。每个 QD 仍然发光,但会显著吸收其他 QD 的光。这是一种纯粹的集体自吸收现象,在整个 QD 群体的规模上,依赖于吸收和发射之间的光谱重叠 [3]。给定等式。 (S13),同源 FRET 可以正式描述为一种统计现象,涉及整个 QD 群体的吸收 A (λ) 和发射光谱 I 0 (λ) 之间的有效重叠,方式与 IFE 类似,只要 ∆ S ≳ δλ ,即 A (λ) ≈ I 0 (λ + ∆ S) 在重叠的光谱范围内(见图 S2)。出于这些原因,我们在此建议,首先,计算由于内滤波效应(IFE)引起的红移,其次,将结果推断到形式上类似的同源 FRET 情况。
自 2020 年 1 月 1 日起,SNCF 成为一个综合统一集团——3 家 EPIC 成为 5 家公司:SNCF(母公司)、SNCF Réseau、SNCF Gares & Connexions、Fret SNCF SAS 和 SNCF Voyageurs。– 法国政府全资拥有 SNCF,其股本不可转让。– SNCF 直接或间接持有所有公司。SNCF Réseau 和 SNCF Voyageurs 的股份不可转让。– Geodis 和 Keolis 属于 SNCF 母公司。自 2021 年 1 月 1 日起,TFMM 和 Fret SNCF SAS 将并入 Rail Logistics Europe。
在相关努力中,[10] 我们扩展了适用于均相 FRET 检测的分子识别元件列表,包括变构转录因子 (aTF),这是一类特定的底物结合蛋白,可在离散蛋白质结构域中结合 DNA 和小分子效应物。在这里,我们描述了使用特征明确的 aTF TetR 进行分子识别的其他新型传感器,使用改变 aTF-DNA 结合亲和力的 aTF 变体来调节传感器灵敏度,并展示了一种带有遗传编码供体荧光团的额外传感器设计。这些额外的传感器展示了我们方法的普遍性,同时详细介绍了一种更容易被各种研究小组采用的传感器设计。变构转录因子是调节蛋白,包含 DNA 结合结构域和效应物结合结构域,能够以高特异性和选择性识别小分子。 [11] 在目标分析物存在的情况下,aTF 对其 DNA 结合序列的亲和力会受到调节,从而促进下游基因表达的阻遏物或去阻遏物调节。[11] aTF 与其同源 DNA 和效应配体之间独特但相互关联的结合提供了一种内在的转导机制,我们将其与 FRET 偶联以进行光学读出。[10] 其他先前描述的基于底物结合蛋白的 FRET 传感器通过染料标记的配体的置换(竞争性测定)或蛋白质的构象变化来实现供体-受体距离的变化。[6,7] 我们的基于 aTF 的 FRET 传感器利用供体标记的 aTF 与其受体标记的同源 DNA 序列的分析物响应性解离来引起供体-受体距离的大幅变化。因此,这些 FRET 传感器无需对配体进行染料标记,因为染料标记会改变配体的结合行为 [12],同时能够通过供体和受体荧光团的完全解离产生显著的信号变化(图 1)。我们之所以选择 TetR 进行这项研究,是因为它是一种特性良好的 aTF,在实验室环境中广泛用于基因调控和诱导蛋白表达。[11] TetR
在聚合物机械化学领域 [10,11],OFP [12,13] 可以实现光学可视化,并监测不同材料体系(从传统的热固性材料和热塑性材料 [14–18] 到蛋白质)内不同长度尺度上的机械诱导事件。[19–23] 在机械生物学领域也可以找到类似的概念。[24–27] 在施加力时,OFP 会发生构象、构型或组成键异构化反应,从而改变其在吸收、荧光或化学发光方面的光学性质。[28] 材料科学中高分辨率显微镜技术的出现甚至使我们能够追踪亚微米尺度的宏观材料损伤。[29–37] 因此,OFP 有助于开发具有改进性能的材料方法。 [38] 尽管 OFP 已成功用于研究合成和生物大分子材料的损伤,但令人惊讶的是,尚未使用 OFP 研究粘合剂的失效。现有的研究粘合剂疲劳和断裂的方法[39]包括目视检查、[40] X 射线光电子能谱、[41,42] 质谱 (MS)、[43,44] 傅里叶变换红外光谱、[42,45] 和接触角测量。[42] 然而,这些技术都无法对胶水成分的机械状态提供空间分辨的光学反馈。我们在此报道了一种由阳离子力响应蛋白 FRET 对和阴离子芳香族表面活性剂的静电共聚形成的生物胶。[46,47] 因此,我们将 FRET 供体荧光团连接到力响应的 FRET 受体荧光蛋白。在机械测试过程中,施加力会改变 FRET 效率,从而改变发射光谱以及供体荧光寿命。我们使用这些蛋白质粘合剂粘合高能和低能表面,以对其断裂行为进行详细的光学分析。机械损伤
1. 简介 只有借助原子力显微镜 (AFM) (1 , 2) 和光学单分子光谱 (3–9) 等新方法,才能直接研究单个蛋白质分子的折叠。这些技术除了直接描述分子过程之外,还提供了根本性的优势:它们可以解析和量化单个分子或亚群的属性,而这些属性在经典的集合实验中是无法获得的,在经典的集合实验中,信号是许多粒子的平均值。荧光光谱是一种特别有吸引力的技术,因为它具有极高的灵敏度和多功能性 (5 , 10 , 11) 。与 Förster 共振能量转移 (FRET) (12–14) 相结合,它使我们能够研究单个蛋白质的分子内距离分布和构象动力学。时间分辨的集合 FRET 还可用于分离亚群并获取有关距离的信息
•我们的大多数有效的CBP选择性降解器具有> 10µm的结合亲和力(Tr-Fret IC 50),而没有观察到BRD4(> 30µm)
图1。比例计量CRISPR-CAS12A系统。基于双通道FRET的CRISPR-CAS12A记者系统的示意图。电流(顶部)报告基因系统依赖于荧光团 - 猝灭记者,该记者包括黑暗(非辐射)淬火以防止发射和单个通道读数来检测裂解的报告基因。提出的读取系统而不是使用可见光的淬火。虽然报告荧光团保持与猝灭剂的结合,但报告基因系统形成一个fret对,并在可见的淬灭的发射波长中发出光。在CAS12A裂解时,报告荧光团发射通道中的信号增加,而淬火发射通道中的信号降低。因此,被分析的信号是报告荧光团发射通道与减少淬灭发射通道的比率。
量子点(QD)固体是有希望的光电材料;进一步提高其设备功能需要了解其能量传输机制。The commonly invoked near-field Förster reso- nance energy transfer (FRET) theory often underestimates the exciton hopping rate in QD solids, yet no consen- sus exists on the underlying cause.为了响应,我们使用了时间分辨超快刺激的发射消耗(STED)显微镜,这是STED的超快速转化,以在泰氏剂掺杂的核心/核心/钙含量的核/钙含量硫化物硫化物硫化物 - 硫化物 - 硫化物 - 壳QD超弹药中的超快转化。我们测量了由于激子在超晶格内采样异质的能量景观而导致的伴随时间分辨的激子衰减。通过单粒子发射光谱量化异质性。这套强大的多模式集合集合对激子传输的动力学蒙特卡洛模拟提供了足够的约束,以阐明一种复合运输机制,该机制包括近场和以前被忽视的远场排放/吸收性贡献。发现这种机制提供了一个急需的统一框架,可以在其中表征QD固体中的传输和设备设计的其他原理。