图1使用下一代AMA1质粒增强了麦克利荧光蛋白的表达。A。分析了MCHERRY表达的AMA1质粒的示意图,其选择标记物具有不同的变体。b荧光曲霉曲霉菌落的荧光照片显示,用Ubi-M-Pyrg和Ubi-Y-Y-Pyrg质粒转化的菌落中荧光增加。来自转化菌落的孢子中麦克利荧光的流式细胞仪分析表明,使用UBI-Y-Y-PYRG质粒实现了最均匀和最高的麦克利信号。在图S1a中,来自不同转化菌落的重复之间的平均荧光和重复的直方图。在液体培养中生长的菌丝体的共聚焦显微镜图像显示,在含有UBI-M-PYRG和UBI-Y-PYRG质粒的菌丝体中的表达增加。ImageJ火灾校准栏代表不同级别的MCHERRY信号。在图中重复S2。e。对等差质粒浓度下不同质粒的转化效率的评估显示,质质质质量降低的质粒的转化效率降低了,将pyRG融合到降解标签。字母表示由ANOVA确定的,并在Tukey后的测试中确定了显着不同的组。F.在选定和非选择条件下固体培养基上菌落生长速率的比较表明,在选择性条件下,携带UBI-M-PYRG和UBI-Y-Y-PYRG质粒的菌株的生长较慢。星号代表pADJ <0.05 <0.05,韦尔奇的t检验表示选择性和非选择性培养基之间的直径差异,用于携带每种质粒的菌株。
摘要:塑料被称为顽固的材料,在自然界中很难降解,如果环境无法正确管理,则会导致其积累并威胁到环境。有关塑料降解的研究最近引起了很多关注。这项研究旨在确定从垃圾填埋场中塑料废物中分离出的真菌的多样性,并确定分离株的潜在塑料降解能力。从印度尼西亚的Medan Marelan的Terjun垃圾填埋场收集塑料废物样品。真菌直接在马铃薯葡萄糖琼脂培养基上分离,并在宏观上和显微镜上进行表征。塑料降解势。塑料板用于测试真菌的生物降解能力。24种不同的真菌形态型成功地从塑料废物中纯化,其中五种分离株显示出更好的生长。分子鉴定表明,五个电势分离株属于不同种类的紫solani(LDPE5),botryosphaeria laricina(lldpe10),曲霉菌(hdpe1),阿斯皮格鲁斯·弗拉维斯(Aspergillus flavus flavus flavus flavus(hdpe3)和植物(hdpe3)和植物(pp5)。生物降解测试表明,分离株LDPE5表现出最佳活性,45天后塑料板的重量减小了20.83%,然后是分离株LLDPE10,重量减轻了6.49%。扫描电子显微照片显示塑料片的退化片的表面变得粗糙而波浪状。傅立叶变换红外分析显示塑料片上新功能组的形成。然后,这表明垃圾填埋场中的真菌在生物降解过程中起着重要作用。关键字:多样性,真菌,身份证明,垃圾填埋,塑料退化简介
1。简介地衣是Mycobiont和Photobiont(藻类和/或蓝细菌)群落的高度整合系统。地衣真菌需要特定的光片以发展共生表型。类似于植物组织的地衣thallus为多种微生物提供了一个有趣的生物学环境(Zhang等,2016)。除了它们的主要共生体外,地衣还具有地衣真菌,内醇真菌以及可培养和不可培养的不可培养的非肉质细菌(Biosca等,2016; Muggia et al。,2014)。以来,地衣的历史可以追溯到超过6亿年(Yuan等,2005),如今,它们在地球上约有10%的陆地生态系统,地衣及其合作伙伴中占据了共生的成功风格(Papazi等,2015)。然而,地衣是微生物多样性的未置换栖息地。为了更好地理解微生物的生物学并将其独特的基因用于技术,研究较少研究的环境条件和栖息地是有利可图的(Suryanarayanan等,2017)。
1纽瓦克大学生物学研究所微生物学实验室,瑞士纽瓦克(Neuch),瑞士; anaele.simon@gmail.com(A.S。); guillaume.cailleau@unine.ch(G.C.); saskia.bindschedler@unine.ch(S.B.); pilar.junier@unine.ch(p.j.)2洛桑大学地面动力学研究所生物科学实验室,瑞士洛桑1015; finaritraran@gmail.com(F.R.); eric.verrecchia@unil.ch(E.V.)3 Max Planck陆地微生物学研究所,德国Marburg 35043 4 EcoleSupérirerieure des Sciences Agronsiques,Universitéd'antananarivoUniversition,Antananarivo,Antananarivo 101,马达加斯加; g.rajoelison@yahoo.fr 5 Laboratoire des Radio-Esopopes,Madagascar Antananarivo 101的Antanarivo大学; herintsitohaina.razakamanarivo@gmail.com *通信:vincent.herve8@gmail.com;电话。: +49-6421178122
摘要:抗生素是当前医学治疗传染病的主食。然而,它们的广泛使用和滥用,结合细菌的高适应能力,危险地增加了多药耐药(MDR)细菌的发生率。这使得感染的治疗具有挑战性,尤其是当MDR细菌形成生物膜时。进入市场的最新抗生素与现有的抗生素具有非常相似的作用方式,因此细菌也迅速吸引了这些作用模式。因此,采取有效的措施避免致病细菌抗生素耐药性的发展非常重要,同时也要对来自不同来源的新分子进行生物培训,以扩大可用于结构这些感染性细菌的药物的库。丝状真菌具有大型且未探索的次级代谢组,并且富含生物活性分子,这些分子可能是潜在的新型抗菌药物。他们的生产可能具有挑战性,因为在标准培养条件下相关的生物合成途径可能不活跃。涉及代谢和基因工程的新技术可以帮助增强抗生素的产生。这项研究旨在回顾真菌的生物投入,以生产新药,以面对MDR细菌和生物FILM相关感染的日益增长的问题。
细菌、真菌和癌细胞群在接受治疗后的一个共同特征是,存在耐受性和持久性细胞,这些细胞能够存活,有时甚至在通常具有抑制或致死浓度的药物存在下也能生长,这是由群体中单个细胞之间的非遗传差异所致。在这里,我们回顾和比较了有关细菌、真菌和癌细胞中药物存活的数据,以揭示共同的特征和细胞途径,并指出它们的独特之处。这种比较工作还允许跨领域思想的相互交流。我们特别关注基因表达变异性在细胞间非遗传异质性出现中的作用,因为它代表了大多数持久性现象起源的可能共同的基本分子过程,并且可以进行监测和调整以帮助改善治疗干预。
内生菌可以生活在植物组织中,而不会引起宿主的明显症状(Hardoim等,2015)。内生真菌在研究中引起了极大的关注,因为它们不仅提供了多种药物的骨干的生物活性次级代谢产物(SMS)的新来源,而且还可以保护宿主植物免受生物和非生物胁迫的影响,从而对作物食品安全和安全构成严重威胁。因此,内生真菌对医学,农业和工业以及经济产生了相当大的影响。先前的研究(Torkamani等,2014; Tashackori等,2018; Salehi等,2019)呈现了真菌引起剂的显着潜力,以及在Corelus Avellus Avellus Avellus Avellus Avellus Crunture中的Paclitaxel Biosynthesis增量的内生性真菌和植物细胞的共处。在这个研究主题中,Zhang等人。表明,接种内生菌的根促进了巴黎多形根茎中多晶林的产生,抗病毒,镇痛,抗菌和抗炎性剂的产生,可能是由于下游细胞色素p450 p450和udp-glycosylthers composen composen composen composen composen composen composen comply cons comply comply consement consyla consyla。Santra和Banerjee将内生弯曲的Eragrostidis描述为有效的抗微生物生产者。这种分离的产生的挥发性有机化合物(VOC)可以通过防止危险植物病的生长来用作可持续农业的工具。此外,许多研究表明,大多数trichoderma spp。可以生物合成生物活性化合物并显示出引起植物性疾病的线虫和真菌的拮抗作用(Yao等人此外,曲线曲霉产生的生物活性代谢产物可以是传统抗生素的有力替代品,并有效地遏制了人群中由多种耐药的革兰氏阴性阳性和革兰氏阴性细菌病原体引起的致命疾病。)。这些生物活性化合物包括细胞壁降解酶和二级代谢产物,可以有效地降低植物性疾病,促进作物耐药性并增强植物的生长(Yao等人。)。Gangaraj等。表明,尼日尔曲霉产生了不同的抗菌代谢物,并且对包括番石榴枯萎病等的土壤传播疾病的生物防治具有很高的潜力。几个
关于根特征的最新研究表明,有两个轴解释了地下的特征变化:与菌根合作伙伴的协作轴和保护和保护(“快速 - 慢”)轴。然而,这些特征轴是否影响土壤传播真菌的组装尚不清楚。我们期望腐生性真菌与根特征的保护轴相连,而致病性和羊膜菌根真菌真菌与协作轴的链接相反,但在相反的方向上,如弧形菌根菌根真菌可能提供致病原的保护。为了检验这些假设,我们测序了根际真菌群落和25种草地植物物种的单一培养物中的根特征,年龄不同。在真菌公会中,我们评估了真菌物种的丰富度,相对丰度和社区组成。与我们的假设相反,真菌多样性和相对丰度与根特征轴没有密切相关。然而,腐生真菌群落组成受到菌群梯度的保护梯度和致病群落组成的影响。根际AMF社区组成并未沿协作梯度发生变化,即使根性状轴与根菌根菌落定殖速率一致。总体而言,我们的结果表明,从长远来看,根特性轴与真菌群落组成有关。
摘要地球的大部分树木都依赖于外生菌根真菌(ECMF)释放并提供的关键土壤养分,并且地球上的所有土地植物都与Bacte RIA相关,这些植物可以帮助它们在自然中生存。然而,我们对ECMF的存在如何修饰土壤细菌群落,土壤食物网和根化学的理解需要直接的实验证据,以理解ECMF在地下植物中可能产生的影响。为此,我们在接种ECMF和本地森林细菌群落或仅是本地细菌群落的土壤中种植了Pinus Muricata植物。然后,我们介绍了土壤细菌群落,应用的代谢组学和脂质组学,以及连接的OMICS数据集,以了解ECMF的存在如何修饰地下生物地球化学,细菌群落结构及其功能潜力。我们发现,ECMF(i)的存在丰富了与自然界增强植物生长有关的土壤细菌,(ii)改变脂质和非脂质土壤代谢物的数量和组成,(iii)将植物的根化学变化为病原体抑制,酶促保存,酶促氧和反应性氧气探测。使用这种多摩变方法,我们表明这种广泛的真菌共生可能是构建土壤食物网的常见因素。
摘要:对三方共生中豆类根际的这项研究的研究重点是共生体之间的关系,而较少的整体根际微生物组。,我们使用了一种实验模型,该模型与AM真菌接种(根瘤菌异常和AM物种混合)的不同花园豌豆基因型来研究它们对土壤微生物主要营养基团的人群水平以及根茎微生物群落中的结构和功能关系的影响。实验是在植物的两个物候周期上进行的。分析:微生物种群密度定义为CUF/G A.D.S.和AMF(%)的根定植率。 我们发现,AMF对微切菌和放线菌的密度有证明的显性作用,朝着还原的方向,表明拮抗作用,以及氨化,磷酸盐 - 溶解和自由生命的非同营养性氮杂杆菌细菌在刺激方向,指示相互关系的指示。 我们确定基因型对于固定矿物质NH 4 + -N和细菌根茎的细菌种群的形成是决定性的。 我们报道了与土壤氮和磷离子可用性相关的营养基团之间的显着双向关系。 微生物群落中营养基团之间保存的比例表明结构和功能稳定性。和AMF(%)的根定植率。我们发现,AMF对微切菌和放线菌的密度有证明的显性作用,朝着还原的方向,表明拮抗作用,以及氨化,磷酸盐 - 溶解和自由生命的非同营养性氮杂杆菌细菌在刺激方向,指示相互关系的指示。我们确定基因型对于固定矿物质NH 4 + -N和细菌根茎的细菌种群的形成是决定性的。我们报道了与土壤氮和磷离子可用性相关的营养基团之间的显着双向关系。微生物群落中营养基团之间保存的比例表明结构和功能稳定性。