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非菌根根相关的真菌通过各种机制提高土壤c库存和稳定性
摘要。虽然各种与根相关的真菌可以促进土壤碳（C）储存，因此有助于缓解气候变化，但到目前为止，该地区的研究基本上集中在菌根真菌上，并且在很大程度上对其他真菌的潜在影响和机制却在很大程度上尚不清楚。在这里，为了识别可以引入农作物以促进c固次的新生物体，我们评估了12种根相关的非杂菌真菌的土壤C储存潜力（跨越了九个属（跨越九个属）（跨越了九个属，并根据特征与土壤中的特征相互链接，从宽池中选择，并基于土壤中的菌方和菌方和cressial and-sedgial and-sedgial cungial cungial cungial cungial undigual。我们种植了与单个分离株接种的小麦植物，允许连续13 C标记。收获后，我们通过测量不同的Origin（植物与土壤）的池以及长期的土壤孵化和大小/密度分馏的不同稳定性来量化C的储存电位。我们在一项平行的体外研究中评估了植物和微生物群落的反应以及真菌的物理学和形态学特征。虽然与12个分离物中的3种接种导致总土壤C显着增加，但在大多数分离株的接种下，土壤C稳定性提高了 - 由于抗C池的增加以及不稳定的池和不稳定的C的减少，土壤C的稳定性和呼吸量的降低。进一步的土壤C稳定性在包括各种植物的植物中呈阳性，包括各种植物的生长，包括较高的植物繁殖体，该植物的繁殖体积较大，繁殖体系的繁殖体系，这些繁殖体系的含量更大，繁殖量较高多种直接和间接的机制，用于对土壤C存储的真菌影响。我们发现，与真菌治疗下的物理限制相比，对微生物分解的代谢抑制更多。我们的研究提供了在植物 - 土壤系统中的第一个直接实验证据，这些证据与特定的非菌根接种
重点和深入了解合成生物学介导的经济重要真菌的底盘，用于生产高价值代谢物
摘要：已经取得了实质性进步，并在合成生物学的生物学生物学工程中涉及的知识差距，以产生高价值代谢产物。基于生物的产品进行了广泛的探索，这归因于它们在工业部门，医疗保健和食品应用中的新兴重要性。可食用的真菌和多种真菌菌株的可食用组定义了包括食品添加剂，颜料，染料，工业化学物质和抗生素（包括其他化合物）的高价值代谢物的有吸引力的生物学资源。在这个方向上，合成生物学介导的真菌菌株的遗传底盘增强/增加生物学起源的新化学实体的价值正在开放真菌生物技术中的新途径。在经济可行的真菌（包括酿酒酵母）的遗传操纵中取得了巨大成功，在产生社会经济相关性代谢物中，知识差距/障碍需要得到补救，以使有价值的Fungal菌株完全剥削。在本文中，主题文章讨论了来自真菌的生物基产品的新属性以及创建高价值的真菌菌株，以促进产量，生物功能和社会经济价值代谢物的增值。已经努力讨论真菌底盘的现有局限性以及合成生物学的进步如何提供合理的解决方案。
真菌和细菌的隔离和表征能够在含汽油和柴油燃料的培养基上生长
摘要：石油产品是重要的环境污染物。这项研究旨在分离能够在含汽油和柴油燃料的培养基上生长的微生物。微生物。细菌分离株进行了表征和测试，含有10％至100％汽油和柴油燃料的浓度，以及50/50％和25/25/50％的组合（汽油/柴油/柴油/Mueller Hinton Broth）。结果表明，微生物分离株属于假单胞菌，芽孢杆菌，葡萄球菌，微球菌，黄酮细菌，静脉细菌，青霉菌，汉斯福德菌和替代性。假单胞菌属。和芽孢杆菌属。表明，两种产品的浓度都具有80％的浓度。但是，在该浓度和两种混合物上都没有发现生长。在整个研究中，已经表明，使用选择性筛选方法来对污染物生长的微生物可以带来生物修复的重要优势。
共生细菌和真菌在滞育中增殖，并可能在孤独的蜜蜂中增强冬季的生存
宿主 - 微生物相互作用是包括蜜蜂在内的许多宏观生物的发展和适应性的基础。尽管许多社会蜜蜂受益于垂直传播的肠道细菌，但当前的数据表明，孤立的蜜蜂构成了蜜蜂中绝大多数物种多样性，但缺乏高度专业的肠道微生物组。在这里，我们研究了整个野生蜜蜂bonthophora bomboides Standfordiana的整个生命周期中细菌和真菌的成分和丰度。与期望相反，未成熟的蜜蜂阶段保持了一个独特的核心微生物组，该核心体由静脉细菌属（链霉菌，诺卡氏菌）和真菌Moniliella spathulata组成。休眠（尿布）幼虫蜜蜂占据了最丰富，最独特的细菌和真菌，分别达到其初始拷贝数的33和52倍。我们测试了关于尿布蜜蜂的微生物功能的两个自适应假设。首先，使用孤立的细菌和真菌，我们发现来自育雏细胞的链霉菌抑制了多种致病性丝状真菌的生长，这表明当蜜蜂面对高病原体压力时，在越冬期间在病原体保护中起作用。第二，糖酒精成分随着真菌丰度的重大变化而变化，这表明与蜜蜂冷耐受性或越冬的生物学有联系。我们发现，炸弹抗体有一个保守的核心微生物组，可以通过幼虫的发育和滞育提供关键的适应性优势，这提出了一个问题，即如何维持和忠实地传播这种微生物组。我们的结果表明，关注成熟或活跃的昆虫发育阶段的微生物组可能会忽略宿主休眠期间特定阶段的共生体和微生物适应性的贡献。
岩石栖息菌 Knufia petricola 的基因工程为极端耐受性黑真菌的生物学提供了见解
黑色微菌落真菌（来自 Arthonio-、Dothideo- 和 Eurotiomycetes 的子囊菌）是自然和人为极端栖息地中耐压力和持久的栖息者。它们表现出缓慢的酵母样或分生生长，不形成专门的生殖结构，并在多层细胞壁中积累黑色素 1,8-二羟基萘 (DHN) 黑色素。要了解黑色真菌如何生活、存活、在矿物基质上定殖以及与光养菌相互作用，需要使用遗传方法来测试这些功能和相互作用。我们选择了 Chaetothyriales 的岩石栖息菌 Knufia petricola 作为开发遗传操作方法的模型。在这里，我们报告了通过更高效的多重 CRISPR/Cas9 扩展遗传工具包的情况，使用基于质粒的系统表达 Cas9 和多个 sgRNA，并实施三个抗性选择标记 genR（遗传霉素/ nptII）、baR（草铵膦/ bar）和 suR（氯嘧磺隆/ sur）。通过替换色素合成必需基因有针对性地整合表达构建体，可以对转化体进行额外的颜色筛选。由于消除了 pks1（黑色素），黑粉色筛选被用于启动子研究，使用 GFP 荧光作为报告基因。由于同时消除了 pks1 和 phs1（类胡萝卜素），黑白筛选可以识别包含两个表达构建体的转化体，以进行共定位或双分子荧光互补 (BiFC) 研究。证实了两种 K. petricola White Collar 直系同源物的共定位和相互作用。确定了两个基因间区域 ( igr1 、 igr2 )，其中可以插入表达构建体而不会引起明显的表型。使用 pNXR-XXX 系列质粒和新的兼容入门质粒可以快速轻松地生成表达构建体，适合在其他真菌中广泛实施。这种遗传工具的多样性为黑真菌基因组编码的基因/蛋白质的表达、功能和调控的机制和非常详细的研究开辟了一个全新的视角。
昆虫病毒线虫和真菌对spodoptera frugiperda（J. E. Smith）幼虫的死亡率和发展的影响
进行了本研究，以评估昆虫致病性线虫，Steinernema Carpocapsae Weiser和三种昆虫病变真菌（Metarhizium arisopliae（Metschn。）（Metschn。）Sorokin，Trichoderma Harzianum Rifai和T. Viride Pers。）针对Spodoptera Frugiperda的第二和第四幼虫龄（J. E. Smith）。结果表明，CarpoCapeAe在接种后4天（DPI）使用叶片浸入法（DPI）的LC 50值分别为52.03和4.11感染力少年（IJS）ML -1，在接种后4天，在接种后使用叶片浸出方法，使脆性链球菌的第二和第四个幼虫龄出现了明显的死亡率。另一方面，三种测试的昆虫病作用真菌对弗鲁吉帕尔达链球菌的幼虫龄产生了较强的毒性。真菌T。arzianum在第二个幼虫龄（LC 50 = 1.1×10 7孢子ML -1）和M. Anisopliae上显示出最高的杀虫活性，在10 dpi后，在第四个幼虫龄（LC 50 = 1.5×10 7个孢子ML -1）上表现出最高的杀虫活性。我们的结果表明，在250 IJS ML -1的幼虫中完全抑制了帕克环链球菌和成年幼虫的成年出现。昆虫致病性线虫和真菌对S. frugiperda幼虫龄的致命作用表明，这些生物控制剂在这种侵入性昆虫的综合害虫管理程序中可能是有用的候选者。
基于特征的分子网络在比较代谢组学和藻生真菌立体异构体的靶向分离中的应用
摘要：海藻内生真菌是生物活性天然产物的优秀生产者。我们之前已从褐藻 Fucus vesiculosus 的叶状体中分离出两株内生真菌，Pyrenochaetopsis sp. FVE-001 和 FVE-087。初步化学研究产生了四种具有抗黑素瘤活性的新型十氢化萘酰螺四酸衍生物，即来自 Pyrenochaetopsis sp. 菌株 FVE-001 的 pyrenosetins A–C ( 1 – 3 ) 和来自菌株 FVE-087 的 pyrenosetin D ( 4 )。在本研究中，我们对这两株 Pyrenochaetopsis 菌株进行了比较代谢组学研究，采用基于 HRMS/MS 的特征分子网络 (FB MN)。在 Pyrenochaetopsis sp. FVE-087 中观察到了更高的十氢化萘衍生物生产化学能力。值得注意的是，尽管几种十氢化萘与之前分离的核糖脲具有相同的质谱数据和MS/MS碎片模式，但它们的保留时间却不同，这表明它们可能是后者的立体异构体。基于FB MN的靶向分离研究结合对菌株FVE-087的抗黑素瘤活性测试，得到了两个新的立体异构体，核糖脲E(5)和F(6)。在化合物5和6的结构解析中采用了广泛的核磁共振波谱，包括DFT计算研究、HR-ESIMS和Mosher酯法。确定的化合物6的3′R,5′R立体化学与之前报道的核糖脲C(3)相同，在本研究中将其立体化学修改为3′S,5′R。 Pyrenosetin E ( 5 ) 抑制人类恶性黑色素瘤细胞 (A-375) 的生长，IC 50 值为 40.9 µ M，而 6 则无活性。这项研究指出了两种密切相关的真菌菌株化学成分的显著差异以及 FB MN 在立体异构体的鉴定和靶向分离方面的多功能性。它还证实了鲜为人知的真菌属 Pyrenochaetopsis 是复杂的十氢化蓖麻油酰螺四酸衍生物的丰富来源。
Rangelands的真菌促进：Arbuscular mycorrhizal Fungi是否介导了Sagebrush草原中的韧性和抵抗力？
弧形菌根真菌（AMF）可能会对牧场的生态系统弹性和入侵分析产生深远的影响。通过生态反馈机制维护植物群落结构，例如促进营养循环和寄主植物吸收，物理和化学对土壤结构稳定性的贡献，植物竞争的介导表明，AMF可能是压力大干旱环境中的重要促进者。植物-AMF相互作用可能会通过提高本地植物群落社区对干旱，放牧以及对异国植物入侵的抵抗力而影响继承。然而，侵入性的外来植物可能会从与本地AMF社区的关联以及Alter的关联中受益。此外，问题仍然存在于AMF在压力环境中的作用，特别是鼠尾草的菌根依赖性（Artemisia spp。）草原植物。在这里，我们审查了与牧场中与AMF相关的科学文献，特别关注土地管理，干扰和入侵对Sagebrush Steppe中AMF社区的影响。我们强调了与牧场有关的AMF生态学的含义，并讨论了用于测量菌根反应的方法。我们的审查发现了令人信服的证据表明，AMF对干扰和对入侵的抵抗力的适应能力随植物和真菌群落组成而有所不同，包括植物菌根的宿主状况，植物功能行为以及生理适应植物和真菌的干扰。我们通过概述了一个框架来提高对牧场入侵生态的AMF知识的框架。了解AMF在半干旱的Sagebrush草原生态系统中的作用可能需要多种研究方法，因为植物AMF相互作用的高度可变性质，弹性会议的复杂机制以及未知的阈值 - 对环境压力的响应。这可能需要从植物生物量范式中转移到评估菌根的好处，以便在Sagebrush Steppe和其他半干旱生态系统中获得对植物对AMF或缺乏植物的依赖性的更全面看法。©2019范围管理协会。由Elsevier Inc.发布的所有权利保留。
对甲基甲基蛋白抗甲氧西林和甲氧西林敏感的金黄色葡萄球菌ST398菌株的基因组分析
摘要：多氯联苯（PCB）引起重大健康和生态障碍，是持续的有机污染物，但仍在世界各地恢复。微生物PCB生物转化是一种用于污染的有前途的技术，但所涉及的分子机制仍然被误解。木质氨基利因酶被怀疑参与许多PCB转化，但它们的评估仍然很少。为了进一步清单微生物通过其木氨基利性酶转化PCB的能力，我们研究了氧化酶和过氧化物酶在从历史悠久的PCB污染位点分离的一组微生物中的作用。Among 29 isolated fungi and 17 bacteria, this work reports for the first time the PCB-transforming capabilities from fungi affiliated to Didymella , Dothiora , Ilyonectria , Naganishia , Rhodoturula , Solicoccozyma , Thelebolus and Truncatella genera and bacteria affiliated to Peribacillus frigotolerans ,壁画peribacillus，macillus mycoides，蜡状芽孢杆菌，丰尼芽孢杆菌，伪刺杆菌，假单胞菌冠状动脉法，埃尔维尼亚蚜虫和se肉杆菌静脉。以相同的方式，这是对Dothiora maculans Specie和cladosporium属的真菌分离株的第一份报告，分别显示了氧化酶（推定的漆酶）和过氧化物酶活性，在PCBS的存在下（分别超过4倍和20圈），可增强。基于这些结果，怀疑观察到的活动参与PCB转换。
英国SMI ID 01：初步鉴定医学重要细菌和培养的真菌
4.1分类/特征在分类微生物时，考虑所有已知特征；但是，为了识别而选择并使用了某些差异和可区分特征。主要识别通常涉及一个或多个特征。这些可能是表型特征，例如形态和染色模式（例如，革兰氏染色反应，乳苯酚棉蓝色），在各种大气条件和温度下的生长，各种类型的培养基的生长（例如MacConkey琼脂，Sabouraud琼脂板培养物），Catalase和氧化酶测试或氧化酶测试或氧化酶测试或氧化酶特征。使用这几个简单的测试通常可以将有机体放置在医学重要性的主要群体之一中（2,3）。