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AML
Venetoclax Bcl2抑制剂与降压药结合使用，代表了老年AML患者的诱导疗法的基石，不适合强化化学疗法。与其他有针对性的疗法一样，基于Venetoclax的疗法具有先天和获得的抗药性。虽然已经确定了几种抗性机制，但对患者人群的抗药性机制的异质性却很少。在这里，我们利用了AML患者的转录组和EX-VIVO药物反应数据的综合分析来鉴定四个具有不同表型，遗传和药物反应模式的转录不同的抗VEN抗性簇（VR_C1-4）。vr_c1的特征是分化单核细胞和类似CDC的爆炸，PI3K-AKT-MTOR信号轴的转录激活以及能量代谢途径的特征。他们对MTOR和CDK抑制作用表现出敏感性。vr_c2富含NRAS突变，并与HOX表达的独特转录抑制有关。vr_c3的特征是富集TP53突变和细胞毒性T细胞浸润较高。该簇显示了红细胞标记的转录表达，表明肿瘤细胞模仿了红细胞分化，JAK-STAT信号的激活以及对JAK抑制的敏感性，在与Venetoclax协同的一部分中。vr_c4与维内诺克斯敏感的患者共享转录相似性，干扰素信号的过度表达适度。它们也以较高的DNMT3A突变发生率。最后，我们将Venetoclax抗性状态预测到来自一个患者的单个细胞上，该患者在Venetoclax治疗下复发，在肿瘤中捕获多种抗性状态，并在Venetoclax选择下的丰度转移，这表明单个肿瘤可能由模仿多个VR_C组成的细胞组成，这些细胞由多种VR_C组成，这些细胞促成了内聚糖元素的内聚糖元素。综上所述，我们的结果提供了一种评估Venetoclax耐药机制的肿瘤内和肿瘤内异质性的策略，并提供了有关导航BCL2抑制剂治疗失败患者进一步管理的方法的见解。
Paula Tamagnini教授蓝绿色的可持续性
摘要：制药和化学工业提供社会大部分日常使用的材料，但是它们是主要污染者，对碳排放量产生了重大贡献，并且产生了比产品多5-100倍。在这种情况下，生物催化成为一种有前途的方法，可以发展出蓝细菌作为当前使用的异养费用的替代底盘的绿色，更可持续和更便宜的化学制造。旨在表达与工业相关的异源酶，例如氢化酶和单加氧化酶[1]，产生了几种具有流线性光合电子流量的综合囊体突变体。我们的目标包括编码推定竞争电子水槽的基因，例如：双向氢化酶HOX，Flavodiiron蛋白FLV1/3，NDH-1复合物的NDHD2亚基，Cox终端氧化酶和天然CYP120A1。当前，这些底盘的有效性，从电子流向氧化还原酶方面，正在通过P450传感器蛋白（CYP1A1）通过乙氧基resorufin-O-二甲基酶（EROD）测定进行评估。初步结果表明，与野生型相比，突变体的CYP1A1活性更高。并行，生成并测试了合成装置的合成装置，并生成了合成装置，并生成了并测试并测试了合成装置，并具有合成装置，并测试了。 与野生型相比，该装置在综合囊体突变体中缺乏生产的生产中缺乏天然兼容溶质葡萄糖基甘油（δGGP）增强了3％NaCl的生长[2,3]。 参考文献1。 Mascia等。 Ferreira等。 （2018）Synt。。与野生型相比，该装置在综合囊体突变体中缺乏生产的生产中缺乏天然兼容溶质葡萄糖基甘油（δGGP）增强了3％NaCl的生长[2,3]。参考文献1。Mascia等。Ferreira等。（2018）Synt。通过将AHBET装置引入EPS生产中的突变体中，评估了推定碳竞争途径的损害，即细胞外聚合物（EPS）对甘氨酸甜菜碱的产生的影响。Δkpsm_AHBET突变体比δGGPS_AHBET产生的甘氨酸蛋白甜味蛋白多2倍，并增加了前体甘氨酸的可用性，从而产生了更高的甘氨酸菜碱的产生。然而，作为δGGPS_AHBET，δkpsm_AHBET突变体在3％NaCl以下的生长没有增加。因此，针对海水中的大规模培养，例如AHBET被引入染色体中性位点[4]。（2022）绿色化学，doi.org/10.1039/d1gc04714k 2。biol。，doi.org/10.1093/synbio/ysy014 3。Ferreira等。（2022）正面。Bioeng。Biotechnol。，doi.org/10.3389/fbioe.2021.821075 4。Pinto等。（2015）DNA res。，doi.org/ 10.1093/dnares/dsv024
识别和工程黄素依赖性卤素酶用于选择性生物催化的Jared C. Lewis*印第安纳大学化学系，Blo
识别和工程黄素依赖性卤化酶用于选择性生物催化分析Jared C. Lewis*印第安纳大学化学系，印第安纳州布卢明顿，印第安纳州布卢明顿47405，美国焦点有机组织化合物被广泛用作基本块，中间体，药品，药物和农业属性的构成区块，以及其独特的化学性质。但是，安装卤素取代基经常需要功能化的起始材料和多步函数组互换。几类在自然界中进化的卤代酶可以实现不同类别的底物的卤素化；例如，富含电子芳香族化合物的位点选择性卤化是通过黄素依赖性卤代酶（FDHS）催化的。的机理研究表明，这些酶使用黄素还原酶（FRED）提供的FADH 2将O 2降低至与X-偶有氧化为HOX的水（X = Cl，BR，I）。该物种穿过酶内的隧道，进入FDH活性位点。在这里，据信它可以与活跃的位点赖氨酸近端与结合的底物结合，从而实现了通过分子识别赋予的选择性的亲电卤代化，而不是指导基团或强电子激活。FDH的独特选择性导致了几项早期的生物催化努力，制备卤素化很少见，而Hallmark催化剂控制的FDHS的选择性并未转化为非本地底物。FDH工程仅限于站点定向的诱变，从而导致位点选择性或底物偏好的适度变化。这些结果突出了FDH活动位点耐受不同底物拓扑的能力。为了解决这些局限性，我们优化了FDH REBH及其同源Fred Rebf的表达条件。然后，我们表明REBH可用于具有催化剂控制的选择性的非本地底物的卤化。我们报道了第一个示例，其中通过有向进化提高了FDH的稳定性，底物范围和位点选择性为合成有用的水平。X射线晶体结构的进化FDH和归还突变表明，整个REBH结构中的随机突变对于在不同的芳族底物上实现高水平的活性和选择性至关重要，并且这些数据与分子动力学模拟结合使用，以开发FDH选择性的预测模型。最后，我们使用全家基因组挖掘来鉴定一组具有新颖的底物范围和互补区域选择性的FDH集，对大型三维复杂化合物。我们进化和开采的FDH的多样性使我们能够在简单的芳族卤化之外追求合成应用。例如，我们确定FDHS催化涉及脱离对称性，肿瘤性卤素化和卤代基合理的对映选择性反应。我们最近对单个组件FDH/FRED AETF的研究进一步扩展了该实用程序。最初被AETF吸引到AETF时，因为它不需要单独的FRED，我们发现它会卤代卤代，这些基质不会有效地或其他FDHS有效地或根本没有卤化，并且为仅在繁殖后使用REBH变体而实现的反应提供了高的对映选择性。也许最值得注意的是，AETF催化位点选择性芳香族碘化和对映选择性碘醚化。一起，这些研究强调了FDH的起源
Anne Ferguson-Smith和Kateryna Makova加入基因组研究编辑团队，纽约州冷春港 - 2020年10月27日，Cold Spring Harbor Laborat
安妮·弗格森·史密斯（Anne Ferguson-Smith）和卡特里纳·马克瓦（Kateryna Makova）加入了基因组研究编辑小组，纽约州冷春港 - 2020年10月27日，冷泉港实验室出版社（Cold Spring Harbour Laboratory Press）很高兴地宣布任命两名领先的学家，DRS。安妮·弗格森·史密斯（Anne Ferguson-Smith）和卡特里纳·马科娃（Kateryna Makova），是一群主要的基因组学期刊的学术编辑，基因组研究。安妮·弗格森·史密斯（Anne Ferguson-Smith）研究了表观遗传遗传，重点是基因组印记和基因组功能的表观遗传控制超过25年。这项工作有助于理解发展和生理过程，包括神经发生和代谢，以及指导动态和可遗传表观遗传状态的机械主义。弗格森·史密斯（Ferguson-Smith）博士在格拉斯哥大学（University of Glasgow）学习了分子生物学，然后加入了弗兰克·鲁德（Frank Ruddle）的实验室博士学位。耶鲁大学的研究，克隆和表征哺乳动物HOX簇，以了解基因组或功能。她现在是剑桥大学的亚瑟·巴尔福遗传学教授，也是遗传学的负责人。她于2006年当选EMBO，2012年在英国医学科学院，并于2017年担任皇家学会院士。“我真的很高兴加入Genome Research的编辑团队，这是一本期刊，这是我们遗传学和基因组学社区不可或缺的一部分。多年来，它一直是我们学科中最具创新性和原创作品的家，我期待着它继续取得成功，”弗格森·史密斯（Ferguson-Smith）博士说。“博士的工作。我们期望跑步 -乌克兰人Kateryna Makova获得了博士学位。德克萨斯理工大学的学位在那里研究了切尔诺贝利核电站事故的遗传后果。然后，她在芝加哥大学完成了博士后研究，在那里她研究了男性和女性之间的突变率差异。现在，Verne M. Willaman生命科学主席和宾夕法尼亚州立大学生物学系教授，她的实验室从事进化和医学基因组学研究。她目前的利益包括性染色体的发展，突变率，线粒体突变，进化中的微卫星变化以及儿童的服从。Makova博士实验室的研究是高度跨学科和合作，包括统计，计算机科学和生物化学方面的专家。她目前在宾夕法尼亚州立大学指导医学基因组学中心，并在美国国立卫生研究院国家医学图书馆的科学委员会任职。Makova博士说：“自2004年以来，我一直在基因组研究中发表，我很高兴能加入其编辑团队。我希望带来更多的进化专业知识，并加强期刊的学科观点。”“我很高兴弗格森·史密斯（Ferguson-Smith）和马科娃（Makova）博士加入了基因组研究社论团队，”冷泉港实验室出版社执行主任约翰·英格里斯（John Inglis）博士说。Aravinda Chakravarti，Richard Gibbs，Eric Green，Richard Myers，Evan Eichler和Bill Pavan作为该期刊的现任学术编辑，对其成功及其在批判性判断，公平和完整性方面的声誉至关重要。将这两个杰出的科学家加入该小组是继续实现这些目标的重要一步。”执行编辑希拉里·苏斯曼（Hillary Sussman Ph.D.助理编辑詹妮弗·德莱昂（Jennifer DeLeon）博士组成了内部社论团队，并补充说：“随着日记本纪念日的25周年，我们承认基因组学已经发生了大大变化，变得更加复杂，变得更加复杂和生物学，并将其传播到其他领域。
C-JUN的磷酸化状态和DNA结合活性取决于结合位点的细胞内浓度 第8卷31980核酸研究 受体结合的尿激酶与I型纤溶酶原激活剂抑制剂的可及性 胰岛素调节有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶（MEK），有丝分裂原激活的蛋白激酶和酪蛋白激酶在细胞核中：Possibl gi-protein A大鼠大脑皮层中的亚基 协调人造血细胞中HOX基因的调节 在体内抑制tonb盒的tonb盒共识pentapeptide 中的甲基定向修复框架突变 CALF的DNA依赖性RNA聚合酶的合成...
基因选择性转录因子通过与其靶基因调节区域内的特定DNA元件结合（1）。但是，并非完全定义此DNA结合的序列要求。几个参数，例如蛋白质 - 蛋白质相互作用与相邻结合的因素，DNA结构的影响（弯曲等）。），重要的是，结合位点与认知因子的比率确定给定转录因子是否可以有效地与相应的结合位点相互作用。体外和大概也在体内也是如此，对于确定转录因子是否会与其最佳识别序列的变体结合，因此，它的基因调节。在这些考虑因素中提示，我们询问是否存在一种蜂窝机制，该机制是否存在在转录因子活动和可用目标位点的繁琐之间保持平衡。对AP-1家族成员的特征良好转录因子C-Jun进行了实验（2-4）。包含AP-1结合位点的启动子是C-Jun调节的目标。C-Jun的活性受到多种机制的紧密控制，并且对蛋白质的异常调节会导致恶性转化和致癌作用（5）。在这项研究中，我们描述了一种机制，该机制通过改变其磷酸化态的DNA结合活性，取决于细胞中存在的C-Jun结合位点的浓度。这种机制可以用来设置和微调C-Jun与其结合位点的比率。有趣的是，与这种现象有关的磷酸化位点与以前据报道经历信号依赖性去磷酸化相同。