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braker3：使用RNA的完全自动基因组注释...
基因预测长期以来一直是生物信息学研究的活跃领域。仍然，大核基因组中的基因预测提出了一个挑战，必须通过新算法来解决。转录组和蛋白质组可获得的词的数量和意义在基因组，基因甚至单个基因之间都不同。需要应对此类数据异质性的用户友好，准确的注释管道。先前的注释管道Braker1和Braker2分别使用RNA-Seq或蛋白质数据，但并非两者都使用。最近发布的Genemark-ETP进行了进一步的显着改进，整合了所有三种数据类型。我们在这里提出了基于Genemark-Etp和Augustus的Braker3管道，并使用Tsebra Combiner进一步提高了准确性。braker3使用短阅读RNA-Seq和大蛋白数据库的真核基因组中的蛋白质编码基因，以及针对靶标的迭代和专门学习的统计模型。，我们在目标物种蛋白质组与可用蛋白质组的相关性水平下基于11种基因组的新管道。Braker3优于Braker1和Braker2。平均成绩单级别的F1得分平均增加约20个百分点，而对于具有较大和复杂基因组的物种，差异最为明显。Braker3还胜过其他现有工具，Maker2，FunAntotate和Finder。Braker3的代码可在GitHub上获得，作为一个现成的Docker容器，可用于使用Docker或Singularity执行。总体而言，Braker3是真核基因组注释的准确，易于使用的工具。
大脑行为疗法的未来
被认为不再需要为耐火患者保留。实际上，正如Chey及其同事指出的那样，“综合护理正在成为IBS的规则，而不是IBS的例外。” 8我们怀疑许多其他DGBI会效仿，并且在专业医疗中心已经建立了综合护理。但是，大脑行为疗法不是单一形式，而是包括各种技术。最近，关于DGBI的有关大脑工作团队的报告，关于不同大脑行为治疗的摘要和建议。9工作团队报告的重点是就哪种大脑行为疗法及其机械框架/目标以及将其纳入DGBI护理的建议提供共识。大脑 - 肠道行为疗法包括具有不同所谓靶标的方法。在罗马报告的基础上，我们的概念综述着重于目标参与 - 即（即机制），以及（即主持人）脑部 - 脑饮用行为疗法（如证据所假设和/或支持）。值得注意的是，我们在这篇评论中分享的观点和总体前提是，脑部 - 脑核行为疗法的活跃成分（即，技术）涉及DGBI特异性目标，旨在减少经过DGBI处理的中心症状（例如，减少腹部疼痛，减少腹部疼痛，减少的疗法，减少了Remurgitations）。我们详细描述了假设的目标，即提议干预/适合这些目标的介入，可用来实现所提出的目标的作用，并以未来的研究方向结束。
通过脑电图管理中风后抑郁症（PSD）以实现有效康复
卒中后抑郁症 (PSD) 对卒中患者的日常生活产生负面影响并延缓他们的神经系统康复。然而，传统的卒中后康复主要侧重于运动功能恢复，而很少关注情感功能障碍。有效的 PSD 管理，包括诊断、干预和随访，对于卒中后康复至关重要。作为神经系统的客观测量，脑电图 (EEG) 已被用于 PSD 的诊断和评估。在本文中，我们回顾了与 EEG 治疗 PSD 的临床应用最相关的文献，并提供了一个有助于在实践中选择合适方法的横断面。本研究旨在收集基于 EEG 的 PSD 诊断实证证据，回顾管理 PSD 的干预措施，并分析评估方法。总共从文献中选取了 33 项与 PSD 和抑郁症相关的诊断研究和 19 项干预研究。研究发现，基于频带和非线性动态方法分析的EEG特征能够量化皮质水平的异常神经反应，以用于PSD诊断和干预评估/预测。同时，基于EEG的机器学习也被应用于抑郁症的诊断和评估，以自动化和加速该过程，并且结果令人欣喜。虽然脑机接口（BCI）干预已经广泛应用于中风后运动康复和认知训练，但BCI情绪训练尚未直接用于PSD。这篇综述表明需要了解PSD的皮质反应以改进其诊断和精准治疗。它还表明未来的中风后康复计划应包括运动、情感和认知功能的训练课程，并密切监测它们的改善情况。
拟除虫菊酯和发育神经毒性 - 对流行病学研究和支持机械证据的批判性综述
背景：拟除虫菊酯代谢物在包括孕妇和儿童在内的一般人群中广泛检测到尿液中。拟除虫菊酯是神经毒性的，建议的内分泌破坏者。易受伤害的发育时间窗口的暴露可能会对神经发育产生长期影响。目的：评估与产前和儿童期拟除虫菊酯暴露有关的神经发育作用的流行病学证据，并在系统的综述中评估生物学的合理性，以评估机械态证据。方法：我们搜索了截至2021年9月1日，我们搜索了PubMed和Web of Science，其中包括用英语发表的原始研究，其中研究了或估计怀孕期间或儿童期间的拟除虫菊酯暴露，并研究了儿童与神经发育结果的关联。导航指南系统审查方法用于评估流行病学证据。对于机械证据，我们专注于使用经合组织支持的AOP-Wiki平台在不良结果途径（AOP）中建议的相关关键事件（KES）。在Toxcast数据库中执行了将KE与拟除虫菊酯与包括26个个体化合物在内的系统搜索。结果：25个流行病学研究符合纳入标准，17个关于产前暴露的发现，10个关于儿童暴露的发现，两个在两个暴露窗口中都有2个。总体证据体被评为“中等质量”，并具有“足够的证据”，以证明产前拟除虫菊酯暴露和不良神经发育之间的关联。EV IDENCE在干扰甲状腺激素（Th）功能方面最强。在儿童期暴露中，由于横断面研究设计，总体评级为“低质量”，“有限的证据”。关于机械证据，我们发现拟除虫菊酯能够干扰已建立的不良神经发育的AOP中包含的神经发育KE。结论：拟除虫菊酯可能是人类发育性神经毒性，而拟除虫菊酯暴露对神经发育的不利影响可能是普通人群发生的暴露水平。有必要采取预防措施，以减少孕妇和儿童的暴露。
糖价值链的可持续性
农业工业中的价值链方法提供了一种有条不紊的方法来增强农民市场的联系[19]。框架有助于识别至关重要的局限性和探索合适的补救措施。成功解决这些局限性和补救措施涉及该过程中各个实体的同步努力，进而需要一个偶然的基础和读书来共同努力[20]。价值链方法允许对农民与贸易商之间的联系，权力动力以及优势分配有全面的了解[21]。也有人认为，价值链分析对于理解市场，它们的互连，各种利益相关者的参与以及涉及农业生产的扩大以及Conse -Conse -Conse -Consey的重要限制至关重要。目前，这些农民仅收到其全部农产品的一小部分。全球制糖行业是一种“推链”系统，其中甘蔗通过链条生成生糖[5]。然后将这种原糖作为批量商品出售，而产品和市场价值没有太大变化。典型的糖价值链包括以下部门：种植，收割，甘蔗运输，铣削，糖的运输以及储存/运输/营销。近几十年来，学者和从业人员主要关注不同行业（包括制糖行业）的价值链的可持续性[2，6，7]。他们因此，已经审议了对价值链的一系列担忧。例如，Koilo调查了海上行业，并建议解决该行业可持续性的数字双胞胎的解决方案[23]。希金斯和拉雷多（Laredo）对澳大利亚制糖业进行了一项研究[2]。
ruo2中的多频道传输
对RUO 2的基础研究始于60年前，当时它被确定为高度金属的氧化物[1-3]。 其化学稳定性和直接合成意味着它迅速发现应用是精度电阻的组成部分，并且早期也被鉴定为用于半导体设备的潜在屏障材料[4]。 在过去的二十年中，它已经看到了作为催化剂的兴趣[5]，以及可能的应用作为锂储存材料[6]。 在过去的几年中，实验和理论工作表明，即使是如此简单且众所周知的材料也可以容纳物质的外来状态。 ruo 2已成为一种候选材料，该材料托有altermagnetism，在该状态下，由于磁性和晶体lattices的不同符号，共线抗磁性排序也破坏了时间逆转对称性[7]。 但是，该系统中的磁有序并未得到很大的观察。 单晶体上的中子散射测量值检测到通常在金红石结构中禁止的磁反射，该反射在金红石结构中被禁止，该磁反射约为1000k [8]。 谐振X射线散射[9]随后在晶体和薄膜上都进行了类似的观察。 此后，依赖于时间逆向对称性破坏的异常特性在RUO 2的薄膜中观察到，包括自旋转运[10，11]，磁性菌群二科运动[12]和异常的霍尔效应（AHE）[13]。 自旋分辨光发射[14]还发现了al术状态预期的D-波对称性。 最近的争议在参考文献中得到了很好的总结。对RUO 2的基础研究始于60年前，当时它被确定为高度金属的氧化物[1-3]。其化学稳定性和直接合成意味着它迅速发现应用是精度电阻的组成部分，并且早期也被鉴定为用于半导体设备的潜在屏障材料[4]。在过去的二十年中，它已经看到了作为催化剂的兴趣[5]，以及可能的应用作为锂储存材料[6]。实验和理论工作表明，即使是如此简单且众所周知的材料也可以容纳物质的外来状态。ruo 2已成为一种候选材料，该材料托有altermagnetism，在该状态下，由于磁性和晶体lattices的不同符号，共线抗磁性排序也破坏了时间逆转对称性[7]。但是，该系统中的磁有序并未得到很大的观察。单晶体上的中子散射测量值检测到通常在金红石结构中禁止的磁反射，该反射在金红石结构中被禁止，该磁反射约为1000k [8]。谐振X射线散射[9]随后在晶体和薄膜上都进行了类似的观察。依赖于时间逆向对称性破坏的异常特性在RUO 2的薄膜中观察到，包括自旋转运[10，11]，磁性菌群二科运动[12]和异常的霍尔效应（AHE）[13]。自旋分辨光发射[14]还发现了al术状态预期的D-波对称性。最近的争议在参考文献中得到了很好的总结。似乎有大量的Altermagnetic效应观察到有关磁性的某些原始观察结果，尤其是在散装晶体中的问题[15，16]。muon光谱法通常对局部力矩非常敏感，在散装RUO 2中没有磁性[17]。16的计算提出了一个假设，即仅在化学计量材料被孔掺杂时才出现RUO 2中的Altermagnitism。非常清楚，尽管众所周知，但在应用磁场中，RUO 2的散装特性的研究相对较少。在本文中，我们介绍了