XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemKMT2D
KMT2D 缺乏会促进易受核糖体生物合成抑制的髓系白血病
KMT2C 和 KMT2D 是人类癌症中最常见的突变表观遗传基因。虽然 KMT2C 被确定为急性髓系白血病 (AML) 中的肿瘤抑制因子，但 KMT2D 在这种疾病中的作用仍不清楚，尽管它的缺失会促进 B 细胞淋巴瘤和各种实体癌。据报道，KMT2D 在 AML 中下调或突变，并且通过 shRNA 敲低或 CRISPR/Cas9 编辑导致其缺陷会加速小鼠的白血病形成。造血干细胞和祖细胞以及 Kmt2d 缺失的 AML 细胞的核糖体生物合成显著增强，并且核仁持续增大，rRNA 和蛋白质合成率增加。从机制上讲，发现 KMT2D 缺陷会导致小鼠和人类 AML 细胞中 mTOR 通路的激活。 Kmt2d 直接调节 Ddit4 的表达，Ddit4 是 mTOR 通路的负调节因子。与核糖体生物合成异常一致，研究表明，RNA 聚合酶 I 抑制剂 CX-5461 可显著抑制体内 Kmt2d 缺失的 AML 生长，并延长白血病小鼠的生存期。这些研究证实 KMT2D 是 AML 中事实上的肿瘤抑制因子，并揭示了对核糖体生物合成抑制前所未有的脆弱性。
绘制 KMT2D 肿瘤抑制基因的计算机遗传网络图，以揭示新的功能关联和癌细胞脆弱性
1 加拿大不列颠哥伦比亚大学基因组科学与技术研究生项目 2 加拿大不列颠哥伦比亚大学迈克尔史密斯实验室 3 加拿大迈克尔史密斯基因组科学中心 加拿大不列颠哥伦比亚癌症研究所 4 加拿大哈利法克斯达尔豪斯大学医学系 5 加拿大不列颠哥伦比亚大学温哥华沿岸卫生研究所医学系呼吸医学分部空气污染暴露实验室 6 加拿大不列颠哥伦比亚省温哥华不列颠哥伦比亚癌症中心肿瘤医学系 7 加拿大不列颠哥伦比亚省温哥华不列颠哥伦比亚胰腺中心 8 加拿大不列颠哥伦比亚大学医学遗传学系
在前列腺癌中使用PARP抑制剂
结果：21例（75％）患者可检测到CtDNA突变。最常见的突变基因是Crebbb（54％，15/28），KMT2D（50％，14/28），STAT6（29％，8/28），Card11（18％，5/28）（18％，5/28），PCLO（14％，4/28），EP300（14％，4/28），11％，BCL2（11％，3/28） 3/28），突变频率> 10％。患有可检测的CTDNA突变的患者倾向于出现晚期Ann Arbor期（III-IV）（p = 0.009），高FLIPI风险（3-5）（p = 0.023）和严重的淋巴结受累（编号涉及区域≥5）（p = 0.02）。此外，我们发现，晚期Ann Arbor阶段，高危FLIPI，乳酸脱氢酶升高（LDH：0 - 248U/L）的患者中的平均VAF较高，晚期病理学级，骨髓受累（BMI）和淋巴结的参与。此外，KMT2D，EP300和STAT6突变与下PFS相关（P <0.05）。
Dragen TSO 500分析软件发行说明
由于测序区域的GC含量丰富而在低覆盖范围内。另一个示例区域是PMS2基因，该基因与伪基和读取可能无法正确对齐。通常，TSO 500面板旨在针对独特的区域，并且该软件在小型变体中说明了每个基因组位置的背景噪声。此设计旨在防止误报。分析性能的分析性能是评估整个面板的，而不是每个基因或外显子。但是，由于这些挑战，由于高背景噪声，产品清单中涵盖的某些区域被排除在分析之外。使用标志在VCF中识别所有排除的变体。此块列表包括以下基因：HLA-A，HLA-B，HLA-C，KMT2B，KMT2C，KMT2D，KMT2D，CHRY和VAF> 1％的位置发生在60个基线样本中的六个或更多。可以根据当地Illumina代表的要求获得排除站点的块列表。
Dragen TSO 500分析软件发行说明
•已知某些区域难以顺序。一个例子是TERT启动子区域。尽管可以在TERT启动子区域进行测序，但由于测序区域的GC含量富含GC，该位置可能会导致覆盖率较低。另一个示例区域是PMS2基因，该基因与伪基和读取可能无法正确对齐。通常，TSO 500面板旨在针对独特的区域，并且该软件在小型变体中说明了每个基因组位置的背景噪声。此设计旨在防止误报。分析性能的分析性能是评估整个面板的，而不是每个基因或外显子。但是，由于这些挑战，由于高背景噪声，产品清单中涵盖的某些区域被排除在分析之外。使用标志在VCF中识别所有排除的变体。此块列表包括以下基因：HLA-A，HLA-B，HLA-C，KMT2B，KMT2C，KMT2D，KMT2D，CHRY和VAF> 1％的位置发生在60个基线样本中的六个或更多。可以根据当地Illumina代表的要求获得排除站点的块列表。
利用表观基因组编辑治疗歌舞伎综合征
歌舞伎综合征 (KS) 是一种罕见的多发性畸形疾病，在大多数情况下，这种疾病是由 KMT2D 和 KDM6A 基因的新生突变引起的，这两个基因编码了参与基因调控的 MLL4 复合物的两个组成部分。缺乏 KS 的体外疾病模型，这对了解 MLL4 损伤导致疾病的机制以及确定靶向疗法构成了重大障碍。该项目旨在建立一种创新的 KS 治疗方法。我们将利用间充质干细胞的自我更新能力，结合新方法来修改它们的转录程序，以挽救受损的 MLL4 功能
Kabuki综合征的突触发展改变了
智力残疾影响了2-3％的普通人群，通常与神经发育障碍一致，并且经常是由突变损害突触功能的突变引起的。kabuki综合征是一种与发育延迟和智力障碍相关的罕见多系统疾病，是由KMT2D（1型）或KDM6A（类型2）中的突变引起的，该突变分别编码了染色质型甲基转移酶和脱甲基酶的染色质型化合物。然而，促成卡布基综合征智力残疾的机制仍然知之甚少。在这项研究中，我们使用Kabuki综合征1和2型的体外人类模型研究了神经元的突触发育，以及Kabuki综合征1型的体内小鼠模型。我们的发现表明，成熟的人IPSC衍生的神经元和具有致病突变的小鼠均表现出抑制性突触的发育增加。这种突触失衡导致神经网络中的兴奋性信息转移受损，这可能是在Kabuki综合征中观察到的认知缺陷的基础。
充血性心力衰竭是与SARS- 感染失去Kabuki综合征有关的心脏缺陷的表现
电子邮件：flavia.asilva@uol.com.br摘要简介：Kabuki综合征（SK）是一种罕见的多系统疾病，通常以“ Niikawa Pen”为特征：独特的面部特征，骨骼异常，皮肤病异常，生长不足，生长缺乏症，精神衰弱程度。但是，其他SK特征可能包括先天性心脏缺陷，胃肠道畸形，palatal裂，嘴唇和/或嘴唇以及多系统功能缺陷，例如：增加对自身免疫性感染，癫痫发作和内分泌学条件的敏感性增加（包括女性孤立的早产telarca）。（Salwa等人，2020）。 SK中有两种遗传模式：一种主要的常染色体形式，这再次是由KMT2D基因座突变引起的，基于临床经验，这是高度普遍的。当探针的母亲具有致病性kdm6a时，X连接的遗产。（Boniel等，2021）。目的：本文旨在报告一例充血性心力衰竭的案例，以表现出与一个8岁男孩SARS-COV2感染代偿相关的与Kabuki综合征有关的心脏缺陷。方法：这是一份案例研究报告，该报告是在感染时患有基本心脏病的患者。 SARS-CoV-2。该研究遵循了针对国家卫生委员会人类研究的决议提倡的建议。案例相关：这是非语言水的第一个孩子。在生命的第五周内被接受
乳腺癌细胞的检测和母乳衍生细胞的表征
放射学技术仍然是乳腺癌早期检测的主要方法，对于从癌症中获得有利的结果至关重要。但是，需要更敏感的检测方法来补充放射学技术，以增强早期检测和治疗策略。使用我们最近建立的培养方法，该方法允许传播腔原性的正常和癌性乳房上皮细胞，流式细胞仪表征和基因组测序，我们表明可以在母乳中检测到癌细胞。细胞从乳腺癌中衍生而来的乳腺癌富含CD49F+/EPCAM-，CD44+/CD24-和CD271+癌症干细胞（CSC）。这些CSC在HDAC6的细胞质保留结构域，MORF4L1中的停止/增益插入以及SWI/SNF复合物分量Smarcc2中的缺失突变。csc对HDAC6抑制剂，BET溴ab剂抑制剂和EZH2抑制剂敏感，因为已知SWI/SNF复合成分的突变会增加对这些药物的敏感性。来自其他10名未知患有乳腺癌的女性的母乳的细胞中，其中两个含有富含CSC表型的细胞，并在NF1或KMT2D中携带突变，这些突变经常在乳腺癌中突变。具有NF1突变的母乳源性细胞在CDKN2C，PTEN和REL基因中还带有拷贝数变化。此处描述的方法可以使快速癌细胞表征，包括妊娠/产后乳腺癌的驾驶员突变检测和治疗性筛查。