多药耐药细菌对公共卫生构成了重要的全球威胁,尤其是在严重的医院感染患者中。值得注意的是,由于它们与人类感染和抗生素耐药基因的转移,克雷伯氏菌和拉乌尔特省属引起了人们的关注。噬菌体疗法最近引起了人们的注意,作为治疗这些感染的一种新方法。但是,这种方法的效率依赖于具有广泛宿主范围的噬菌体。在这项研究中,使用肺炎克雷伯氏菌作为宿主,从河水样品中分离出具有较宽宿主范围的噬菌体K14-2。噬菌体的生物学特性的特征是评估其感染的多样性,杀死曲线,一步生长曲线以及跨不同pH水平和温度的稳定性。形态学分析表明,噬菌体非常类似于肌瘤病毒。宿主范围包括来自克雷伯氏菌,拉乌尔特氏菌和埃希里希氏菌的6种菌株。发现K14-2的基因组是双链DNA,包括175,759个碱基对,GC含量为41.8%。基因组注释揭示了280个蛋白质编码基因,其中96个分配了功能。与K14-2具有最高基因组相似性的噬菌体为vb_kpm-牛奶。基于主要衣壳蛋白建造的系统发育树发现噬菌体属于Straboviridae家族的Slopekvirus属。鉴于这些特征,新型噬菌体K14-2的发现具有广泛的宿主范围,具有增强噬菌体疗法在未来研究中的有效性的潜力。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。这是该版本的版权所有,该版本发布于2023年12月12日。 https://doi.org/10.1101/2023.12.12.12.571344 doi:Biorxiv Preprint
肺炎克雷伯氏菌是机会性病原体,可能导致奶牛乳腺炎。K.肺炎乳腺炎通常的治愈率较差,并且可能导致慢性感染的发展,这对健康和生产都有影响。但是,很少有研究旨在通过牛乳腺炎病例进行全基因组测序来充分表征肺炎。在这里,使用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和全基因组测序鉴定出与乳腺炎相关的肺炎分离株与乳腺炎相关的肺炎。此外,全基因组序列数据用于遗传分析,并且都与表型AMR测试并行,均与virulenceandantimicrobial耐药性(AMR)预测。四十二个分离株被鉴定为K.肺炎。进行全基因组测序,观察到31种多层次序列类型,这表明这些分离株的来源可能是环境的。分离株的关键毒力决定因素,编码了获得的铁载体,结肠癌和高胶体。其中大多数是缺乏的,除了YBST(编码Yersiniabactin)以六个分离株存在。在整个数据集中,对链霉素(26.2%)和四环素(19%)的表型AMR水平很明显,以及对头孢霉素(26.2%)和新霉素(21.4%)的中间易感性。的重要性是检测两个产生ESBL的分离株,这些分离株表现出对阿莫西林 - 克拉维酸,链霉素,四环素,头孢霉素,头孢菌素,头孢霉素和头孢菌素的抗性性。
42003,土耳其科尼亚,通讯作者电子邮件:mevatalay@gmail.com.tr摘要klebsiella物种会导致各种宿主的不同组织中发生感染。在牛健康方面,它是一种众所周知的机会性病原体,在乳腺炎的发病机理中发挥了作用。 实际上,这种细菌可以在牛农场环境中广泛传播,主要是通过乳制品设施和繁殖区域最终导致乳腺炎。 彻底表征生态学剂可以帮助理解机会性感染的发病机理。 在这项研究中,首先通过加利福尼亚乳腺炎测试(CMT)筛选了6个农场的1206头奶牛。 通过CMT发现的样品,来自临床乳腺乳房的样品以及从同一动物的直肠和鼻腔孔获得的Sıwab样品及其周围环境都有有氧培养的,并且通过表型和基因分型来实现分离株的完整鉴定。 研究中还包括一些来自该部门文化库的牛klebsiella菌株。 最后,检测到菌株的抗生素耐药性。 使用机器人挤奶或经典挤奶系统,农场的大肠菌群数量没有差异(p> 0.05)。 在这项研究中检查的农场中克雷伯菌乳腺炎的最高患病率为8.75%。 无论如何,在所有农场的克雷伯氏菌分离株中都可以看到抗co蛋白的耐药性。 分别在直肠和器官起源菌株中看到了最低的12%和最高50%的抗药性。 从乳酸牛奶样品中分离出来。在牛健康方面,它是一种众所周知的机会性病原体,在乳腺炎的发病机理中发挥了作用。实际上,这种细菌可以在牛农场环境中广泛传播,主要是通过乳制品设施和繁殖区域最终导致乳腺炎。彻底表征生态学剂可以帮助理解机会性感染的发病机理。在这项研究中,首先通过加利福尼亚乳腺炎测试(CMT)筛选了6个农场的1206头奶牛。通过CMT发现的样品,来自临床乳腺乳房的样品以及从同一动物的直肠和鼻腔孔获得的Sıwab样品及其周围环境都有有氧培养的,并且通过表型和基因分型来实现分离株的完整鉴定。研究中还包括一些来自该部门文化库的牛klebsiella菌株。最后,检测到菌株的抗生素耐药性。使用机器人挤奶或经典挤奶系统,农场的大肠菌群数量没有差异(p> 0.05)。在这项研究中检查的农场中克雷伯菌乳腺炎的最高患病率为8.75%。无论如何,在所有农场的克雷伯氏菌分离株中都可以看到抗co蛋白的耐药性。分别在直肠和器官起源菌株中看到了最低的12%和最高50%的抗药性。从乳酸牛奶样品中分离出来。出乎意料的是,检测到碳青霉烯(Imipenem)耐药性,并且是环境中分离株中最高的50%。在克雷伯氏菌属中测量了碳青霉苯甲酸耐药性的较低发生。碳青霉烯耐药性进一步验证。关键词:碳青霉烯,奶牛健康,环境污染,机会性感染。引言klebsiella种是革兰氏阴性,杆状,封装,乳糖阳性的(除了肺炎klebsiella pneumoniae subsp。rhinoscleromatis ), non-motile, H 2 S negative, facultatively anaerobic bacteriae (Atalay, 2023; Cheng et al., 2021) Klebsiella pneumoniae ( K. pneumoniae ) causes high morbidity rates and significant economic losses in cases of mastitis (Oliver, Gonzalez, Hogan, Jayarao, & Owens, 2004).牛乳腺炎会导致重大经济损失,并对动物福利产生深远的负面影响。因此,重要的是要成功管理此类感染,包括尤其是在炎症开始或亚临床阶段的信息。K。肺炎通常被认为是机会性病原体之一,不仅引起环境衍生的牛乳腺炎,而且还引起奶牛的上呼吸道感染。这是一个新兴的人畜共患者和食源
1个整形手术,博洛尼亚的IRCCS医院 - 意大利博洛尼亚40138; Alessandro.ammar@icloud.com(A.A。); ieroviazeneli@yahoo.com(F.Z.); mariaelisa.lozano@gmail.com(m.e.l.m.); riccardo.cipriani@aosp.bo.it(r.c。)2博洛尼亚大学医学和外科科学系(DIMEC),意大利博洛尼亚40138; e.zamagni@unibo.it(E.Z。); renato.pascale2@unibo.it(R.P. ); katia.mancuso3@unibo.it(k.m. ); pierluigi.viale@unibo.it(p.v. ); davide.pacini@unibo.it(d.p。) 3胸外科手术,博洛尼亚的IRCCS医院大学,意大利博洛尼亚40138; sweet.giampiero@gmail.com 4 Bologna IRCCS医院 - 40138意大利Bologna血液学5传染病单元,Bologna的IRCCS医院 - 40138 Bologna,意大利6 Otorinolaryngology,Irccs Hospitalngology,Irccs Hospital noversity of Bologna of Bologna,401138 Bologna,Bogna,4011138 Bologna,Ital,Ital,ITALAY; ottavio.piccin@unitn.it 7整形外科,Policlinico di Modena,Modena和Reggio Emilia,41126意大利Modena,意大利摩德纳8心脏手术,Bogna的IRCCS医院 - 大学,40138 BOLOGNA,意大利博洛尼亚; sifinsarez@aosp.bo.it *通信:marco.pignatti@unibo.it); katia.mancuso3@unibo.it(k.m.); pierluigi.viale@unibo.it(p.v.); davide.pacini@unibo.it(d.p。)3胸外科手术,博洛尼亚的IRCCS医院大学,意大利博洛尼亚40138; sweet.giampiero@gmail.com 4 Bologna IRCCS医院 - 40138意大利Bologna血液学5传染病单元,Bologna的IRCCS医院 - 40138 Bologna,意大利6 Otorinolaryngology,Irccs Hospitalngology,Irccs Hospital noversity of Bologna of Bologna,401138 Bologna,Bogna,4011138 Bologna,Ital,Ital,ITALAY; ottavio.piccin@unitn.it 7整形外科,Policlinico di Modena,Modena和Reggio Emilia,41126意大利Modena,意大利摩德纳8心脏手术,Bogna的IRCCS医院 - 大学,40138 BOLOGNA,意大利博洛尼亚; sifinsarez@aosp.bo.it *通信:marco.pignatti@unibo.it
摘要:对英国遍布医院的爆发的肺炎(K.肺炎)培养,持续了12个月以上。我们试图对爆发菌株进行序列和遗传表征。抗生素敏感性测试(AST)是在从暴发中保存的65 k肺炎分离株上进行的。使用牛津纳米孔技术(ONT)奴才流循环对所有分离株进行了测序:10个分离株,包括2017年最早收集日期的分离株,在Novaseq 6000平台上还测序,以构建高准确性纳米孔 - 小颗粒组件。在测序菌株中,60个键入ST628。96.6%(n = 58/60)ST628菌株具有大约247-kb fib(k)质粒,含有多达11种抗微生物抗性基因,包括扩展的谱β-内酰胺氨基氨基氨基氨基氨基酶(ESBL)基因,BLA CTX-M-15。使用单核苷酸多态性(SNP)键入爆发分离株之间的克隆性。暴发菌株在爆发前6年的2012年与临床ST628菌株有关。在持久的医学医学医学爆发期间,在多个独立的病房中检测到了具有多药抗药性(MDR)质粒的稀有ESBL K.肺炎K2 ST628菌株。建议对这种菌株进行监视,以防止未来的医院暴发。
ntimicrobial抗药性(AMR)是全球主要的健康问题,与2019年全球估计495万人死亡有关(1,2)。尽管已经对AMR对临床和经济结果的影响进行了广泛的研究,但对AMR对感染反复感的影响相对较少,这是一项重大事件,导致大量疾病,死亡和医疗保健成本(3)。复发在菌血症患者中特别关注,他们通常脆弱并且患有潜在的疾病,因为菌血症与高死亡率和AMR有关(4)。AMR与更大的感染严重程度,治疗衰竭更高的风险以及更长的住院时间有关,所有这些都可能影响复发的风险(5-7)。很少有研究研究AMR是复发性菌血症的潜在危险因素,并且所有研究都限于归因于引起初始感染的同一细菌的感染的复发(8-13)。相反,少数不针对特定细菌物种或患者人群(例如,具有潜在条件的人)和研究危险因素在1年内复发的危险因素并不认为AMR是潜在的危险因素(14-16)。然而,在研究AMR与复发之间的联系时,重要的是要考虑延长的微生物不平衡,即广谱抗生素暴露(即标准细菌治疗)可以诱导宿主微生物组。AMR在初始菌血症发作中可能会增加这种不平衡包括对宿主对定殖和感染的易感性的影响(17)以及对抗生素耐药细菌的选择和持续时间的影响,例如,扩展的谱β-内酰胺酶(ESBL)可能会超过1年 - 产生肠tocteriaceae(18)。
5. Mishra Mitali. 等人。“抗生素耐药性特征、外膜蛋白、毒力因子和基因组序列分析表明,与环境分离株相比,肠杆菌临床分离株是潜在病原体”。《细胞与感染微生物学前沿》第 10 卷 (2020):54。
街头食品是印度烹饪文化不可或缺的一部分,为顾客提供了多种负担得起的选择。但是,由于基础设施不足和街头小贩的瞬时性质,人们对与街头食品消费有关的公众健康风险的担忧持续存在。受污染的街头食品会导致食源性疾病,例如胃肠炎,伤寒,肺炎,食物中毒和丙型肝炎A。益生菌是有益的细菌,可以通过靶向特定的感染来有效。富含益生菌的果实饮料提出了一种创新的方法,可改善人口营养和益生菌提供。乳杆菌Gasseri是一种革兰氏阳性细菌,由于其对酸度的抗性和对肠道健康的有益作用,因此被证明是有希望的益生菌菌株。藻酸盐封装改善了益生菌菌株的稳定性和释放。益生菌果汁可以由富含抗氧化剂和养分的水果制成,例如西番茄,fragaria ananassa和phyllanthus emblica。这项研究的目的是使用分子方法来发现从街头食品中分离出来的klebsiella aerogenes(pp335235)。该研究还试图确定分离株的抗生素灵敏度模式,并探索用乳糖乳杆菌将果汁加固的潜力,作为益生菌营养的治疗策略。
5。Okogeri EI。等。 “尼日利亚临床标本中的klebsiella种类的扩展光谱β-内酰胺酶基因(SHV,TEM,CTX-M和OXA)的横断面研究”。 《美国医学科学杂志》 8(2020):180-186。Okogeri EI。等。“尼日利亚临床标本中的klebsiella种类的扩展光谱β-内酰胺酶基因(SHV,TEM,CTX-M和OXA)的横断面研究”。《美国医学科学杂志》 8(2020):180-186。