摘要:基于 CRISPR(成簇的规律间隔的短回文重复序列)的技术是用于定点基因组修饰的强大、可编程工具。在成功改造并有效使用 CRISPR-Cas9 进行甲基营养酵母 Komagataella phaffii 的基因组工程后,人们希望有更多可用的核酸内切酶来增加实验灵活性,并在由于第三方的知识产权 (IPR) 而对工业研究有特定法律限制的情况下提供替代方案。MAD7 是一种工程化的 2 类 V 型 Cas 核酸酶,被推广为学术和工业研究的免版税替代品,由 Inscripta(美国加利福尼亚州普莱森顿)开发。本研究首次将CRISPR-MAD7用于K. phaffii基因组编辑,对编码甘油激酶1(GUT1)、红色荧光蛋白(DsRed)和zeocin抗性基因(Sh ble)的三个靶基因均获得了较高的基因编辑率(高达90%)。此外,还通过靶向K. phaffii中的259个激酶基因,系统地比较了CRISPR-MAD7和CRISPR-Cas9系统的基因组编辑效率。在这次大范围的测试中,与应用的CRISPR-MAD7工具箱(约23%)相比,CRISPR-Cas9具有更高的基因组编辑率,约为65%。
如果 MAD7 和 gRNA 由不同的载体编码,则可以依次(MAD7 然后是 gRNA)或同时将其转化为细胞。如果 MAD7 和 gRNA 在同一个载体中,只需将载体转化为细胞即可。根据需要进行基因编辑实验。注意:如果进行精确编辑,则需要 DNA 供体模板。DNA 供体可以是化学合成的单链 DNA (ssDNA) 或双链 DNA (dsDNA),也可以克隆到表达 gRNA 的载体中。5' 和 3' 同源臂的长度取决于所需精确编辑的长度,可能需要针对您的系统进行优化。此外,Lambda Red(或其他重组酶)必须与 MAD7 共同表达才能实现最佳重组。
摘要 MAD7 是从直肠真杆菌中分离出来的一种工程化的 2 类 VA 型 CRISPR-Cas (Cas12a/Cpf1) 系统。与 Cas9 类似,它是一种 RNA 引导的核酸酶,在大肠杆菌和酵母细胞中具有基因编辑活性。本文报告称,MAD7 能够分别在人类 HCT116 和 U2OS 癌细胞系中产生内源基因的插入/缺失和荧光基因标记。此外,MAD7 非常擅长在小鼠和大鼠胚胎中产生插入/缺失、小 DNA 插入(23 个碱基)和 1 至 14 kb 大小的较大整合,从而产生活产转基因动物。由于不同的原间隔区相邻基序要求、小引导 RNA 和高效的靶向基因破坏和插入,MAD7 可以扩展 CRISPR 工具箱,用于跨不同系统和模型生物进行基因组工程。
