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背景信息PMS2(也称为PMSL2)属于DNA不匹配修复MUTL/HEXB家族。它是后复制性DNA不匹配修复系统(MMR)的组成部分。它与MLH1异二聚体形成MUTL alpha。mull alpha(MLH1-PMS2)与DNA聚合酶III的夹具加载子亚基进行物理相互作用,这表明将DNA聚合酶III募集到MMR位置可能起作用。它也与DNA损伤信号传导有关,该过程诱导细胞周期停滞,并在发生重大DNA损伤的情况下导致凋亡。(PMID:16873062,PMID:18206974)PMS2中的缺陷是遗传性非poly型大肠癌4型4型(HNPCC4)的原因。PMS2中的缺陷是导致不匹配修复癌综合征(MMRC)的原因。
图1真核MMR的概述MUTS同源物识别不匹配的碱基对。 MUTSα识别错误和小安培碱基,而MUTSβ识别大型安培碱基。 MUTLα与MUTSα-不匹配复合物相互作用。 PCNA通过夹具装载机放置在双链DNA链的不连续部分中的DNA上。夹具形的PCNA在滑动夹具孔时移动。由于PCNA的结构具有极性(侧面和前部),因此PCNA在保持其极性的同时移动到DNA上,并与MUTLα相互作用。 PCNA的极性不同会激活MUTLα以仅裂解新生的链侧,从而导致不匹配两侧的划痕。核酸外切酶EXO 1去除含错误的区域,所得的间隙区域充满DNA聚合酶δ,一种复制的聚合酶。除大肠杆菌及其相关物种外,人们认为许多真正的细菌将以几乎相同的机制反应。但是,预计区分新链和旧链的机制将会有所不同。24)。一些古细菌具有真核MMR(可能是从真实细菌水平传播的)40),这是少数族裔,大多数具有完全不同的机制,称为内质系统41)。内体是一种与限制酶具有结构和功能相似性的酶,并且在不匹配的碱基对附近裂解了双链DNA的两个链。这种双链裂解预计将通过同源重组系统修复。使用同源重组系统的维修反应非常准确,这是有道理的,因为修复合成是使用另一个DNA分子(染色体)作为模板的同源区域进行的,因此无需区分旧链和新链。
目标:通过MUTL蛋白同源物1的免疫组织化学表达评估微卫星稳定性状态,并在子宫内膜类子宫内膜癌(EC)中评估MUTS蛋白质同源物2。结果将与各种临床和病理参数(包括总体生存)相关,以最大程度地提高靶向治疗益处。背景:EC是全球女性中第四大最常见的恶性肿瘤。旨在通过分子分类来改善EC患者的治疗算法的新风险地层模型。与子宫内膜类型类型相关的分子改变之一是微卫星不稳定性(MSI)。患者和方法:这项回顾性研究包括72个子宫切除术标本,被埃及患者诊断为子宫内膜类腺癌。对MUTL蛋白同源物1和MUTS蛋白同源物2的免疫组织化学染色,并使用结果将病例隔离为微磷灰石稳定和MSI病例。它们与临床病理学参数(包括总体存活率)最终相关。结果:在其中48.6%的子宫内膜类药物腺癌病例中检测到MSI,并且似乎与肿瘤 - 纤维化淋巴细胞(p¼0.049),明显的坏死性(P¼0.045)和增生的相邻子宫内膜(P¼0.045)有关。微卫星稳定性状况对治疗反应或总体生存没有影响。结论:具有MSI的子宫内膜类药物腺癌病例的组织病理学特征包括明显的肿瘤 - 纤维纤维淋巴细胞,明显的坏死和邻近的增生子宫内膜。需要进行更多的研究来验证微卫星状况对治疗反应和总体存活的影响,以便更好地选择有资格获得免疫检查点抑制剂治疗的患者。
致癌作用是由致癌基因 Kirsten Ra Sarcoma (kras) 的驱动突变和肿瘤抑制基因(如 tp53、细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶 (cdkn2a)、抗 decapentaplegic 同源物 (smad)-3 和 − 4 的缺失突变逐渐积累引起的 [3] 。乳腺癌 A2 (brca2) 和 A1 (brca1)、brca2 的伴侣和定位器 (palb2)、毛细血管扩张性共济失调突变 (atm)、mutL 同源物 1 (mlh1)、mutS 同源物 2 (msh2) 和 6 (msh6) 中的种系突变也与胰腺癌易感性有关,在 4 – 19 % 的遗传性 PDAC 中发现 [4] 。这些基因改变伴随着胰腺导管细胞内的组织学变化,导致癌前病变(称为胰腺上皮内瘤变 (PanIN))的等级不断提高。
致癌作用是由癌基因Kirsten RA SARMA(KRAS)中驱动突变的逐渐积累以及肿瘤抑制基因的功能丧失突变引起的,例如TP53,Cyclin-依赖性激酶(CDKN2A),母亲(母亲),针对Decentapplegic filestaplegic同源物(Smad)-3和-3和-4 [3]。BRCA2(PALB2)的合作伙伴和本地化,乳腺癌A2(BRCA2)和A1(BRCA1)中的种系突变,Ataxia telangictia症突变(ATM),MUTL同源1(MLH1),MUTS同源2(MSSH2)和6(MSH2)和6(MSH6)也与Prantis cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer cancer canters cantl of sentoccant也很少相关。这些遗传改变伴随着胰腺导管细胞内的组织学变化,导致
单链 DNA 重组工程在肠道细菌以外物种的基因组编辑中的应用受到重组酶效率和内源性错配修复 (MMR) 系统作用的限制。在这项工作中,我们建立了一个遗传系统,用于在生物技术相关菌株 EM42 的染色体中输入多种变化。为此,设计了 PL / c I857 系统的控制下,rec2 重组酶和 P. putida 的等位基因 mutL E36K PP 的高水平热诱导共转录。短时间热转移循环,然后用一套诱变寡核苷酸进行转化,可产生不同类型的基因组变化,每次修饰的频率高达 10%。相同的方法有助于超级多样化短染色体部分,以创建功能性基因组片段文库——例如核糖体结合位点。这些结果使得假单胞菌基因组工程的多重化成为可能,这是这种重要合成生物学底盘代谢重编程所必需的。
大肠杆菌不匹配维修系统能够识别DNA中的非分配基础对,显然是通过局部切除和重新合成的,以取代错误的基础(有关审查,请参见参考,请参见参考文献1)。DNA的区域GATC序列是完全腺嘌呤 - 甲基化的似乎是对不匹配修复的难治性(2,3),并且似乎是在复制叉后紧接在复制后立即将新合成的GATC序列的短暂甲基化,从而使修复的重复修复仅可重复进行新的合成,从而将其撤离了新的合成和错误。大肠杆菌不匹配修复系统没有识别和/或维修所有不匹配的效率(6,7)。两个过渡不匹配(G-T和CGA)都很容易予以修复和修复,而六个转移不匹配中的三个不是(6)。这种模式可以部分解释,因为发现在大肠杆菌,mutl,muts和mutu突变体中观察到的突变效应,这些突变体缺乏不匹配修复(参考文献。2-8;有关评论,请参见参考。1)和未指向不匹配修复的大坝突变体(2,6)主要是由于过渡和移码突变的增加(1)。不匹配维修不足的突变体显示移码突变的频率增加,这表明大肠杆菌不匹配修复系统可以识别和修复一个或多个未配对的碱基 - i.e。,移交/野生型型异源杂质。该假设进行了检验。结果表明,具有一个未配对基碱的异源型可以通过大肠杆菌不匹配修复系统识别和修复。
基因组编辑通过提供更快,更具成本效益的方法来在特定靶位点上修改细菌基因组,从而显着提高。基因组编辑很大程度上是基于诱导所需表型的遗传变异和筛查/选择(Pines等,2015)。It is now possible to target spe- cific genomic sites using indirect techniques such as programmable nucleases (CRISPR /Cas9, Zinc Finger Nucleases, and Transcription Activator-Like Effector Nucleases (TALENS)) ( Esvelt and Wang, 2013 ) and more direct methods such as multiplex automated genome engi- neering (MAGE) ( Court et al., 2002 ; Wang et al., 2009; Wang等人,2012年;具体来说,法师使用带有所需突变的单链寡核苷酸,这些突变被重新组合到基因组中,并依赖于甲基指导的不匹配修复系统的成功失活。这最终导致背景突变率提高了两个数量级,并且脱靶突变的积累影响了未来的表型研究(CS O等人,2020年)。Nyerges等。(Nyerges等,2016)随后修改了此方法(Portmage),以克服MAGE的局限性,从而创建具有温度控制的显性负MUTL等位基因,该质粒仅在寡核苷酸整合过程中限制DNA修复以及λ红重组酶酶。这减少了细菌易受突变率增加的时间,从而降低了脱靶效应。在这里我们使用有些人甚至声称该系统的使用基本上可以消除脱靶效应(Nyerges等,2016; cs; org org o et et al。,2020)。许多人现在已经使用这些方法将新型表型与特定的核苷酸变化相关联,尽管没有报告脱靶突变的报道(Russ等,2020; Tiz等,2019; Moura de Sousa等,2017; Sato等,2018; Spohn等,2018; Spohn等,2019)。