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基因组编辑通过提供更快，更具成本效益的方法来在特定靶位点上修改细菌基因组，从而显着提高。基因组编辑很大程度上是基于诱导所需表型的遗传变异和筛查/选择（Pines等，2015）。It is now possible to target spe- cific genomic sites using indirect techniques such as programmable nucleases (CRISPR /Cas9, Zinc Finger Nucleases, and Transcription Activator-Like Effector Nucleases (TALENS)) ( Esvelt and Wang, 2013 ) and more direct methods such as multiplex automated genome engi- neering (MAGE) ( Court et al., 2002 ; Wang et al., 2009; Wang等人，2012年；具体来说，法师使用带有所需突变的单链寡核苷酸，这些突变被重新组合到基因组中，并依赖于甲基指导的不匹配修复系统的成功失活。这最终导致背景突变率提高了两个数量级，并且脱靶突变的积累影响了未来的表型研究（CS O等人，2020年）。Nyerges等。（Nyerges等，2016）随后修改了此方法（Portmage），以克服MAGE的局限性，从而创建具有温度控制的显性负MUTL等位基因，该质粒仅在寡核苷酸整合过程中限制DNA修复以及λ红重组酶酶。这减少了细菌易受突变率增加的时间，从而降低了脱靶效应。在这里我们使用有些人甚至声称该系统的使用基本上可以消除脱靶效应（Nyerges等，2016; cs; org org o et et al。，2020）。许多人现在已经使用这些方法将新型表型与特定的核苷酸变化相关联，尽管没有报告脱靶突变的报道（Russ等，2020; Tiz等，2019; Moura de Sousa等，2017; Sato等，2018; Spohn等，2018; Spohn等，2019）。
使用Portmage System报告重组工程的目标效果
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