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在没有错配修复的情况下，主要编辑的效率和保真度会得到增强
Prime 编辑 (PE) 是一种强大的基因组工程方法，能够将碱基替换、插入和删除引入任何给定的基因组位点。然而，PE 的效率差异很大，不仅取决于目标基因组区域，还取决于编辑细胞的遗传背景。在这里，为了确定哪些细胞因素会影响 PE 效率，我们针对 32 个 DNA 修复因子进行了有针对性的遗传筛选，涵盖了所有已报道的修复途径。我们表明，根据细胞系和编辑类型，错配修复 (MMR) 的消融可使 PE 效率提高 2-17 倍，涵盖多种人类细胞系、编辑类型和基因组位点。关键 MMR 因子 MLH1 和 MSH2 在 PE 位点的积累表明 MMR 直接参与 PE 控制。我们的研究结果为 PE 机制提供了新的见解，并提出了如何优化其效率。
豁免（b）（6）适用于本文档中的所有修复
EPA-2021-000684 Tyler Spear先生Thrasher Group，Inc。The Thrasher Group，Inc。（Thrasher）目前正在对位于西弗吉尼亚州拉利县海狸（WV）的海狸（一般纬度：37.779085 n，pertitution：81.095882958829的大约287.81英亩）进行大约287.81英亩的土地（下面列出的包裹数字）进行环境尽职调查审查。作为本次评论的一部分，Thrasher要求您办公室维护有关上述属性的任何文件信息的副本。您可能拥有的有关主题财产的任何记录都将不胜感激，因为您的办公室提供的信息是我们环境尽职调查审查的关键且必要的组成部分。我们将感谢您在加快此请求时提供的任何帮助。请随时通过常规邮件将信息发送到Thrasher Bridgeport办公室，或通过电子邮件发送给tspear@thethrashergroup.com。
Lee，B。H.，Shin，H.，Rasouli，A。S.，Choubisa，H.，Ou，P.，Dorakhan，R。，...＆Sargent，E。H.（2023）。支撑的金属邻thal的超分子调整 朝着bory的合成（氨基甲基... ROS如何诱导Netosis？氧化DNA损伤，DNA修复和染色质脱凝 使用斑马鱼研究多外观跳过作为的潜在疗法 啮齿动物的心肌病和心力衰竭的啮齿动物模型，用于翻译研究和治疗发现
1.3 T HIS W ORK ................................................................................................................................................ 21
淀粉样蛋白纤维-UIO-66-NH2环境修复
有毒污染物（例如重金属和有机化合物）对人类健康产生有害影响，从而引发全球关注。1,2此外，气候变化的行星边界已经超过，并且正在对地球造成不可逆转的损害。3因此，已经引入了几种水纯化和CO 2捕获方法。4,5尽管这些技术既可靠又有效，但由于高能源需求和成本，它们是不可持续的。6因此，开发可持续和环保的技术至关重要。金属 - 有机框架（MOF）是高度多孔纳米结构，其中包括金属离子/簇和有机接头7具有特色特征，例如高孔隙率和表面积，多样性和灵活性。8这些特性使MOF能够在吸附，9气体捕获，10和分离，11以及环境修复方面具有较高的潜力。12个基于锆的MOF，UIO-66和UIO-66-NH 2具有较高的热液稳定性，13对水的应用有益。此外，UIO-66-NH 2中的氨基组允许CO 2吸附属性。14然而，直接应用粉末状MOF（例如由于脆弱和晶体结构引起的可加工性差），存在某些局限
OGG1的小分子激活可增强氧化性DNA损伤的修复
两种 OGG1 调节剂均减少了 KBrO 3 诱导的 AP 位点（图 2G），我们发现 TH5487 的 DNA 链断裂（γH2AX）更少（图 2H），表明 OGG1 糖基化酶活性受损会导致 AP 位点数量减少。相反，我们发现 TH10785 的 DNA 链断裂（γH2AX）更多（图 2H），证实 TH10785 在细胞中的催化活性会导致 DNA 链断裂。总之，这些结果表明 TH10785 激活的 OGG1 具有新的细胞作用，即比 8-oxoG 更倾向于 AP 位点。接下来，我们测试了 TH10785 在细胞中诱导 β,δ 消除的程度。我们假设同时刺激 β,δ-消除和阻断 PNKP1 活性应会使系统因未修复的 DNA 单链断裂而超载（图 1A）。因此，在单独暴露于 OGG1 抑制剂或激活剂（图 3A、图 S26）和类似化合物（表 S6 和图 3B）或与 PNKP1i 联合使用的 U2OS 细胞中，使用标记物 γH2AX 和 53BP1 通过 IF 测量 DDR。我们发现 PNKP1 抑制剂只有与引起体外 β,δ-裂解酶活性的 OGG1 激活剂联合使用时才会诱导强 DDR。为了评估这种因果关系，我们使用 RNA 测序监测转录变化，发现 PNKP1i 与 TH10785 联合使用（而非单独使用）会诱导识别和修复 DNA 双链断裂的关键参与者的转录显着上调（图 3C）。此外，TH10785 与 PNKP1 抑制相结合时细胞活力降低，但 TH5487 则不会降低（图 3D 和 3E）。这些结果表明，TH10785 激活 OGG1 β,δ-裂解酶活性在体外和细胞内均会发生，并且 PNKP1 对于避免 DNA 损伤的积累和随之而来的细胞死亡至关重要。总之，我们提出了一种新概念，即通过酶导向的小分子催化剂诱导 OGG1 β,δ-裂解酶活性，结合到酶的活性位点（图 3F、S27 和 S28）。TH10785 的存在引起的新催化功能更倾向于 AP 位点而不是 8-oxoG，并在体外和细胞内产生 PNKP1 依赖性。改善或重新规划处理氧化性DNA损伤的修复途径对许多疾病（如炎症、癌症、阿尔茨海默氏症或衰老）具有重要意义，这里概述的概念允许以新的方式控制和重新规划修复途径（24）。
研究高光 - 修复电子学。 ...
根在纽约州长岛长大，高中期间他找到了一份在柔性印刷方面的工作 - 一种快速印刷在各种材料（例如塑料和纸）上的方法。这项工作经验促使他追求学士学位罗切斯特大学化学工程学。 他热爱他的大学有机化学课程，并被有机分子（特别是聚合物）的复杂几何形状所吸引。 聚合物是由较小的定制分子单元组成的巨大分子，它们通过化学键相互连接，形成具有独特且有用的材料特性的柔性链和网络。 作为一个类比，聚合物就像由互连的乐高积木组成的完整LEGO®设置。 一个重要的细微差别是聚合物不是像LegoS®那样刚性，而是分子构建块的柔性组件。 一些众所周知的聚合物的例子包括DNA，泡沫聚苯乙烯和橡胶。 山姆对聚合物的兴趣，再加上他对柔性印刷的背景，使他从事软光刻的本科研究项目。 从罗切斯特毕业后，Root攻读博士学位。加州大学圣地亚哥分校的化学工程专业，被南加州的温暖天气和美丽的海滩引诱，以及进一步探索他对聚合物的热爱的机会。 在接下来的四年中，Root研究了Darren Lipomi教授的指导下的半导体聚合物的机械性能。 在2021年，Root返回加利福尼亚，并加入了斯坦福教授Zhenan Bao的实验室，将他在聚合物复合材料的经验应用于自我修复电子产品。罗切斯特大学化学工程学。他热爱他的大学有机化学课程，并被有机分子（特别是聚合物）的复杂几何形状所吸引。聚合物是由较小的定制分子单元组成的巨大分子，它们通过化学键相互连接，形成具有独特且有用的材料特性的柔性链和网络。作为一个类比，聚合物就像由互连的乐高积木组成的完整LEGO®设置。一个重要的细微差别是聚合物不是像LegoS®那样刚性，而是分子构建块的柔性组件。一些众所周知的聚合物的例子包括DNA，泡沫聚苯乙烯和橡胶。山姆对聚合物的兴趣，再加上他对柔性印刷的背景，使他从事软光刻的本科研究项目。从罗切斯特毕业后，Root攻读博士学位。加州大学圣地亚哥分校的化学工程专业，被南加州的温暖天气和美丽的海滩引诱，以及进一步探索他对聚合物的热爱的机会。在接下来的四年中，Root研究了Darren Lipomi教授的指导下的半导体聚合物的机械性能。在2021年，Root返回加利福尼亚，并加入了斯坦福教授Zhenan Bao的实验室，将他在聚合物复合材料的经验应用于自我修复电子产品。在UCSD之后，Sam的学术旅程将他带回了东北，在那里他在乔治·怀特塞德斯教授的实验室的哈佛大学博士后工作了几年。Root喜欢跑步，很高兴发现Bao集团拥有自己的跑步俱乐部“跑步Baos”，该俱乐部由BAO Group成员Lukas Michalek博士创建！这座课外社区建筑确实有助于建立了一个有效的团队，并引发了Root和Lukas之间的研究合作，他们都是自我修复电子科学论文的合着者。这篇Nano@Stanford通讯文章提供了有关其研究的高级摘要，该摘要是为具有广泛技术背景的多样化受众编写的。如果您想了解更多信息，则可以阅读其科学论文中的所有细节：（ doi：10.1126/science.adh0619）。
proc。纳蒂。学院。科学。美国卷77，第8号，第4602-4606页，1980年8月，生物化学的肾上腺素核酸内切核酸酶修复嘧啶二聚体
摘要 通过大肠杆菌内核的损坏DNA的特征（单链断裂）III，IV和VI以及通过噬菌体T4 UV鼻核ASE进行了研究，已通过E coli dna Polymerase I（DNA Polymerase I（DNA coletidylyclase ind of DNA）的dna-nicks Incriv dna-dna-dna in nicks dna complose se a聚合酶的末端，而核酸内切酶III或通过T4紫外线溶液引入脱固定的DNA的痕迹却没有。 该结果表明核酸内切酶IV尼古克在源自核酸位点的5'侧降低了DNA，而核酸内切酶VI也是如此，而核酸内切酶III具有不同的切口机制。 t4紫外核酸内切酶还具有apur- inic核酸内切酶活性，该活性在聚合酶的脱尿中产生了脱尿的DNA，对聚合酶的启动活性低。 通过与核酸内切酶VI的额外孵育，可以增强用核酸内切酶III或T4 UV内核酸酶划分的DNA的启动活性，并在较小程度上与核酸内切酶IV孵育。 这些结果表明，核酸内切酶III和T4 UV核酸内切酶（分别作用于撤离和放射性的DNA）产生含有3末端的载膜/阿哌丁汀位点的划痕，并且这些位点并未通过DNA Polymase I. divne divne的3' -5'活性来[' -5' - 5' - 5' 然而，核酸内切酶IV或VI显然可以去除未经零件位点的5'侧的末端肾上腺素/apyrimidinic位点以及裂解。 这些结果表明，在DNA中肾上腺素/III，IV和VI的连核III，IV和VI的作用。通过大肠杆菌内核的损坏DNA的特征（单链断裂）III，IV和VI以及通过噬菌体T4 UV鼻核ASE进行了研究，已通过E coli dna Polymerase I（DNA Polymerase I（DNA coletidylyclase ind of DNA）的dna-nicks Incriv dna-dna-dna in nicks dna complose se a聚合酶的末端，而核酸内切酶III或通过T4紫外线溶液引入脱固定的DNA的痕迹却没有。 该结果表明核酸内切酶IV尼古克在源自核酸位点的5'侧降低了DNA，而核酸内切酶VI也是如此，而核酸内切酶III具有不同的切口机制。 t4紫外核酸内切酶还具有apur- inic核酸内切酶活性，该活性在聚合酶的脱尿中产生了脱尿的DNA，对聚合酶的启动活性低。 通过与核酸内切酶VI的额外孵育，可以增强用核酸内切酶III或T4 UV内核酸酶划分的DNA的启动活性，并在较小程度上与核酸内切酶IV孵育。 这些结果表明，核酸内切酶III和T4 UV核酸内切酶（分别作用于撤离和放射性的DNA）产生含有3末端的载膜/阿哌丁汀位点的划痕，并且这些位点并未通过DNA Polymase I. divne divne的3' -5'活性来[' -5' - 5' - 5' 然而，核酸内切酶IV或VI显然可以去除未经零件位点的5'侧的末端肾上腺素/apyrimidinic位点以及裂解。 这些结果表明，在DNA中肾上腺素/III，IV和VI的连核III，IV和VI的作用。通过大肠杆菌内核的损坏DNA的特征（单链断裂）III，IV和VI以及通过噬菌体T4 UV鼻核ASE进行了研究，已通过E coli dna Polymerase I（DNA Polymerase I（DNA coletidylyclase ind of DNA）的dna-nicks Incriv dna-dna-dna in nicks dna complose se a聚合酶的末端，而核酸内切酶III或通过T4紫外线溶液引入脱固定的DNA的痕迹却没有。 该结果表明核酸内切酶IV尼古克在源自核酸位点的5'侧降低了DNA，而核酸内切酶VI也是如此，而核酸内切酶III具有不同的切口机制。 t4紫外核酸内切酶还具有apur- inic核酸内切酶活性，该活性在聚合酶的脱尿中产生了脱尿的DNA，对聚合酶的启动活性低。 通过与核酸内切酶VI的额外孵育，可以增强用核酸内切酶III或T4 UV内核酸酶划分的DNA的启动活性，并在较小程度上与核酸内切酶IV孵育。 这些结果表明，核酸内切酶III和T4 UV核酸内切酶（分别作用于撤离和放射性的DNA）产生含有3末端的载膜/阿哌丁汀位点的划痕，并且这些位点并未通过DNA Polymase I. divne divne的3' -5'活性来[' -5' - 5' - 5' 然而，核酸内切酶IV或VI显然可以去除未经零件位点的5'侧的末端肾上腺素/apyrimidinic位点以及裂解。 这些结果表明，在DNA中肾上腺素/III，IV和VI的连核III，IV和VI的作用。通过大肠杆菌内核的损坏DNA的特征（单链断裂）III，IV和VI以及通过噬菌体T4 UV鼻核ASE进行了研究，已通过E coli dna Polymerase I（DNA Polymerase I（DNA coletidylyclase ind of DNA）的dna-nicks Incriv dna-dna-dna in nicks dna complose se a聚合酶的末端，而核酸内切酶III或通过T4紫外线溶液引入脱固定的DNA的痕迹却没有。该结果表明核酸内切酶IV尼古克在源自核酸位点的5'侧降低了DNA，而核酸内切酶VI也是如此，而核酸内切酶III具有不同的切口机制。t4紫外核酸内切酶还具有apur- inic核酸内切酶活性，该活性在聚合酶的脱尿中产生了脱尿的DNA，对聚合酶的启动活性低。通过与核酸内切酶VI的额外孵育，可以增强用核酸内切酶III或T4 UV内核酸酶划分的DNA的启动活性，并在较小程度上与核酸内切酶IV孵育。这些结果表明，核酸内切酶III和T4 UV核酸内切酶（分别作用于撤离和放射性的DNA）产生含有3末端的载膜/阿哌丁汀位点的划痕，并且这些位点并未通过DNA Polymase I. divne divne的3' -5'活性来[' -5' - 5' - 5'然而，核酸内切酶IV或VI显然可以去除未经零件位点的5'侧的末端肾上腺素/apyrimidinic位点以及裂解。这些结果表明，在DNA中肾上腺素/III，IV和VI的连核III，IV和VI的作用。我们使用T4 UV核酸内切酶的结果表明，T4紫外核酸内切酶对辐照DNA的切口涉及在嘧啶二聚体的5'一半处的糖基键的裂解，又涉及磷酸二二聚体的裂解，又是磷酸二酯键的裂解，最初连接了两个核位核位核苷酸的两个核苷酸。他们还暗示糖基键在磷酸酯键之前切割。
修复咨询委员会
修复咨询委员会 Microsoft Teams 混合会议记录 前海军航空站 缅因州布伦瑞克 2023 年 9 月 20 日，星期三 介绍 Dave Barney 于下午 2:05 开始会议 这次会议采用混合形式，有虚拟和面对面与会者。Jackie Boltz 审查了会议的 Microsoft Teams 工具，包括问答选项，Dave 审查了会议议程、混合会议信息和基本规则。Dave 指出，采用混合会议形式是为了允许最广泛的参与，并且会议仅用于准备会议记录。幻灯片 7 列出了会议公告比过去分发更广泛的方式。此更改符合最近更新的社区信息计划 (CIP)。Dave 参考了 RAB 成员名单（幻灯片 8），并指出 Rachelle Knight 将转任海军 RAB 联合主席。苏珊娜·约翰逊注意到斯科特·利比已辞去托普沙姆镇代表一职，并介绍了新任托普沙姆代表苏珊·肖。苏珊拥有 30 年的环境和公共卫生专业经验，具备风险评估、环境合规和流行病学背景，并曾担任多个州和联邦政府职务，包括能源部橡树岭国家实验室和缅因州疾病控制和预防中心的职务。苏珊娜询问月底政府可能关门的影响。戴夫回答说，海军的 BRAC 活动仍有资金支持，工作将继续进行。苏珊娜询问环保署是否会受到影响，戴夫回答说，在上次关门期间，环保署仅靠约 5% 到 10% 的员工开展工作。主要现场活动更新 RAB 成员 – 戴夫·巴尼戴夫在幻灯片 9 中总结了有关 RAB 成员的信息。 Suzanne 和 Dave 指出，虽然幻灯片中提到 RAB 成员预计任期 2 年，但任何人都可以根据自己的时间参与并出席任意数量的会议。