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癌症仍然是全球健康挑战,其发病率和死亡率很高。在2020年,癌症造成了近1000万人死亡,这使其成为全球第二大死亡原因。但是,化学抗性的出现成为成功治疗患者的主要障碍。人类肠道微生物在通过其代谢物调节药物疗效中的作用而被认可,最终导致化学抗性。目前可用的数据库仅限于有关肠道微生物组与药物之间相互作用的知识。然而,尚未报道包含人类肠道微生物基因序列的数据库及其对化学疗法对癌症患者疗效的影响。为了应对这一挑战,我们提出了微生物化学抗性知识库(MICK),这是一种与化学耐药性癌症相关的综合数据库分类微生物基因序列。mick包含160万个与化学抗性和药物代谢相关的29种基因类型的序列,并从最近的文献和序列数据库中手动策划。数据库支持有效的数据检索和分析,为序列搜索和下载功能提供用户友好的Web界面。Mick旨在通过作为研究人员的宝贵资源来促进癌症中化学抗性的理解和缓解
仅供研究使用。不得用于诊断程序。© 2024 Pacific Biosciences of California, Inc.(“PacBio”)。保留所有权利。本文件中的信息如有更改,恕不另行通知。PacBio 对本文件中的任何错误或遗漏不承担任何责任。某些通知、条款、条件和/或使用限制可能与您使用 PacBio 产品和/或第三方产品有关。请参阅适用的 PacBio 销售条款和条件以及 pacb.com/license 上的适用许可条款。Pacific Biosciences、PacBio 徽标、PacBio、Circulomics、Omniome、SMRT、SMRTbell、Iso-Seq、Sequel、Nanobind、SBB、Revio、Onso、Apton、Kinnex、PureTarget、SPRQ 和 Vega 是 PacBio 的商标。
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相应的作者:哈佛T.H. Curtis Huttenhower博士Chan公共卫生学院,麻省理工学院和哈佛大学广泛研究所,chuttenh@hsph.harvard.edu;医学博士Dong D. Wang,SCD,Brigham and妇女医院以及哈佛大学T.H.的哈佛医学院 Chan公共卫生学院,麻省理工学院和哈佛大学广泛研究所,dow471@mail.harvard.edu。 *同样贡献了作者贡献Z.M.,F.W.,C.H。和D.D.W. 概念化了研究。 Z.M. 和F.W. 进行了数据分析。 Z.M.,F.W.,C.H。和D.D.W. 起草了手稿。 C.H. 和D.D.W. 监督研究。 E.B.R,M.D.,W.C.W.,R.K.,F.B.H.,Q.Q.,A.T.C.,R.D.B.,M.J.S.,E.R.S.,I.S.,I.S.,R.C.K.,C.H.和D.D.D.W. 收集了样本和数据,并获得了资金。 所有作者都讨论了结果,对文本进行了严格审查,并批准了最终手稿。Chan公共卫生学院,麻省理工学院和哈佛大学广泛研究所,chuttenh@hsph.harvard.edu;医学博士Dong D. Wang,SCD,Brigham and妇女医院以及哈佛大学T.H.的哈佛医学院Chan公共卫生学院,麻省理工学院和哈佛大学广泛研究所,dow471@mail.harvard.edu。 *同样贡献了作者贡献Z.M.,F.W.,C.H。和D.D.W. 概念化了研究。 Z.M. 和F.W. 进行了数据分析。 Z.M.,F.W.,C.H。和D.D.W. 起草了手稿。 C.H. 和D.D.W. 监督研究。 E.B.R,M.D.,W.C.W.,R.K.,F.B.H.,Q.Q.,A.T.C.,R.D.B.,M.J.S.,E.R.S.,I.S.,I.S.,R.C.K.,C.H.和D.D.D.W. 收集了样本和数据,并获得了资金。 所有作者都讨论了结果,对文本进行了严格审查,并批准了最终手稿。Chan公共卫生学院,麻省理工学院和哈佛大学广泛研究所,dow471@mail.harvard.edu。*同样贡献了作者贡献Z.M.,F.W.,C.H。和D.D.W.概念化了研究。Z.M.和F.W.进行了数据分析。Z.M.,F.W.,C.H。和D.D.W. 起草了手稿。 C.H. 和D.D.W. 监督研究。 E.B.R,M.D.,W.C.W.,R.K.,F.B.H.,Q.Q.,A.T.C.,R.D.B.,M.J.S.,E.R.S.,I.S.,I.S.,R.C.K.,C.H.和D.D.D.W. 收集了样本和数据,并获得了资金。 所有作者都讨论了结果,对文本进行了严格审查,并批准了最终手稿。Z.M.,F.W.,C.H。和D.D.W.起草了手稿。C.H. 和D.D.W. 监督研究。 E.B.R,M.D.,W.C.W.,R.K.,F.B.H.,Q.Q.,A.T.C.,R.D.B.,M.J.S.,E.R.S.,I.S.,I.S.,R.C.K.,C.H.和D.D.D.W. 收集了样本和数据,并获得了资金。 所有作者都讨论了结果,对文本进行了严格审查,并批准了最终手稿。C.H.和D.D.W.监督研究。E.B.R,M.D.,W.C.W.,R.K.,F.B.H.,Q.Q.,A.T.C.,R.D.B.,M.J.S.,E.R.S.,I.S.,I.S.,R.C.K.,C.H.和D.D.D.W.收集了样本和数据,并获得了资金。所有作者都讨论了结果,对文本进行了严格审查,并批准了最终手稿。
塑料废物在环境中的积累带来了重大的生态和健康风险。本研究评估了微生物群落降解各种塑料的有效性,包括低密度聚乙烯 (LDPE)、低线性密度聚乙烯 (LLDPE)、聚对苯二甲酸乙二醇酯 (PET) 和聚苯乙烯 (PS)。对五种微生物菌株进行了与塑料生物降解相关的酯酶和木质酶的定性酶测定。根据其成分的酶谱,组装了四种微生物群落,结合了细菌和真菌菌株,并评估了它们降解原始塑料和再生塑料的能力。结果表明,菌落 C2(枯草芽孢杆菌 RBM2、尖镰孢 RHM1 和链格孢 RHM4)和 C4(枯草芽孢杆菌 RBM2 和假单胞菌 REBP7)表现出最高的生物降解效率,尤其是在回收的 LDPE、原始 LLDPE 和回收的 PET 中实现了显著的重量损失。FTIR 分析进一步证实了生物降解,该分析揭示了处理后的塑料的化学成分和功能组的变化,表明微生物相互作用和降解。这项研究强调了微生物菌落 在解决塑料污染方面的潜力,高度强调了基于酶谱和塑料定植能力的战略菌落设计的重要性。这些有希望的结果表明,进一步优化微生物菌落可以为大规模塑料废物管理提供可行的解决方案。
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电泳:1%琼脂糖凝胶,1×TAE缓冲液 上样DNA量:uL/泳道大小 marker:Lambda/HindIII(200ng/泳道) marker(Lambda/HindIII,NEB#3012S)(uL)
研讨会包括2个小时的讲座和12个小时的动手生物信息学,在此期间,参与者分析了从原始数据到MAGS生成的shot弹枪元基因组数据集。 div>共有49名来自智利的12个不同大学的与众来自巴西的德大学(巴西,巴西),来自智利大学(圣地亚哥),一个来自Playa Ancha(Valparaíso)的Concepción大学(Concepción),两家来自大学(Santiago)的chile chile chile of santia santia chile of santia chile santia santia santia santia GO),来自技术大学Federico SantaMaría(Valparaíso)的三个。 div>