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揭开火星 2020 任务装配洁净室中隐藏的微生物多样性，从分子层面洞察难以进行宏基因组测序的新物种的持久性和毅力
。CC-BY-NC 4.0 国际许可（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2025 年 1 月 24 日发布。；https://doi.org/10.1101/2025.01.21.633868 doi：bioRxiv 预印本
制药业中的微生物生物膜
摘要 微生物生物膜是包裹在细胞外基质内的复杂而有结构的微生物群落，由于其广泛存在并对包括制药在内的各个行业产生重大影响而受到关注。本研究旨在探讨微生物生物膜在制药应用中的挑战、机制和创新解决方案。生物膜的形成涉及附着、定植、成熟和分离的顺序过程，由复杂的微生物相互作用和胞外聚合物 (EPS) 的分泌驱动，对此进行了详细讨论。在制药领域，生物膜在多个方面带来了显著的挑战。最关键的问题之一是生物膜相关微生物对抗菌剂的耐药性增强。EPS 基质充当屏障，阻止药物渗透并保护细胞免受抗生素的影响。这种耐药性导致与医疗器械、慢性伤口和各种生物膜介导疾病相关的持续性感染。在制药制造中，生物膜会污染生产场所、设备和药品，导致药品质量和安全性受损。此外，生物膜的存在使药物测试和开发变得复杂。传统方法主要侧重于浮游细胞，可能无法准确预测新药对生物膜相关感染的疗效，因此需要开发创新的测试方法。为了应对这些挑战，专业人士正在积极探索预防、管理和治疗生物膜相关问题的策略。这些方法包括破坏生物膜的形成、增强药物通过 EPS 基质的渗透性以及开发专门针对生物膜的新型抗菌剂。此外，成像技术和生物材料设计的进步为制药行业监测和预防生物膜的形成提供了有希望的途径。
宏蛋白质组学在“同一个健康”框架中用于阐明微生物 1
https://doi.org/10.26434/chemrxiv-2024-jg1mq-v2 ORCID：https://orcid.org/0000-0003-3280-9042 内容未经 ChemRxiv 同行评审。许可：CC BY 4.0
微生物农药：一种全面的生态方法 -
微生物农药为化学农药提供了可持续且环保的替代品，为管理害虫种群提供了有效的解决方案，同时最大程度地减少了环境伤害。随着其在农业，林业和公共卫生中的不断应用，微生物农药有可能彻底改变害虫控制实践。但是，必须解决诸如有限频谱和环境因素之类的挑战，以实现广泛采用。随着研究和发展的继续，微生物农药可能在可持续的有害生物管理和促进健康生态系统中发挥越来越重要的作用。
被子植物种类花蜜微生物群落的季节性聚集：评估气候和植物性状的贡献
摘要 植物—微生物共生关系无处不在，但分析扩散、宿主过滤、竞争和温度对微生物群落组成的影响却颇具挑战性。花蜜中栖息的微生物可以影响开花植物的健康和授粉，它们为解开群落组装过程提供了一个易处理的系统。我们将一个合成的酵母和细菌群落接种到 31 种植物的花蜜中，同时排除传粉者。我们监测天气，并在 24 小时后收集并培养群落。我们发现植物种类对最终的微生物丰度和群落组成有很强的影响，部分原因是植物系统发育和花蜜过氧化物含量，而不是花的形态。温度升高会降低微生物多样性，而最低温度升高会促进生长，表明温度具有复杂的生态效应。植物物种内一致的花蜜微生物群落可以促进植物或传粉者的适应。我们的工作支持宿主身份、特征和温度在微生物群落组装中的作用，并指出宿主相关微生物组内的多样性-生产力关系。
参考材料8376微生物病原体DNA标准标准，用于检测和鉴定r递观m偏见。
目的：此参考材料（RM）旨在使用基于下一代测序的元基因组学来协调丰度和身份的测量。描述：RM 8376的单位由20个试管（组件）组成，其中包含细菌（19个试管）或人（1个管）基因组DNA（1×Tris-EDTA）中的人（1管）基因组DNA。每个组件包含大约100 µL溶液。细菌成分的名义浓度为50 ng/ µl，而人DNA名义上为100 ng/ µl。未认证的值：非认证值是基于当前可用信息的最佳估计值。但是，它们不符合NIST的认证标准。未认证的值不为国际单位系统（SI）或其他高阶参考系统提供计量学可追溯性[1]。染色体拷贝数浓度的未认证值如下提供。未经证实的值在学上可以追溯到其确定中使用的材料和程序。
微生物生物技术在生物肥料开发中的应用。
微生物在生物肥料生态系统中发挥着关键作用。固氮菌，如根瘤菌、固氮菌和固氮螺菌，将大气中的氮转化为植物可利用的形式，从而减少对合成氮肥的依赖。同样，磷酸盐溶解细菌和真菌，包括芽孢杆菌和青霉菌，从土壤中的不溶性化合物中释放磷。其他微生物，如假单胞菌和菌根真菌，可增强养分吸收，提高植物对非生物胁迫的耐受性 [2]。
利用 PacBio HiFi 测序进行大规模微生物基因组学研究
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