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社论：主要免疫缺陷的社区系列...
肠道微生物组在人类健康中起关键作用，影响消化，免疫和预防疾病。有益的肠道细菌，例如Akkermansia Muciniphila，Adlercreutzia equolifaciens和Christensenella minuta，通过生物活性代谢物（如短链脂肪酸（SCFAS））有助于代谢调节和免疫支持。富含益生元，发酵食品和基于植物的生物活性化合物的饮食模式，包括多酚和类黄酮，促进了微生物组的多样性和稳定性。然而，诸如个人变异性，生物利用度，饮食依从性和肠道微生物群的动态性质等挑战仍然显着。这篇评论综合了当前对肠道细菌在健康中作用的见解，强调了饮食干预调节微生物群的机制。此外，它强调了微生物组靶向疗法的进步以及个性化营养的变革潜力，利用微生物群和人工智能（AI）来开发量身定制的饮食策略，以优化肠道健康和缓解慢性炎症性疾病。应对这些挑战需要一种多学科的方法，该方法将科学创新，道德框架和实际实施策略整合在一起。
引用Zhang H，Ma L，Peng W，Wang B和Sun Y（2024）肠道微生物群和2型糖尿病的发作之间的关联：两种样品Mendel 心血管疾病的见解 水和碳动力学，森林和草原的生态系统稳定性响应气候变化 社论：核苷，核苷酸和核酸 利用肿瘤微环境进行妇科癌症治疗 自发皮肤中的生物传输循环microRNA ...
2型糖尿病（T2DM）在21世纪（国际糖尿病联合会（IDF），2022年）以惊人的速度增长。T2DM及其并发症在所有地区都带来了沉重的疾病负担（Ali等，2022）。确定与T2DM发展有因果关系的因素可以为预防疾病提供重要的证据基础，并促进新治疗策略的发展。肠道菌群（GM）是一个复杂的生态系统，由大约4×10 13种共生细菌，原生动物，真菌，古细菌和病毒组成（Chen等，2021; Martino等，2022）。gm参与了人体的各种生理活性，例如代谢，炎症过程和免疫反应（Fan and Pedersen，2021; Gill等，2022）。越来越多的证据表明，转基因在T2DM等代谢疾病中起重要作用（Gurung等，2020）。T2DM患者患有代谢疾病和慢性炎症状态，并伴有GM障碍（Yang等，2021）。还发现了GM组成的变化与T2DM的发展以及相关并发症的显着关联（Iatcu等，2021），例如，门类细菌群/企业的不平衡与近距离渗透性相关联，与近距离渗透性相关联，并渗透性渗透性，伴有细胞质，伴有细胞质，并渗透性，并伴有细胞处理效果。随后的DM的炎症反应特征（Iatcu等，2021）。也已经报道了几种细菌，例如发酵乳杆菌，足底和酪蛋白，罗斯伯里亚肠道，akkermansia muciniphila和fragilis菌丝，通过降低流量疗法和维持肠道的速度（IIAT）（降低dm）的风险，通过降低DM发育的风险来发挥保护作用（20）。 尽管如此，有必要区分引起疾病的GM的特征以及疾病或其治疗引起的疾病的特征。 孟德尔随机化（MR）是评估可观察到的可修改暴露或危险因素与临床相关结果之间观察到的关系的因果关系的宝贵工具（Sekula等，2016）。 由于孟德尔的种族隔离和独立的分类法，它可以消除与传统观察性流行病学研究相比，可以消除混杂的偏见，并促进了出现的因果途径的分离表型分组风险也已经报道了几种细菌，例如发酵乳杆菌，足底和酪蛋白，罗斯伯里亚肠道，akkermansia muciniphila和fragilis菌丝，通过降低流量疗法和维持肠道的速度（IIAT）（降低dm）的风险，通过降低DM发育的风险来发挥保护作用（20）。尽管如此，有必要区分引起疾病的GM的特征以及疾病或其治疗引起的疾病的特征。孟德尔随机化（MR）是评估可观察到的可修改暴露或危险因素与临床相关结果之间观察到的关系的因果关系的宝贵工具（Sekula等，2016）。由于孟德尔的种族隔离和独立的分类法，它可以消除与传统观察性流行病学研究相比，可以消除混杂的偏见，并促进了出现的因果途径的分离表型分组风险
益生元对特应性皮炎的影响
人类微生物群与宿主免疫相互作用，导致与过敏和哮喘相关的免疫功能障碍。1特别是，许多研究表明，肠道菌群在特应性皮炎的病理生理学（AD）中起重要作用。在AD患者和健康对照组之间的比较分析中，前组显示肠道中双歧杆菌的水平降低。此外，在AD严重程度和双歧杆菌百分比之间确定了反相关。2低肠道菌群多样性（p = 0.004），尤其是细菌门类细菌类细菌的多样性（p = 0.02）和细菌属（p = 0.01），年龄在1个月大时与AD显着相关。3与对照组相比，AD的亚组显示出与宿主免疫发育相关的功能较低，并且这一发现与粘蛋白降解细菌的定殖（Akkkermansia粘液菌，ruminocococcus gnavus gnavus和lachnospiracterium 2_1_1_1_1_58faa）有关。4 6个月大的粪便样品表明，链球菌的比例明显更高，并且在2岁时的AD婴儿中，梭状芽胞杆菌的比例明显降低。5总体而言，AD的发育和持久性与肠道微生物组的改变有关，并且这种作用可能是通过免疫，代谢和神经内分泌途径介导的肠道皮肤轴。6,7
人类肠道微生物组：希望，威胁和诺言
摘要在过去15年中，微生物组受到了越来越多的关注。尽管已经探索了数十年的肠道微生物，但对居住在人类肠道中的微生物的作用的调查吸引了超出经典的传染病。例如，许多研究报告了肥胖，糖尿病和肝病期间肠道菌群的变化，而且还包括癌症，甚至是神经退行性疾病。人类肠道菌群被视为新型治疗剂的潜在来源。在2013年至2017年之间，关注肠道菌群的出版物数量是12 900，它代表了过去40年来调查该主题的出版物总数的四分之一。本综述讨论了肠道菌群对代谢疾病的影响的最新证据，并专注于选定的关键机制。本评论还旨在对该领域的当前知识进行批判性分析，确定推定的关键问题或问题并讨论误解。在比较患病和健康受试者时产生的大量宏基因组数据可能导致错误的说法，即细菌与疾病的保护或发作有因果关系。实际上，环境因素，例如饮食习惯，药物治疗，肠运动性，粪便频率和一致性都是影响菌群组成的因素，应考虑。将讨论细菌prevotella prevotella prevotella copri和akkermansia Muciniphila作为关键例子。
肠道菌群的动态变化及其在非小细胞肺癌发展过程中的功能性宏基因组潜力
摘要：肠道菌群通过调节宿主代谢和免疫反应在肿瘤发病机理中起着重要作用，并且很少有研究重点是跟踪肺癌发作的肠道菌群变化。因此，我们研究的目的是结合临床前和临床研究，以彻底分析粪便中粪便中肺癌的特征，这将有助于早期诊断并预测肺癌的治疗功效。本研究的第一部分分析了非小细胞肺癌和健康受试者之间的粪便元基因组差异，这项工作的第二部分构建了一种鼠类肺癌模型，以监测肺癌进展过程中小鼠粪便宏基因组学和T细胞免疫学的变化。我们发现，肺癌和小鼠患有肺癌的小鼠的粪便微生物群发生了明显降低的微生物多样性和有益微生物的数量，潜在病原体的增加。与健康受试者相比，在人类和肺癌的小鼠中，Akkermansia Muciniphila的粪便水平和继发性胆汁酸代谢的肠道代谢模块均降低。脾肿大。脾细胞的流式细胞仪分析揭示了肺癌小鼠T细胞亚群比例的重大改变，其特征是CD4 + FOXP3 + CD25 +
下一代益生菌
当前市场上目前可用的大多数益生菌细菌候选者包括属于不同类别的各种菌株。尽管如此，胃肠道微生物组是未定义的微生物剂的集合，可能会对人类产生一些医学益处。因此，目前，来自不同角落的研究人员集中于研究和识别胃肠道衍生的益生菌菌株，以提高下一代益生菌的发展。下一代益生菌术语是指通过删除，添加或修饰特定基因产生的遗传修饰的微生物，以产生益生菌菌株，从而调节代谢，胃肠道健康并直接递送到粘膜。由不同益生菌菌株产生的下一代益生菌旨在为宿主提供一种或多种健康益处，并有效控制和/或对多种疾病的治疗。即使某些下一代益生菌对几种慢性病的控制和治疗吉祥，但对人类的研究仍然是零星的，因此监管机构的确认很少。此外，需要通过向公众发布广泛的应用来解决一些问题。这篇评论强调了下一代益生菌的益生菌潜力，并讨论了现有和新兴的下一代益生菌的潜在益生菌。Probiotic strains such as Faecalibacterium prausnitzii, Prevotella copri, Bacteroides uniformis , Bacteroides thetaiotaomicron , Bacteroides acidifaciens , Clostridium butyricum , Christensenella minuta , Akkermansia muciniphila and Parabacteroides goldsteinii , have been postulated as next-generation益生菌候选者由于对结肠炎，肥胖，糖尿病和肝病等疾病的治疗或预防作用。
重复使用抗生素的病史导致微生物群 -
摘要的最新证据表明，重复使用的抗生素使用降低了微生物的多样性，并最终改变了肠道微生物群社区。然而，重复（但不是最近）抗生素使用对微生物群介导的粘膜屏障功能的生理影响在很大程度上尚不清楚。通过从深层表型的爱沙尼亚微生物组队列（ESTMB）中选择人类，我们在这里利用人类对小鼠的粪便微生物群移植来探索反复使用抗生素对肠道粘液功能的长期影响。虽然健康的粘液层可以保护肠上皮层免受感染和炎症的影响，但使用可行的结肠组织外植体的离体粘液功能分析，但我们表明，与健康对照组相比，与健康对照组相比，具有反复使用抗生素的人的史微生物群会降低粘液生长速率，并增加了粘液渗透率。此外，shot弹枪元基因组测序鉴定出抗生素形的微生物群落中的微生物群的明显改变，其中包括已知的粘液氧化细菌，包括粘膜粘膜粘膜粘膜和细菌菌属和细菌，脆弱的脆弱性脆弱的脆弱性，占主导地位。改变的菌群组成进一步以独特的代谢产物特征，这可能是由差异粘液降解能力引起的。因此，我们的概念证明研究表明，人类中的长期抗生素使用可能会导致微生物群落改变，该群落降低了肠道中保持适当粘液功能的能力。
shot弹枪宏基因组学和全身性靶向代谢组学突出显示吲哚-3-丙酸作为保护性肠道微生物代谢物，抗流感感染
摘要肠道轴在呼吸道感染期间至关重要，包括流感病毒（IAV）感染。在本研究中，我们使用了高分辨率的shot弹枪元基因组学和靶向代谢组学分析来表征小鼠肠道肠道微生物群的组成和元倾斜度中与流感相关的变化。我们观察到7天（d）7天的分类级变化，包括明显减少乳酸杆菌科和双歧杆菌科的成员，以及akkermansia muciniphila的丰度增加。在D14上，某些物种持续存在扰动。宏基因组数据的功能尺度分析揭示了几种代谢途径的短暂变化，尤其是导致短链脂肪酸（SCFA），多胺和色氨酸代谢物的瞬时变化。对血清的定量靶向代谢组学分析揭示了特定类别的肠道微生物群代谢产物的变化，包括SCFAS，三甲胺，多胺和含吲哚的色氨酸代谢物。在D7上观察到吲哚-3-丙酸（IPA）血液水平的明显降低。微生物群相关的代谢产物的变化与分类单元丰度和疾病标志物水平的变化相关。特别是，IPA与一些乳酸杆菌科和双歧杆菌科（limosilactobacillus reuteri，Animalis limosilactobacillus）正相关，并与细菌M7，病毒载量和炎症标志物呈负相关。在患病动物中补充IPA可减少病毒载量，并降低局部（肺）和全身炎症。用靶向IPA产生细菌的抗生素治疗感染前的抗生素，从而增强了病毒载量和肺部炎症，这是补充IPA抑制的作用。这种综合的宏基因组 - 代谢组分分析的结果强调了IPA是导致流感结果的重要因素和潜在的疾病严重性生物标志物。
免疫系统和肠道微生物群决定雄激素剥夺疗法对前列腺癌的疗效
摘要 背景 前列腺癌 (PC) 对雄激素剥夺疗法 (ADT) 的反应通常是暂时的，从激素敏感性 PC (HSPC) 发展为去势抵抗性 PC (CRPC)。我们研究了 PC 的小鼠模型以及 PC 患者的标本，以揭示胸腺衍生的 T 淋巴细胞和肠道微生物群对 ADT 疗效的意想不到的贡献。 方法 在患有 PC 的小鼠（免疫功能正常或免疫缺陷）中进行临床前实验。同时，我们前瞻性地纳入了 65 名 HSPC 和 CRPC 患者（Oncobiotic 试验）来分析他们的粪便和血液样本。 结果 在患有 PC 的小鼠中，ADT 增加了胸腺细胞和输出。植入 T 淋巴细胞耗竭或无胸腺小鼠的 PC 对 ADT 的反应不如免疫功能正常的小鼠。此外，口服抗生素会消耗肠道微生物群，从而降低 ADT 的疗效。 PC 降低了肠道中 Akkermansia muciniphila 的相对丰度，而 ADT 可以逆转这种影响。此外，将患有 PC 的小鼠与无肿瘤小鼠同养或口服管饲 Akkermansia 可提高 ADT 的疗效。这似乎适用于 PC 患者，因为长期 ADT 可导致胸腺输出增加，这表现为循环中近期胸腺移出细胞 (sjTREC) 的增加。此外，与 HSPC 对照相比，CRPC 患者的肠道菌群发生了变化，并且与 sjTREC 显着相关。虽然健康志愿者的粪便恢复了 ADT 功效，但 PC 患者的粪便却未能恢复功效。结论这些发现表明逆转肠道菌群失调和修复 PC 患者的获得性免疫缺陷具有潜在的临床效用。
肠道小鼠模型中的肠道菌群和代谢产物变化
偏头痛是一种普遍的临床疾病，其特征是复发性单侧跳动头痛发作，并伴随着恶心，呕吐，恐惧症和恐惧症等症状。尽管发生了常见，但偏头痛的诊断，病理生理和治疗仍然存在争议。广泛的研究已将肠道微生物群涉及各种中枢神经系统疾病，包括焦虑症，抑郁症和帕金森氏病。一些研究还表明，偏头痛可能源于对神经激素和代谢的中断。这项研究旨在研究偏头痛小鼠模型和正常小鼠之间肠道微生物群和代谢产物的差异，以阐明潜在的机制和潜在的治疗方法。在偏头痛小鼠模型和正常小鼠之间观察到肠道微生物组成的明显差异，表明这些变化与偏头痛的发病机理之间存在潜在的相关性。这项研究提供了肠道菌群组成和偏头痛小鼠模型和正常小鼠之间代谢物差异的证据，这表明Akkermansiaceae构成了假注射小鼠组中最丰富的分类群，而Lachnospiraceae构成了迁移小鼠模型组中最普遍的组。Akkermansia Muciniphila和Lachnospileceae细菌与代谢产物的丰富性之间的关联表明它们在偏头痛发病机理中的潜在作用。在偏头痛的小鼠中观察到的lachnospileaceae的丰度及其与代谢物变化的相关性表明它可能会影响宿主的健康。因此，益生菌治疗是偏头痛的可能治疗方法。此外，在偏头痛小鼠和正常小鼠之间观察到肠道代谢产物的显着差异。这些变化涵盖了多种代谢途径，表明代谢障碍也可能有助于偏头痛的发展。