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World File Search SystemMycobiome
肠道真菌群与神经精神疾病
在过去十年中，微生物群及其对健康的影响已得到广泛研究。肠道菌群已被公认为是健康状况的关键调节器，因此，其改变可导致多种疾病（D'Argenio 等人，2022）。研究人员主要关注肠道细菌菌群，往往忽略了真菌、病毒和寄生虫的作用。事实上，尽管真菌在肠道中占微生物总数的约 0.1%（Chin 等人，2020），但在与细菌和宿主细胞相互作用过程中产生的次级代谢产物对于免疫控制和代谢稳态至关重要。越来越多的研究强调了肠道菌群与精神疾病之间的密切关系，菌群失调在抑郁症、焦虑症、自闭症谱系障碍 (ASD)、注意力缺陷多动障碍 (ADHD) 和精神分裂症 (SCZ) 等疾病中起着关键作用 (Ahmed 等人，2024)。事实上，正常肠道菌群的失调会对人类产生负面影响，尤其是在生命的关键阶段，因为肠道微生物的表型和细菌种类数量都会随着年龄的增长而发生变化。肠道菌群代谢产物的变化会影响神经系统疾病、精神健康状况，甚至情绪稳定状态 (Jones 等人，2019)。新兴证据表明，肠道真菌群落与细菌群落一样，影响着微生物-肠-脑轴和心理健康结果，真菌群落的变化与精神分裂症（SCZ）、情绪障碍和自闭症（ASD）等疾病相关。本综述探讨了研究肠道真菌群落的技术局限性，并总结了肠道真菌群落与神经精神疾病之间联系的最新研究成果。
土壤真菌组和森林内生真菌
真菌是森林中重要的生态剂，有助于提高整个生态系统的韧性，以应对环境挑战。地中海森林中的栖息地中最受气候变化和害虫传播所威胁的栖息地中，这最终使他们陷入了衰落的螺旋式衰落。因此，土壤和树木的菌根组成的变化可能与森林的健康状况相关，并且在地中海树种中几乎没有解决。在这项工作中，来自西班牙木磨坊的西班牙森林中落下的根际和树皮样品。（Chestnut），Quercus ilex L.（Holm Oak），Q. Suber L.（Cork Oak）和Q. Pyrenaica Willd。（比利亚橡树）。真菌群落的特征是通过其跨编码。在土壤中发现了较高的多样性，在土壤中，有674属属于15个门，在土壤中，属于420属，树木中有6个门。真菌属不包括森林的土壤和树木不包括致病生物，从而阻止了某些属属与森林下降的关联。alpha多样性也与健康状况或样本类型无关，因为它仅在无症状栗子土壤中增加，而在其他任何分析的树种中都没有增加。在无症状的树中发现的一些差异丰富的属，例如metarhizium，assergillus，Russula，Chaetomium，mortierella或clodophialophora，可能与对衰落的病原体的生物控制有关。最后，在土壤和树皮中，健康状况与真菌的主要生活方式之间没有发现任何关系，这可以解释为在土壤和植物真菌群落之间进行串扰之后对逆境的韧性标志。
肿瘤内mycobiome如何调节肺...
在导致癌症发病机理和预后的无数因素中，微生物组已成为调节肿瘤发生和对治疗反应的关键参与者。尽管许多研究强调了细菌的作用，并在某种程度上强调了肿瘤进展中的病毒，但真菌或真菌组在这种复杂的景观中的影响仍然是一个很大程度上未知的领域。1尽管与细菌组相比其生物量较低，但对健康和疾病的影响不可否认。不仅真菌在人体内有重要的份额，而且它们也可以表现为机会性病原体，尤其是在具有免疫功能低下的免疫系统（例如癌症患者）的患者中。2值得注意的是，已在广泛的人类癌症中鉴定出了mycobiome。3然而，尽管有这些见解，但深入的研究询问了真菌微生物组和癌症之间的联系。4-6
肠道结肠炎患者的肠道果酱组的动力学
ulcerative结肠炎（UC）是一种主要影响结肠的炎症性肠病（IBD）的一种形式，导致频繁复发，住院，手术和终生发病率提高。1 UC的病原体可能是由宿主微生物组稳态中的中断驱动的，特定细菌分类群的改变和与结肠渗透性相关的微生物产物的变化。2然而，针对肠道微生物组的疗法，包括益生菌，抗体或粪便微生物移植（FMT），在治疗UC方面具有适度且不一致的影响，因为在不完全表征的微生物组中存在个体间差异，因此在治疗UC方面具有适度的影响。3，4特别是，非细菌微生物王国在UC途径中的作用，尤其是真菌，以及操纵人群对疾病过程的影响。肠道真菌和真菌属念珠菌先前已与UC的发病机理有关。Dys-Biosis，其UC患者显示念珠菌中相对不断变化。5此外，包括Dectin-1在内的真菌抗原感应基因中的遗传多态性已与严重的UC形式有关。6小鼠中念珠菌的口服膨胀加剧了Th17介导的洪水，7和纤维形式的念珠菌可以激活炎症的肿瘤，并诱导结肠Th17的重音。8有趣的是，在移植前患有粪便念珠菌的FMT患者表现出对微生物疗法的有利反应。109我们先前还表明，在一小部分UC患者中，在内窥镜活性和缓解粪便中富含念珠菌（N¼53）。
肠道菌组的改变和对肝脏疾病的影响
慢性肝病及其并发症是全球重大的健康负担。真菌群落（Mycobiome）的变化是肠道微生物组的组成部分，与肝病的发展相结合并有助于。真菌营养不良可以诱导肠道屏障功能障碍，并允许真菌产物转移到引起疾病进展的肝脏。本评论探讨了了解不同肝病的肠道菌组特征的组成和功能多样性方面的最新进展。它深入研究了肠道真菌与肝病之间的致病联系。我们强调真菌易位的重要性，特别关注真菌衍生的代谢物和真菌诱导的免疫细胞，这是肝病的关键因素。此外，我们回顾了肝内的真菌组对肝脏疾病进展的潜在影响。
人类肠道真菌群的组成、发育模式和病理关联
目的：人类肠道真菌群由多种真菌物种组成，尽管与细菌种群相比数量相对较少，但其在健康和疾病中发挥着至关重要的作用。本综述概述了真菌群的组成、发育模式和各种病理条件下的菌群失调。此外，还讨论了肠道微生物群内真菌群落的复杂相互作用。当前内容：肠道真菌群的发展遵循与细菌微生物群相似的模式，出生方式、饮食和年龄是关键决定因素。与细菌趋势相反，真菌群多样性在儿童和老年时期增加。最近的研究表明，不同种族群体的真菌群组成存在差异。真菌群失调与自身免疫、胃肠道和心血管疾病有关。某些真菌，尤其是白色念珠菌，在病理状态下相对更丰富。真菌代谢活动，特别是次级代谢产物的产生，可显著影响疾病进展。肠道微生物群中的细菌-真菌相互作用很复杂，受饮食和抗生素使用等环境因素的调节。此外，肠道真菌群调节治疗效果。肠道真菌通过生物转化增强天然产物化合物的生物活性，包括其抗癌和抗炎作用。这表明肠道真菌群具有优化天然产物治疗效果的潜力。结论：本综述强调了肠道真菌群作为诊断生物标志物和治疗靶点的相关性。未来的研究应侧重于阐明真菌群变化与疾病状态之间的因果关系，并进一步探索肠道生态系统中的细菌-真菌相互作用。
鸟类肺Mycobiome：肺摄入群落的系统发育和生态驱动因素及其潜在病原体
脊椎动物肺部包含多种微生物群落，但鲜为人知的是社区组成或其对健康的后果的原因。肺微生物组组装，例如分散，协同进化和宿主开关。然而，肺微生物组的比较调查很少，特别是对于真菌成分，是mycobiome。区分真菌分类群是通才或专业共生体，潜在的病原体或偶然吸入的孢子，这是迫切的，因为有很高的新兴疾病潜力。在这里，我们提供了禽肺菌落体的第一个特征，并测试了环境，系统发育和功能性状的相对影响。我们使用了195个肺样本中的元法编码和培养，代表20个家庭中的32种鸟类。我们确定了532个真菌分类群（Zotus），其中包括许多机会病原体。这些主要由门comycota（79％）组成，其次是basidiomycota（16％）和粘膜瘤（5％）。酵母和类似酵母菌的类群（Malassezia，Filobasidium，saccharomyces，Meyerozyma和Aureobasidium）和丝状真菌（cladosporium，cladosporium，externaria，neurospora，fusarium和spergillus）很丰富。肺Mycobiomes受环境暴露的强烈影响，并通过宿主身份，性状和系统发育亲和力进一步调节。我们的结果暗示了迁移性鸟类作为机会性致病真菌的长距离传播的潜在向量。
肠道菌组的变化与种群中的2型糖尿病和二甲双胍治疗有关
图1：二甲双胍与（a）T2D中的肠道真菌的关联，（a）总数据集，（b）随机临床试验（RCTS）和（3）横断面研究。黑色三角形和Pointrange显示了骨料数据集的后均值和后部95％可靠的间隔。有色钻石点显示了单个研究的后验。箭头显示基线（左）或二甲双胍（Met）处理（右）时的丰度增加。虚线垂直线表示零关联。（d）来自同一个体的配对样品显示为基线和二甲双胍处理期间比例相对丰度的相邻水平条。分类单元为阶级：家庭，相对较少的分类单元被合并为“其他”类别。
怀孕期间肠道菌组动力学的景观及其与宿主代谢和妊娠健康的关系
抽象目标在怀孕期间的肠道霉菌组（IE，真菌）的重塑及其对宿主代谢和妊娠健康的潜在影响仍然很大程度上尚未探索。在这里，我们的目的是检查孕妇肠道真菌的特征，并揭示肠道菌组合，宿主代谢组和妊娠健康之间的关联。基于中国中部的前瞻性出生队列（2017年至2020年）的设计：Tongji-Huaxi-Shuangliu出生队列，我们包括4800名参与者，他们在怀孕期间提供了ITS2测序数据，饮食信息和临床记录。此外，我们建立了一个由1059名参与者组成的子幼虫，其中包括514名妇女，这些妇女生育着早产，低出生体重或宏观疾病婴儿，以及545个随机选择的对照。在此子体内，共有750、748和709名参与者的参与者分别在所有三个固定器中分别提供了2个测序数据，16S测序数据和血清代谢组数据。结果与肠道细菌中观察到的变化相比，肠道真菌的组成从早期到晚期急剧变化，表现出更大程度的可变性和个性。多组学数据提供了肠道菌组，生物功能，血清代谢产物和妊娠健康中网络的景观，从而指出了粘膜与不良妊娠结局之间的联系。孕前超重状态是影响肠道菌组合体组成改变和妊娠期间代谢重塑模式的关键因素。结论本研究提供了怀孕期间肠道菌果实的动力学的景观及其与宿主代谢和妊娠健康的关系，这奠定了未来肠道肠菌组织健康妊娠调查的基础。
微生物组研究解决方案
大多数关于人类微生物组的初步研究主要集中在细菌群落上。鉴于真菌是泛质的，并且与人体共生，研究人员现在正在积极研究霉菌组在人类健康和疾病中的作用。测序技术的最新进步使真菌的社区概况得到了分析；但是，与宏基因组测序分析相关的复杂性突出了参考材料的需求。为了解决这个问题，ATCC开发了基因组和全细胞真菌模拟社区标准，其中包括10种不同的和临床相关的真菌。